KEGG   ENZYME: 2.8.1.4Help
Entry
EC 2.8.1.4                  Enzyme                                 

Name
tRNA uracil 4-sulfurtransferase;
thiI (gene name);
transfer ribonucleate sulfurtransferase (ambiguous);
RNA sulfurtransferase (ambiguous);
ribonucleate sulfurtransferase (ambiguous);
transfer RNA sulfurtransferase (ambiguous);
transfer RNA thiolase (ambiguous);
L-cysteine:tRNA sulfurtransferase (incorrect);
tRNA sulfurtransferase (ambiguous)
Class
Transferases;
Transferring sulfur-containing groups;
Sulfurtransferases
BRITE hierarchy
Sysname
[ThiI sulfur-carrier protein]-S-sulfanyl-L-cysteine:uracil in tRNA sulfurtransferase
Reaction(IUBMB)
ATP + [ThiI sulfur-carrier protein]-S-sulfanyl-L-cysteine + uracil in tRNA + 2 reduced ferredoxin [iron-sulfur] cluster = AMP + diphosphate + 4-thiouracil in tRNA + [ThiI sulfur-carrier protein]-L-cysteine + 2 oxidized ferredoxin [iron-sulfur] cluster [RN:R03923]
Reaction(KEGG)
R03923;
(other) R07461
Show
Substrate
ATP [CPD:C00002];
[ThiI sulfur-carrier protein]-S-sulfanyl-L-cysteine;
uracil in tRNA [CPD:C00868];
reduced ferredoxin [iron-sulfur] cluster [CPD:C00138]
Product
AMP [CPD:C00020];
diphosphate [CPD:C00013];
4-thiouracil in tRNA;
[ThiI sulfur-carrier protein]-L-cysteine;
oxidized ferredoxin [iron-sulfur] cluster [CPD:C00139]
Comment
The enzyme, found in bacteria and archaea, is activated by EC 2.8.1.7, cysteine desulfurase, which transfers a sulfur atom to an internal L-cysteine residue, forming a cysteine persulfide. The activated enzyme then transfers the sulfur to a uridine in a tRNA chain in a reaction that requires ATP. The enzyme from the bacterium Escherichia coli forms 4-thiouridine only at position 8 of tRNA. The enzyme also participates in the biosynthesis of the thiazole moiety of thiamine, but different domains are involved in the two processes.
History
EC 2.8.1.4 created 1984, modified 2017
Pathway
ec00730  Thiamine metabolism
ec01100  Metabolic pathways
Orthology
K03151  tRNA uracil 4-sulfurtransferase
Genes
TVA: TVAG_291700
ECO: b0423(thiI)
ECJ: JW0413(thiI)
ECD: ECDH10B_0379(thiI)
EBW: BWG_0305(thiI)
ECOK: ECMDS42_0322(thiI)
ECE: Z0526(yajK)
ECS: ECs0477
ECF: ECH74115_0507(thiI)
ETW: ECSP_0491(thiI)
EOJ: ECO26_0455(thiI)
EOI: ECO111_0453(thiI)
EOH: ECO103_0397(thiI)
ECG: E2348C_0358(thiI)
EOK: G2583_0535(thiI)
ECC: c0534(yajK)
ECI: UTI89_C0446(yajK)
ECV: APECO1_1588(thiI)
ECX: EcHS_A0495(thiI)
ECW: EcE24377A_0455(thiI)
ECM: EcSMS35_0459(thiI)
ECY: ECSE_0445
ECR: ECIAI1_0423(thiI)
ECQ: ECED1_0446(thiI)
ECK: EC55989_0434(thiI)
ECT: ECIAI39_0253(thiI)
EOC: CE10_0390(thiI)
EUM: ECUMN_0462(thiI)
ECZ: ECS88_0419(thiI)
ELH: ETEC_0476
ESE: ECSF_0383
ESO: O3O_05905
ESM: O3M_19375
ESL: O3K_19390
EBR: ECB_00371(thiI)
EBD: ECBD_3238
EKF: KO11_21485(thiI)
EAB: ECABU_c05010(thiI)
EDJ: ECDH1ME8569_0408(thiI)
EIH: ECOK1_0403(thiI)
ENA: ECNA114_0400(yajK)
EUN: UMNK88_473(thiI)
ELW: ECW_m0492(thiI)
ELL: WFL_02435(thiI)
ELC: i14_0515(yajK)
ELD: i02_0515(yajK)
ELP: P12B_c0435(thiI)
EBL: ECD_00371(thiI)
EBE: B21_00375(thiI)
ELF: LF82_2252(thiI)
ECOI: ECOPMV1_00409(thiI)
ECOJ: P423_02150
ECOO: ECRM13514_0421(yajK)
ECOH: ECRM13516_0406(yajK)
ECOS: EC958_0561(yajK)
EFE: EFER_2602(thiI)
EAL: EAKF1_ch1014c(thiI)
STY: STY0464
STT: t2438
STM: STM0425(thiI)
SEO: STM14_0503(thiI)
SEY: SL1344_0419(thiI)
SEJ: STMUK_0431(thiI)
SEB: STM474_0445(thiI)
SENI: CY43_02460
SPT: SPA2298(thiI)
SEK: SSPA2140
SEI: SPC_0437(thiI)
SEC: SCH_0466(xseB)
SEH: SeHA_C0527(thiI)
SHB: SU5_01117
SEE: SNSL254_A0472(thiI)
SEW: SeSA_A0485(thiI)
SEA: SeAg_B0464(thiI)
SENS: Q786_02085
SED: SeD_A0466(thiI)
SEG: SG0436(thiI)
SEL: SPUL_2542(thiI)
SEGA: SPUCDC_2528(thiI)
SET: SEN0407(thiI)
SENA: AU38_02075
SENO: AU37_02070
SENV: AU39_02075
SENQ: AU40_02305
SENL: IY59_02125
SEEP: I137_11575
SENB: BN855_4220(thiI)
SENE: IA1_02270
SBG: SBG_0378
SBZ: A464_384
SFX: S0368(yajK)
SFV: SFV_0388(yajK)
SFE: SFxv_0400(thiI)
SFN: SFy_0449
SFS: SFyv_0484
SFT: NCTC1_00370(thiI)
SSN: SSON_0400(yajK)
SBO: SBO_0317(yajK)
SBC: SbBS512_E0345(thiI)
SDY: SDY_0307(yajK)
ENC: ECL_01180
ECLO: ENC_23370
EEC: EcWSU1_00946(thiI)
ECLX: LI66_04795
ECLY: LI62_05295
ECLZ: LI64_04985
ESA: ESA_02879
CSK: ES15_2962(thiI)
CTU: CTU_09990(thiI)
KPN: KPN_00375(thiI)
KPU: KP1_1241(thiI)
KPP: A79E_3910
KPT: VK055_2179(thiI)
KPE: KPK_4309(thiI)
KPR: KPR_4346(thiI)
KPJ: N559_4033
KPX: PMK1_02704(thiI)
KPNU: LI86_20730
KPNK: BN49_1349(thiI)
KVA: Kvar_4006
KOX: KOX_12620
KOE: A225_1254
EAE: EAE_12585
EAR: CCG31460
CKO: CKO_02738
CRO: ROD_04721
CAMA: F384_01840
BFL: Bfl239(thiI)
BPN: BPEN_246(thiI)
BVA: BVAF_240(thiI)
BCHR: BCHRO640_250(thiI)
BEN: BOBLI757_239(thiI)
BED: BTURN675_228(thiI)
SENM: TRABTM_A_00930(thiI)
EBT: EBL_c29000(thiI)
DEN: MHIR_DE00070(thiI)
CMIK: PMARG_ME00217(thiI)
EBF: D782_3432
PSTS: E05_49000
YPE: YPO3173(thiI)
YPK: y1012
YPA: YPA_2667
YPN: YPN_0915
YPM: YP_0758(thiI)
YPG: YpAngola_A3070(thiI)
YPZ: YPZ3_2793
YPD: YPD4_2783
YPH: YPC_3458(thiI)
YPW: CH59_2886(thiI)
YPJ: CH55_1751(thiI)
YPV: BZ15_355(thiI)
YPL: CH46_1927(thiI)
YPS: YPTB0943(thiI)
YPO: BZ17_1604(thiI)
YPI: YpsIP31758_3108(thiI)
YPY: YPK_3250
YPB: YPTS_0984
YPQ: DJ40_1415(thiI)
YPU: BZ21_187(thiI)
YPR: BZ20_1103(thiI)
YPC: BZ23_463(thiI)
YPF: BZ19_300(thiI)
YEN: YE3151(thiI)
YEY: Y11_20701
YEW: CH47_2525(thiI)
YET: CH48_2686(thiI)
YEE: YE5303_36131(thiI)
YAL: AT01_1472(thiI)
YFR: AW19_2115(thiI)
YIN: CH53_2846(thiI)
YKR: CH54_3671(thiI)
YRO: CH64_3562(thiI)
YRU: BD65_2813(thiI)
SPE: Spro_1081
SRL: SOD_c09200(thiI)
SPLY: Q5A_004900(thiI)
SMAF: D781_0993
SMW: SMWW4_v1c10240(thiI)
SMAR: SM39_0385(thiI)
SMAC: SMDB11_0328(thiI)
SERF: L085_23430
RAA: Q7S_16965
ECA: ECA1134(thiI)
PATR: EV46_05715
PATO: GZ59_11620(thiI)
PCT: PC1_1033
PEC: W5S_3275
SGL: SG0659
SOD: Sant_3014(thiI)
PES: SOPEG_4019(thiI)
DDD: Dda3937_01963(thiI)
DDQ: DDI_0873
ETA: ETA_25240(thiI)
EPY: EpC_26390(thiI)
EPR: EPYR_02864(thiI)
EAM: EAMY_0967(thiI)
EAY: EAM_0976(thiI)
EBI: EbC_09940(thiI)
ERJ: EJP617_20940(thiI)
EGE: EM595_0961(thiI)
PAM: PANA_0979(thiI)
PLF: PANA5342_3322(thiI)
PAJ: PAJ_0305(thiI)
PVA: Pvag_0362(thiI)
PSTW: DSJ_19240
PLU: plu3884(thiI)
PAY: PAU_03436
PMR: PMI0097(thiI)
PMIB: BB2000_0256(thiI)
XBO: XBJ1_1656(thiI)
XBV: XBW1_0959(thiI)
XNE: XNC1_0999(thiI)
XNM: XNC2_0981(thiI)
XDO: XDD1_0860(thiI)
XPO: XPG1_0449(thiI)
PSI: S70_06850
PSX: DR96_1885(thiI)
PRG: RB151_007400(thiI)
MMK: MU9_3258
ETR: ETAE_0982(thiI)
ETD: ETAF_0915(thiI)
ETE: ETEE_2910(thiI)
PSHI: SAMEA2665130_2281(thiI)
HIT: NTHI1694(thiI)
HIU: HIB_16430
HIE: R2846_0916(thiI)
HIZ: R2866_0952(thiI)
HIK: HifGL_001190(thiI)
HIA: H733_1003
HIW: NTHI477_00203(thiI)
HIC: NTHIC486_01272(thiI)
HIX: NTHI723_00120(thiI)
HDU: HD_1806(thiI)
HAP: HAPS_0213(thiI)
HPAZ: K756_05470
HPAS: JL26_04960
HPAK: JT17_02515
HSO: HS_0902(thiI)
HSM: HSM_1380
PMU: PM0535(thiI)
PMV: PMCN06_0565(thiI)
PMP: Pmu_06010(thiI)
PMUL: DR93_1312(thiI)
MSU: MS1062(thiI)
MHQ: D650_9190
MHAT: B824_17330
MHX: MHH_c25470(thiI)
MHAE: F382_03490
MHAM: J450_02695
MHAO: J451_03800
MHAL: N220_09590
MHAQ: WC39_04590
MHAY: VK67_04590
MVR: X781_8520
MVI: X808_7040
MVG: X874_7130
APL: APL_1074(thiI)
APJ: APJL_1090(thiI)
APA: APP7_1132(thiI)
ASU: Asuc_1748
AAT: D11S_1411
AAN: D7S_00102
AACN: AANUM_1785
BTO: WQG_8060
BTRE: F542_13990
BTRH: F543_15610
BTRA: F544_8390
VCH: VC0894
VCO: VC0395_A0417(thiI)
VCR: VC395_0910(thiI)
VCM: VCM66_0851(thiI)
VCI: O3Y_04155
VCS: MS6_0695
VCX: VAA049_2849(thiI)
VCZ: VAB027_1531(thiI)
VVU: VV1_0310(thiI)
VVY: VV0873
VPA: VP0691
VPB: VPBB_0662
VAG: N646_2844
VSP: VS_2401
VNI: VIBNI_A0668(thiI)
VAN: VAA_01160
VAU: VANGNB10_cI0770(thiI)
VTA: A2374(thiI)
VFI: VF_0716(thiI)
VFM: VFMJ11_0736(thiI)
VSA: VSAL_I0938(thiI)
AWD: AWOD_I_0685(thiI)
PPR: PBPRA0810
PAE: PA5118(thiI)
PAEV: N297_5291(thiI)
PAEI: N296_5291(thiI)
PAU: PA14_67580(thiI)
PAP: PSPA7_5851(thiI)
PAG: PLES_55081(thiI)
PAF: PAM18_5232(thiI)
PNC: NCGM2_0392(thiI)
PAEB: NCGM1900_5875(thiI)
PAEP: PA1S_27710
PAEM: U769_27950
PAEL: T223_28160
PAEU: BN889_05688(thiI)
PAEG: AI22_06295
PAEC: M802_5289(thiI)
PAEO: M801_5156(thiI)
PMY: Pmen_4139
PMK: MDS_4464
PRE: PCA10_53340(thiI)
PPSE: BN5_3957(thiI)
PCQ: PcP3B5_58650(thiI)
PPU: PP_5045(thiI)
PPF: Pput_4919
PPT: PPS_4892
PPB: PPUBIRD1_4834(thiI)
PPI: YSA_04191
PPX: T1E_0177(thiI)
PPUH: B479_24705
PPUT: L483_30380
PPUN: PP4_51110(thiI)
PPUD: DW66_5282
PMON: X969_24150
PMOT: X970_23785
PST: PSPTO_0360(thiI)
PSB: Psyr_4816
PSYR: N018_01395
PSP: PSPPH_4846(thiI)
PFL: PFL_0387(thiI)
PPRC: PFLCHA0_c03940(thiI)
PPRO: PPC_0400
PFS: PFLU_0349(thiI)
PFE: PSF113_0366(thiI)
PFC: PflA506_0333(thiI)
PFW: PF1751_v1c03220(thiI)
PFB: VO64_3426
PMAN: OU5_3118(thiI)
PEN: PSEEN0391(thiI)
PSA: PST_0354(thiI)
PSZ: PSTAB_0385(thiI)
PSR: PSTAA_0407(thiI)
PSTT: CH92_01280
PPUU: PputUW4_00286(thiI)
PKC: PKB_5410(thiI)
PSES: PSCI_2158
PSEM: TO66_01890
PSEC: CCOS191_0440(thiI)
PSOS: POS17_0378
PANR: A7J50_0335
PSET: THL1_5373
PSIL: PMA3_01190
AVN: Avin_45840(thiI)
AVL: AvCA_45840(thiI)
AVD: AvCA6_45840(thiI)
ACX: Achr_6110(thiI)
MCT: MCR_0741(thiI)
MCS: DR90_1195(thiI)
MCAT: MC25239_00718(thiI)
SON: SO_1531(thiI)
SDN: Sden_2566
SFR: Sfri_2785
SAZ: Sama_2431
SBL: Sbal_1362
SLO: Shew_2766
SSE: Ssed_3324
SPL: Spea_2986
SHL: Shal_3075
SWD: Swoo_3473
SWP: swp_3614
SVO: SVI_1125(thiI)
SPSW: Sps_02241
ILO: IL2133(thiI)
CPS: CPS_1094(thiI)
PHA: PSHAa2280(thiI)
PSM: PSM_A0806(thiI)
PSEO: OM33_00895
PTN: PTRA_a2764(thiI)
PEA: PESP_a1002(thiI)
PSPO: PSPO_a2744(thiI)
PART: PARC_a0951(thiI)
PTU: PTUN_a3684(thiI)
PNG: PNIG_a2957(thiI)
PTD: PTET_a0907(thiI)
MAQ: Maqu_3649
MHC: MARHY3554(thiI)
MAD: HP15_3407
PIN: Ping_2227(thiI)
FBL: Fbal_0879
MVS: MVIS_0592(thiI)
CJA: CJA_3531(thiI)
SDE: Sde_0503
TTU: TERTU_4420(thiI)
SAGA: M5M_14385
MICC: AUP74_00727(thiI)
CBU: CBU_1181(thiI)
CBS: COXBURSA331_A1330(thiI)
CBD: CBUD_1272(thiI)
CBG: CbuG_0830(thiI)
CBC: CbuK_1044(thiI)
TCX: Tcr_1493
AEH: Mlg_1035
TKM: TK90_1380
HCH: HCH_00653(thiI)
CSA: Csal_2118
HEL: HELO_2727(thiI)
HCO: LOKO_01964(thiI)
HBE: BEI_1601(thiI)
TOL: TOL_1675
OAI: OLEAN_C19150(thiI)
AHA: AHA_1695(thiI)
ASA: ASA_2665(thiI)
AVR: B565_1449
AMED: B224_1425
ASR: WL1483_3428(thiI)
ACAV: VI35_07390
TAU: Tola_2502
OCE: GU3_05905
PSPI: PS2015_495
BCI: BCI_0273(thiI)
BCIB: IM45_629
SUA: Saut_1196
ABU: Abu_1419(thiI)
ABT: ABED_1323
ABL: A7H1H_1440(thiI)
ARC: ABLL_1832
SUN: SUN_1482(thiI)
HOH: Hoch_2546
BMX: BMS_2409(thiI)
MAGQ: MGMAQ_3164(thiI)
BSU: BSU29580(ytbJ)
BSR: I33_3010(thiI)
BSL: A7A1_0722
BSH: BSU6051_29580(thiI)
BSUT: BSUB_03148(thiI)
BSUL: BSUA_03148(thiI)
BSUS: Q433_16055
BSS: BSUW23_14330(thiI)
BST: GYO_3204(thiI)
BSQ: B657_29580(thiI)
BSX: C663_2804(thiI)
BLI: BL00431(thiI)
BLD: BLi03100(ytbJ)
BLH: BaLi_c31780(thiI)
BAY: RBAM_026510(thiI)
BAQ: BACAU_2669(thiI)
BYA: BANAU_2869(thiI)
BAMP: B938_13720
BAML: BAM5036_2593(thiI)
BAMA: RBAU_2790(thiI)
BAMN: BASU_2598(thiI)
BAMB: BAPNAU_0899(thiI)
BAMT: AJ82_15040
BAMY: V529_29410(thiI)
BMP: NG74_02798(thiI)
BAO: BAMF_2750(thiI)
BAZ: BAMTA208_14490(thiI)
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MGX: CM1_02270
MPN: MPN550(G12_orf387)
MPM: MPNA5500(thiI)
MPJ: MPNE_0648(thiI)
MPB: C985_0560
MPU: MYPU_7180(MYPU_7180)
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MEZ: Mtc_0093(thiI-1) Mtc_1603(thiI-2)
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BARC: AOA65_1062
BARB: AOA66_1311
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Taxonomy
Reference
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  Authors
Abrell JW, Kaufman EE, Lipsett MN.
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  Journal
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Crystal structure of a 4-thiouridine synthetase-RNA complex reveals specificity of tRNA U8 modification.
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  Authors
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  Title
A [3Fe-4S] cluster is required for tRNA thiolation in archaea and eukaryotes.
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DOI:10.1073/pnas.1615732113
  Sequence
[mmp:MMP1354]
Other DBs
ExplorEnz - The Enzyme Database: 2.8.1.4
IUBMB Enzyme Nomenclature: 2.8.1.4
ExPASy - ENZYME nomenclature database: 2.8.1.4
BRENDA, the Enzyme Database: 2.8.1.4
CAS: 9055-57-6

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