KEGG   ENZYME: 1.14.99.46Help
Entry
EC 1.14.99.46               Enzyme                                 

Name
pyrimidine oxygenase;
RutA
Class
Oxidoreductases;
Acting on paired donors, with incorporation or reduction of molecular oxygen;
Miscellaneous
BRITE hierarchy
Sysname
uracil,FMNH2:oxygen oxidoreductase (uracil hydroxylating, ring-opening)
Reaction(IUBMB)
(1) uracil + FMNH2 + O2 = (Z)-3-ureidoacrylate peracid + FMN [RN:R09936];
(2) thymine + FMNH2 + O2 = (Z)-2-methylureidoacrylate peracid + FMN [RN:R09937]
Reaction(KEGG)
Substrate
uracil [CPD:C00106];
FMNH2 [CPD:C01847];
O2 [CPD:C00007];
thymine [CPD:C00178]
Product
(Z)-3-ureidoacrylate peracid [CPD:C20231];
FMN [CPD:C00061];
(Z)-2-methylureidoacrylate peracid [CPD:C20232]
Comment
In vitro the product (Z)-3-ureidoacrylate peracid is spontaneously reduced to ureidoacrylate [1,2]. Part of the Rut pyrimidine catabolic pathway.
History
EC 1.14.99.46 created 2012
Pathway
ec00240  Pyrimidine metabolism
ec01100  Metabolic pathways
Orthology
K09018  pyrimidine oxygenase
Genes
ECO: b1012(rutA)
ECJ: JW0997(ycdM)
ECD: ECDH10B_1084(rutA)
EBW: BWG_0866(rutA)
ECOK: ECMDS42_0857(ycdM)
ECE: Z1511
ECS: ECs1258
ECF: ECH74115_1249
ETW: ECSP_1181
ELX: CDCO157_1203
EOJ: ECO26_1250(ycdM)
EOI: ECO111_1201(ycdM)
EOH: ECO103_1058(ycdM)
ECOO: ECRM13514_1189(rutA)
ECOH: ECRM13516_1118(rutA)
ECG: E2348C_1063(rutA)
EOK: G2583_1245(rutA)
ESO: O3O_09370
ESM: O3M_15900
ESL: O3K_15925
ELH: ETEC_1081
ECC: c1149
ECP: ECP_1011
ECI: UTI89_C1075(ycdM)
ECV: APECO1_103(ycdM)
ECY: ECSE_1074
ECR: ECIAI1_1057(rutA)
ECQ: ECED1_1168(rutA)
ECK: EC55989_1123(rutA)
ECT: ECIAI39_2143(rutA)
EOC: CE10_1090(rutA)
EUM: ECUMN_1195(rutA)
ECZ: ECS88_1028(rutA)
ELO: EC042_1087(rutA)
ESE: ECSF_0918
EBR: ECB_01015(ycdM)
EBD: ECBD_2582
EKF: KO11_17660(rutA)
EAB: ECABU_c10390(rutA)
EDJ: ECDH1ME8569_0966(rutA)
ELW: ECW_m1122(rutA)
ELL: WFL_05475(rutA)
ELC: i14_1049
ELD: i02_1049
ELP: P12B_c0997(ycdM)
EBL: ECD_01015(rutA)
EBE: B21_01022(rutA)
ELF: LF82_2049(rutA)
ECOI: ECOPMV1_01034(rutA)
ECOJ: P423_05500
ECOS: EC958_1209(ycdM)
SFL: SF1015
SFX: S1085
SFV: SFV_1024
SFE: SFxv_1101(rutA)
SFN: SFy_1390
SFS: SFyv_1433
SFT: NCTC1_01054(rutA)
SBO: SBO_2045
SDY: SDY_0987
ENC: ECL_02622(rutA)
EEC: EcWSU1_01610(rutA)
ECLX: LI66_07890
ECLY: LI62_08680
ECLZ: LI64_08215
ENF: AKI40_2539(rutA)
ESA: ESA_02361
CSK: ES15_2461(rutA)
CTU: CTU_15930(rutA)
KPN: KPN_01038(ycdM)
KPU: KP1_2027(ycdM)
KPP: A79E_3194
KPT: VK055_1439(rutA)
KPE: KPK_3520
KPR: KPR_3485(rutA)
KPJ: N559_3248
KPX: PMK1_03378(rutA)
KPNU: LI86_16880
KPNK: BN49_2127(rutA)
KVA: Kvar_3341
KOX: KOX_17000
KOE: A225_2250
EAE: EAE_16035
EAR: CCG30700
KQV: B8P98_18060(rutA)
RAO: DSD31_16095(rutA)
LEI: C2U54_13140(rutA)
LEH: C3F35_03165(rutA)
LNI: CWR52_04065(rutA)
LEW: DAI21_18780(rutA)
EBC: C2U52_26760(rutA)
PSTS: E05_37920
YEN: YE1950(ssuD)
YEY: Y11_13681
YEW: CH47_1382(rutA)
YET: CH48_3374(rutA)
YEE: YE5303_22861(ssuD)
YMA: DA391_09485(rutA)
SPE: Spro_1823
SRL: SOD_c16480(rutA)
SPLY: Q5A_009030(rutA)
RAA: Q7S_15215
EBI: EbC_11600 EbC_15660(rutA)
EGE: EM595_1350(rutA)
PAM: PANA_4033(ycdM)
PLF: PANA5342_p10174(rutA1) PANA5342_p10175(rutA3)
PAJ: PAJ_p0253(ycdM)
PAQ: PAGR_p120
PVA: Pvag_0805(ycdM)
PAGG: AL522_11305(rutA)
PSTW: DSJ_25275
PGZ: C2E15_07960(rutA)
PCD: C2E16_07865(rutA)
PLU: plu3815
PAY: PAU_00991
XBO: XBJ1_1586
XBV: XBW1_0887
PSB: Psyr_0999
PSYR: N018_20685
PAMG: BKM19_007705(rutA)
PAVL: BKM03_06650(rutA)
PSA: PST_3597
PSTT: CH92_21415
PSES: PSCI_0304
ACC: BDGL_002277(rutA)
ACI: ACIAD0027
ASJ: AsACE_CH00966(rutA)
AMAL: I607_16325
AMAE: I876_16630
AMAO: I634_16580
AMAD: I636_16515
AMAI: I635_17260
AMAG: I533_16145
AMAC: MASE_16140
AAUS: EP12_19150
GPS: C427_0832
PLG: NCTC10937_03397(rutA)
VPD: VAPA_1c50080(rutA)
VAM: C4F17_21770(rutA)
HOH: Hoch_3938
PLA: Plav_0991
ATU: Atu2500(rutA)
ARA: Arad_7073
ATF: Ach5_23700(rutA)
AVI: Avi_7126
AGR: AGROH133_08499(rutA)
AGC: BSY240_839(rutA)
ARO: B0909_00430(rutA)
RIR: BN877_I2581(rutA)
BBT: BBta_1128(ycdM)
MEX: Mext_1738
MDI: METDI2412
MCH: Mchl_2057
MPO: Mpop_1075
MOR: MOC_1964(rutA)
META: Y590_08280
MEE: DA075_20040(rutA)
DEI: C4375_16505(rutA) C4375_16510(rutA) C4375_16515(rutA) C4375_16520(rutA)
KVU: EIO_1827
KVL: KVU_1293 KVU_1872(rutA)
KRO: BVG79_02009(rutA)
CID: P73_1975
YPAC: CEW88_14425(rutA)
LVS: LOKVESSMR4R_02448(rutA)
HNE: HNE_1252
HBA: Hbal_2538
SWI: Swit_4216
SPHD: HY78_20735
SPHR: BSY17_3628(rutA)
SFLA: SPHFLASMR4Y_01888(rutA)
AAY: WYH_00064(rutA)
ROS: CTJ15_11265(rutA) CTJ15_21285(rutA)
NCB: C0V82_24835(rutA)
MTHN: 4412656_02908(rutA_4)
RRZ: CS378_24480(rutA)
RRT: 4535765_00373(rutA_2)
NDA: Ndas_4506
KRA: Krad_3110
PSEA: WY02_01035
PSEE: FRP1_17015
AMI: Amir_2625
ACTN: L083_3836
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Taxonomy
Reference
1  [PMID:20369853]
  Authors
Mukherjee T, Zhang Y, Abdelwahed S, Ealick SE, Begley TP
  Title
Catalysis of a flavoenzyme-mediated amide hydrolysis.
  Journal
J Am Chem Soc 132:5550-1 (2010)
DOI:10.1021/ja9107676
  Sequence
[eco:b1012]
Reference
2  [PMID:20400551]
  Authors
Kim KS, Pelton JG, Inwood WB, Andersen U, Kustu S, Wemmer DE
  Title
The Rut pathway for pyrimidine degradation: novel chemistry and toxicity problems.
  Journal
J Bacteriol 192:4089-102 (2010)
DOI:10.1128/JB.00201-10
  Sequence
[eco:b1012]
Other DBs
ExplorEnz - The Enzyme Database: 1.14.99.46
IUBMB Enzyme Nomenclature: 1.14.99.46
ExPASy - ENZYME nomenclature database: 1.14.99.46
BRENDA, the Enzyme Database: 1.14.99.46

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