KEGG   ENZYME: 1.21.98.4
Entry
EC 1.21.98.4                Enzyme                                 

Name
PqqA peptide cyclase;
pqqE (gene name)
Class
Oxidoreductases;
Catalysing the reaction X-H + Y-H = X-Y;
With other, known, physiological acceptors
Sysname
PqqA peptide:S-adenosyl-L-methionine oxidoreductase (cyclizing)
Reaction(IUBMB)
a PqqA peptide + S-adenosyl-L-methionine = a PqqA peptide with linked Glu-Tyr residues + 5'-deoxyadenosine + L-methionine
Substrate
PqqA peptide;
S-adenosyl-L-methionine [CPD:C00019]
Product
PqqA peptide with linked Glu-Tyr residues;
5'-deoxyadenosine [CPD:C05198];
L-methionine [CPD:C00073]
Comment
This bacterial enzyme, which is a member of the radical SAM protein family, catalyses the formation of a C-C bond between C-4 of glutamate and C-3 of tyrosine residues of the PqqA protein (which are separated by three amino acid residues). This is the first enzymic step in the biosynthesis of the bacterial enzyme cofactor pyrroloquinoline quinone (PQQ). The reaction is dependent on the presence of a reductant (flavodoxin) and the accessory protein PqqD.
History
EC 1.21.98.4 created 2018
Orthology
K06139  PqqA peptide cyclase
Genes
ECLE: ECNIH2_10520
ECLI: ECNIH5_09670
ECLX: LI66_09895
ECLY: LI62_10660
ECLZ: LI64_09960
EHM: AB284_15140
EXF: BFV63_10075
ECLA: ECNIH3_09680
ECLC: ECR091_09655
ESA: ESA_02996
CSK: ES15_3084(pqqE)
CTU: CTU_08700(pqqE)
KPN: KPN_01812
KPU: KP1_2864(pqqE)
KPP: A79E_2423
KPT: VK055_0676(pqqE)
KPR: KPR_2416(pqqE)
KPJ: N559_2487
KPX: PMK1_04152(moaA1)
KPNU: LI86_12340
KPNK: BN49_2910(pqqE)
KVA: Kvar_2487
KPE: KPK_2541(pqqE)
EAE: EAE_19575
EAR: CCG29970
KQV: B8P98_13480(pqqE)
CLAP: NCTC11466_01757(moaA)
KOT: EH164_01075(pqqE)
IZH: FEM41_01630(pqqE)
EBU: CUC76_02050(pqqE)
SMAR: SM39_1857(pqqE)
SMAC: SMDB11_1672(pqqE)
SMW: SMWW4_v1c09280(pqqE1) SMWW4_v1c24110(pqqE2)
SRL: SOD_c22480(pqqE)
SPLY: Q5A_012585(mftC)
SMAF: D781_2271
SERF: L085_16610
SERM: CLM71_11730(pqqE)
SFJ: SAMEA4384070_2478(moaA_1)
SOF: NCTC11214_04411(moaA)
RAA: Q7S_24831
SOD: Sant_1506(pqqE)
PES: SOPEG_1905(pqqE)
EAM: EAMY_3079(pqqE)
EAY: EAM_0516(pqqE)
ETA: ETA_28860(pqqE)
EPY: EpC_05750(pqqE)
EPR: EPYR_00598(pqqE)
EBI: EbC_37750(pqqE)
ERJ: EJP617_05270(pqqE)
EGE: EM595_0235(pqqE)
EPE: CI789_15575(pqqE)
ERWI: GN242_18265(pqqE)
PAM: PANA_1857(pqqE)
PLF: PANA5342_2340(pqqE)
PAJ: PAJ_1190(pqqE)
PVA: Pvag_1286(pqqE)
PAGG: AL522_13695(pqqE)
PANS: FCN45_09175(pqqE)
PEY: EE896_09910(pqqE)
PGZ: C2E15_01385(pqqE)
PCD: C2E16_01445(pqqE)
MINT: C7M51_03746(skfB)
MTHI: C7M52_03280(skfB)
TPTY: NCTC11468_01821(moaA)
XCC: XCC2940(pqqE)
XCB: XC_1169
XCP: XCR_3310(pqqE)
XCV: XCV3248(pqqE)
XAX: XACM_3036(pqqE)
XAC: XAC3117(pqqE)
XCI: XCAW_03403(pqqE)
XFU: XFF4834R_chr15150(pqqE)
XOM: XOO1633(XOO1633)
XOO: XOO1733(pqqE)
XOP: PXO_01588(pqqE)
XOR: XOC_3321(pqqE)
XPH: XppCFBP6546_03190(XppCFBP6546P_03190)
XHY: FZ025_03660(pqqE)
XCZ: EBN15_13680(pqqE)
LAB: LA76x_3898(pqqE)
LAQ: GLA29479_3372(pqqE)
LCP: LC55x_3921(pqqE)
LGU: LG3211_3732(pqqE)
LEZ: GLE_3759(pqqE)
LEM: LEN_1383(pqqE)
DKO: I596_3132
PAE: PA1989(pqqE)
PAEV: N297_2052(pqqE)
PAEI: N296_2052(pqqE)
PAU: PA14_38780(pqqE)
PAP: PSPA7_3305(pqqE)
PAG: PLES_33341(pqqE)
PAF: PAM18_3056(pqqE)
PNC: NCGM2_2963(pqqE)
PAEB: NCGM1900_4498(pqqE)
PAEP: PA1S_15750
PAEM: U769_15335
PAEL: T223_17025
PAEU: BN889_02165(pqqE)
PAEG: AI22_18025
PAEC: M802_2050(pqqE)
PAEO: M801_2051(pqqE)
PMY: Pmen_1969
PMK: MDS_2932
PRE: PCA10_31280(pqqE)
PPSE: BN5_2337(pqqE)
PCQ: PcP3B5_36390(moaA_3)
PPU: PP_0376(pqqE)
PPF: Pput_0401
PPT: PPS_0371
PPI: YSA_05759
PPX: T1E_2177(pqqE)
PPUH: B479_02355
PPUT: L483_01920
PPUN: PP4_04060(pqqE)
PPUD: DW66_0385
PMON: X969_00180
PMOT: X970_00180
PST: PSPTO_0509(pqqE)
PSB: Psyr_4674
PSYR: N018_02425
PSP: PSPPH_4708(pqqE)
PAVL: BKM03_02850(pqqE)
PVD: CFBP1590_0576(pqqE)
PFL: PFL_5677(pqqE)
PPRC: PFLCHA0_c56280(pqqE2)
PPRO: PPC_5621
PFS: PFLU_5602(pqqE)
PFE: PSF113_5387(pqqE)
PFC: PflA506_4903(pqqE)
PFB: VO64_2489
PFW: PF1751_v1c50290(pqqE)
PEN: PSEEN0394(pqqE)
PSZ: PSTAB_1970(pqqE)
PSR: PSTAA_2101(pqqE-2) PSTAA_2108(pqqE)
PSTT: CH92_10990
PLUL: FOB45_07400(pqqE)
PPUU: PputUW4_02938(pqqE1) PputUW4_04969(pqqE2)
PKC: PKB_2787(pqqE)
PSEM: TO66_28775
PSEC: CCOS191_4949(pqqE)
PSOS: POS17_5608
PANR: A7J50_5333
PSET: THL1_2869
PKE: DLD99_26340(pqqE)
AVN: Avin_41640(pqqE)
AVL: AvCA_41640(pqqE)
AVD: AvCA6_41640(pqqE)
ACX: Achr_8820(pqqE)
PALI: A3K91_1274
PSYA: AOT82_366
PSYP: E5677_07040(pqqE)
ABM: ABSDF1983(pqqE)
ABY: ABAYE1878(pqqE)
ABN: AB57_1992
ABB: ABBFA_01708(moaA_2)
ABX: ABK1_2257
ABH: M3Q_2151
ABAD: ABD1_17550(ppqE)
ABAZ: P795_8385
ABAU: IX87_19760
ABAA: IX88_10775
ACC: BDGL_001130(pqqE)
ACI: ACIAD2507(pqqE)
SWD: Swoo_2249
CPS: CPS_0857(pqqE)
MHC: MARHY3254(pqqE)
MAD: HP15_3137
MBS: MRBBS_1218(pqqE)
MARA: D0851_08185(pqqE) D0851_09770(pqqE)
MARJ: MARI_32630(pqqE_2)
AMAL: I607_15620
AMAE: I876_15920
AMAO: I634_15865
AMAD: I636_15780
AMAI: I635_16420
AMAG: I533_15505
AMAC: MASE_15520
ASP: AOR13_197
ALR: DS731_15120(pqqE)
MCA: MCA1449(pqqE)
METU: GNH96_10760(pqqE)
METL: U737_22045(pqqE)
MAH: MEALZ_0595(pqqE)
MBUR: EQU24_02945(pqqE)
MMAI: sS8_2219
MMOB: F6R98_08490(pqqE)
MEC: Q7C_1402
CYQ: Q91_0457(pqqE)
CZA: CYCME_2187(pqqE)
BLEP: AL038_07330(pqqE)
NOC: Noc_2623
NHL: Nhal_3513
NWA: Nwat_0494
NWR: E3U44_06645(pqqE)
GAI: IMCC3135_24225(mftC)
HCH: HCH_03621
CSA: Csal_0848
HVN: EI420_18150(pqqE)
HOL: HORIV_65380(pqqE)
KUY: FY550_04760(pqqE)
ADI: B5T_02551
AXE: P40_12335
NCU: F0U83_00345(pqqE)
SINI: GT972_14925(pqqE)
PSE: NH8B_3462(pqqE) NH8B_4040(pqqE)
RIN: ACS15_4558(pqqE)
REH: H16_B1049(pqqE)
CNC: CNE_2c10110(pqqE) CNE_BB1p04390(pqqE)
CTI: RALTA_B0442(pqqE2) RALTA_B0668(pqqE1)
CGD: CR3_1420(pqqE)
COX: E0W60_17920(pqqE)
BVE: AK36_5991(pqqE)
BCN: Bcen_3249
BCJ: BCAM2360(pqqE)
BCEN: DM39_5483(pqqE)
BCEW: DM40_5679(pqqE)
BCEO: I35_6256(pqqE)
BAM: Bamb_6168
BMJ: BMULJ_05561(pqqE)
BMU: Bmul_5965
BMK: DM80_6414(pqqE)
BMUL: NP80_5658(pqqE)
BCT: GEM_4430
BCED: DM42_5627(pqqE)
BDL: AK34_5446(pqqE)
BCON: NL30_00660
BUB: BW23_3517(pqqE)
BLAT: WK25_18615
BTEI: WS51_29270
BSEM: WJ12_31740
BPSL: WS57_02305
BMEC: WJ16_30180
BGU: KS03_3688(pqqE)
BGO: BM43_6662(pqqE)
BUK: MYA_5947
BUE: BRPE67_BCDS01120(pqqE)
BGP: BGL_2c29000(pqqE)
BXE: Bxe_B2470(pqqE)
BXB: DR64_4797(pqqE)
BPH: Bphy_6512
BFN: OI25_3472(pqqE)
PMEG: FNZ07_04245(pqqE)
PLG: NCTC10937_04973(moaA_2)
CABA: SBC2_61700(pqqE)
LIMN: HKT17_04285(pqqE)
AMIM: MIM_c14260(pqqE)
PNA: Pnap_0729
VEI: Veis_4038
VPD: VAPA_1c31190(pqqE)
HYR: BSY239_1085(pqqE)
HYC: E5678_01675(pqqE)
HPSE: HPF_17495
MPT: Mpe_A2588
JAJ: EKL02_13045(pqqE)
MALI: EYF70_16440(pqqE)
MUM: FCL38_02020(pqqE)
MFLA: GO485_03820(pqqE)
MPLI: E1742_04520(pqqE)
NOK: FAY22_02695(pqqE)
LCH: Lcho_0248
THI: THI_0495(pqqE)
RGE: RGE_40550(pqqE)
SNN: EWH46_15750(pqqE)
METR: BSY238_2142(pqqE)
MFA: Mfla_1680
MMB: Mmol_0997
MEH: M301_1195
MEP: MPQ_1589
MBAC: BN1209_0759(pqqE)
MBAT: BN1208_0723(pqqE)
DAR: Daro_1702
AZO: azo1190(pqqE)
AZA: AZKH_0824(pqqE) AZKH_1538(pqqE)
AOA: dqs_1304
AZQ: G3580_07735(pqqE) G3580_12720(pqqE)
SULR: B649_05195
PACO: AACT_0606(pqqE)
GBM: Gbem_0807
GEM: GM21_3455
DGG: DGI_4008
ADE: Adeh_0871
SFU: Sfum_2921
DBR: Deba_2506
MESM: EJ066_29990(pqqE)
SME: SM_b20208(pqqE)
SMX: SM11_pD1403(pqqE)
SMI: BN406_06456(pqqE)
SMEL: SM2011_b20208(pqqE)
SMER: DU99_32325
SMD: Smed_3915
SFH: SFHH103_05873(pqqE) SFHH103_06434(pqqE)
SFD: USDA257_c31250(pqqE)
SIX: BSY16_5730(pqqE) BSY16_6310(pqqE)
SAME: SAMCFNEI73_pC0402(pqqE)
ARA: Arad_8719(pqqE)
RGA: RGR602_PC01538(pqqE)
RHT: NT26_3278(pqqE)
NEN: NCHU2750_46890(pqqE)
ABAW: D5400_04015(pqqE)
BJA: blr6739(pqqE)
BRA: BRADO5797(pqqE)
BBT: BBta_6304(pqqE)
BRS: S23_15740(pqqE)
AOL: S58_18220(pqqE)
BRAD: BF49_4914
BRO: BRAD285_1512(pqqE)
BOT: CIT37_20935(pqqE)
BRQ: CIT40_25540(pqqE)
BGQ: X265_09545(pqqE)
BGZ: XH91_08425(pqqE)
BSYM: CIT39_24525(pqqE)
BBET: F8237_23035(pqqE)
RPA: RPA1950(pqqE)
RPB: RPB_3419
RPC: RPC_0883
RPD: RPD_2033
RPE: RPE_0843
RPT: Rpal_2161
NWI: Nwi_0689
VGO: GJW-30_1_00290(albA)
XAU: Xaut_1799
SNO: Snov_1057
LNE: FZC33_09255(pqqE)
ANC: GBB76_01790(pqqE)
APRA: G3A50_17740(pqqE)
MEA: Mex_1p1748(pqqE)
MDI: METDI2500(pqqE)
MEX: Mext_1817
MCH: Mchl_2153
MPO: Mpop_1769
MOR: MOC_0672(pqqE) MOC_1624
META: Y590_08700
MEE: DA075_10650(pqqE)
METD: C0214_10455(pqqE)
METS: DK389_20585(pqqE)
METI: DK427_18590(pqqE)
MMES: MMSR116_16620(pqqE)
MTEA: DK419_17765(pqqE)
BID: Bind_3319
MSL: Msil_1151
MTUN: MTUNDRAET4_0660(pqqE)
MLG: CWB41_08990(pqqE)
HMC: HYPMC_1634(pqqE)
RVA: Rvan_0684
PHL: KKY_2337
FIL: BN1229_v1_0593(pqqE)
FIY: BN1229_v1_0595(pqqE)
DEQ: XM25_03190(PqqE)
YTI: FNA67_07020(pqqE)
MSC: BN69_3487
MROS: EHO51_08825(pqqE)
MHEY: H2LOC_009785(pqqE)
MPAR: F7D14_16940(pqqE)
PLEO: OHA_1_04315(pqqE)
BRN: D1F64_22520(pqqE)
MCG: GL4_2351
HDI: HDIA_2204(pqqE)
NOH: G5V57_12100(pqqE)
METG: HT051_07610(pqqE)
RBM: TEF_06420
SIL: SPO1500(pqqE)
RUA: D1823_18665(pqqE)
RUT: FIU92_21435(moaA3)
RSP: RSP_0790(pqqE)
RDE: RD1_1150(pqqE)
RLI: RLO149_c036960(pqqE)
RPON: G3256_16155(pqqE)
PDE: Pden_2359
PAMN: JCM7685_2823(pqqE)
PARR: EOJ32_02470(pqqE)
PKD: F8A10_01035(pqqE)
PPAN: ESD82_19125(pqqE)
DSH: Dshi_0454(pqqE)
KVL: KVU_2027(pqqE)
KVU: EIO_2509(pqqE)
KRO: BVG79_02153(pqqE)
PGD: Gal_03896
LEJ: ETW24_02690(pqqE)
LAQU: R2C4_20225(pqqE)
RHC: RGUI_0968
RMM: ROSMUCSMR3_01477(mftC)
ROH: FIU89_13865(albA2)
SAGU: CDO87_19425(pqqE)
PPRU: FDP22_11505(pqqE)
MALU: KU6B_56180(pqqE)
THAS: C6Y53_11365(pqqE)
FAQ: G5B39_17140(pqqE)
NTD: EGO55_18335(pqqE)
GOX: GOX0983
GOH: B932_1173
GOY: GLS_c10610(pqqE)
GTI: FXF46_05330(pqqE)
ACR: Acry_0081
AMV: ACMV_01060(pqqE)
GDI: GDI0501 GDI1267(pqqE)
GXY: GLX_18130
GXL: H845_3151
KSC: CD178_01100(albA)
KRE: GWK63_00065(pqqE)
APT: APA01_21290(pqqE)
APW: APA42C_21290(pqqE)
APF: APA03_21290(pqqE)
APU: APA07_21290(pqqE)
APG: APA12_21290(pqqE)
APQ: APA22_21290(pqqE)
APX: APA26_21290(pqqE)
APZ: APA32_21290(pqqE)
APK: APA386B_987(pqqE)
ASZ: ASN_1017(pqqE)
AOY: EOV40_010220(pqqE)
ABG: Asbog_02838(pqqE)
SVC: STVA_28350(pqqE)
NTN: D5366_04820(pqqE)
NEH: E3E11_03660(pqqE)
SSAM: E3D00_04250(pqqE)
BOB: GN304_08515(pqqE)
BOMB: GT348_08105(pqqE)
AZL: AZL_a10000(pqqE)
ABS: AZOBR_100320(pqqE)
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KCR: Kcr_1025
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Reference
1  [PMID:20737074]
  Authors
Wecksler SR, Stoll S, Iavarone AT, Imsand EM, Tran H, Britt RD, Klinman JP
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Interaction of PqqE and PqqD in the pyrroloquinoline quinone (PQQ) biosynthetic pathway links PqqD to the radical SAM superfamily.
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  Authors
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  Title
PqqD is a novel peptide chaperone that forms a ternary complex with the radical S-adenosylmethionine protein PqqE in the pyrroloquinoline quinone biosynthetic pathway.
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  Authors
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  Title
Demonstration That the Radical S-Adenosylmethionine (SAM) Enzyme PqqE Catalyzes de Novo Carbon-Carbon Cross-linking within a Peptide Substrate PqqA in the Presence of the Peptide Chaperone PqqD.
  Journal
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