KEGG   ENZYME: 4.6.1.12
Entry
EC 4.6.1.12                 Enzyme                                 
Name
2-C-methyl-D-erythritol 2,4-cyclodiphosphate synthase;
MECDP-synthase;
2-phospho-4-(cytidine 5'-diphospho)-2-C-methyl-D-erythritol CMP-lyase (cyclizing)
Class
Lyases;
Phosphorus-oxygen lyases;
Phosphorus-oxygen lyases (only sub-subclass identified to date)
Sysname
2-phospho-4-(cytidine 5'-diphospho)-2-C-methyl-D-erythritol CMP-lyase (cyclizing; 2-C-methyl-D-erythritol 2,4-cyclodiphosphate-forming)
Reaction(IUBMB)
2-phospho-4-(cytidine 5'-diphospho)-2-C-methyl-D-erythritol = 2-C-methyl-D-erythritol 2,4-cyclodiphosphate + CMP [RN:R05637]
Reaction(KEGG)
R05637
Substrate
2-phospho-4-(cytidine 5'-diphospho)-2-C-methyl-D-erythritol [CPD:C11436]
Product
2-C-methyl-D-erythritol 2,4-cyclodiphosphate [CPD:C11453];
CMP [CPD:C00055]
Comment
The enzyme from Escherichia coli requires Mg2+ or Mn2+. Forms part of an alternative nonmevalonate pathway for terpenoid biosynthesis (for diagram, click here).
History
EC 4.6.1.12 created 2001
Pathway
ec00900  Terpenoid backbone biosynthesis
ec01100  Metabolic pathways
ec01110  Biosynthesis of secondary metabolites
Orthology
K01770  2-C-methyl-D-erythritol 2,4-cyclodiphosphate synthase
K12506  2-C-methyl-D-erythritol 4-phosphate cytidylyltransferase / 2-C-methyl-D-erythritol 2,4-cyclodiphosphate synthase
Genes
AJM119057666
ATHAT1G63970(ISPF)
ALY9322439
CRB17894704
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BRP103838115 103838240
BNA106366495 106390240 106392209 106450544
BOE106315633 106315698
RSZ108825483 108825877 130499727
THJ104809368 104823600
CPAP110819136
CIT102614336
CICCICLE_v10021991mg
PVY116107488
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TCC18606591
GRA105788279 105791388
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GAB108464969 108469485
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EGR104443930
GMX100306378 112998589
GSJ114376858 114379757
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VRA106776456
VAR108320320
VUN114174243
VUM124821343
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TPRA123909868
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VVO131647066
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AHF112749685 112801453
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PMUM103337568
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SDUL129890099
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NSY104210807
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SMIL131024965
APAN127265496
HAN110930441
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LSV111901111
CCAV112529751
DCR108206051
CSIN114261498 114279313 114316125
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AEW130753614 130793973
BVG104892243
SOE110805603
CQI110719586 110722601
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MOF131157357
NNU104600215
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PSOM113274654 113304116 113304194
OSA4330320
DOSAOs02t0680600-01(Os02g0680600)
OBR102717874
OGL127762442
BDI100821610
ATS109780119
TDC119317436 119323621
TAES123128006 123137618 123145101
TUA125514125
LPER127306669
LRD124687376 124688055
SBI8076034
ZMA100276918 100284320
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SVS117866927
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ATR18424363
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ECSECs_3600(ispF)
ECFECH74115_3997(ispF)
ETWECSP_3694(ispF)
ELXCDCO157_3360(ispF)
EOIECO111_3470(ispF)
EOJECO26_3815(ispF)
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ECKEC55989_3018(ispF)
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ECPECP_2728
ENAECNA114_2784(ygbB)
ECOSEC958_3017(ygbB)
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ECOAAPECO78_17320
ECXEcHS_A2884(ispF)
ECMEcSMS35_2871(ispF)
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ECRECIAI1_2847(ispF)
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EUMECUMN_3070(ispF)
ECTECIAI39_2935(ispF)
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SEWSeSA_A3080(ispF)
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SELSPUL_2928(ispF)
SEGASPUCDC_2914(ispF)
SETSEN2768(ispF)
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SENOAU37_14070(ispF)
SENVAU39_14070(ispF)
SENQAU40_15825(ispF)
SENLIY59_14665(ispF)
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SEEBSEEB0189_005510(ispF)
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SENEIA1_14035(ispF)
SENCSEET0819_21480(ispF)
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SFVSFV_2752(ygbB)
SFESFxv_3037(ispF)
SFNSFy_3940
SFSSFyv_4017
SFTNCTC1_03047(ispF)
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ENLA3UG_18005(ispF)
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EKBBFV64_18490
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ENTEnt638_3217
EASEntas_3465
ENRH650_10195(ispF)
ENXNI40_017610(ispF)
ENFAKI40_0966(ispF)
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EBGFAI37_11370(ispF)
ENDA4308_02440(ispF)
ENZG0034_18160(ispF)
ENSHWQ15_03210(ispF)
ENKLOC22_05985(ispF)
EHUD5067_0004860(ispF)
EMORL6Y89_17180(ispF)
ENBELK40_18255
EQUOM418_17475(ispF)
EPUQVH39_18510(ispF)
ESAESA_00545
CSKES15_0802(ispF)
CSZCSSP291_02755(ispF)
CSJCSK29544_01791
CCONAFK62_15660(ispF)
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CMJAFK66_003850(ispF)
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CMWAFK63_02825(ispF)
CTUCTU_33200(ispF)
KPNKPN_03108(ispF)
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KPMKPHS_41830
KPPA79E_0990
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KPQKPR0928_20320(ispF)
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CPOTFOB25_16380(ispF)
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CAMAF384_14950(ispF)
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CTELGBC03_09800(ispF)
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CARSE1B03_21050(ispF)
CIXM4I31_04875(ispF)
CIBHF677_004910(ispF)
CENSP2W74_04720(ispF)
BPNBPEN_172(ispF)
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BCHRBCHRO640_173(ispF)
BHBM9394_02445(ispF)
BVXM9408_02425(ispF)
BENBOBLI757_167(ispF)
BECGN160_01370(ispF)
BEMM9396_01605(ispF)
BOCRM9405_00745(ispF)
HDEHDEF_1714(ispF)
SECTA359_02170
SEHCA35E_00366
RIPRIEPE_0039(ispF)
EBTEBL_c08680(ispF)
CNTJT31_16705(ispF)
CEMLH23_00995(ispF)
CENLH86_00985(ispF)
CLAPNCTC11466_00749(ispF)
PGELG71_09515(ispF)
ESCEntcl_0954
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