KEGG   ENZYME: 1.3.5.3Help
Entry
EC 1.3.5.3                  Enzyme                                 

Name
protoporphyrinogen IX dehydrogenase (menaquinone);
HemG
Class
Oxidoreductases;
Acting on the CH-CH group of donors;
With a quinone or related compound as acceptor
BRITE hierarchy
Sysname
protoporphyrinogen IX:menaquinone oxidoreductase
Reaction(IUBMB)
protoporphyrinogen IX + 3 menaquinone = protoporphyrin IX + 3 menaquinol [RN:R09489]
Reaction(KEGG)
Substrate
protoporphyrinogen IX [CPD:C01079];
menaquinone [CPD:C00828]
Product
protoporphyrin IX [CPD:C02191];
menaquinol [CPD:C05819]
Comment
This enzyme enables Escherichia coli to synthesize heme in both aerobic and anaerobic environments.
History
EC 1.3.5.3 created 2010
Pathway
ec00860  Porphyrin and chlorophyll metabolism
ec01100  Metabolic pathways
ec01110  Biosynthesis of secondary metabolites
Orthology
K00230  menaquinone-dependent protoporphyrinogen oxidase
Genes
LMA: LMJF_06_1280
LIF: LINJ_06_1340
LDO: LDBPK_061340
LMI: LMXM_06_1280
LBZ: LBRM_06_1270
ECO: b3850(hemG)
ECJ: JW3827(hemG)
ECD: ECDH10B_4039(hemG)
EBW: BWG_3526(hemG)
ECOK: ECMDS42_3288(hemG)
ECE: Z5372(hemG)
ECS: ECs4778(hemG)
ECF: ECH74115_5289(hemG)
ETW: ECSP_4903(hemG)
ELX: CDCO157_4516(hemG)
EOJ: ECO26_4737(hemG)
EOI: ECO111_4676(hemG)
EOH: ECO103_4315(hemG)
ECOO: ECRM13514_4921(hemG)
ECOH: ECRM13516_4701(hemG)
ECG: E2348C_4162(hemG)
EOK: G2583_4648(hemG)
ELR: ECO55CA74_22285(hemG)
ESO: O3O_00720(hemG)
ESM: O3M_24535(hemG)
ESL: O3K_24615(hemG)
ECW: EcE24377A_4369(hemG)
ELH: ETEC_4125
ECC: c4797(hemG)
ECP: ECP_4063
ECI: UTI89_C4435(hemG)
ECV: APECO1_2607(hemG)
ECX: EcHS_A4073(hemG)
ECM: EcSMS35_4231(hemG)
ECY: ECSE_4136
ECR: ECIAI1_4043(hemG)
ECQ: ECED1_4552(hemG)
ECK: EC55989_4325(hemG)
ECT: ECIAI39_3145(hemG)
EOC: CE10_4509(hemG)
EUM: ECUMN_4374(hemG)
ECZ: ECS88_4298(hemG)
ELO: EC042_4228(hemG)
ELN: NRG857_19220(hemG)
ESE: ECSF_3707
EBR: ECB_03741(hemG)
EBD: ECBD_4175
EKF: KO11_04260(hemG)
EAB: ECABU_c43520(hemG)
EDJ: ECDH1ME8569_3727(hemG)
EIH: ECOK1_4319(hemG)
ENA: ECNA114_4159(hemG)
ELU: UM146_19505(hemG)
ELW: ECW_m4150(hemG)
ELL: WFL_20250(hemG)
ELC: i14_4391(hemG)
ELD: i02_4391(hemG)
ELP: P12B_c3972(hemG)
EBL: ECD_03741(hemG)
EBE: B21_03690(hemG)
ELF: LF82_0981(hemG)
ECOL: LY180_19940(hemG)
ECOI: ECOPMV1_04208(hemG)
ECOJ: P423_21390(hemG)
ECOS: EC958_4330(hemG)
EFE: EFER_3631(hemG)
EAL: EAKF1_ch2094c(hemG)
STY: STY3573(hemG)
STT: t3311(hemG)
SENT: TY21A_16780(hemG)
STM: STM3987(hemG)
SEO: STM14_4793(hemG)
SEY: SL1344_3940(hemG)
SEM: STMDT12_C41370(hemG)
SEJ: STMUK_3971(hemG)
SEB: STM474_4165(hemG)
SEF: UMN798_4325(hemG)
SETU: STU288_20100(hemG)
SETC: CFSAN001921_20495(hemG)
SENR: STMDT2_38541(hemG)
SEND: DT104_40001(hemG)
SENI: CY43_20855(hemG)
SEEN: SE451236_00965(hemG)
SPT: SPA3827(hemG)
SEK: SSPA3564
SEI: SPC_4094(hemG)
SEC: SCH_3883(hemG)
SEH: SeHA_C4313(hemG)
SHB: SU5_095
SENH: CFSAN002069_12125(hemG)
SEEH: SEEH1578_06015(hemG)
SEE: SNSL254_A4266(hemG)
SEW: SeSA_A4194(hemG)
SEA: SeAg_B4217(hemG)
SENS: Q786_19545(hemG)
SED: SeD_A4373(hemG)
SEG: SG3465(hemG)
SEL: SPUL_3445(hemG)
SEGA: SPUCDC_3431(hemG)
SET: SEN3781(hemG)
SENA: AU38_19545(hemG)
SENO: AU37_19540(hemG)
SENV: AU39_19560(hemG)
SENQ: AU40_21810(hemG)
SENL: IY59_20015(hemG)
SENJ: CFSAN001992_13750(hemG)
SEEC: CFSAN002050_02815(hemG)
SEEB: SEEB0189_022410(hemG)
SEEP: I137_16495(hemG)
SENB: BN855_40580(hemG)
SENE: IA1_19375(hemG)
SENC: SEET0819_03770(hemG)
SBG: SBG_3518(hemG)
SBZ: A464_4041
SBV: N643_17615(hemG)
SFL: SF3926(hemG)
SFX: S3826(hemG)
SFV: SFV_3650(hemG)
SFE: SFxv_4279(hemG)
SFN: SFy_5602
SFS: SFyv_5665
SFT: NCTC1_04243(hemG)
SSN: SSON_4023(hemG)
SBO: SBO_3862(hemG)
SBC: SbBS512_E4320(hemG)
SDY: SDY_3895(hemG)
SHQ: A0259_00795(hemG)
ENC: ECL_04947
ENO: ECENHK_21110(hemG)
EEC: EcWSU1_04332(hemG)
ENL: A3UG_21930(hemG)
ECLE: ECNIH2_22490(hemG)
ECLN: ECNIH4_21650(hemG)
ECLI: ECNIH5_21010(hemG)
ECLX: LI66_21780(hemG)
ECLY: LI62_23800(hemG)
ECLZ: LI64_20895(hemG)
EHM: AB284_03040(hemG)
EXF: BFV63_21120(hemG)
ECLA: ECNIH3_21090(hemG)
ECLC: ECR091_21020(hemG)
EAU: DI57_19575(hemG)
EKB: BFV64_22390(hemG)
ELG: BH714_23320(hemG)
ERN: BFV67_21070(hemG)
ECLS: LI67_023270(hemG)
ENR: H650_16385(hemG)
ENX: NI40_021160(hemG)
ESA: ESA_03710
CSK: ES15_3641(hemG)
CSZ: CSSP291_17170(hemG)
CCON: AFK62_01585(hemG)
CDM: AFK67_01555(hemG)
CMJ: AFK66_018535(hemG)
CUI: AFK65_01495(hemG)
CMW: AFK63_17055(hemG)
CTU: CTU_02810(hemG)
KPN: KPN_04344(hemG)
KPU: KP1_0207(hemG)
KPP: A79E_4843
KPK: A593_11830(hemG)
KPH: KPNIH24_01010(hemG)
KPZ: KPNIH27_01035(hemG)
KPV: KPNIH29_00995(hemG)
KPW: KPNIH30_01030(hemG)
KPY: KPNIH31_01025(hemG)
KPG: KPNIH32_01035(hemG)
KPC: KPNIH10_01005(hemG)
KPQ: KPR0928_01010(hemG)
KPE: KPK_5329(hemG)
KPO: KPN2242_24720(hemG)
KPR: KPR_0293(hemG)
KPJ: N559_4944
KPI: D364_22130(hemG)
KPX: PMK1_01831(hemG)
KPB: FH42_18085(hemG)
KPNE: KU54_026190(hemG)
KPNU: LI86_25540(hemG)
KPNK: BN49_4495(hemG)
KVA: Kvar_4888
KVD: KR75_09255(hemG)
KVQ: SP68_15845(hemG)
KOX: KOX_07855(hemG)
KOE: A225_0220
KOY: J415_01890(hemG)
KOM: HR38_06460(hemG)
KMI: VW41_17660(hemG)
KOK: KONIH1_01325(hemG)
KOC: AB185_05890(hemG)
KQU: AVR78_05580(hemG)
EAE: EAE_08070(hemG)
EAR: CCG32386
KQV: B8P98_26515(hemG)
CKO: CKO_00193
CRO: ROD_39051(hemG)
CFD: CFNIH1_03615(hemG)
CYO: CD187_23500(hemG)
CAMA: F384_20850(hemG)
CFAR: CI104_24630(hemG)
HDE: HDEF_1765(hemG)
EBT: EBL_c37420(hemG)
ROR: RORB6_17660(hemG)
RON: TE10_03350(hemG)
RPLN: B1209_25820(hemG)
CNT: JT31_11400(hemG)
CEM: LH23_06305(hemG)
CEN: LH86_06235(hemG)
PGE: LG71_05260(hemG)
KLE: AO703_00950(hemG)
KSA: C813_14295(hemG)
KOR: AWR26_23935(hemG)
KRD: A3780_25830(hemG)
KCO: BWI95_22580(hemG)
KIN: AB182_23925(hemG)
LAX: APT61_01145(hemG)
LAZ: A8A57_20550(hemG)
DEN: MHIR_DE00542(hemG)
HED: TPER_HE00029(hemG)
GED: FVIR_GE00450(hemG)
EBF: D782_4305
PSTS: E05_20100
YPE: YPO3761(hemG)
YPK: y0469(hemG)
YPH: YPC_0480(hemG)
YPA: YPA_3430
YPN: YPN_0204
YPM: YP_3286(hemG)
YPG: YpAngola_A1916(hemG)
YPT: A1122_07045(hemG)
YPW: CH59_1694
YPJ: CH55_3256
YPV: BZ15_3956
YPL: CH46_1306
YPS: YPTB0271(hemG)
YPO: BZ17_2312
YPI: YpsIP31758_0287(hemG)
YPY: YPK_3929
YPB: YPTS_0287
YPQ: DJ40_2150(hemG)
YPU: BZ21_3628
YPR: BZ20_1853
YPC: BZ23_3900
YPF: BZ19_3731
YEN: YE0273(hemG)
YEY: Y11_34791
YEW: CH47_3213(hemG)
YET: CH48_1971
YEE: YE5303_42111(hemG)
YAL: AT01_2198
YFR: AW19_2932(hemG)
YIN: CH53_2075
YKR: CH54_2857
YRO: CH64_2863
YRU: BD65_1672
SPE: Spro_0266
SRL: SOD_c02170(hemG)
SPLY: Q5A_001215(hemG)
SSZ: SCc_013(hemG)
SMAF: D781_0232
SMW: SMWW4_v1c02680(hemG)
SMAR: SM39_4242(hemG)
SMAC: SMDB11_4363(hemG)
SERF: L085_05715(hemG)
SERS: SERRSCBI_01195(hemG)
RAA: Q7S_21060(hemG)
ECA: ECA0212(hemG)
PATR: EV46_01100
PATO: GZ59_02240(hemG)
PCT: PC1_4040
PEC: W5S_4399
SGL: SG0121
SOD: Sant_0261(hemG)
PES: SOPEG_3607(hemG)
DDD: Dda3937_02081(hemG)
DDQ: DDI_4529
ETA: ETA_02500(hemG)
EPY: EpC_02370(hemG)
EPR: EPYR_00247(hemG)
EAM: EAMY_0227(hemG)
EAY: EAM_0217(hemG)
EBI: EbC_02480(hemG)
ERJ: EJP617_14350(hemG)
EGE: EM595_3279(hemG)
WBR: hemG
WGL: WIGMOR_0133(hemG)
PAM: PANA_0205(hemG)
PLF: PANA5342_4222(hemG)
PAJ: PAJ_3365(hemG)
PVA: Pvag_3446(hemG)
PSTW: DSJ_21850
TPTY: NCTC11468_03458(hemG)
PLU: plu4398(hemG)
PAY: PAU_03869(hemG)
PMR: PMI3554(hemG)
PMIB: BB2000_3556(hemG)
XBO: XBJ1_0522(hemG)
XBV: XBW1_4061(hemG)
XNE: XNC1_3871(hemG)
XNM: XNC2_3725(hemG)
XDO: XDD1_3184(hemG)
XPO: XPG1_3059(hemG)
PSI: S70_07675
PSX: DR96_1638
PRG: RB151_005930(hemG)
PHEI: NCTC12003_00595(hemG)
MMK: MU9_775
ASY: AUT07_00512(hemG)
ETR: ETAE_0162(hemG)
ETD: ETAF_0135(hemG)
ETE: ETEE_1923(hemG)
LRI: NCTC12151_03540(hemG)
PSHI: SAMEA2665130_3044(hemG)
HPR: PARA_04470(fldA)
HAP: HAPS_1976(hemG)
HPAZ: K756_10085
HPAS: JL26_08595
HPAK: JT17_05955
HSO: HS_1569
HSM: HSM_0443
PMU: PM1499
PMV: PMCN06_1764(hemG)
PMP: Pmu_17530(hemG)
PMUL: DR93_340
PDAG: 4362423_01817(hemG)
MSU: MS0176(fldA)
MHQ: D650_1350
MHAT: B824_2090
MHX: MHH_c04690(hemG)
MHAE: F382_08425
MHAM: J450_06535
MHAO: J451_07550
MHAL: N220_13595
MHAQ: WC39_00680
MHAY: VK67_00685
MVI: X808_600
MVG: X874_570
APL: APL_1591
APJ: APJL_1624
APA: APP7_1653
ASU: Asuc_0513
AAT: D11S_0582
AAN: D7S_00764
AACN: AANUM_0474
BTO: WQG_21160
BTRE: F542_1430
BTRH: F543_1470
BTRA: F544_21700
VCH: VC2755(hemG)
VCS: MS6_0030
VCE: Vch1786_I2430(hemG)
VCI: O3Y_13170(hemG)
VCO: VC0395_A2537(hemG)
VCR: VC395_0200(hemG)
VCM: VCM66_2675(hemG)
VVU: VV1_0978
VVY: VV0033
VVL: VV93_v1c00210(hemG)
VPA: VP0033(hemG)
VPB: VPBB_0032
VAG: N646_2213
VSP: VS_0044
VEJ: VEJY3_00155(hemG)
VNI: VIBNI_A0035(hemG)
VAN: VAA_00815
VAU: VANGNB10_cI2691c(hemG)
VSC: VSVS12_00177(hemG)
VTA: A3242(hemG)
VFI: VF_0028(hemG)
VSA: VSAL_I2977(hemG)
AWD: AWOD_I_0028(hemG)
PPR: PBPRA0067(STY3573)
SON: SO_0025(hemG) SO_0027(hemG) SO_3720(hemG)
SDN: Sden_0019
SVO: SVI_0056
PIN: Ping_0198
MVS: MVIS_4403(hemG)
MYA: MORIYA_2958(hemG)
TTU: TERTU_0857(hemG)
TEE: Tel_09215
AHA: AHA_0144
ASA: ASA_4245(hemG)
AVR: B565_3929
AMED: B224_5680
ASR: WL1483_1488(hemG)
ACAV: VI35_20655
TAU: Tola_0022
OCE: GU3_01830
DNO: DNO_0458
SLIM: SCL_2779
RFR: Rfer_4072
CBX: Cenrod_0639(hemG)
BBAY: A4V04_12270(hemG)
GME: Gmet_2953(hemG)
GEO: Geob_0349(hemG)
BBA: Bd2899(hemG)
BBAC: EP01_10585
MLO: mlr4722
MCG: GL4_2361
PZU: PHZ_c2297
JAN: Jann_0852
PSF: PSE_4407(hemG)
OTM: OSB_00070(hemG)
BBEV: BBEV_1657
BSE: Bsel_1927
PSAB: PSAB_13745
CBO: CBO1022
CBA: CLB_1062
CBH: CLC_1075
CBY: CLM_1178
CBL: CLK_0466
CBB: CLD_3543
CBI: CLJ_B1069
CBF: CLI_1107
CBM: CBF_1078
CPAS: Clopa_0488
CCEL: CCDG5_0543
HMO: HM1_0647
ELM: ELI_1758
RRT: 4535765_00850(hemG)
SFA: Sfla_5574
STRP: F750_1032
STRD: NI25_03645
SLAU: SLA_0820
ACH: Achl_3336
BCV: Bcav_2375
JDE: Jden_0573
MPH: MLP_22260(hemG)
NCA: Noca_2314
TFU: Tfu_3023
NML: Namu_2438
AMD: AMED_4155(hemG)
AMN: RAM_21165
AMM: AMES_4107(hemG)
AMZ: B737_4107(hemG)
AOI: AORI_4637(hemG) AORI_5273(hemG)
PSEA: WY02_15225
KAL: KALB_3647
SNA: Snas_3662
TPY: CQ11_02100(hemG)
TPYO: X956_07140
PMC: P9515_09631(hemG)
PMH: P9215_10111(hemG)
RCA: Rcas_2492
HAU: Haur_1699
STI: Sthe_2947
ATM: ANT_01010
RBA: RB4887(hemG)
ABAC: LuPra_03992(hemG)
GBA: J421_5054
BXY: BXY_10310
PSAC: PSM36_3238
DORI: FH5T_04930
MBAS: ALGA_2896
ZPR: ZPR_1057
TLE: Tlet_0030
KOL: Kole_0641
MSI: Msm_1262
MRU: mru_0006
MEB: Abm4_0003
MMIL: sm9_0003
METH: MBMB1_0263
MFC: BRM9_2018
MCUB: MCBB_0273
PYS: Py04_0006
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Taxonomy
Reference
1  [PMID:19583219]
  Authors
Boynton TO, Daugherty LE, Dailey TA, Dailey HA
  Title
Identification of Escherichia coli HemG as a novel, menadione-dependent flavodoxin with protoporphyrinogen oxidase activity.
  Journal
Biochemistry 48:6705-11 (2009)
DOI:10.1021/bi900850y
Other DBs
ExplorEnz - The Enzyme Database: 1.3.5.3
IUBMB Enzyme Nomenclature: 1.3.5.3
ExPASy - ENZYME nomenclature database: 1.3.5.3
BRENDA, the Enzyme Database: 1.3.5.3

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