KEGG   ENZYME: 3.4.21.107
Entry
EC 3.4.21.107               Enzyme                                 

Name
peptidase Do;
DegP;
DegP protease;
HtrA;
high temperature requirement protease A;
HrtA heat shock protein;
protease Do;
Do protease
Class
Hydrolases;
Acting on peptide bonds (peptidases);
Serine endopeptidases
Reaction(IUBMB)
Acts on substrates that are at least partially unfolded. The cleavage site P1 residue is normally between a pair of hydrophobic residues, such as Val!Val
Comment
This serine endopeptidase is essential for the clearance of denatured or aggregated proteins from the inner-membrane and periplasmic space in Escherichia coli. Natural substrates of the enzyme include colicin A lysis protein, pilin subunits and MalS from E. coli [3]. The enzyme has weak peptidase activity with casein and other non-native substrates [3]. The peptidase acts as a chaperone at low temperatures but switches to a peptidase (heat shock protein) at higher temperatures [1,6]. Molecular chaperones and peptidases control the folded state of proteins by recognizing hydrophobic stretches of polypeptide that become exposed by misfolding or unfolding. They then bind these hydrophobic substrates to prevent aggregation or assist in protein refolding. If attempts at refolding fail, then irreversibly damaged proteins are degraded by peptidases such as this enzyme [6]. Belongs in peptidase family S1C.
History
EC 3.4.21.107 created 2006
Orthology
K04771  serine protease Do
Genes
LVE: 103072277 103075408
AQU: 100642159
ECO: b0161(degP)
ECJ: JW0157(degP)
ECD: ECDH10B_0141(degP)
EBW: BWG_0154(degP)
ECOK: ECMDS42_0148(degP)
ECE: Z0173(htrA)
ECS: ECs0165
ECF: ECH74115_0171(degP)
ETW: ECSP_0162(degP)
EOI: ECO111_0163(degP)
EOJ: ECO26_0164(degP)
EOH: ECO103_0161(degP)
ECOO: ECRM13514_0168(htrA)
ECOH: ECRM13516_0171(htrA)
ESL: O3K_20755
ESO: O3O_04625
ESM: O3M_20655
ECK: EC55989_0156(degP)
ECG: E2348C_0168(degP)
EOK: G2583_0165(degP)
ELH: ETEC_0157
ECW: EcE24377A_0166(degP)
ECP: ECP_0171
ENA: ECNA114_0152(htrA)
ECOS: EC958_0309(degP)
ECV: APECO1_1824(htrA)
ECX: EcHS_A0165(degP)
ECM: EcSMS35_0173(degP)
ECY: ECSE_0162
ECR: ECIAI1_0160(degP)
ECQ: ECED1_0168(degP)
EUM: ECUMN_0159(degP)
ECT: ECIAI39_0165(degP)
EOC: CE10_0165(degP)
EBR: ECB_00160(degP)
EBL: ECD_00160(degP)
EBE: B21_00159(degP)
EBD: ECBD_3457
ECI: UTI89_C0177(degP)
EIH: ECOK1_0164(degP)
ECZ: ECS88_0172(degP)
ECC: c0197(htrA)
ELO: EC042_0161(htrA)
ESE: ECSF_0178
EKF: KO11_00785(degP)
EAB: ECABU_c01750(degP)
EDJ: ECDH1ME8569_0155(degP)
ELW: ECW_m0158(degP)
ELL: WFL_00785(degP)
ELC: i14_0182(htrA)
ELD: i02_0182(htrA)
ELP: P12B_c0150(htrA)
ELF: LF82_0461(degP)
ECOI: ECOPMV1_00167(degP)
ECOJ: P423_00875
EFE: EFER_0184(degP)
EAL: EAKF1_ch1252c(degP)
ESZ: FEM44_15290(degP)
STY: STY0231(htrA)
STT: t0210(htrA)
STM: STM0209(htrA)
SEO: STM14_0249(htrA)
SEY: SL1344_0210(htrA)
SEJ: STMUK_0211(htrA)
SEB: STM474_0218(htrA)
SEF: UMN798_0230(htrA)
SENR: STMDT2_02111(htrA)
SEND: DT104_02141(htrA)
SENI: CY43_01050
SPT: SPA0215(htrA)
SEK: SSPA0208
SEI: SPC_0225(htrA)
SEC: SCH_0209(htrA)
SEH: SeHA_C0246(degP)
SHB: SU5_0858
SEE: SNSL254_A0230(degP)
SEW: SeSA_A0232(degP)
SEA: SeAg_B0248(degP)
SENS: Q786_01105
SED: SeD_A0229(degP)
SEG: SG0213(htrA)
SEL: SPUL_0228(htrA)
SEGA: SPUCDC_0228(htrA)
SET: SEN0214(htrA)
SENA: AU38_01065
SENO: AU37_01065
SENV: AU39_01065
SENQ: AU40_01225
SENL: IY59_01090
SEEP: I137_01015
SENB: BN855_2250(degP)
SENE: IA1_01135
SBG: SBG_0199(htrA)
SBZ: A464_210
SALZ: EOS98_18160(degP)
SFL: SF0153(htrA)
SFX: S0156(htrA)
SFV: SFV_0146(htrA)
SFE: SFxv_0161(degP)
SFN: SFy_0203
SFS: SFyv_0207
SFT: NCTC1_00156(degP)
SSN: SSON_0174(htrA)
SBO: SBO_0150(htrA)
SBC: SbBS512_E0154(degP)
SDY: SDY_0178(htrA)
ENC: ECL_00965
ECLX: LI66_04040
ECLY: LI62_04555
ECLZ: LI64_04215
ECLO: ENC_46830
EEC: EcWSU1_00772(degP)
ECHG: FY206_04705(degP)
EBG: FAI37_02595(degP)
ESA: ESA_03179
CSK: ES15_3167(degP)
CTU: CTU_07920(degP)
KPN: KPN_00176(degP)
KPU: KP1_1014(degP)
KPP: A79E_4114
KPT: VK055_2389(htrA)
KPR: KPR_1107(degP)
KPJ: N559_4238
KPX: PMK1_02484(degP)
KPNU: LI86_21805
KPNK: BN49_4161(degP)
KVA: Kvar_4205
KPE: KPK_4557(degP)
KOX: KOX_11405
KOE: A225_0990
EAE: EAE_11605
EAR: CCG31661
KLW: DA718_23325(degP)
CRO: ROD_01651(htrA)
CKO: CKO_03206
CPOT: FOB25_06775(degP)
CAMA: F384_00850
CTEL: GBC03_25010(degP)
HDE: HDEF_1479(degP_1) HDEF_1488(degP_2)
EBT: EBL_c32020(degP)
RTG: NCTC13098_06092(degP)
REE: electrica_04171(degP)
CLAP: NCTC11466_03765(degP_1) NCTC11466_03766(degP_2)
KOR: AWR26_20705(degP)
KOT: EH164_18245(degP)
KPSE: IP581_04055(degP)
KIE: NCTC12125_02863(degP)
LER: GNG29_04275(degP)
LEA: GNG26_03765(degP)
LNI: CWR52_08155(degP)
BUF: D8682_11155(degP)
BAGE: BADSM9389_33920(degP)
PPET: C9I82_125
AHN: NCTC12129_00957(htrA)
YRE: HEC60_21960(degP)
SGOE: A8O29_018785(degP)
PDZ: HHA33_23500(degP)
EBF: D782_3709
PSTS: E05_02920
IZH: FEM41_09965(degP)
YPE: YPO3382(degP)
YPK: y0807(htrA)
YPH: YPC_3708(htrA)
YPA: YPA_2881
YPN: YPN_0709
YPM: YP_0303(gsrA)
YPG: YpAngola_A0987(degP)
YPZ: YPZ3_2979(gsrA)
YPD: YPD4_2965
YPX: YPD8_2963(gsrA)
YPW: CH59_2666
YPJ: CH55_1962
YPV: BZ15_140
YPL: CH46_1708
YPS: YPTB0749(htrA)
YPO: BZ17_1806
YPI: YpsIP31758_3323(degP)
YPY: YPK_3452
YPB: YPTS_0782
YPQ: DJ40_1623(degP)
YPU: BZ21_4133
YPR: BZ20_1336
YPC: BZ23_226
YPF: BZ19_99
YEN: YE0741(gsrA)
YEY: Y11_39751
YEW: CH47_2744(degP)
YET: CH48_865
YEE: YE5303_25991(degP)
YAL: AT01_3267
YFR: AW19_4078(degP)
YIN: CH53_955
YKR: CH54_1712
YRO: CH64_3358
YRU: BD65_2614
YHI: D5F51_04565(degP)
YCA: F0T03_04285(degP)
YMO: HRD69_09475(degP)
SMAR: SM39_0104(degP)
SMAC: SMDB11_0106(degP)
SMW: SMWW4_v1c07750(degP)
SPE: Spro_0789
SRL: SOD_c06550(degP)
SPLY: Q5A_003435(degP)
SSZ: SCc_148(htrA)
SMAF: D781_0742
SERF: L085_00380
SQU: E4343_12650(degP)
SFJ: SAMEA4384070_0813(degP)
SOF: NCTC11214_00736(degP)
RAA: Q7S_18355
EAME: GXP68_17115(degP)
RBAD: H2866_11500(degP)
ECA: ECA3301(degP)
PATR: EV46_16395
PATO: GZ59_33250(degP)
PCT: PC1_3096
PEC: W5S_1085
PPUJ: E2566_15985(degP)
DDD: Dda3937_00496(degP)
DDQ: DDI_3079
DAQ: DAQ1742_01023(degP)
DIC: Dpoa569_000854(degP)
BRB: EH207_13210(degP)
BNG: EH206_05575(degP)
LPOP: I6N93_12200(degP)
SGL: SG0505
SOD: Sant_3278(degP)
PES: SOPEG_0995(degP)
EAM: EAMY_2765(htrA)
EAY: EAM_0814(degP)
ETA: ETA_08840
EPY: EpC_08640
EPR: EPYR_00913(htrA)
EBI: EbC_08040(gsrA)
EGE: EM595_0797(degP)
EHD: ERCIPSTX3056_557(degP)
ERWI: GN242_17150(degP)
BUC: BU228(htrA)
BAP: BUAP5A_223(htrA)
BAU: BUAPTUC7_225(htrA)
BAW: CWU_01495
BAJC: CWS_01205
BUA: CWO_01190
BUP: CWQ_01235
BAK: BAKON_229(degP)
BUH: BUAMB_210(degP)
BAPF: BUMPF009_CDS00366(htra)
BAPG: BUMPG002_CDS00367(htra)
BAPU: BUMPUSDA_CDS00366(htra)
BAPW: BUMPW106_CDS00366(htra)
BAS: BUsg_222(htrA)
BAB: bbp_210(htrA)
BAPH: IX46_01190
PAM: PANA_0785(degP)
PLF: PANA5342_3522(htrA)
PAJ: PAJ_0131(degP)
PVA: Pvag_0196(htrA)
PSTW: DSJ_06605
PANS: FCN45_03770(degP)
PEY: EE896_15610(degP)
PDIS: D8B20_03610(degP)
MINT: C7M51_00123(degP)
MTHI: C7M52_02595(degP)
TPTY: NCTC11468_03034(degP)
ETR: ETAE_2771
ETD: ETAF_2511
ETE: ETEE_0948(htrA)
HDU: HD_0260(degP)
HSO: HS_0816(htrA)
APL: APL_1293(htrA)
APJ: APJL_1306(degP)
XFT: PD_0231(htrA) PD_1286(mucD)
XCC: XCC1269(mucD)
XCB: XC_2972
XCP: XCR_1523
XCV: XCV1372(mucD)
XAX: XACM_1304(mucD)
XAC: XAC1321(mucD)
XFU: XFF4834R_chr31800(mucD)
XOM: XOO0115(XOO0115) XOO1747(XOO1747)
XOO: XOO0059(htrA) XOO1851(mucD)
XOP: PXO_01713
XOR: XOC_3186
XAL: XALC_2545
XPH: XppCFBP6546_04830(XppCFBP6546P_04830)
SML: Smlt3553
SMT: Smal_2979
SMZ: SMD_3130
PSUW: WQ53_01925
PSD: DSC_11580
LEZ: GLE_1705(degQ)
LEM: LEN_3262
DKO: I596_492
RBD: ALSL_1287
VCH: VC0566
VCS: MS6_0390
VCE: Vch1786_I2879(htrA)
VCI: O3Y_02670
VCO: VC0395_A0100(htrA)
VCR: VC395_0583(htrA)
VCM: VCM66_0524(htrA)
VVU: VV1_0603
VVY: VV0591
VPA: VP0433
VPB: VPBB_0416
VAG: N646_2592
VSP: VS_0426
VNI: VIBNI_A0204(degP)
VAN: VAA_03741
VAU: VANGNB10_cI2192(degQ?)
VSC: VSVS12_02586(degP)
VTA: A0214(degP)
VAQ: FIV01_11900(degP)
VSR: Vspart_02667(degP)
VFI: VF_2225(degP)
PAE: PA0766(mucD)
PAEV: N297_792
PAEI: N296_792
PAU: PA14_54390(mucD)
PAP: PSPA7_4753(mucD)
PAG: PLES_45771(mucD)
PAF: PAM18_4272(mucD)
PNC: NCGM2_1493(mucD)
PAEB: NCGM1900_2012(mucD)
PAEP: PA1S_22825
PAEM: U769_22335
PAEL: T223_23350
PAEU: BN889_00790(mucD_1)
PAEG: AI22_11330
PAEC: M802_789
PAEO: M801_792
PMY: Pmen_1471
PMK: MDS_1527
PRE: PCA10_42670(mucD)
PPSE: BN5_2903
PCQ: PcP3B5_49050(mucD_2)
PPU: PP_1430
PPF: Pput_4291
PPT: PPS_4219
PPB: PPUBIRD1_4126(algY)
PPI: YSA_02789
PPX: T1E_0289(htrA1)
PPUH: B479_21150
PPUT: L483_26290
PPUN: PP4_09800(mucD)
PPUD: DW66_4610
PMON: X969_20775
PMOT: X970_20410
PSB: Psyr_3955
PSYR: N018_05720
PSP: PSPPH_3952(mucD)
PVD: CFBP1590__1335(mucD)
PFL: PFL_1451(mucD)
PPRC: PFLCHA0_c14870(degP2)
PPRO: PPC_1504
PFS: PFLU_1471
PFE: PSF113_1416(mucD)
PFC: PflA506_1403(mucD)
PFB: VO64_4603
PMAN: OU5_2011(mucD)
PFW: PF1751_v1c13990(mucD)
PEN: PSEEN4293(mucD)
PSA: PST_1227(mucD)
PSZ: PSTAB_1135(mucD)
PSR: PSTAA_1190(mucD)
PKC: PKB_1415
PSES: PSCI_3036
PSEM: TO66_07200
PSOS: POS17_1470 POS17_3725(MED92_00864)
PANR: A7J50_1595
PSET: THL1_4312
PSIL: PMA3_22510
PADE: C3B55_00727(mucD)
PALL: UYA_07700
POJ: PtoMrB4_16010(mucD)
AVN: Avin_13730(mucD)
AVL: AvCA_13730(mucD)
AVD: AvCA6_13730(mucD)
PAR: Psyc_0147(mucD)
PALI: A3K91_0188
PSYC: DABAL43B_0179(mucD)
PSYA: AOT82_1630
ACB: A1S_2525
ABM: ABSDF0946
ABY: ABAYE0936
ABN: AB57_2966
ABB: ABBFA_00912(mucD_1)
ABX: ABK1_2855
ABH: M3Q_3035
ABAD: ABD1_25120
ABAZ: P795_4335
ABAU: IX87_09295
ABAA: IX88_15825
ACC: BDGL_001994(degP)
ACI: ACIAD2586
ASJ: AsACE_CH01904(degP)
AGU: AS4_31420(mucD)
AUG: URS_2282
SDN: Sden_0504
CPS: CPS_4143 CPS_4346(degP)
PSEO: OM33_18505
PSPO: PSPO_b0901
MAQ: Maqu_2259
MHC: MARHY0958(mucD)
MAD: HP15_779
MBS: MRBBS_2655(degP)
MARJ: MARI_19830(degP)
AMAG: I533_03805
AAUS: EP12_04005
MICC: AUP74_00290(hhoB) AUP74_03100(mucD_2)
MICT: FIU95_06690(mucD) FIU95_17665(degP1)
CBU: CBU_0176(degP.1) CBU_0755(degP.2)
CBD: CBUD_0769(degP.1) CBUD_1924(degP.2)
CBG: CbuG_1247(htrA) CbuG_1836
CBC: CbuK_0363 CbuK_0614(htrA)
RVI: RVIR1_13940(htrA)
ALG: AQULUS_09530(degQ)
ASIP: AQUSIP_14130(degP)
LPN: lpg1331(htrA)
LPH: LPV_1440(htrA)
LPO: LPO_1314(htrA)
LPM: LP6_1312(htrA)
LPF: lpl1284(htrA)
LPP: lpp1285(htrA)
LPC: LPC_0747(htrA)
LPA: lpa_01964
LPE: lp12_1269
LLO: LLO_2348(htrA)
LFA: LFA_1256(degQ)
LHA: LHA_1906(htrA)
LOK: Loa_01944
LCD: clem_05640(degQ)
LLG: 44548918_01022(htrA_2)
LJR: NCTC11533_01208(htrA)
LCJ: NCTC11976_01992(htrA)
LWA: SAMEA4504053_1508(degP)
LSS: NCTC12082_00744(htrA)
LADL: NCTC12735_01194(htrA)
TMC: LMI_1837(degP)
MCA: MCA1467 MCA1599 MCA2343(htrA)
MAH: MEALZ_0576(mucD) MEALZ_1450(degP)
TCX: Tcr_0731
HMAR: HVMH_0833
MEJ: Q7A_1370
MEC: Q7C_425
TIG: THII_2491
TEE: Tel_07580
TKM: TK90_1952
TNI: TVNIR_0823(mucD_[H])
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CSA: Csal_1628
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HSR: HSBAA_25970(mucD)
HAXI: HAALTHF_33590n(mucD)
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PLI: PLF_041(mucD)
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CJY: QZ67_01304(degP)
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CJR: CJE1363(htrA)
CJD: JJD26997_0497(htrA)
CLA: CLA_0779(htrA)
CLR: UPTC16701_0793(htrA)
CLM: UPTC16712_0797(htrA)
CLQ: UPTC4110_0799(htrA)
CLN: UPTC3659_0896(htrA)
CLL: CONCH_0793(htrA)
CCQ: N149_1180
CCF: YSQ_02780
CCY: YSS_06630
CCOI: YSU_02805
CCOF: VC76_06105(degP)
CCOO: ATE51_01130(degP)
CIS: CINS_0754(htrA)
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CUX: CUP3940_0744(htrA)
CGEO: CGEO_1161(htrA)
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CCOR: CCORG_0594(htrA)
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CMUC: CMCT_0647(htrA) CMCT_1775
CSHO: CSHOW_1147(htrA) CSHOW_1952
ABU: Abu_2099(htrA)
ABT: ABED_1905
ABL: A7H1H_2038(htrA)
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ACIB: ACBT_0151 ACBT_0414(htrA)
ACRE: ACRYA_1712(htrA)
ALAN: ALANTH_2042(htrA)
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ACAA: ACAN_2596(htrA)
AMOL: AMOL_2555(htrA)
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HEBR: AEBR_2812(htrA)
PACO: AACT_2781(htrA)
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GME: Gmet_1014(degP-2) Gmet_3052 Gmet_3362(degP-1)
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DDE: Dde_2013
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SME: SMc01438(degP2) SMc02365(degP1)
SMX: SM11_chr0684(degP1) SM11_chr1198(degP2)
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SMEL: SM2011_a1128(degP4) SM2011_c01438(degP2) SM2011_c02365(degP1)
EAD: OV14_2044 OV14_3519(degP)
ATU: Atu0977(dop) Atu2043
ARA: Arad_1497(degPch2) Arad_2906(degPch4) Arad_8476(degPch1)
AVI: Avi_1368(dop) Avi_2812(htrA)
RET: RHE_CH01120(degPch1) RHE_CH01293(degPch2) RHE_CH02795(degPch4) RHE_PD00021
REL: REMIM1_CH01120(degP-1) REMIM1_CH01297(degP-2) REMIM1_CH02838(degP-4)
REP: IE4803_CH01144(degP-1) IE4803_CH01335(degP-3) IE4803_CH02932(degP-5)
REI: IE4771_CH01180(degP-1) IE4771_CH01380(degP-3) IE4771_CH02963(degP-5)
RLE: RL1251(degP2) RL1440(degP1) RL1877 RL3252
RHL: LPU83_1265(dop) LPU83_2678(htrA)
RGA: RGR602_CH01213(degP-1) RGR602_CH02444(degP-3) RGR602_PC01349(degP-4)
RPHA: AMC79_CH01162(degP-1) AMC79_CH01343(degP-2) AMC79_CH02953(degP-4)
RHX: AMK02_CH01159(degP-1) AMK02_CH01335(degP-2) AMK02_CH02889(degP-4)
RHK: Kim5_CH01250(degP-1) Kim5_CH01458(degP-3) Kim5_CH03002(degP-5)
NEN: NCHU2750_08570(degP) NCHU2750_20570(degP)
LAA: WSI_02470
LSO: CKC_00575
LAR: lam_253(degQ)
BMI: BMEA_A0649(degP) BMEA_A1441(degP)
BMT: BSUIS_A0641(degP) BSUIS_A1445(degP)
BCS: BCAN_A0627(degP) BCAN_A1426(degP)
BJA: bll6506(bll6506) blr2591(dop) blr3130(blr3130) blr5235(degP)
RPA: RPA1929 RPA3488 RPA4572(htrA_degQ_degS)
VGO: GJW-30_1_01887(degP1_1) GJW-30_1_03763(degP1_2)
BHE: BH04770(htrA1) BH10940(htrA3)
BHN: PRJBM_00482(htrA1) PRJBM_01057(htrA3)
BHS: BM1374165_00455(htrA1) BM1374165_01135(htrA3)
BQU: BQ03970(htrA1) BQ08590(htrA3)
BTR: BT_0704(htrA1) BT_1564(htrA3)
BTX: BM1374166_00659(htrA1) BM1374166_01488(htrA3)
BGR: Bgr_05170(htrA1) Bgr_13690(htrA3)
BCD: BARCL_0392(htrA) BARCL_0970(htrA)
BAUS: BAnh1_03940(htrA1) BAnh1_08140(htrA3)
BVN: BVwin_04150(htrA1) BVwin_06250(htrA3)
BEZ: NCTC12898_00377(mucD_1) NCTC12898_01002(mucD_2)
MAQU: Maq22A_1p37345(degQ) Maq22A_c05760(degQ)
MTUN: MTUNDRAET4_0246(htrA) MTUNDRAET4_1198(htrA)
HMC: HYPMC_1274(depP) HYPMC_2364(degP) HYPMC_3885
FIL: BN1229_v1_2477(degP) BN1229_v1_4026(htrA)
FIY: BN1229_v1_3438(degP) BN1229_v1_4013(htrA)
PLEO: OHA_1_01617(degP1_1) OHA_1_02582(htrA) OHA_1_04172(degP1_2)
MMED: Mame_02722(degP1_1) Mame_03542(degP1_2)
HDI: HDIA_0023(degP1_1) HDIA_2871(degP1_2) HDIA_3349
PSF: PSE_2484(degP) PSE_4228
LABT: FIU93_11300(htrA) FIU93_15030(degP1) FIU93_25915(degP2)
CCR: CC_2758
TSV: DSM104635_02426(degP1_2) DSM104635_02750(mucD_4) DSM104635_03712(htrA)
RUT: FIU92_05500(degP1) FIU92_06370(mucD) FIU92_17935(degP2)
RCP: RCAP_rcc02402(degP)
JAN: Jann_3170
RDE: RD1_1923(degP)
RLI: RLO149_c010200(degP)
PDE: Pden_1382
PAMN: JCM7685_1304(htrA)
DSH: Dshi_2733(degP) Dshi_3911
KVL: KVU_0360
KVU: EIO_0827
PGA: PGA1_c23690(degP)
PGL: PGA2_c21650(degP)
PGD: Gal_01021
PHP: PhaeoP97_02240(degP)
PPIC: PhaeoP14_02155(degP)
OAT: OAN307_c16310(degP)
OTM: OSB_10440(degP1)
CID: P73_3501
MALG: MALG_02191
RSU: NHU_01034 NHU_03156(degQ)
RHC: RGUI_1205
RID: RIdsm_00314(degP1)
ROH: FIU89_00205(degP1)
LVS: LOKVESSMR4R_00926(degP)
MARU: FIU81_02090(degP1) FIU81_09435(degP2)
ROT: FIV09_04360(degP1) FIV09_14540(degP2)
PALW: PSAL_002360(degP)
ZMO: ZMO0234
ZMN: Za10_0980
ZMM: Zmob_0796
ZMB: ZZ6_0980
ZMI: ZCP4_1013
ZMC: A265_01006(mucD)
ZMR: A254_01005(mucD)
SAL: Sala_2247
SPHP: LH20_00535
SGI: SGRAN_3746(degP)
SPHU: SPPYR_3304
SPHD: HY78_13745
SPHM: G432_09735
STAX: MC45_08355
SPHI: TS85_21275
SPKC: KC8_12045
SECH: B18_15430
SSY: SLG_38790
SPHR: BSY17_650
SFLA: SPHFLASMR4Y_01833(degP)
SMIC: SmB9_05900
AAY: WYH_00949 WYH_02800(degP1)
ALB: AEB_P1056
ANH: A6F65_00814(degP1)
ADO: A6F68_00157(degP1) A6F68_01793(htrB)
GDI: GDI0884(degP) GDI1303 GDI1457
KSC: CD178_00848(degP1_1) CD178_01057(degP1_2) CD178_01583(degP1_3)
APT: APA01_07240(degP) APA01_24860(degP) APA01_25660(htrA)
APW: APA42C_07240(degP) APA42C_24860(degP) APA42C_25660(htrA)
APF: APA03_07240(degP) APA03_24860(degP) APA03_25660(htrA)
APU: APA07_07240(degP) APA07_24860(degP) APA07_25660(htrA)
APG: APA12_07240(degP) APA12_24860(degP) APA12_25660(htrA)
APQ: APA22_07240(degP) APA22_24860(degP) APA22_25660(htrA)
APX: APA26_07240(degP) APA26_24860(degP) APA26_25660(htrA)
APZ: APA32_07240(degP) APA32_24860(degP) APA32_25660(htrA)
ASZ: ASN_1195(degP) ASN_1831(htrA) ASN_431(htrA)
RRU: Rru_A2201
RRF: F11_11330
RCE: RC1_1980(degP) RC1_2156(degP)
MGRY: MSR1_03360(mamE) MSR1_03420(mamO) MSR1_07320(hhoB) MSR1_07790(degP1)
MAGX: XM1_2081 XM1_2342(mamE) XM1_2348(mamO) XM1_2397(mamE) XM1_2399(mamO) XM1_4173 XM1_4367(degP)
TMO: TMO_2651(degP) TMO_d0063(degP)
THAL: A1OE_1485
EFK: P856_791(degPch1)
MAI: MICA_400
MAN: A11S_385
BBAT: Bdt_2725(algY) Bdt_3397(htrA)
BBW: BDW_10170
BEX: A11Q_880
ATX: GCD22_03508(mucD)
HTL: HPTL_0024
BSU: BSU12900(htrA) BSU33000(htrB)
BSH: BSU6051_12900(htrA) BSU6051_33000(htrB) BSU6051_40360(htrC)
BSUT: BSUB_01407(htrA) BSUB_03523(htrB) BSUB_04283(htrC)
BSUL: BSUA_01407(htrA) BSUA_03523(htrB) BSUA_04283(htrC)
BSO: BSNT_07774(htrA) BSNT_09805(yvtA)
BSQ: B657_12900(htrA) B657_33000(htrB) B657_40360(htrC)
BSX: C663_1328(htrA) C663_3161(yvtA) C663_3954(yyxA)
BSS: BSUW23_16140(htrB)
BLI: BL00734(htrB)
BLD: BLi03481(htrB)
BLH: BaLi_c15300(htrA) BaLi_c35450(htrB) BaLi_c43120(yyxA)
BAQ: BACAU_1252(htrA1) BACAU_3034(htrA3) BACAU_3745(yyxA)
BYA: BANAU_1211(htrA) BANAU_3199(yvtA) BANAU_3914(yyxA)
BAML: BAM5036_1209(htrA) BAM5036_2923(htrB) BAM5036_3656(htrC)
BAMA: RBAU_1252(htrA) RBAU_3142(htrB) RBAU_3859(htrC)
BAMN: BASU_1231(htrA) BASU_2929(htrB) BASU_3644(htrC)
BAMB: BAPNAU_2491(htrA1) BAPNAU_3190(htrA5) BAPNAU_3925(yyxA)
BAMY: V529_12230(htrA) V529_32700(yvtA) V529_40000(yyxA)
BMP: NG74_01321(htrA_1) NG74_03160(htrB) NG74_03912(htrA_2)
BAO: BAMF_3139(htrB)
BQL: LL3_01392(htrA) LL3_03420(htrB) LL3_04178(htrC)
BXH: BAXH7_02184(htrA) BAXH7_03409(yvtA) BAXH7_04168(yyxA)
BQY: MUS_1364(htrA) MUS_4428(yyxA)
BCA: BCE_3619
BWW: bwei_1356(htrA) bwei_4315
BACL: BS34A_14280(htrA) BS34A_36000(htrB) BS34A_43660(htrC)
BGY: BGLY_1383 BGLY_3876(htrB) BGLY_4697(yyxA)
BMQ: BMQ_5252(htrA)
BMD: BMD_5240(htrA)
BMH: BMWSH_0029(yyxA) BMWSH_1316(hhoA)
BAG: Bcoa_1316
BCOA: BF29_2235
BKW: BkAM31D_13245(hhoB) BkAM31D_21895(mucD) BkAM31D_25190(htrB)
OIH: OB1100
GKA: GK0332
GTN: GTNG_2765
GEA: GARCT_00377(htrA_1) GARCT_03453(htrA_2)
AFL: Aflv_1177(htrA) Aflv_2834
HHD: HBHAL_2127(mucD) HBHAL_4777 HBHAL_5115(yyxA)
VPN: A21D_00824(htrA_1) A21D_01506(htrA_2) A21D_02463(hhoA) A21D_02626(mucD_1) A21D_03822(mucD_2)
BLEN: NCTC4824_00382(htrB) NCTC4824_04253(htrA)
BSE: Bsel_1995
SUE: SAOV_1714
SUG: SAPIG1780
SUF: SARLGA251_16180(htrA1)
SAUA: SAAG_01630
SAUS: SA40_1590(htrA1)
SAUU: SA957_1673(htrA1)
SAUG: SA268_1677(htrA1)
SAUB: C248_1770
SAMS: NI36_09255
SLN: SLUG_12010(htrA1) SLUG_18400(htrA2)
SDT: SPSE_1064 SPSE_1814(htrA)
SDP: NCTC12225_01271(htrA_1) NCTC12225_02034(htrA_2)
MCAK: MCCS_08620 MCCS_18120(htrA)
LMO: lmo0292
LMOC: LMOSLCC5850_0290(htrA)
LMOD: LMON_0294
LMOW: AX10_10000
LMOM: IJ09_08795
LMOG: BN389_03160(yyxA)
LMP: MUO_01655
LMOL: LMOL312_0299(htrA)
LMOX: AX24_14235
LMQ: LMM7_0325(htrA_degP)
LML: lmo4a_0317(htrA)
LMS: LMLG_0758
LMW: LMOSLCC2755_0299(htrA)
LMX: LMOSLCC2372_0294(htrA)
LMZ: LMOSLCC2482_0300(htrA)
LMON: LMOSLCC2376_0270(htrA)
LMOS: LMOSLCC7179_0285(htrA)
LMOO: LMOSLCC2378_0314(htrA)
LMOY: LMOSLCC2479_0293(htrA)
LMOT: LMOSLCC2540_0306(htrA)
LMOA: LMOATCC19117_0310(htrA)
LMOK: CQ02_01650
LIN: lin0320
LWE: lwe0266
LSG: lse_0275
LIV: LIV_0269
LGZ: NCTC10812_00345(htrA)
GMO: NCTC11323_00107(htrA)
GHA: NCTC10459_00118(htrA)
PPO: PPM_1386(htrA) PPM_4514(M1_4946) PPM_5030(yyxA)
PLV: ERIC2_c01640(yyxA) ERIC2_c35160(htrA)
ASOC: CB4_00417(htrB) CB4_01577(hhoB) CB4_03519(htrA_2)
KZO: NCTC404_00802(htrA)
LLA: L187771(htrA)
LLK: LLKF_2384(htrA)
LLT: CVCAS_2170(htrA)
LLS: lilo_2116(htrA)
LLX: NCDO2118_2243(htrA)
LLJ: LG36_2075(htrA)
LLM: llmg_2419(htrA)
LLC: LACR_2439
LLR: llh_12405
LLI: uc509_2116(htrA)
LLW: kw2_2196(htrA)
LGR: LCGT_1837
LGV: LCGL_1858
LPK: LACPI_2239(htrA)
SPY: SPy_2216(htrA)
SPZ: M5005_Spy1865(htrA)
SPYM: M1GAS476_1920(htrA)
SPYA: A20_1914(htrA)
SPG: SpyM3_1864(degP)
SPS: SPs1860
SPH: MGAS10270_Spy1986(htrA)
SPI: MGAS10750_Spy1978(htrA)
SPJ: MGAS2096_Spy1897(htrA)
SPK: MGAS9429_Spy1877(htrA)
SPF: SpyM51837(htrA)
SPB: M28_Spy1898(htrA)
STG: MGAS15252_1757(htrA)
STX: MGAS1882_1791(htrA)
SOZ: Spy49_1821(degP)
STZ: SPYALAB49_001871(htrA)
SPYH: L897_09275
SPN: SP_2239
SPD: SPD_2068
SPR: spr2045(sphtra)
SPW: SPCG_2205(sphtra)
SJJ: SPJ_2269
SNV: SPNINV200_20490(htrA)
SPX: SPG_2188
SNT: SPT_2260
SND: MYY_2162
SPNN: T308_10790
SNE: SPN23F22720(htrA)
SPV: SPH_2438
SPP: SPP_2295
SNI: INV104_19410(htrA)
SNP: SPAP_2288
SNX: SPNOXC19810(htrA)
SNU: SPNA45_02089(htrA)
SPNE: SPN034156_10610(htrA)
SPNU: SPN034183_19830(htrA)
SPNM: SPN994038_19730(htrA)
SPNO: SPN994039_19740(htrA)
SAG: SAG2174
SAN: gbs2133
SAK: SAK_2135(htrA)
SGC: A964_2021
SAGL: GBS222_1766(htrA)
SAGM: BSA_21890
SAGI: MSA_22550
SAGR: SAIL_21720
SAGP: V193_09365
SAGC: DN94_09365
SAGE: EN72_11485
SAGG: EN73_10485
SAGN: W903_2080
SMU: SMU_2164(htrA)
SMC: SmuNN2025_1894(htrA)
SMJ: SMULJ23_1920(htrA)
SMUA: SMUFR_1877
STC: str2024(htrA)
STL: stu2024(htrA)
STE: STER_2002
STN: STND_1966
STU: STH8232_2336(htrA)
STW: Y1U_C1909
STHE: T303_01085
SSA: SSA_2381(htrA)
SSB: SSUBM407_2032(htrA)
SSI: SSU1968(htrA)
SSS: SSUSC84_1985(htrA)
SUP: YYK_09495
SSUY: YB51_10055
SSUT: TL13_2006(htrA)
SSUI: T15_2240
SGO: SGO_2150(degP)
SEZ: Sez_1960
SEQ: SZO_19400
SEQU: Q426_09440
SEU: SEQ_2237
SUB: SUB1868(htrA)
SDS: SDEG_2177(htrA)
SDA: GGS_1977(htrA)
SDC: SDSE_2286(htrA)
SDQ: SDSE167_2292(htrA)
SGG: SGGBAA2069_c23080(htrA)
SGT: SGGB_2294
SMB: smi_2088(htrA)
SOR: SOR_1990(htrA)
STK: STP_1867(htrA)
STB: SGPB_2025
SCP: HMPREF0833_11473(htrA)
SCF: Spaf_2108(degP)
SSR: SALIVB_2155(htrA)
STJ: SALIVA_2085(htrA)
SSAH: HSISS4_01902(htrA)
SMN: SMA_2191(htrA)
SIF: Sinf_1963
SIE: SCIM_1706(degP)
SIB: SIR_1904
SIU: SII_1872
SANG: SAIN_1838
SANC: SANR_2125
SANS: DK43_00105
SCG: SCI_1942
SCON: SCRE_1898
SCOS: SCR2_1898
SIK: K710_2215
SLU: KE3_2047
STRN: SNAG_1902(htrA)
STRG: SRT_20810
SVB: NCTC12167_01963(htrA)
LJO: LJ_0070
LJF: FI9785_127(htrA)
LJH: LJP_0077
LAC: LBA0083(htrA)
LAD: LA14_0087
LAF: SD55_0085(htrA)
LDB: Ldb0140(htrA)
LBU: LBUL_0118
LDL: LBU_0100
LGA: LGAS_0069
LHE: lhv_0100
LHL: LBHH_0101
LHV: lhe_0111
LHH: LBH_0076
LHD: HUO_01455
LCR: LCRIS_00078(htrA)
LAM: LA2_00530
LKE: WANG_1648(htrA)
LAE: LBAT_0102
LPW: LpgJCM5343_00660(degQ)
LCA: LSEI_2802
LCS: LCBD_3027
LCE: LC2W_3012
LCW: BN194_29460(htrA)
LPAP: LBPC_2749
LCB: LCABL_30080(htrA)
LRH: LGG_02806(htrA)
LRG: LRHM_2700
LRL: LC705_02797(htrA)
LRA: LRHK_2915(htrA)
LPL: lp_0043(htrA)
LPJ: JDM1_0056(htrA)
LPT: zj316_0262(htrA)
LPS: LPST_C0035(htrA)
LPZ: Lp16_0036
LRE: Lreu_0024
LRF: LAR_0023
LRU: HMPREF0538_21177(htrA)
LRT: LRI_0028
LFE: LAF_0020
LFR: LC40_0013
LFF: LBFF_0020
LBH: Lbuc_0050
LBN: LBUCD034_0025(htrA)
LHIL: G8J22_00020(htrA)
LBR: LVIS_0034
LSL: LSL_0042(degP)
LSI: HN6_00034(degP) HN6_01489
LSJ: LSJ_0053(degP)
LRM: LRC_00450
LOL: LACOL_0025(htrA)
PPE: PEPE_1792
PPEN: T256_08835
PCE: PECL_1826
LSA: LCA_0082(htrA)
LME: LEUM_1946
LCI: LCK_00189(htrA) LCK_01484
LGS: LEGAS_0312(htrA1) LEGAS_0381(htrA2)
WKO: WKK_02480
WCE: WS08_0056
WCT: WS74_0055
WSO: WSWS_01383(degP)
EFA: EF3027(htrA)
EFL: EF62_0112(htrA)
EFI: OG1RF_12305(htrA)
EFD: EFD32_2609(htrA)
EFS: EFS1_2470
EFQ: DR75_1760
ENE: ENT_27820
EFM: M7W_471
EHR: EHR_06435
ECAS: ECBG_00289
EMU: EMQU_0271
EDU: LIU_02945
ESG: EsVE80_20040(htrA)
MPS: MPTP_0325
MPX: MPD5_1561
THL: TEH_02530(htrA)
AUR: HMPREF9243_1703(htrA)
CRN: CAR_c00290(htrC)
CML: BN424_72(htrA)
CARC: NY10_1779
JDA: BW727_101667(htrA)
CAC: CA_C2433
CPE: CPE2230
CPF: CPF_2494
CPR: CPR_2200
CBO: CBO3541
CBA: CLB_3622
CBH: CLC_3519
CBY: CLM_4033
CBL: CLK_3010
CBK: CLL_A0456
CBB: CLD_0942
CBI: CLJ_B3871
CBT: CLH_0448
CBF: CLI_3761
CBM: CBF_3728
CBE: Cbei_0379
CBZ: Cbs_0379
CBEI: LF65_00437
CPAT: CLPA_c16270(htrB1) CLPA_c37480(htrB2)
CPAE: CPAST_c16270(htrB1) CPAST_c37480(htrB2)
CSB: CLSA_c04750(htrB)
CLD: CLSPO_c37240(htrB)
HSC: HVS_07015(hhoA) HVS_11065(htrB1) HVS_15615(htrB2)
CSD: Clst_1125
ESR: ES1_07640
ESU: EUS_23050
FPR: FP2_12070
FPA: FPR_10140
BFI: CIY_26240
RIM: ROI_08430
COO: CCU_00310
CCT: CC1_32550
CSCI: HDCHBGLK_01396(htrB_1) HDCHBGLK_03535(htrB_2)
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