KEGG   ENZYME: 3.1.3.104Help
Entry
EC 3.1.3.104                Enzyme                                 

Name
5-amino-6-(5-phospho-D-ribitylamino)uracil phosphatase;
5-amino-6-ribitylamino-2,4(1H,3H)-pyrimidinedione 5'-phosphate phosphatase
Class
Hydrolases;
Acting on ester bonds;
Phosphoric-monoester hydrolases
BRITE hierarchy
Sysname
5-amino-6-(5-phospho-D-ribitylamino)uracil phosphohydrolase
Reaction(IUBMB)
5-amino-6-(5-phospho-D-ribitylamino)uracil + H2O = 5-amino-6-(D-ribitylamino)uracil + phosphate [RN:R07280]
Reaction(KEGG)
Substrate
5-amino-6-(5-phospho-D-ribitylamino)uracil [CPD:C04454];
H2O [CPD:C00001]
Product
5-amino-6-(D-ribitylamino)uracil [CPD:C04732];
phosphate [CPD:C00009]
Comment
Requires Mg2+. The enzyme, which is found in plants and bacteria, is part of a pathway for riboflavin biosynthesis. Most forms of the enzyme has a broad substrate specificity [1,3].
History
EC 3.1.3.104 created 2016
Pathway
ec00740  Riboflavin metabolism
ec01100  Metabolic pathways
ec01110  Biosynthesis of secondary metabolites
Orthology
K20860  FMN hydrolase / 5-amino-6-(5-phospho-D-ribitylamino)uracil phosphatase
K20861  FMN hydrolase / 5-amino-6-(5-phospho-D-ribitylamino)uracil phosphatase
K20862  FMN hydrolase / 5-amino-6-(5-phospho-D-ribitylamino)uracil phosphatase
K21063  5-amino-6-(5-phospho-D-ribitylamino)uracil phosphatase
K21064  5-amino-6-(5-phospho-D-ribitylamino)uracil phosphatase
K22912  5-amino-6-(5-phospho-D-ribitylamino)uracil phosphatase
Genes
ATH: AT1G79790(FHY1) AT4G11570
ALY: ARALYDRAFT_477291 ARALYDRAFT_489979
CRB: 17883392 17894972
CSAT: 104707452 104714407 104718697 104737154 104752557
EUS: EUTSA_v10019052mg EUTSA_v10028735mg
BRP: 103830395 103833856
BNA: 106353342 106383068(BNAC06G18900D) 106422372 106446287
BOE: 106298842 106319085
THJ: 104806390 104813550 104814486
CPAP: 110809412 110812776
LJA: Lj0g3v0126039.1(Lj0g3v0126039.1) Lj1g3v2809360.1(Lj1g3v2809360.1) Lj1g3v2809360.2(Lj1g3v2809360.2) Lj2g3v2017680.1(Lj2g3v2017680.1) Lj2g3v2017680.2(Lj2g3v2017680.2) Lj2g3v2017680.3(Lj2g3v2017680.3)
DOSA: Os04t0557000-01(Os04g0557000) Os09t0569100-01(Os09g0569100)
ZMA: 100283746(IDP274) 100285779(cl39673_1b) 541872(isr1)
OLU: OSTLU_119473(isr)
ECO: b0844(ybjI) b3812(yigB)
ECJ: JW3785(yigB) JW5113(ybjI)
ECD: ECDH10B_0913(ybjI) ECDH10B_4004(yigB)
EBW: BWG_0697(ybjI) BWG_3491(yigB)
ECOK: ECMDS42_0695(ybjI) ECMDS42_3253(yigB)
ECE: Z1071 Z5329(yigB)
ETW: ECSP_0944(ybjI) ECSP_4864(yigB)
EOJ: ECO26_0971(ybjI) ECO26_4774(yigB)
EOI: ECO111_0912(ybjI) ECO111_4638(yigB)
EOH: ECO103_0888(ybjI) ECO103_4352(yigB)
ECOO: ECRM13514_0921(ybjI) ECRM13514_4877(yigB)
ECOH: ECRM13516_0876(ybjI) ECRM13516_4661(yigB)
ECG: E2348C_0795(ybjI) E2348C_4112(yigB)
EOK: G2583_1074(ybjI) G2583_4609(yigB)
ECC: c0929 c4733(yigB)
ECI: UTI89_C0847(ybjI) UTI89_C4375(yigB)
ECV: APECO1_1249(ybjI) APECO1_2664(yigB)
ECR: ECIAI1_0883(ybjI) ECIAI1_4003(yigB)
ECQ: ECED1_0808(ybjI) ECED1_4497(yigB)
ECK: EC55989_0889(ybjI) EC55989_4286(yigB)
ECT: ECIAI39_0823(ybjI) ECIAI39_2975(yigB)
EOC: CE10_0867(ybjI) CE10_4460(yigB)
EUM: ECUMN_1034(ybjI) ECUMN_4337(yigB)
ECZ: ECS88_0861(ybjI) ECS88_4238(yigB)
EBR: ECB_00811(ybjI) ECB_03688(yigB)
EAB: ECABU_c08850(ybjI) ECABU_c42940(yigB)
ELW: ECW_m0902(ybjI) ECW_m4113(yigB)
ELL: WFL_04390 WFL_20060(yigB)
ELC: i14_0893 i14_4326(yigB)
ELD: i02_0893 i02_4326(yigB)
EBL: ECD_00811(ybjI) ECD_03688(yigB)
EBE: B21_00828(ybjI) B21_03637(yigB)
ELF: LF82_2658(ybjI) LF82_3390(yigB)
ECOS: EC958_0956(ybjI) EC958_4274(yigB)
EFE: EFER_0985(ybjI) EFER_3690(yigB)
STY: STY0900 STY3609(yigB)
STT: t2029 t3347(yigB)
STM: STM0867 STM3950(yigB)
SEB: STM474_0893(ybji) STM474_4127(yigB)
SPT: SPA1895 SPA3791(yigB)
SEI: SPC_0866 SPC_4057(yigB)
SEC: SCH_0861(ybjI) SCH_3849(yigB)
SEG: SG0848 SG3499(yigB)
SET: SEN0813 SEN3747(yigB)
SBG: SBG_0745 SBG_3484(yigB)
SFL: SF0797 SF3890(yigB)
SFX: S0840 S3866(yigB)
SFV: SFV_0829 SFV_3687(yigB)
SFE: SFxv_0866 SFxv_4237(yigB)
SFT: NCTC1_04206(yfnB)
SSN: SSON_0829 SSON_3985(yigB)
SBO: SBO_0740 SBO_3823(yigB)
SDY: SDY_3933(yigB)
EEC: EcWSU1_01400(ybjI) EcWSU1_04365(yigB)
CTU: CTU_02440(yigB) CTU_14460(ybjI)
KPN: KPN_00875(ybjI) KPN_04311(yigB)
KPU: KP1_0171(yigB) KP1_1837(ybjI)
KPE: KPK_3689(ybjI) KPK_5367
KPX: PMK1_01798(yigB) PMK1_03211(ybjI)
BFL: Bfl578(yigB)
BPN: BPEN_599(yigB)
BVA: BVAF_580(yigB)
BCHR: BCHRO640_619(yigB)
BED: BTURN675_577(yigB)
SECT: A359_01420
EBT: EBL_c37730(yigB)
CLAP: NCTC11466_03098(ybjI_2) NCTC11466_04413(yfnB)
KOT: EH164_21430(yigB)
SBW: TGUWTKB_1240(yigB)
YPE: YPO3842
YPK: y0388
YPH: YPC_0389(yigB)
YPA: YPA_0180
YPN: YPN_0122
YPM: YP_3205
YPZ: YPZ3_3397
YPD: YPD4_3389
YPX: YPD8_3389
YPW: CH59_1777
YPJ: CH55_3173
YPV: BZ15_3871
YPL: CH46_1224
YPS: YPTB0193
YPO: BZ17_2390
YPY: YPK_4008
YPB: YPTS_0206
YPQ: DJ40_2227
YPU: BZ21_3550
YPR: BZ20_1929
YPC: BZ23_3820
YPF: BZ19_3654
YEW: CH47_1860(ybjI) CH47_3288
YET: CH48_1891 CH48_4011(ybjI)
YFR: AW19_3009
YIN: CH53_1999 CH53_3678(ybjI)
YKR: CH54_2779
YRU: BD65_1750
SPE: Spro_0185
SRL: SOD_c01440(yigB)
SPLY: Q5A_000815(yigB)
SSZ: SCc_685(yigB)
SMAF: D781_0159
SMW: SMWW4_v1c01940(yigB)
SMAR: SM39_4316
SERF: L085_05345
ECA: ECA4180
PATR: EV46_20825
PATO: GZ59_42370
PCT: PC1_3972
PEC: W5S_4320
SGL: SG2343
SOD: Sant_0333(yigB)
PES: SOPEG_0327(yigB)
SENY: HBA_0200(yigB)
DDD: Dda3937_00300(yigB)
DDQ: DDI_3972
ETA: ETA_02180
EPY: EpC_02060
EPR: EPYR_00216(yigB)
EAM: EAMY_0193(yigB)
EAY: EAM_0186
EBI: EbC_02150
EGE: EM595_1046(ybjI) EM595_3315(yigB)
WBR: yigB
WGL: WIGMOR_0507(yigB)
PAM: PANA_0168(yigB) PANA_1108(ybjI)
PLF: PANA5342_3180(ybjI) PANA5342_4259(yigB)
PAJ: PAJ_0430(ybjI) PAJ_3328(yigB)
PVA: Pvag_0472(ybjI) Pvag_3407(yigB)
HHS: HHS_00100(yigB)
PSTW: DSJ_22070
TPTY: NCTC11468_03508(yfnB)
PLU: plu4637
PAY: PAU_04118(yigB)
PMR: PMI3339
PHAU: PH4a_08165
XBO: XBJ1_4152(yigB)
XBV: XBW1_4505
XNE: XNC1_0412(yigB)
XNM: XNC2_0405(yigB)
XDO: XDD1_0371
XPO: XPG1_3459
PSI: S70_11765
PSX: DR96_824
PRG: RB151_041910(yigB)
MMK: MU9_233
AEN: ARADI_0500(yigB)
ETR: ETAE_0125
ETD: ETAF_0097
ETE: ETEE_1885
LRI: NCTC12151_03561(yfnB)
PSHI: SAMEA2665130_2964(yfnB)
PMU: PM1700
PMV: PMCN06_2158(yigB)
PMP: Pmu_20780(yigB)
PMUL: DR93_661
PDAG: 4362423_02055(yigB)
MSU: MS0522
ASU: Asuc_1975
AAT: D11S_0544
AAN: D7S_01356
AACN: AANUM_0276
RPNE: NCTC8284_00754(yigB)
XCC: XCC3903
XCB: XC_3991
XCP: XCR_0373
XCV: XCV4079
XAX: XACM_3855
XAC: XAC3986
XOO: XOO0451
XOM: XOO0414(XOO0414)
XOP: PXO_02868
XOR: XOC_4286
XAL: XALC_0429
XPH: XppCFBP6546_14600(XppCFBP6546P_14600)
SML: Smlt0374
SMT: Smal_0262
SMZ: SMD_0298
PSUW: WQ53_10210
PSD: DSC_14005
LEZ: GLE_4457
LEM: LEN_0765
DKO: I596_2901
VCH: VC0129
VCS: MS6_2494
VCI: O3Y_00580
VVU: VV1_1130
VVY: VV0090
VPA: VP2980
VPB: VPBB_2817
VAG: N646_2076
VSP: VS_3044
VAN: VAA_01959
VTA: A3382(yigB)
VAF: D1115_00465(yigB)
PPR: PBPRA3519(STM3950)
PAE: PA5281
PAEV: N297_5461
PAEI: N296_5461
PAEP: PA1S_28560
PAEM: U769_29065
PAEL: T223_29020
PAEG: AI22_05430
PAEC: M802_5459
PAEO: M801_5326
PMY: Pmen_0263
PMK: MDS_0320
PPSE: BN5_0184
PCQ: PcP3B5_60170(yigB)
PPU: PP_5231(had)
PPF: Pput_5140
PPT: PPS_5085
PPI: YSA_04592
PPX: T1E_4396(yigB)
PPUH: B479_25700
PPUT: L483_31335
PPUN: PP4_53060
PMON: X969_25125
PMOT: X970_24760
PSB: Psyr_0186
PSYR: N018_00730
PFL: PFL_6016
PPRO: PPC_5969
PFS: PFLU_5949
PFB: VO64_2834
PMAN: OU5_3664
PEN: PSEEN5369
PSA: PST_0507
PSTT: CH92_02245
PKC: PKB_5622
PSES: PSCI_1503
PSEM: TO66_30365
PSOS: POS17_5973
PANR: A7J50_5679
PSET: THL1_5549
PSIL: PMA3_29280
SON: SO_4305
SDN: Sden_0394
SFR: Sfri_0448
SAZ: Sama_3246
SBL: Sbal_3992
SLO: Shew_0326
SSE: Ssed_4126
SPL: Spea_0381
SHL: Shal_3909
SWD: Swoo_0490
SWP: swp_0411
SVO: SVI_3834
SPSW: Sps_03081
ILO: IL2552
CPS: CPS_0079
PHA: PSHAa0089
PAT: Patl_4077
PSM: PSM_A0094
PSEO: OM33_03440
PPHE: PP2015_49
PSPO: PSPO_a0045
PART: PARC_a3839
PSEN: PNC201_00390(yigB)
AMAL: I607_00930
AMAE: I876_00875
AMAO: I634_01025
AMAD: I636_00955
AMAI: I635_00980
AMAG: I533_00910
AMAC: MASE_00740
AAUS: EP12_00985
GNI: GNIT_0304
GPS: C427_5256
PIN: Ping_0009
FBL: Fbal_3713
MVS: MVIS_0058
SAGA: M5M_11850
TIG: THII_1513
NOC: Noc_2075
NHL: Nhal_1876
NWA: Nwat_1022
NTT: TAO_1133
AEH: Mlg_1990
HHA: Hhal_0261
TGR: Tgr7_1991
TKM: TK90_1771
TNI: TVNIR_0842(yigB_[H])
TVR: TVD_04405
GAI: IMCC3135_11355(yigB)
CSA: Csal_3116
HAM: HALO0148
HCO: LOKO_03500(yigB)
HBE: BEI_0140(yigB)
ABO: ABO_2335
ADI: B5T_04034
APAC: S7S_01170
AXE: P40_19580
KKO: Kkor_0178
KGE: TQ33_0083
TOL: TOL_0258
AHA: AHA_0477
ASA: ASA_3683
AVR: B565_0286
AMED: B224_5949
TAU: Tola_0235
OCE: GU3_02450
TBN: TBH_C2646
BCI: BCI_0126
BCIB: IM45_297
BCIG: AB162_104
ENM: EBS_0363
RME: Rmet_5775
BCJ: BCAM0591
BCEW: DM40_3653
BCEO: I35_4487
BAM: Bamb_5301
BCT: GEM_5167
BCED: DM42_4499
BCON: NL30_22830
BUB: BW23_3753
BLAT: WK25_20855
BTEI: WS51_01545
BSEM: WJ12_22965
BMEC: WJ16_21990
PLG: NCTC10937_00133(ppaX_1)
LMIR: NCTC12852_00068(yjjG)
POL: Bpro_2014
PNA: Pnap_2972
AAV: Aave_2999
AJS: Ajs_1653
AAA: Acav_2298
ACRA: BSY15_77
VEI: Veis_1575
DAC: Daci_2563
CTES: O987_06840
RTA: Rta_15710
LIM: L103DPR2_02185(yigB)
LIH: L63ED372_01024(yigB)
HYB: Q5W_07500
MPT: Mpe_A2493
HAR: HEAR2653
MMS: mma_2888
JAG: GJA_393
CFU: CFU_3851
CARE: LT85_4400
LCH: Lcho_2564
EBA: ebA861
PSF: PSE_4414
BSU: BSU04040(ycsE) BSU11140(yitU) BSU35850(ywtE)
BSH: BSU6051_04040(ycsE) BSU6051_11140(yitU) BSU6051_35850(ywtE)
BSUT: BSUB_00457(ycsE) BSUB_01212(yitU) BSUB_03818(ywtE)
BSUL: BSUA_00457(ycsE) BSUA_01212(yitU) BSUA_03818(ywtE)
BSS: BSUW23_02095(ycsE) BSUW23_05625(yitU) BSUW23_17620(ywtE)
BSO: BSNT_06749(ycsE) BSNT_07547(yitU) BSNT_10229(ywtE)
BSQ: B657_04040(ycsE) B657_11140(yitU) B657_35850(ywtE)
BSX: C663_0399(ycsE) C663_1140(yitU) C663_3479(ywtE)
BLI: BL02437(ywtE) BL03254(yitU) BL05029(ycsE)
BLD: BLi00497(ycsE) BLi01203(yitU) BLi03834(ywtE)
BAY: RBAM_004270(ycsE) RBAM_011130(yitU) RBAM_032980(ywtE)
BAQ: BACAU_0363(ycsE) BACAU_1074(yitU) BACAU_3328(ywtE3)
BYA: BANAU_0364(ycsE) BANAU_1019(yitU) BANAU_3487(ywtE)
BAML: BAM5036_0387(ycsE) BAM5036_1013(yitU) BAM5036_2356(supH) BAM5036_3222(ywtE)
BAMA: RBAU_0401(ycsE) RBAU_1073(yitU) RBAU_3438(ywtE)
BAMN: BASU_0386(ycsE) BASU_1052(yitU) BASU_3216(ywtE)
BMP: NG74_00405 NG74_01124(yidA_1) NG74_03474(ywpJ_1)
BAO: BAMF_0371(ycsE) BAMF_1186(yitU) BAMF_3424(ywtE)
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Taxonomy
Reference
1  [PMID:24123841]
  Authors
Haase I, Sarge S, Illarionov B, Laudert D, Hohmann HP, Bacher A, Fischer M
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  Authors
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3  [PMID:26316208]
  Authors
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  Title
Catalysis of an Essential Step in Vitamin B2 Biosynthesis by a Consortium of Broad Spectrum Hydrolases.
  Journal
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Other DBs
ExplorEnz - The Enzyme Database: 3.1.3.104
IUBMB Enzyme Nomenclature: 3.1.3.104
ExPASy - ENZYME nomenclature database: 3.1.3.104
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