KEGG   ENZYME: 5.4.99.27Help
Entry
EC 5.4.99.27                Enzyme                                 

Name
tRNA pseudouridine13 synthase;
TruD;
YgbO;
tRNA PSI13 synthase;
RNA:PSI-synthase Pus7p;
Pus7p;
RNA:pseudouridine-synthase Pus7p;
Pus7 protein
Class
Isomerases;
Intramolecular transferases;
Transferring other groups
BRITE hierarchy
Sysname
tRNA-uridine13 uracil mutase
Reaction(IUBMB)
tRNA uridine13 = tRNA pseudouridine13
Substrate
tRNA uridine13
Product
tRNA pseudouridine13
Comment
Pseudouridine synthase TruD from Escherichia coli specifically acts on uridine13 in tRNA [2,3]. The Pus7 protein from Saccharomyces cerevisiae is a multisite-multisubstrate pseudouridine synthase that is able to modify uridine13 in several yeast tRNAs, uridine35 in the pre-tRNATyr, uridine35 in U2 small nuclear RNA, and uridine50 in 5S rRNA [5].
History
EC 5.4.99.27 created 2011
Orthology
K06176  tRNA pseudouridine13 synthase
Genes
HSA: 54517(PUS7) 83448(PUS7L)
PTR: 466961(PUS7L) 472481(PUS7)
PPS: 100967615(PUS7L) 100984627(PUS7)
GGO: 101139872(PUS7L) 101151571(PUS7)
PON: 100173954(PUS7) 100445492(PUS7L)
NLE: 100590083(PUS7) 100604134(PUS7L)
MCC: 697463(PUS7) 700448(PUS7L)
MCF: 102137970(PUS7)
CSAB: 103226697(PUS7) 103238181(PUS7L)
RRO: 104675902(PUS7) 104677386(PUS7L)
RBB: 108531282(PUS7) 108539983(PUS7L)
CJC: 100391010(PUS7) 100403577(PUS7L)
SBQ: 101029968(PUS7L) 101032240(PUS7)
MMU: 78697(Pus7) 78895(Pus7l)
RNO: 296751(Pus7) 315264(Pus7l)
CGE: 100751602(Pus7l) 100763044(Pus7)
NGI: 103728612(Pus7l) 103732190(Pus7)
HGL: 101697809(Pus7l) 101714237(Pus7) 101722118
CCAN: 109695366(Pus7) 109700563(Pus7l)
OCU: 100342624(PUS7) 100350002(PUS7L)
TUP: 102487247(PUS7) 102489649(PUS7L)
CFA: 100856353(PUS7) 477637(PUS7L)
AML: 100468893(PUS7) 100469632(PUS7L)
UMR: 103674644(PUS7) 103675404(PUS7L)
ORO: 101363129(PUS7) 101380853(PUS7L)
FCA: 101081058(PUS7L) 101083412(PUS7)
PTG: 102950179(PUS7) 102961890(PUS7L)
AJU: 106978293(PUS7L) 106978477(PUS7)
BTA: 505464(PUS7L) 615644(PUS7)
BOM: 102279945(PUS7) 102287315(PUS7L)
BIU: 109557373(PUS7) 109559200(PUS7L)
PHD: 102316173(PUS7) 102344787(PUS7L)
CHX: 102169827(PUS7) 102170947(PUS7L)
OAS: 101115198(PUS7L) 101122688(PUS7)
SSC: 100155187(PUS7L) 100518209(PUS7)
CFR: 102515253(PUS7) 102518219(PUS7L)
CDK: 105093023(PUS7) 105097093(PUS7L)
BACU: 103012263(PUS7L) 103020682(PUS7)
LVE: 103073188(PUS7) 103080422(PUS7L)
OOR: 101283670(PUS7L) 101284867(PUS7)
ECB: 100054808(PUS7L) 100059013(PUS7)
EPZ: 103541680(PUS7) 103547488(PUS7L)
EAI: 106825234(PUS7) 106828055(PUS7L)
MYB: 102245299(PUS7) 102262149(PUS7L)
MYD: 102758048(PUS7) 102771198(PUS7L)
HAI: 109388402(PUS7L) 109392050(PUS7)
RSS: 109454599(PUS7) 109456242(PUS7L)
PALE: 102881297(PUS7L) 102887726(PUS7)
LAV: 100670307(PUS7L) 100671355(PUS7)
MDO: 100018668(PUS7)
SHR: 100924417(PUS7)
OAA: 100077414(PUS7) 100085424(PUS7L)
GGA: 417709(PUS7) 417795(PUS7L)
MGP: 100538814(PUS7L) 100545860(PUS7)
CJO: 107305992(PUS7) 107309741(PUS7L)
APLA: 101792415(PUS7L) 101794582(PUS7)
ACYG: 106043286(PUS7) 106045493(PUS7L)
TGU: 100218339(PUS7L) 100224509(PUS7)
GFR: 102040936(PUS7L) 102045305(PUS7)
FAB: 101812679(PUS7) 101816428(PUS7L) 107604543
PHI: 102106667(PUS7L) 102107967(PUS7)
PMAJ: 107204274(PUS7) 107204544(PUS7L)
CCW: 104686871(PUS7) 104698326(PUS7L)
FPG: 101920267(PUS7) 101923719(PUS7L)
FCH: 102047702(PUS7) 102048389(PUS7L)
CLV: 102089093(PUS7) 102092452(PUS7L)
EGZ: 104128569(PUS7) 104129341(PUS7L)
AAM: 106485960(PUS7) 106488382(PUS7L)
ASN: 102374860(PUS7L) 102384204(PUS7)
AMJ: 102559645(PUS7L) 102562083(PUS7)
PSS: 102444542(PUS7L)
CMY: 102940093(PUS7L) 102944626
CPIC: 101931773(PUS7L) 101950494(PUS7)
ACS: 100557028(pus7l) 100560457(pus7)
PVT: 110071735 110080951(PUS7) 110082140(PUS7L)
PBI: 103051570(PUS7) 103053995(PUS7L)
GJA: 107113716(PUS7) 107125934(PUS7L)
XLA: 431837(pus7l.L) 734727(pus7.L)
XTR: 100127797(pus7l) 549638(pus7)
NPR: 108789458(PUS7L) 108795233(PUS7)
DRE: 402995(pus7) 561376(pus7l)
SGH: 107566648(pus7) 107591455
IPU: 108274689(pus7) 108279733(pus7l)
AMEX: 103023151(pus7l) 103041743(pus7)
TRU: 101063732(pus7) 101071156(pus7l)
LCO: 104934115(pus7l) 104936220(pus7) 109142143
NCC: 104955659(pus7) 104961702(pus7l)
MZE: 101464826(pus7) 101485099(pus7l)
OLA: 101156163(pus7) 101166099(pus7l)
XMA: 102225293(pus7) 102229914(pus7l)
PRET: 103459442(pus7l) 103478749(pus7)
NFU: 107384552(pus7l) 107388437(pus7)
CSEM: 103380329(pus7) 103382843(pus7l)
LCF: 108883084(pus7) 108888945(pus7l)
HCQ: 109523675(pus7l) 109529862(pus7)
BPEC: 110161860(pus7l) 110169593(pus7)
ELS: 105020432(pus7l) 105029399(pus7)
SFM: 108931335(pus7l) 108935880(pus7)
LCM: 102363096(PUS7) 102365655(PUS7L)
CMK: 103176973(pus7) 103190444(pus7l)
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CNB: CNBI3170
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ABV: AGABI2DRAFT203148(AGABI2DRAFT_203148)
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DDI: DDB_G0271632(pus7)
DFA: DFA_05965(pus7)
EHI: EHI_199620(45.t00007)
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TAN: TA15850
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ECO: b2745(truD)
ECJ: JW2715(truD)
ECD: ECDH10B_2913(truD)
EBW: BWG_2481(truD)
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SEEH: SEEH1578_23450(truD)
SEE: SNSL254_A3134(truD)
SEW: SeSA_A3079(truD)
SEA: SeAg_B3053(truD)
SENS: Q786_14110(truD)
SED: SeD_A3238(truD)
SEG: SG2831(truD)
SEL: SPUL_2927(truD)
SEGA: SPUCDC_2913(truD)
SET: SEN2767(truD)
SENA: AU38_14055(truD)
SENO: AU37_14065(truD)
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SENQ: AU40_15820(truD)
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SEEB: SEEB0189_005515(truD)
SEEP: I137_13940(truD)
SENE: IA1_14030(truD)
SENC: SEET0819_21475(truD)
SBG: SBG_2542
SBZ: A464_2947
SBV: N643_12440(truD)
SFL: SF2768(truD)
SFX: S2961(ygbO)
SFV: SFV_2753(ygbO)
SFE: SFxv_3036(truD)
SFN: SFy_3939
SFS: SFyv_4016
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SSN: SSON_2893(ygbO)
SBO: SBO_2775(ygbO)
SBC: SbBS512_E3129(truD)
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Taxonomy
Reference
1  [PMID:15135053]
  Authors
Ericsson UB, Nordlund P, Hallberg BM
  Title
X-ray structure of tRNA pseudouridine synthase TruD reveals an inserted domain with a novel fold.
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  Authors
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Enzymatic characterization and mutational studies of TruD--the fifth family of pseudouridine synthases.
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A novel unanticipated type of pseudouridine synthase with homologs in bacteria, archaea, and eukarya.
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  Authors
Behm-Ansmant I, Urban A, Ma X, Yu YT, Motorin Y, Branlant C
  Title
The Saccharomyces cerevisiae U2 snRNA:pseudouridine-synthase Pus7p is a novel multisite-multisubstrate RNA:Psi-synthase also acting on tRNAs.
  Journal
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Urban A, Behm-Ansmant I, Branlant C, Motorin Y
  Title
RNA sequence and two-dimensional structure features required for efficient substrate modification by the Saccharomyces cerevisiae RNA:{Psi}-synthase Pus7p.
  Journal
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  Sequence
[sce:YOR243C]
Other DBs
ExplorEnz - The Enzyme Database: 5.4.99.27
IUBMB Enzyme Nomenclature: 5.4.99.27
ExPASy - ENZYME nomenclature database: 5.4.99.27
BRENDA, the Enzyme Database: 5.4.99.27
CAS: 430429-15-5

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