KEGG   ENZYME: 6.5.1.6Help
Entry
EC 6.5.1.6                  Enzyme                                 

Name
DNA ligase (ATP or NAD+)
Class
Ligases;
Forming phosphoric-ester bonds;
Ligases that form phosphoric-ester bonds (only sub-subclass identified to date)
BRITE hierarchy
Sysname
poly(deoxyribonucleotide)-3'-hydroxyl:5'-phospho-poly(deoxyribonucleotide) ligase (ATP or NAD+)
Reaction(IUBMB)
(1) ATP + (deoxyribonucleotide)n-3'-hydroxyl + 5'-phospho-(deoxyribonucleotide)m = (deoxyribonucleotide)n+m + AMP + diphosphate (overall reaction) [RN:R00381];
(1a) ATP + [DNA ligase]-L-lysine = 5'-adenosyl [DNA ligase]-Nepsilon-phosphono-L-lysine + diphosphate;
(1b) 5'-adenosyl [DNA ligase]-Nepsilon-phosphono-L-lysine + 5'-phospho-(deoxyribonucleotide)m = 5'-(5'-diphosphoadenosine)-(deoxyribonucleotide)m + [DNA ligase]-L-lysine;
(1c) (deoxyribonucleotide)n-3'-hydroxyl + 5'-(5'-diphosphoadenosine)-(deoxyribonucleotide)m = (deoxyribonucleotide)n+m + AMP;
(2) NAD + (deoxyribonucleotide)n-3'-hydroxyl + 5'-phospho-(deoxyribonucleotide)m = (deoxyribonucleotide)n+m + AMP + beta-nicotinamide D-nucleotide (overall reaction) [RN:R00382];
(2a) NAD + [DNA ligase]-L-lysine = 5'-adenosyl [DNA ligase]-Nepsilon-phosphono-L-lysine + beta-nicotinamide D-nucleotide;
(2b) 5'-adenosyl [DNA ligase]-Nepsilon-phosphono-L-lysine + 5'-phospho-(deoxyribonucleotide)m = 5'-(5'-diphosphoadenosine)-(deoxyribonucleotide)m + [DNA ligase]-L-lysine;
(2c) (deoxyribonucleotide)n-3'-hydroxyl + 5'-(5'-diphosphoadenosine)-(deoxyribonucleotide)m = (deoxyribonucleotide)n+m + AMP
Reaction(KEGG)
Substrate
ATP [CPD:C00002];
(deoxyribonucleotide)n-3'-hydroxyl;
5'-phospho-(deoxyribonucleotide)m;
[DNA ligase]-L-lysine;
5'-adenosyl [DNA ligase]-Nepsilon-phosphono-L-lysine;
5'-(5'-diphosphoadenosine)-(deoxyribonucleotide)m;
NAD [CPD:C00003]
Product
(deoxyribonucleotide)n+m [CPD:C00039];
AMP [CPD:C00020];
diphosphate [CPD:C00013];
5'-adenosyl [DNA ligase]-Nepsilon-phosphono-L-lysine;
5'-(5'-diphosphoadenosine)-(deoxyribonucleotide)m;
[DNA ligase]-L-lysine;
beta-nicotinamide D-nucleotide
Comment
The enzymes from the archaea Thermococcus fumicolans and Thermococcus onnurineus show high activity with either ATP or NAD+, and significantly lower activity with TTP, GTP, and CTP. The enzyme catalyses the ligation of DNA strands with 3'-hydroxyl and 5'-phosphate termini, forming a phosphodiester and sealing certain types of single-strand breaks in duplex DNA. Catalysis occurs by a three-step mechanism, starting with the activation of the enzyme by ATP or NAD+, forming a phosphoramide bond between adenylate and a lysine residue. The adenylate group is then transferred to the 5'-phosphate terminus of the substrate, forming the capped structure 5'-(5'-diphosphoadenosine)-[DNA]. Finally, the enzyme catalyses a nucleophilic attack of the 3'-OH terminus on the capped terminus, which results in formation of the phosphodiester bond and release of the adenylate. Different from EC 6.5.1.1, DNA ligase (ATP), EC 6.5.1.2, DNA ligase (NAD+) and EC 6.5.1.7, DNA ligase (ATP, ADP or GTP).
History
EC 6.5.1.6 created 2014, modified 2016
Orthology
K10747  DNA ligase 1
Genes
HSA: 3978(LIG1)
PTR: 468936(LIG1)
PPS: 100969963(LIG1)
GGO: 101127133(LIG1) 109024219
PON: 100432978(LIG1)
NLE: 105740366(LIG1)
MCC: 718528(LIG1)
MCF: 101864859(LIG1)
CSAB: 103234960(LIG1)
RRO: 104673372(LIG1)
RBB: 108540136(LIG1)
CJC: 100415094(LIG1)
SBQ: 101039983(LIG1)
MMU: 16881(Lig1)
RNO: 100911727 81513(Lig1)
CGE: 100767365(Lig1)
NGI: 103732421(Lig1)
HGL: 101702301(Lig1)
CCAN: 109697575(Lig1)
OCU: 100340979(LIG1)
TUP: 102474595(LIG1)
CFA: 100686967(LIG1)
AML: 100482586(LIG1)
UMR: 103657224(LIG1)
ORO: 101386487(LIG1)
FCA: 101093313(LIG1)
PTG: 102958578(LIG1)
AJU: 106984824(LIG1)
BTA: 100124507(LIG1)
BOM: 102278584 102287527(LIG1)
BIU: 109572798(LIG1)
PHD: 102344626(LIG1)
CHX: 102174153(LIG1)
OAS: 101104173(LIG1)
SSC: 100520434(LIG1)
CFR: 102519149(LIG1)
CDK: 105098930(LIG1)
BACU: 103006526(LIG1)
LVE: 103075195(LIG1)
OOR: 101271923(LIG1)
ECB: 100053186(LIG1)
EPZ: 103555787(LIG1)
EAI: 106838232(LIG1)
MYB: 102255838(LIG1)
MYD: 102763533(LIG1)
HAI: 109390993(LIG1)
RSS: 109442877 109458737(LIG1)
PALE: 102888944(LIG1)
LAV: 100663865(LIG1)
TMU: 101344141
MDO: 100616962
SHR: 100927773
OAA: 100086878(LIG1)
GGA: 430516(LIG1)
MGP: 100550112(LIG1)
CJO: 107325897(LIG1)
APLA: 101796914(LIG1)
AAM: 106482030(LIG1)
ASN: 102380268(LIG1)
AMJ: 102566879(LIG1)
PSS: 102443770(LIG1)
CMY: 102943387
CPIC: 101937304(LIG1)
ACS: 100565521(lig1)
PVT: 110086446(LIG1)
PBI: 103064233(LIG1)
GJA: 107109747(LIG1)
XLA: 397978(lig1.L)
XTR: 100271763(lig1)
NPR: 108796895(LIG1)
DRE: 556995(lig1)
CCAR: 109108561
IPU: 108261058(lig1)
AMEX: 103035285(lig1)
LCO: 104926552(lig1)
MZE: 101479550(lig1)
OLA: 101167483(lig1)
XMA: 102234160(lig1)
PRET: 103479496(lig1)
NFU: 107383457(lig1)
CSEM: 103396815(lig1)
LCF: 108884325(lig1)
HCQ: 109529490(lig1)
BPEC: 110175118(lig1)
SASA: 106569579(lig1)
ELS: 105024554(lig1)
SFM: 108937809(lig1)
CIN: 100181519
SPU: 752989
APLC: 110981878
DME: Dmel_CG5602(DNA-ligI)
DSI: Dsimw501_GD11806(Dsim_GD11806)
MDE: 101890999
AAG: 23687986
AME: 408752
BIM: 100748010
BTER: 100644633
SOC: 105198875
AEC: 105148421
ACEP: 105619094
PBAR: 105433393
HST: 105191828
CFO: 105259166
LHU: 105673270
PGC: 109852587
NVI: 100122984
TCA: 658633
DPA: 109541725
NVL: 108562145
BMOR: 101739080
PMAC: 106716423
PRAP: 110996386
API: 100167056
DNX: 107173730
ZNE: 110828947
FCD: 110848453
TUT: 107371241
CEL: CELE_C29A12.3(lig-1)
CBR: CBG09716(Cbr-lig-1)
BMY: Bm1_26765
OBI: 106867431
LAK: 106176891
SHX: MS3_09949
EPA: 110250131
HMG: 100206246
AQU: 100641788
ATH: AT1G08130(LIG1) AT1G49250
CRB: 17899705
LJA: Lj1g3v3244630.1(Lj1g3v3244630.1) Lj1g3v3244630.2(Lj1g3v3244630.2) Lj3g3v3033290.1(Lj3g3v3033290.1)
DOSA: Os01t0685500-01(Os01g0685500) Os10t0489200-01(Os10g0489200)
OBR: 102700561
BDI: 100843366
ATS: 109745687(LOC109745687) 109764751(LOC109764751)
PPP: 112290811
CRE: CHLREDRAFT_133143(LIG1)
SCE: YDL164C(CDC9)
KMX: KLMA_50322(CDC9)
NCS: NCAS_0A14110(NCAS0A14110)
NDI: NDAI_0A01940(NDAI0A01940)
TPF: TPHA_0D04570(TPHA0D04570)
TBL: TBLA_0E02050(TBLA0E02050)
TDL: TDEL_0C02040(TDEL0C02040)
KAF: KAFR_0B00830(KAFR0B00830)
CAL: CAALFM_C300830CA(CaO19.6155)
CAUR: QG37_02309
SLB: AWJ20_2732(CDC9)
NTE: NEUTE1DRAFT41251(NEUTE1DRAFT_41251) NEUTE1DRAFT85482(NEUTE1DRAFT_85482)
ANG: ANI_1_2644024(An02g06890) ANI_1_594104(An12g04690)
PBN: PADG_05364 PADG_11178(PADG_00973)
PNO: SNOG_06940(SNOG_06939) SNOG_14590
SPO: SPAC20G8.01(cdc17) SPBC713.06(adl1)
ABP: AGABI1DRAFT127415(AGABI1DRAFT_127415) AGABI1DRAFT51454(AGABI1DRAFT_51454) AGABI1DRAFT71206(AGABI1DRAFT_71206)
ABV: AGABI2DRAFT122838(AGABI2DRAFT_122838) AGABI2DRAFT214235(AGABI2DRAFT_214235) AGABI2DRAFT69760(AGABI2DRAFT_69760)
DDI: DDB_G0274493(lig1)
DFA: DFA_07246(lig1)
EHI: EHI_111060(1.t00017)
PYO: PY17X_1404200(PY01533)
PCB: PCHAS_140450(PC000747.04.0)
TAN: TA05175
TPV: TP03_0549
BBO: BBOV_IV001520(21.m02964)
CPV: cgd3_3820
SMIN: v1.2.007861.t1(symbB.v1.2.007861.t1) v1.2.007862.t3(symbB.v1.2.007862.t3) v1.2.007862.t5(symbB.v1.2.007862.t5) v1.2.007862.t6(symbB.v1.2.007862.t6) v1.2.012543.t1(symbB.v1.2.012543.t1) v1.2.029029.t1(symbB.v1.2.029029.t1) v1.2.029030.t1(symbB.v1.2.029030.t1)
TPS: THAPSDRAFT_268404(Lig1)
ESM: O3M_26019
ECLX: LI66_23945
YPK: Y1095.pl
YPH: YPC_4846
YPM: YP_pMT090
YPJ: CH55_4262
HIT: NTHI1352(ligA)
HIU: HIB_13380
HIE: R2846_1161(ligA)
HIZ: R2866_1220(ligA)
HIK: HifGL_001437(ligB)
HIA: H733_1273
HIW: NTHI477_00555(ligA_1)
HIC: NTHIC486_01562(ligA_1)
HIX: NTHI723_00464(ligA_1)
HSO: HS_1324(ligA)
HSM: HSM_0291
PDAG: 4362423_00908(ligA_1)
MSU: MS0939(cDC9)
MHT: D648_5040
MHAT: B824_21720
MHAE: F382_10365
MHAM: J450_09290
MHAO: J451_10585
MHAL: N220_02460
MHAQ: WC39_11390
MHAY: VK67_11395
MVI: X808_3700
MVG: X874_3790
ASU: Asuc_1188
AAT: D11S_1722
AAN: D7S_02189
AACN: AANUM_2139
BTO: WQG_15920
BTRE: F542_6140
BTRH: F543_7320
BTRA: F544_16300
XCC: XCC1290(lig2)
XCB: XC_2951
XCP: XCR_1545
XCV: XCV1394
XAX: XACM_1324
XAC: XAC1341(lig2)
XCI: XCAW_03007(cDC9)
XOO: XOO1875(lig2)
XOM: XOO1771(XOO1771)
XOP: PXO_01736
XOR: XOC_3163
XPH: XppCFBP6546_04730(XppCFBP6546P_04730)
SML: Smlt3530(ligB)
SMT: Smal_2960
SMZ: SMD_3111(ligC)
SACZ: AOT14_16160(ligA_1)
LEZ: GLE_2471(lig)
LEM: LEN_2441(ligB)
VCH: VC1542
VCS: MS6_1327
VCI: O3Y_07490
VCO: VC0395_A1148(ligA-2)
VCR: VC395_1659(ligA-2)
VCM: VCM66_1483(ligA-2)
VVU: VV1_2657
VVY: VV1634
VPA: VP1477
VPB: VPBB_1385
VAG: N646_0534
VSP: VS_1518
VAN: VAA_1806
VSC: VSVS12_01765(lig1)
VTA: A0709
VFI: VF_1450
PPR: PBPRB1093(NMB2048)
PMY: Pmen_2195
PMK: MDS_2516
PPU: PP_1105
PPF: Pput_1145
PPT: PPS_4150
PPI: YSA_07288
PPX: T1E_1846
PPUH: B479_20800
PPUT: L483_25935
PPUN: PP4_10490
PPUD: DW66_4541
PMON: X969_20415
PMOT: X970_20050
PSB: Psyr_3873
PSYR: N018_06150
PFS: PFLU_1312
PFE: PSF113_1226(ligC)
PFB: VO64_4474
PMAN: OU5_2202
PSA: PST_2662
PSTT: CH92_14500
PSES: PSCI_0468
PANR: A7J50_1449
PSIL: PMA3_05180
ABAZ: P795_18285
SON: SO_2204
SFR: Sfri_1484
SAZ: Sama_1995
SBL: Sbal_1852
SLO: Shew_1587
SSE: Ssed_2639
SPL: Spea_2511
SHL: Shal_1741
SWD: Swoo_1990
SWP: swp_3085
SVO: SVI_2562
SPSW: Sps_01379
ILO: IL2054
CPS: CPS_4404(lig)
PHA: PSHAa2177
PAT: Patl_0073
PSM: PSM_A0958
PSEO: OM33_08050
PTN: PTRA_a2633(lig)
PEA: PESP_a1136(lig)
PSPO: PSPO_a1114(lig)
PART: PARC_a2902(lig)
PTU: PTUN_a1223(lig)
PNG: PNIG_a2829(lig)
PTD: PTET_a1085(lig)
PSEN: PNC201_14030(ligA1)
MAQ: Maqu_3695
MHC: MARHY3604
MAD: HP15_3457
MBS: MRBBS_3653(ligA)
AMAG: I533_17565
AAUS: EP12_18220
GPS: C427_4336
PIN: Ping_1157
FBL: Fbal_0615
LHA: LHA_1491
MAH: MEALZ_3867(ligA)
TCX: Tcr_1672
MEJ: Q7A_922
MEC: Q7C_2001
CYQ: Q91_2135
GAI: IMCC3135_11340(ligB)
ABO: ABO_2702(ligA)
ADI: B5T_02945
APAC: S7S_18135
AXE: P40_13655
TOL: TOL_1024
OCE: GU3_12250
SVA: SVA_1045
NME: NMB2048(ligA-2)
NMP: NMBB_2353(ligA-2)
NMA: NMA0388
NMW: NMAA_0107
NMX: NMA510612_0412(ligA-2)
NMC: NMC2028
NMN: NMCC_0138
NMT: NMV_2251
NMI: NMO_0120
NGO: NGO2034
NGK: NGK_2202
NLA: NLA_2770
NWE: SAMEA3174300_1988(ligA_2)
ECOR: SAMEA4412678_1248(ligA_2)
CNC: CNE_2c18520(lig2)
CGD: CR3_4205
BUT: X994_1381(a544R)
BTD: BTI_1584
BGU: KS03_5192
BGO: BM43_2328
BUL: BW21_2439
BXE: Bxe_B1315
BXB: DR64_6622
BPH: Bphy_4680
BFN: OI25_6363
ODI: ODI_R3551
RFR: Rfer_1436
POL: Bpro_2416
PNA: Pnap_2019
AAV: Aave_0375
AAA: Acav_0445
VEI: Veis_3497
DAC: Daci_3044
CTES: O987_11160
RTA: Rta_31080
LIH: L63ED372_02388(ligA_3)
HAR: HEAR1727
JAG: GJA_3648
CFU: CFU_3225
LCH: Lcho_2712
THI: THI_2564
RGE: RGE_11090 RGE_32640(dnaL)
TBD: Tbd_0812
MEH: M301_2402
EBA: ebA7094(dnaL)
DSU: Dsui_2466
DAR: Daro_1235
AZO: azo0444(lig2) azo3130(dnaL)
TCL: Tchl_0096
HCP: HCN_1808
CJE: Cj1669c
CJU: C8J_1570
CJI: CJSA_1580
CJM: CJM1_1615(ligA-2)
CJS: CJS3_1751
CJEJ: N564_01664
CJEU: N565_01697
CJEN: N755_01698
CJEI: N135_01758
CJER: H730_09665
CJV: MTVDSCj20_1634(lig)
CJY: QZ67_01804(ligA_2)
CJQ: UC78_1607(ligA_2)
CJR: CJE1841
CFV: CFVI03293_1433(lig)
CFX: CFV97608_1533(lig)
CFZ: CSG_15330
CAMP: CFT03427_1358(lig)
CCV: CCV52592_1225(lig)
CCOC: CCON33237_1477(lig)
CLA: Cla_0036
CLR: UPTC16701_0044(lig)
CLM: UPTC16712_0045(lig)
CLQ: UPTC4110_0036(lig)
CLN: UPTC3659_0051(lig)
CLL: CONCH_0033(lig)
CCQ: N149_1623
CCF: YSQ_09555
CCY: YSS_09505
CCOI: YSU_08465
CCOF: VC76_08295(ligA_2)
CCOO: ATE51_04284(ligA_2)
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BAZ: BAMTA208_06575(ligB)
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SHU: SHYC_05295(lig)
PPO: PPM_2737(ligB3) PPM_p0233(ligB)
PPOY: RE92_25010
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DRM: Dred_2002
SAY: TPY_1569(lig)
MTA: Moth_1488
TACI: TDSAC_0254
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MTC: MT3148
MRA: MRA_3094(ligB)
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MTO: MTCTRI2_3125(ligB)
MTD: UDA_3062(ligB)
MTN: ERDMAN_3352(ligB)
MTJ: J112_16400(ligB)
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MTUE: J114_16375(ligB)
MTX: M943_15800(ligB)
MTUL: TBHG_02992
MTUT: HKBT1_3217(ligB)
MTUU: HKBT2_3222(ligB)
MTQ: HKBS1_3228(ligB)
MBO: BQ2027_MB3089(ligB)
MBB: BCG_3087(ligB)
MBT: JTY_3082(ligB)
MBM: BCGMEX_3084(ligB)
MBX: BCGT_2911
MBZ: LH58_16295(ligB)
MAF: MAF_30690(ligB)
MCE: MCAN_30871(ligB)
MCQ: BN44_60575(ligB)
MCV: BN43_60050(ligB)
MCX: BN42_41075(ligB)
MCZ: BN45_60050(ligB)
MMIC: RN08_3373
MPA: MAP_3117(ligB)
MAO: MAP4_0680
MAVI: RC58_03320(ligB)
MAVU: RE97_03325(ligB)
MAV: MAV_3937
MAVR: LA63_18160(ligB)
MIT: OCO_37620
MIA: OCU_37710
MIE: LG41_17870(ligB)
MID: MIP_05705
MYO: OEM_38270
MIR: OCQ_38860
MUL: MUL_3413(ligB)
MMC: Mmcs_1799
MKM: Mkms_1846
MJL: Mjls_1780
MMI: MMAR_1623(ligB)
MMAE: MMARE11_15440(ligB)
MMM: W7S_18845(ligB)
MLI: MULP_01773(ligB)
MKN: MKAN_23085(ligB)
MKS: LG40_22840(ligB)
MKI: LH54_22970(ligB)
MYV: G155_10930(ligB)
MYE: AB431_09720(ligB)
MHAD: B586_16010(ligB)
MYN: MyAD_09935(ligB)
MVA: Mvan_2025
MGI: Mflv_4321
MNE: D174_10145(ligB)
MGO: AFA91_28135(ligB)
MVQ: MYVA_1923(ligB)
ASD: AS9A_2748(ligB)
NFA: NFA_52520
NCY: NOCYR_5058(ligB)
NBR: O3I_039425(ligB)
NNO: NONO_c71200(lig)
NSR: NS506_00230(lig1)
ROP: ROP_13440(ligB)
RPY: Y013_00820(ligB)
RHB: NY08_193
RFA: A3L23_03226(ligB)
RHS: A3Q41_00106(ligB)
RHU: A3Q40_01878(ligB)
GBR: Gbro_0096
GPO: GPOL_c02790(lig)
GOR: KTR9_0084
TPR: Tpau_3810
SCO: SCO1202(ligB)
SMA: SAVERM_7136(ligB)
SGR: SGR_6320
SGB: WQO_04010(ligB)
SCT: SCAT_0666(lig)
SFA: Sfla_5642
SBH: SBI_05488(ligB)
SHY: SHJG_2641
SVE: SVEN_7275
SDV: BN159_7383(lig)
SALS: SLNWT_7268
STRP: F750_0958
SFI: SFUL_761
SCI: B446_06290(ligB)
SALU: DC74_1777
SALL: SAZ_09465
SLV: SLIV_31785(lig)
SGU: SGLAU_04800(lig)
SVT: SVTN_38010(ligB)
STRE: GZL_07362
SCW: TU94_04740(ligB)
SLD: T261_6975
STRM: M444_30905(ligB)
STRC: AA958_32405(ligB)
SAMB: SAM23877_1283(lig)
SPRI: SPRI_1282
SCZ: ABE83_31780(ligB)
SCX: AS200_37710(ligB)
STRF: ASR50_05830(ligB)
SLE: sle_58930(sle_58930)
SPAV: Spa2297_04340(ligB)
STRT: A8713_03985(ligB)
SGS: AVL59_31480(ligB)
STSI: A4E84_05910(ligB)
SNR: SNOUR_33865(lig)
STRD: NI25_33240(ligB)
SSIA: A7J05_03365(ligB)
SMAL: SMALA_3993
SLAU: SLA_7283
SALJ: SMD11_5663
MTS: MTES_2901
ACH: Achl_2592
BCV: Bcav_0272
LMOI: VV02_16105
XCE: Xcel_2642
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CFI: Celf_1767
SERJ: SGUI_1778
MPH: MLP_11790(lig)
NCA: Noca_2845
NDK: I601_3524
KFL: Kfla_3406
PSIM: KR76_12095
MGG: MPLG2_2855(lig)
SRO: Sros_7176
NML: Namu_4586
GOB: Gobs_2344
BSD: BLASA_2878(ligB2)
MMAR: MODMU_2283(ligB)
KRA: Krad_4316
SEN: SACE_0911
AMD: AMED_8064(lig)
AMN: RAM_41435(ligB)
AMM: AMES_7943(lig)
AMZ: B737_7944(lig)
AOI: AORI_6888(lig)
AJA: AJAP_04660(dnlI)
AMQ: AMETH_5862(lig)
PDX: Psed_0956
PSEA: WY02_20970
PSEE: FRP1_22360
PSEH: XF36_20600
AMI: Amir_0719
SESP: BN6_08010
KAL: KALB_884
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MIL: ML5_3329
VMA: VAB18032_28881(ligB)
ASE: ACPL_1298(ligB)
ACTN: L083_1429(ligB)
AFS: AFR_07325(ligB)
ACTS: ACWT_1179
PLAT: C6W10_35330(ligB)
CAI: Caci_1425
TBI: Tbis_2438
SYW: SYNW1321
SYG: sync_1438
SYR: SynRCC307_1018(lig)
SYX: SynWH7803_1194(lig)
SYNR: KR49_01665
SYND: KR52_09110
CYI: CBM981_0345(dnlI)
LET: O77CONTIG1_00296(ykoU)
HHG: XM38_042650(lig)
PMM: PMM0729 PMM1679(lig)
RCA: Rcas_3449
TTR: Tter_1400
PCU: pc0950(lig)
PNL: PNK_1809(lig2)
OTE: Oter_3148
RBA: RB1571(dnlI)
PLM: Plim_3135
GES: VT84_00445(ligA_2)
IPA: Isop_2715
SACI: Sinac_3390
ACA: ACP_2652
SUS: Acid_3563
ABAC: LuPra_00403(ykoU_1)
GAU: GAU_3403(lig)
GBA: J421_1279
CPI: Cpin_6857
FLN: FLA_0565
PHE: Phep_2562
MUC: MuYL_0816
CHU: CHU_3524
DFE: Dfer_3334
GFO: GFO_3524(lig)
GFL: GRFL_1685
FJO: Fjoh_1755
FJG: BB050_03601(ykoU)
ZPR: ZPR_0472
MARM: YQ22_10045
CBAL: M667_06745
CBAT: M666_06765
DDO: I597_0476
ZGA: ZOBELLIA_2113(ligC)
MLT: VC82_1667
NDO: DDD_1789(lig)
CHZ: CHSO_2564(lig)
FBA: FIC_01805
AAE: aq_1394(lig)
HTH: HTH_1466(lig)
TAL: Thal_0274
DTU: Dtur_0780
NMV: NITMOv2_4114(lig)
NJA: NSJP_3320(lig)
LFC: LFE_0739
MJA: MJ_0171
MMP: MMP0970(lig)
MMD: GYY_05675
MAE: Maeo_0864
MVO: Mvol_0195
MAC: MA_0728(lig) MA_2571(lig)
METM: MSMTP_0783
MBU: Mbur_1088(dnl1)
MMET: MCMEM_1588
MPY: Mpsy_0817
MCJ: MCON_0798(ligA) MCON_1559(ligB) MCON_3253(ligD)
MHU: Mhun_2882
MLA: Mlab_0620
MBG: BN140_0526(lig1) BN140_0625(lig3)
MEMA: MMAB1_0658(lig) MMAB1_0810(lig)
MPI: Mpet_2400
MBN: Mboo_2156
MPL: Mpal_2781
MPD: MCP_0613(lig)
MEZ: Mtc_2230(lig1)
RCI: RRC227(lig)
MTH: MTH_1580
MMG: MTBMA_c01660(lig)
METC: MTCT_1436
MWO: MWSIV6_0125(dnl1)
METE: tca_01529(ligB)
MST: Msp_0258(lig)
MSI: Msm_0645
MRU: mru_0445(dnll)
MEB: Abm4_0234(dnlI)
MMIL: sm9_0326(dnlI)
MEYE: TL18_01390
MOL: YLM1_0121
MFC: BRM9_1588(ligD) BRM9_2137(dnl1)
MCUB: MCBB_0172(lig)
MFV: Mfer_0505
MKA: MK0999(cdc9)
AFU: AF_0623
FPL: Ferp_0025
GAC: GACE_1561
GAH: GAH_00141
HAL: VNG_0881G(lig)
HSL: OE_2298F(ligB)
HHB: Hhub_2028(ligB)
HALH: HTSR_1516
HHSR: HSR6_1587(ligB)
HSU: HLASF_1504(lig)
HSF: HLASA_1491(lig)
HMA: rrnAC0463(ligA)
HHI: HAH_1173(lig2)
NPH: NP_3474A(ligB)
NMO: Nmlp_2867(ligB)
HMU: Hmuk_2723
HWA: HQ_2327A(ligB1) HQ_2659A(ligB2)
HWC: Hqrw_2571(ligB1) Hqrw_2987(ligB2)
HVO: HVO_1565(ligA)
HME: HFX_1625(lig)
HLA: Hlac_0878
HTU: Htur_1898
NMG: Nmag_0608(ligB)
NAT: NJ7G_0768
SALI: L593_00175
TAC: Ta1148
TVO: TVG1298537(TVG1298537)
PTO: PTO0672
FAI: FAD_1498(ligB)
CDIV: CPM_0455
MEAR: Mpt1_c07340(lig)
MARC: AR505_1277
PHO: PH1622(PH1622)
PAB: PAB2002
PFU: PF1635
PFI: PFC_10430
PYN: PNA2_0205
PYS: Py04_1516
TKO: TK2140
TON: TON_1515
TGA: TGAM_1718(lig)
TSI: TSIB_0885
THE: GQS_07890
THA: TAM4_1751
THM: CL1_1197
TLT: OCC_10130
THS: TES1_1910
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TEU: TEU_01440
PPAC: PAP_00300
ABI: Aboo_0814
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IHO: Igni_0942
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DKA: DKAM_0279
TAG: Tagg_0212
IAG: Igag_0246
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SOL: Ssol_1170
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SSOF: SULC_1205
SAI: Saci_0788
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SII: LD85_2205
SIH: SiH_1890
SIR: SiRe_1818
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MCN: Mcup_1923
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PIS: Pisl_1115
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LOKI: Lokiarch_12970(lig)
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Taxonomy
Reference
1  [PMID:15251207]
  Authors
Rolland JL, Gueguen Y, Persillon C, Masson JM, Dietrich J
  Title
Characterization of a thermophilic DNA ligase from the archaeon Thermococcus fumicolans.
  Journal
FEMS Microbiol Lett 236:267-73 (2004)
DOI:10.1016/j.femsle.2004.05.045
  Sequence
Reference
2  [PMID:16614906]
  Authors
Kim YJ, Lee HS, Bae SS, Jeon JH, Yang SH, Lim JK, Kang SG, Kwon ST, Lee JH
  Title
Cloning, expression, and characterization of a DNA ligase from a hyperthermophilic archaeon Thermococcus sp.
  Journal
Biotechnol Lett 28:401-7 (2006)
DOI:10.1007/s10529-005-6070-6
  Sequence
[ton:TON_1515]
Other DBs
ExplorEnz - The Enzyme Database: 6.5.1.6
IUBMB Enzyme Nomenclature: 6.5.1.6
ExPASy - ENZYME nomenclature database: 6.5.1.6
BRENDA, the Enzyme Database: 6.5.1.6

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