Entry
Name
2-C-methyl-D-erythritol 2,4-cyclodiphosphate synthase;
MECDP-synthase;
2-phospho-4-(cytidine 5'-diphospho)-2-C-methyl-D-erythritol CMP-lyase (cyclizing)
Class
Lyases;
Phosphorus-oxygen lyases;
Phosphorus-oxygen lyases (only sub-subclass identified to date)
BRITE hierarchy
Sysname
2-phospho-4-(cytidine 5'-diphospho)-2-C-methyl-D-erythritol CMP-lyase (cyclizing; 2-C-methyl-D-erythritol 2,4-cyclodiphosphate-forming)
Reaction(IUBMB)
2-phospho-4-(cytidine 5'-diphospho)-2-C-methyl-D-erythritol = 2-C-methyl-D-erythritol 2,4-cyclodiphosphate + CMP [RN:
R05637 ]
Reaction(KEGG)
Substrate
2-phospho-4-(cytidine 5'-diphospho)-2-C-methyl-D-erythritol [CPD:
C11436 ]
Product
2-C-methyl-D-erythritol 2,4-cyclodiphosphate [CPD:
C11453 ];
CMP [CPD:
C00055 ]
Comment
The enzyme from Escherichia coli requires Mg2+ or Mn2+. Forms part of an alternative nonmevalonate pathway for terpenoid biosynthesis (for diagram, click here).
History
EC 4.6.1.12 created 2001
Pathway
ec00900 Terpenoid backbone biosynthesis
ec01110 Biosynthesis of secondary metabolites
Orthology
K01770 2-C-methyl-D-erythritol 2,4-cyclodiphosphate synthase
K12506 2-C-methyl-D-erythritol 4-phosphate cytidylyltransferase / 2-C-methyl-D-erythritol 2,4-cyclodiphosphate synthase
Genes
CSAT : 104704018 104705227 104714751 104753063
BNA : 106366495 106390240 106392209 106450544
MINC : 123204717 123207832 123211266
GHI : 107947499 107949505 107952123 121203530
MDM : 103411737 103426369 103439200
CPEP : 111807348 111807352
MESC : 110605265 110609024
PALZ : 118028426 118033745
SIND : 105158281 105164054
SSPL : 121756233 121756234 121756541 121759199
CSIN : 114261498 114279313 114316125
MING : 122061017 122081046
TSS : 122646412 122662870 122665639
PSOM : 113274654 113304116 113304194
DOSA : Os02t0680600-01(Os02g0680600)
TAES : 123128006 123137618 123145101
PVIR : 120656809 120712619
PDA : 103715821 103718484 120107193
SMO : SELMODRAFT_130637 SELMODRAFT_90975
CVR : CHLNCDRAFT_53457(MCS)
PCB : PCHAS_030860(PC001256.02.0)
FCY : FRACYDRAFT_205676(MCS)
EHX : EMIHUDRAFT_122012 EMIHUDRAFT_196709
ECOO : ECRM13514_3598(ispF)
ECOH : ECRM13516_3463(ispF)
ELR : ECO55CA74_16160(ispF)
ECW : EcE24377A_3047(ispF)
EDJ : ECDH1ME8569_2656(ispF)
ECOI : ECOPMV1_03006(ispF)
SEM : STMDT12_C29780(ispF)
SETC : CFSAN001921_02430(ispF)
SEEN : SE451236_20740(ispF)
SENH : CFSAN002069_17625(ispF)
SEEH : SEEH1578_00650(ispF)
SENJ : CFSAN001992_18895(ispF)
SEEC : CFSAN002050_20960(ispF)
SEEB : SEEB0189_005510(ispF)
SENC : SEET0819_21480(ispF)
REE : electrica_00951(ispF)
CLAP : NCTC11466_00749(ispF)
KIE : NCTC12125_04939(ispF)
METY : MRY16398_10530(ispF)
AHN : NCTC12129_03947(ispF)
PTF : PROFFT_A_02990(ispF)
PSHI : SAMEA2665130_2346(ispF)
YPG : YpAngola_A0963(ispF)
YPI : YpsIP31758_3298(ispF)
SMW : SMWW4_v1c08060(ispF)
SERS : SERRSCBI_03735(ispF)
SFJ : SAMEA4384070_0855(ispF)
SOF : NCTC11214_00673(ispF)
PAQU : DMB82_0004635(ispF)
DIC : Dpoa569_000802(ispF)
EHD : ERCIPSTX3056_611(ispF)
BAPF : BUMPF009_CDS00180(ispf)
BAPG : BUMPG002_CDS00180(ispf)
BAPU : BUMPUSDA_CDS00180(ispf)
BAPW : BUMPW106_CDS00180(ispf)
MINT : C7M51_02524(ispF_1)
TPTY : NCTC11468_00921(ispF)
PHEI : NCTC12003_00951(ispF)
PRJ : NCTC6933_03100(ispF)
LRI : NCTC12151_01112(ispF)
HIC : NTHIC486_00324(ispF)
HPIT : NCTC13334_00823(ispF)
HHZ : NCTC10839_00534(ispF)
HAEG : NCTC8502_00533(ispF)
PDAG : 4362423_01684(ispF)
ADP : NCTC12871_00379(ispF)
ALIG : NCTC10568_00552(ispF)
ASEG : NCTC10977_00427(ispF)
AVT : NCTC3438_00700(ispF)
RPNE : NCTC8284_00488(ispF)
PAET : NCTC13378_01736(ispF)
XFU : XFF4834R_chr27890(ispF)
XPH : XppCFBP6546_18895(XppCFBP6546P_18895)
XHD : LMG31886_25870(ispF)
VAU : VANGNB10_cI0435(ispF)
PAEB : NCGM1900_2649(ispF)
PPUD : DW66_1163 DW66_1497
PVD : CFBP1590__4019(ispF)
PPRC : PFLCHA0_c12230(ispF)
PFW : PF1751_v1c12430(ispF)
PFF : PFLUOLIPICF701895(ispF)
PPUU : PputUW4_01114(ispF)
PTRT : HU722_0007540(ispF)
PTW : TUM18999_46010(ispF)
PTAE : NCTC10697_03432(ispF)
PSYC : DABAL43B_1690(ispF)
MCAT : MC25239_00591(ispF)
MCUN : NCTC10297_01132(ispF)
SCAA : TUM17387_12450(ispF)
PLZ : S4054249_04450(ispF)
SALH : HMF8227_00532(ispF)
MISZ : MishRS11D_13480(ispF)
TNI : TVNIR_1883(ispF_[H])
GAI : IMCC3135_23785(ispF)
HAXI : HAALTHF_22270n(ispF)
AEL : NCTC12917_03570(ispF)
CDIZ : CEDIAZO_01111(ispF)
NMM : NMBM01240149_0656(ispF)
NMS : NMBM01240355_1434(ispF)
NMQ : NMBM04240196_0708(ispF)
NMZ : NMBNZ0533_1487(ispF)
NMX : NMA510612_1925(ispF)
NWE : SAMEA3174300_1164(ispF)
NZO : SAMEA4504057_1732(ispF)
NCI : NCTC10296_00016(ispF)
NCZ : NCTC10294_00989(ispF)
NANI : NCTC12227_00491(ispF)
ECOR : SAMEA4412678_2077(ispF)
REH : H16_A1457(h16_A1457)
BMV : BMASAVP1_A1986(ispF)
BML : BMA10229_A3320(ispF)
BPM : BURPS1710b_2511(ispF)
BPL : BURPS1106A_2400(ispF)
BUE : BRPE67_ACDS12420(ispF)
PLG : NCTC10937_01493(ispF)
LMIR : NCTC12852_01844(ispF)
BUO : BRPE64_ACDS13450(ispF)
VTR : MYVALT_F_02810(ispF)
BTRM : SAMEA390648702505(ispF)
AXX : ERS451415_01391(ispF)
LIM : L103DPR2_02078(ispF)
LIH : L63ED372_01101(ispF)
SUTT : SUTMEG_07090(ispDF)
URU : DSM104443_02591(ispF)
UPL : DSM104440_02322(ispF)
FPHO : SHINM1_010290(ispF)
HHP : HPSH112_02410(ispDF)
HHQ : HPSH169_02330(ispDF)
HHR : HPSH417_02135(ispDF)
HPO : HMPREF4655_20672(ispD)
HPX : HMPREF0462_0488(ispD)
HEP : HPPN120_02170(ispDF)
HEU : HPPN135_02190(ispDF)
HPYA : HPAKL117_02085(ispDF)
HPYK : HPAKL86_03210(ispDF)
HPYO : HPOK113_0435(ispDF)
HPYL : HPOK310_0430(ispDF)
HCB : HCBAA847_1800(ispD_ispF)
HCL : NCTC13205_00024(ispDF)
HSH : NHP194022_15370(ispDF)
CJV : MTVDSCj20_1564(ispDF)
CFT : CFF04554_0408(ispDF)
CFV : CFVI03293_0407(ispDF)
CFX : CFV97608_0410(ispDF)
CAMP : CFT03427_0418(ispDF)
CCV : CCV52592_0202(ispDF)
CCO : CCC13826_1467(ispDF)
CCOC : CCON33237_1231(ispDF)
CLR : UPTC16701_0252(ispDF)
CLM : UPTC16712_0256(ispDF)
CLQ : UPTC4110_0247(ispDF)
CLN : UPTC3659_0264(ispDF)
CAJ : CIG1485E_0468(ispDF)
CAMR : CAQ16704_0254(ispDF)
CSM : CSUB8521_0256(ispDF)
CSF : CSUB8523_0250(ispDF)
CHV : CHELV3228_1535(ispDF)
CPIN : CPIN18020_0977(ispDF)
CAMZ : CVIC12175_1628(ispDF)
CNV : CNZW441b_0294(ispDF)
GBN : GEOBRER4_36890(ispF)
DMA : DMR_23150(ispD_ispF)
ERW : ERWE_CDS_00990(ispF)
ERG : ERGA_CDS_00950(ispF)
MESW : A9K65_019910(ispDF)
RBS : RHODOSMS8_00938(ispF)
SMEL : SM2011_c01040(ispDF)
SFD : USDA257_c34930(ispDF)
SAME : SAMCFNEI73_Ch1586(ispD)
AGR : AGROH133_05946(ispF)
REC : RHECIAT_CH0002043(ispDF)
REL : REMIM1_CH02004(ispDF)
REP : IE4803_CH02004(ispDF)
REI : IE4771_CH02079(ispDF)
RGA : RGR602_CH01839(ispDF)
RHN : AMJ98_CH02008(ispDF)
RPHA : AMC79_CH02126(ispDF)
RHX : AMK02_CH02016(ispDF)
REZ : AMJ99_CH02086(ispDF)
NEN : NCHU2750_19860(ispD)
BSV : BSVBI22_A1116(ispDF)
BVL : BF3285c1_1932(ispDF)
BIO : BR141012304_11720(ispDF)
BRC : BCCGELA001_18915(ispDF)
BVZ : BRAD3257_4530(ispDF)
VGO : GJW-30_1_02992(ispDF)
BHS : BM1374165_00568(ispDF)
BBK : BARBAKC583_0540(ispDF)
BTX : BM1374166_00809(ispDF)
BEZ : NCTC12898_00518(ispDF)
MDI : METDI3585(ispDF) METDI4485(ispF)
MAQU : Maq22A_c17520(ispF)
MTUN : MTUNDRAET4_1116(ispDF)
FIL : BN1229_v1_2799(ispDF)
FIY : BN1229_v1_3114(ispDF)
BVY : NCTC9239_01631(ispDF)
TSV : DSM104635_01993(ispDF)
RLI : RLO149_c017890(ispF)
PHP : PhaeoP97_01473(ispDF)
PPIC : PhaeoP14_01380(ispDF)
SINL : DSM14862_01391(ispF)
SPSE : SULPSESMR1_01635(ispF)
RMM : ROSMUCSMR3_00179(ispF)
AHT : ANTHELSMS3_02797(ispDF)
RSQ : Rsph17025_1484 Rsph17025_1485
RCP : RCAP_rcc01795(ispDF)
LVS : LOKVESSMR4R_01530(ispDF)
SSY : SLG_18000(ispD_ispF)
SFLA : SPHFLASMR4Y_00766(ispDF)
EBLA : JGUZn3_17530(ispDF)
ABS : AZOBR_p110006(ispDF)
MGY : MGMSRv2__1153(ispDF)
THAC : CSC3H3_09655(ispDF)
MAES : Ga0123461_0625 Ga0123461_0626
MFN : Ga0123462_1650 Ga0123462_1651
BAZ : BAMTA208_00460(ispF)
BAE : BATR1942_19065(ispF)
BSON : S101395_00124(ispF)
BTHR : YBT1520_00405(ispF)
BTHU : YBT1518_00415(ispF)
BACI : B1NLA3E_00415(ispF)
BFD : NCTC4823_04121(ispF)
BLEN : NCTC4824_00114(ispF)
SDP : NCTC12225_02466(ispF)
SSTE : SAMEA4384403_2331(ispF)
LMOC : LMOSLCC5850_0231(ispF)
LMW : LMOSLCC2755_0234(ispF)
LMX : LMOSLCC2372_0238(ispF)
LMZ : LMOSLCC2482_0236(ispF)
LMON : LMOSLCC2376_0206(ispF)
LMOS : LMOSLCC7179_0231(ispF)
LMOO : LMOSLCC2378_0249(ispF)
LMOY : LMOSLCC2479_0237(ispF)
LMOT : LMOSLCC2540_0242(ispF)
LMOA : LMOATCC19117_0244(ispF)
LGZ : NCTC10812_00245(ispF)
PPQ : PPSQR21_045590(ispF)
COHN : KCTCHS21_54620(ispF)
CCOH : SAMEA4530647_0090(ispF)
SMAN : C12CBH8_07540(ispF)
PFAA : MM59RIKEN_31030(ispF)
VFA : MM35RIKEN_10360(ispF)
VCOP : MM50RIKEN_11470(ispF)
BPRO : PMF13cell1_02713(ispF)
CSCI : HDCHBGLK_03341(ispF)
ACHT : bsdcttw_39190(ispF)
PDF : CD630DERM_00480(ispF)
PHX : KGNDJEFE_00082(ispF)
CBAR : PATL70BA_2859(ispF)
ETM : CE91St48_38370(ispDF)
CDIA : CaldiYA01_13680(ispF)
PHAR : NCTC13077_00829(ispF)
PIV : NCTC13079_00836(ispF)
VRM : 44547418_01030(ispDF)
VDN : NCTC11831_00878(ispDF)
DHO : Dia5BBH33_08250(ispDF)
MANA : MAMMFC1_02003(ispDF)
PFAC : PFJ30894_01029(ispF)
ABSI : A9CBEGH2_21610(ispF)
FIT : Fi14EGH31_24820(ispF)
MGN : HFMG06NCA_0170(ispF)
MGS : HFMG95NCA_0170(ispF)
MGT : HFMG01NYA_0170(ispF)
MGV : HFMG94VAA_0170(ispF)
MGW : HFMG01WIA_0171(ispF)
MGAC : HFMG06CAA_0170(ispF)
MGAN : HFMG08NCA_0169(ispF)
MGNC : HFMG96NCA_0170(ispF)
SCR : SCHRY_v1c01600(ispF)
SSYR : SSYRP_v1c01800(ispF)
SDI : SDIMI_v3c08250(ispF)
STAI : STAIW_v1c10730(ispF)
SAPI : SAPIS_v1c09710(ispF)
SCQ : SCULI_v1c10400(ispF)
SSAB : SSABA_v1c08260(ispF)
SATR : SATRI_v1c02440(ispF)
SERI : SERIO_v1c02280(ispF)
STUR : STURON_001054(ispF)
SLL : SLITO_v1c10730(ispF)
SCJ : SCANT_v1c09870(ispF)
SHJ : SHELI_v1c11200(ispF)
SFZ : SFLOR_v1c11080(ispF)
SCOU : SCORR_v1c09720(ispF)
SPRN : S100390_v1c01650(ispF)
SPIT : STU14_v1c01650(ispF)
STAB : STABA_v1c00200(ispD) STABA_v1c10900(ispF)
SMOO : SMONO_v1c07850(ispF)
SALX : SALLE_v1c02300(ispF)
SGQ : SGLAD_v1c09970(ispF)
SCHI : SCHIN_v1c11960(ispF)
MPE : MYPE10270(MYPE10270)
MBO : BQ2027_MB3612C(ispF)
MMAE : MMARE11_48960(ispF)
MBAI : MB901379_04471(ispF)
MHEK : JMUB5695_00456(ispF)
MPHL : MPHLCCUG_00468(ispF)
MTHN : 4412656_04113(ispF)
MHAS : MHAS_01076(ispD_2) MHAS_03798(ispF)
MAUU : NCTC10437_05099(ispF)
MFLV : NCTC10271_00440(ispF)
MSAL : DSM43276_00486(ispF)
MTER : 4434518_03749(ispF)
CDIP : ERS451417_01975(ispF)
CUN : Cul210932_1959(ispF)
CUQ : Cul210931_1904(ispF)
CUJ : CUL131002_1871c(ispF)
CMIN : NCTC10288_00358(ispF)
CRL : NCTC7448_00433(IspF)
CCYS : SAMEA4530656_0200(ispF)
NFR : ERS450000_03800(ispF)
NAD : NCTC11293_01204(ispF)
NWL : NWFMUON74_04550(ispF)
RCR : NCTC10994_02177(ispF)
SAMB : SAM23877_3466(ispF)
SLE : sle_38770(sle_38770)
SGM : GCM10017557_38130(ispF)
STUI : GCM10017668_31510(ispF)
SGOB : test1122_10615(ispF)
AMAU : DSM26151_21940(ispDF)
PSEV : USB125703_00294(ispF)
AAGI : NCTC2676_1_00451(ispF)
GCR : GcLGCM259_0422(ispDF)
RDN : HMPREF0733_11268(ispF)
SKE : Sked_17780 Sked_31800
DCO : SAMEA4475696_0889(ispDF)
PAX : TIA2EST36_01765(ispF)
PAZ : TIA2EST2_01700(ispF)
CGRN : 4412665_00709(ispF)
PAUS : NCTC13651_02382(ispF)
PPC : HMPREF9154_0683(ispF)
MPH : MLP_47310(ispF) MLP_49340(ispF)
NAQU : ENKNEFLB_00914(ispF)