KEGG   Entamoeba histolytica: EHI_160720
Entry
EHI_160720        CDS       T00238                                 
Symbol
346.t00005
Name
(RefSeq) exosome complex exonuclease
  KO
K12585  exosome complex exonuclease DIS3/RRP44 [EC:3.1.13.-]
Organism
ehi  Entamoeba histolytica
Pathway
ehi03018  RNA degradation
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:ehi00001]
 09120 Genetic Information Processing
  09123 Folding, sorting and degradation
   03018 RNA degradation
    EHI_160720 (346.t00005)
 09180 Brite Hierarchies
  09182 Protein families: genetic information processing
   03019 Messenger RNA biogenesis [BR:ehi03019]
    EHI_160720 (346.t00005)
Messenger RNA biogenesis [BR:ehi03019]
 Eukaryotic type
  mRNA degradation factors
   3'-5' decay
    Exosome cofactors
     EHI_160720 (346.t00005)
SSDB
Motif
Pfam: RNB OB_Dis3 Rrp44_CSD1 Rrp44_S1 CSD2 IPK
Other DBs
NCBI-GeneID: 3403363
NCBI-ProteinID: XP_649075
UniProt: C4MAJ9
AA seq 901 aa
MECVNEVKYVVKGKSRCEKIVRQHYLRDDIACGLRKCATCNQTNLPLIGKTQYAMFDHTV
LLNQIDALQTESLTDFIIPQTALNYVANNSKSIYKKVRNIIANEDRAVFLFLNEFFRETY
IIAQNEESNIHRDFRAYVTSVNWLNKHYSLNGSSVLFVTNSKELKEDYINAGIHAMTFID
FVEQYYPNDTTLRDRITDTITSQGTTVFYPNHLTKEEITRLISEKKLVQGSVRMNRFNFK
EATVYTTEKEEILVSGLEDINRAVEGDIVALQLLPKDQWKKESHTINNDYEKNEKEINNT
VHMDNAMEVEGKPTGKIVGIIKRNWKPLPGYIKQESSGSYSTNLLFLPTDKRFPPIRIKA
RDPAKLASQRILVLIDAWDTTSKYPTGHYVATLGNVGDKASETEAILELHEIPHYEFPEI
VLKCLPVLPFEITEDYLKGRRDFRKENVCSIDPPGCTDIDDALHCKILPNGNYEIGVHIA
DVSCFVKPHTALDEEAAKRGTTVYLADRRIDMLPKPLTEVICSITQNTDTLTFSVVWELD
KDANVINCTYHKGIVHSYRAYAYGQAQSVIDDKSNQSEYAQQLRAMLMLSKKLKQKRIDA
GALMLASSEIKIEKDEQFNPIGVKEYQTYETNSMVEEYMLLANVWVAKKIYDAFPHCAML
RRHPPPDEHTFEWLANVLKHKGKSLDFSSSKALSESLDKCGTNEDPIIGKIMRILVTRCM
QQAKYFSSGYFSYNEFRHYGLAAEIYTHFTSPIRRYADVMVHRLLAQAIGFDQIDLTMSK
EKMKEIADNINHRHTMAQHAGRASTQMYTLIFLKDKEVAVDGYVIKVMKNGIIINIPQYG
LEVIVLIDQKYGMVFDENENTLGNMNIKFGIFDKVKGILSIDKSNEFQLKPVLKLTQPHL
E
NT seq 2706 nt   +upstreamnt  +downstreamnt
atggaatgtgtaaatgaagtaaaatatgttgtgaaaggaaaatcacgatgtgaaaagatt
gtaaggcaacactacttaagagatgacattgcttgtggtttaagaaaatgtgctacttgc
aaccaaacaaatttaccattaattggaaaaacacaatacgctatgtttgatcatacagta
ttacttaatcaaattgatgcactacaaacagaaagtttaacagattttattattcctcaa
actgcattaaattatgttgcaaacaattcaaagtccatttataaaaaggtgagaaatatt
attgcaaatgaagaccgtgctgtatttttatttttaaatgaattttttagagagacttat
atcattgcacaaaatgaagaatcaaatattcatagagattttagagcttatgttacatct
gtaaattggttaaataaacattattcattaaatggttcatctgtattatttgttactaat
tccaaagaattaaaagaagattatattaatgcaggaatacatgcaatgacattcattgat
tttgttgaacaatattacccaaacgatactacattacgtgatagaattactgatactatt
acatcacaaggaacaacagtattttatcctaatcatctaacaaaagaagaaataactcgt
ttaatttctgagaaaaaattagtccaaggaagtgttagaatgaatagattcaacttcaaa
gaagcaactgtttataccacagaaaaggaagaaattctagttagtggattggaagatatt
aatcgagctgtcgaaggagatattgttgcattacaactacttcctaaagaccaatggaaa
aaagagtcacatactattaataatgattatgaaaagaatgaaaaagaaataaacaacact
gttcacatggataatgcaatggaagtagaaggaaaacctactggaaaaatagttggtatt
attaaaagaaattggaaacctttacctggttatattaaacaagaaagtagtggtagttat
tctactaatttattattccttccaacagataaaaggttcccaccaattagaattaaagct
agagaccctgctaaattagcttctcaacgaattcttgttttaattgatgcatgggataca
acatcaaaatatccaacaggtcattatgttgcaacattaggtaatgtaggagataaagca
agtgaaacagaagctattttagaacttcatgaaattccccattatgaatttcctgaaatt
gtacttaaatgtcttccagtattaccatttgaaattactgaagattaccttaaagggaga
cgtgattttagaaaagaaaatgtttgttcaattgatccaccaggatgtactgatattgat
gatgccttacattgtaaaattcttcctaatggcaattatgaaattggagttcatattgct
gatgtatcatgttttgttaaaccccatacagcattagatgaagaagctgctaaacgagga
acaaccgtttatttagctgatagaagaattgatatgttaccaaaaccattaaccgaagtt
atttgttcaattacacaaaatactgatacactaacattctctgttgtttgggaattagat
aaagatgctaatgttattaattgtacatatcataaaggaattgttcattcatatagagca
tatgcatatggacaagcacagtcagtaattgatgataagagtaatcaaagtgaatatgct
caacaattacgtgcaatgttaatgttatctaaaaaattaaaacaaaaaagaattgatgca
ggagcattaatgttggcttcaagtgaaattaaaattgaaaaagatgaacaatttaatcca
attggagttaaagaatatcaaacatatgaaaccaattcaatggttgaagaatatatgctt
cttgctaatgtatgggtagctaaaaaaatctatgacgcatttcctcattgtgctatgtta
agaagacatccaccaccagatgaacatacttttgaatggttagcaaatgtattaaaacat
aaaggaaagtcattagatttttctagttctaaagcactttcagaatcattggataaatgt
ggaactaatgaagaccctattattggaaagattatgagaatattagtaacacgttgtatg
caacaagcaaaatacttctctagtggatatttttcttataatgaatttagacattatggt
cttgcagctgaaatttatactcattttacttcaccaattagaagatatgcagatgtaatg
gtacatcgattacttgcacaagcaattggatttgaccaaatagatttaactatgtcaaaa
gaaaaaatgaaagaaatagctgataatattaatcatagacatacaatggcacaacatgct
ggaagagcatcaactcaaatgtatacattaatattcctcaaagataaagaagttgctgtt
gatggttatgtaattaaagttatgaagaatggtattataattaatattccacaatatgga
ttagaagtaattgtattaattgatcaaaaatatggaatggtatttgacgaaaatgaaaat
acacttggtaacatgaatattaaatttggaatatttgataaagtaaaaggaatattaagt
attgacaagagtaatgaattccaattgaaaccagttttaaaattgacacaacctcatttg
gaataa

DBGET integrated database retrieval system