KEGG   ENZYME: 2.1.1.190Help
Entry
EC 2.1.1.190                Enzyme                                 

Name
23S rRNA (uracil1939-C5)-methyltransferase;
RumA;
RNA uridine methyltransferase A;
YgcA
Class
Transferases;
Transferring one-carbon groups;
Methyltransferases
BRITE hierarchy
Sysname
S-adenosyl-L-methionine:23S rRNA (uracil1939-C5)-methyltransferase
Reaction(IUBMB)
S-adenosyl-L-methionine + uracil1939 in 23S rRNA = S-adenosyl-L-homocysteine + 5-methyluracil1939 in 23S rRNA
Substrate
S-adenosyl-L-methionine [CPD:C00019];
uracil1939 in 23S rRNA
Product
S-adenosyl-L-homocysteine [CPD:C00021];
5-methyluracil1939 in 23S rRNA
Comment
The enzyme specifically methylates uracil1939 at C5 in 23S rRNA [1]. The enzyme contains an [4Fe-4S] cluster coordinated by four conserved cysteine residues [2].
History
EC 2.1.1.190 created 2010
Orthology
K03215  23S rRNA (uracil1939-C5)-methyltransferase
Genes
ECO: b2785(rlmD)
ECJ: JW2756(rumA)
ECD: ECDH10B_2953(rumA)
EBW: BWG_2523(rumA)
ECOK: ECMDS42_2289(rumA)
ECE: Z4100(ygcA)
ECS: ECs3645(rumA)
ECF: ECH74115_4045(rumA)
ETW: ECSP_3737(rumA)
ELX: CDCO157_3400(rumA)
EOJ: ECO26_3855(rumA)
EOH: ECO103_3328(rumA)
ECOO: ECRM13514_3644(rumA)
ECOH: ECRM13516_3509(rumA)
ECG: E2348C_3052(rumA)
EOK: G2583_3437(rumA)
ELR: ECO55CA74_16385(rumA)
ESO: O3O_20065(rumA)
ESM: O3M_05630(rumA)
ESL: O3K_05585(rumA)
ECW: EcE24377A_3089(rumA)
ELH: ETEC_2975
EUN: UMNK88_3468(rumA)
ECC: c3348(ygcA)
ECP: ECP_2766
ECI: UTI89_C3155(ygcA)
ECV: APECO1_3746(rumA)
ECX: EcHS_A2929(rumA)
ECM: EcSMS35_2923(rumA)
ECY: ECSE_3043
ECR: ECIAI1_2893(rumA)
ECQ: ECED1_3238(rumA)
ECK: EC55989_3060(rumA)
ECT: ECIAI39_3204(rumA)
EOC: CE10_3209(rumA)
EUM: ECUMN_3114(rumA)
ECZ: ECS88_3053(rumA)
ELO: EC042_2982(rumA)
ELN: NRG857_13635(rumA)
ESE: ECSF_2576
EBR: ECB_02630(rumA)
EBD: ECBD_0944
EKF: KO11_09040(rumA)
EAB: ECABU_c30540(rumA)
EDJ: ECDH1ME8569_2695(rumA)
EIH: ECOK1_3159(rumA)
ENA: ECNA114_2820(ygcA)
ELU: UM146_02645(rumA)
ELW: ECW_m2994(rumA)
ELL: WFL_14620(rumA)
ELC: i14_3073(rumA)
ELD: i02_3073(rumA)
ELP: P12B_c2883(rumA)
EBL: ECD_02630(rlmD)
EBE: B21_02592(rlmD)
ELF: LF82_2046(rumA)
ECOA: APECO78_17540(rumA)
ECOL: LY180_14150(rumA)
ECOI: ECOPMV1_03041(rlmD)
ECOJ: P423_15230(rumA)
ECOS: EC958_3052(ygcA)
EFE: EFER_0279(rumA)
EAL: EAKF1_ch3226(rumA)
STY: STY3095(ygcA)
STT: t2866(ygcA)
SENT: TY21A_14500(rumA)
STM: STM2957(ygcA)
SEO: STM14_3565(rumA)
SEY: SL1344_2938(rumA)
SEM: STMDT12_C30100(rumA)
SEJ: STMUK_2946(rumA)
SEB: STM474_3102(rumA)
SEF: UMN798_3215(rumA)
SETU: STU288_14965(rumA)
SETC: CFSAN001921_02285(rumA)
SENR: STMDT2_28591(rumA)
SEND: DT104_29551(rumA)
SENI: CY43_15430(rumA)
SEEN: SE451236_20885(rumA)
SPT: SPA2822(ygcA)
SEK: SSPA2629
SEI: SPC_3014(rumA)
SEC: SCH_2897(ygcA)
SEH: SeHA_C3163(rumA)
SHB: SU5_03447
SENH: CFSAN002069_17435(rumA)
SEEH: SEEH1578_00845(rumA)
SEE: SNSL254_A3179(rumA)
SEW: SeSA_A3116(rumA)
SEA: SeAg_B3098(rumA)
SENS: Q786_14295(rumA)
SED: SeD_A3277(rumA)
SEG: SG2867(ygcA)
SET: SEN2802(ygcA)
SENA: AU38_14230(rumA)
SENO: AU37_14240(rumA)
SENV: AU39_14240(rumA)
SENQ: AU40_16020(rumA)
SENL: IY59_14835(rumA)
SENJ: CFSAN001992_18780(rumA)
SEEC: CFSAN002050_21145(rumA)
SEEB: SEEB0189_005335(rumA)
SENE: IA1_14230(rumA)
SENC: SEET0819_21650(rumA)
SBG: SBG_2572(ygcA)
SBZ: A464_2981
SBV: N643_12585(rumA)
SFL: SF2798(rumA)
SFX: S2992(ygcA)
SFV: SFV_2672(ygcA)
SFE: SFxv_3069(rumA)
SFN: SFy_3983
SFS: SFyv_4060
SFT: NCTC1_03077(rumA)
SSN: SSON_2942(ygcA)
SBO: SBO_2666(ygcA)
SBC: SbBS512_E3088(rumA)
SDY: SDY_3002(rumA)
SHQ: A0259_17495(rumA)
ENC: ECL_04117
ENO: ECENHK_17820(rumA)
ECLO: ENC_30260
EEC: EcWSU1_03591(rumA)
ENL: A3UG_18115(rumA)
ECLE: ECNIH2_18275(rumA)
ECLN: ECNIH4_04860(rumA)
ECLI: ECNIH5_17045(rumA)
ECLX: LI66_17955(rumA)
ECLY: LI62_19415(rumA)
ECLZ: LI64_16865(rumA)
EHM: AB284_07835(rumA)
EXF: BFV63_17585(rumA)
ECLA: ECNIH3_17130(rumA)
ECLC: ECR091_17065(rumA)
EAU: DI57_01385(rumA)
EKB: BFV64_18600(rumA)
ELG: BH714_21815(rumA)
ERN: BFV67_17600(rumA)
ECLS: LI67_019125(rumA)
ENR: H650_19990(rumA)
ENX: NI40_017720(rumA)
ESA: ESA_00518
CSK: ES15_0778(rumA)
CSZ: CSSP291_02635(rumA)
CCON: AFK62_15775(rumA)
CDM: AFK67_16530(rumA)
CMJ: AFK66_003735(rumA)
CUI: AFK65_15545(rumA)
CMW: AFK63_02715(rumA)
CTU: CTU_33440(rumA)
KPN: KPN_03127(rumA)
KPU: KP1_4399(rumA)
KPP: A79E_0970
KPH: KPNIH24_07780(rumA)
KPZ: KPNIH27_20350(rumA)
KPV: KPNIH29_21110(rumA)
KPW: KPNIH30_21130(rumA)
KPY: KPNIH31_20395(rumA)
KPG: KPNIH32_21990(rumA)
KPC: KPNIH10_20930(rumA)
KPQ: KPR0928_20415(rumA)
KPT: VK055_4387(rumA)
KPE: KPK_0995(rumA)
KPO: KPN2242_18650(rumA)
KPR: KPR_4136(rlmD)
KPJ: N559_1103
KPI: D364_15940(rumA)
KPX: PMK1_00608(rlmD)
KPB: FH42_11655(rumA)
KPNE: KU54_005440(rumA)
KPNU: LI86_05450(rumA)
KPNK: BN49_0987(rlmD)
KVA: Kvar_0928
KPK: A593_05820(rumA)
KVD: KR75_03270(rumA)
KVQ: SP68_09820(rumA)
KOX: KOX_01160(rumA)
KOE: A225_4694
KOY: J415_08535(rumA)
KOM: HR38_27285(rumA)
KMI: VW41_19165(rumA)
KOK: KONIH1_23580(rumA)
KOC: AB185_12800(rumA)
KQU: AVR78_25435(rumA)
EAE: EAE_01970(rumA)
EAR: CCG33598
KQV: B8P98_05455(rumA)
CKO: CKO_04138
CRO: ROD_30311(rumA)
CFD: CFNIH1_00855(rumA)
CYO: CD187_04950(rumA)
CAMA: F384_15090(rumA)
CFAR: CI104_20055(rumA)
GQU: AWC35_08380(rumA)
EBT: EBL_c08420(rumA)
ROR: RORB6_23655(rumA)
RON: TE10_22585(rumA)
RPLN: B1209_05010(rumA)
CNT: JT31_16550(rumA)
CEM: LH23_01165(rumA)
CEN: LH86_01150(rumA)
PGE: LG71_09425(rumA)
KLE: AO703_16925(rumA)
KSA: C813_10570(rumA)
KOR: AWR26_20350(rumA)
KRD: A3780_03390(rumA)
KCO: BWI95_10185(rumA)
LAX: APT61_04615(rumA)
LAZ: A8A57_16785(rumA)
EBF: D782_0931
YEN: YE0743(rumA)
YEY: Y11_39781
YEW: CH47_2742(rumA)
YET: CH48_863(rumA)
YEE: YE5303_25971(rumA)
YAL: AT01_3271(rumA)
YIN: CH53_953(rumA)
YRO: CH64_3360(rumA)
YRU: BD65_2616(rumA)
YRB: UGYR_13460(rumA)
YAK: ACZ76_12835(rumA)
SPLY: Q5A_003485(rlmD)
SMAF: D781_0752
SMW: SMWW4_v1c07770(rlmC)
SMAR: SM39_0106(rumA)
SMAC: SMDB11_0108(rumA)
SLQ: M495_03320(rumA)
SERF: L085_00370(rumA)
SERS: SERRSCBI_03590(rumA)
SFW: WN53_12505(rumA)
SFG: AV650_07910(rumA)
SFO: Z042_17715(rumA)
RAA: Q7S_03025(rumA)
ECA: ECA3570(rumA)
PATR: EV46_17715(rumA)
PATO: GZ59_35940(rumA)
PCT: PC1_3390
PCV: BCS7_17080(rumA)
PPAR: A8F97_00880(rumA)
PEC: W5S_3686
PWS: A7983_02850(rumA)
PPOA: BJK05_11955(rumA)
SGL: SG0509
SOD: Sant_3265
DDD: Dda3937_00194(rumA)
DZC: W909_15985(rumA)
DSO: A4U42_04570(rumA)
CED: LH89_17065(rumA)
DDQ: DDI_3292
BGJ: AWC36_00610(rumA)
LBQ: CKQ53_01840(rumA)
ETA: ETA_27240(rumA)
EPY: EpC_28430(rumA)
EPR: EPYR_03077(ygcA)
EAM: EAMY_0734(ygcA)
EAY: EAM_2707(rumA)
EBI: EbC_35480(rumA)
ERJ: EJP617_18940(rumA)
EGE: EM595_2822(rlmD)
PAM: PANA_3079(rumA)
PLF: PANA5342_0954(rumA)
PAJ: PAJ_2353(rumA)
PVA: Pvag_2462(ygcA)
KLN: LH22_06915(rumA)
PANT: PSNIH1_02080(rumA)
PANP: PSNIH2_02350(rumA)
PAGC: BEE12_02875(rumA)
PSTW: DSJ_05115(rumA)
PALH: B1H58_11490(rumA)
TCI: A7K98_04655(rumA)
TPTY: NCTC11468_00884(rlmD)
PLU: plu0909(rumA)
PLUM: A4R40_04540(rumA)
PAY: PAU_00830(rumA)
PMR: PMI0216(rumA)
PMIB: BB2000_0367(rumA)
PVL: AOB99_03840(rumA)
XBO: XBJ1_3655(rumA)
XBV: XBW1_3960(rumA)
XNE: XNC1_0883(rumA)
XNM: XNC2_0867(rumA)
XDO: XDD1_3125(rumA)
XPO: XPG1_0632(rumA)
XHO: A9255_19580(rumA)
PSI: S70_05035(rumA)
PSX: DR96_122(rumA)
PSTA: BGK56_07930(rumA)
PRG: RB151_034010(rlmD)
PHEI: NCTC12003_01049(rlmD)
MMK: MU9_1158
ETR: ETAE_2715(rumA)
ETD: ETAF_2449(rumA)
ETE: ETEE_0819
ETC: ETAC_13130(rumA)
EDW: QY76_06935(rumA)
EDL: AAZ33_14330(rumA)
EHO: A9798_03620(rumA)
HAV: AT03_05955(rumA)
OPO: DSM2777_20515(rumA)
PFQ: QQ39_05405(rumA)
LRI: NCTC12151_02419(rlmD)
KIN: AB182_04495(rumA)
PSHI: SAMEA2665130_2353(rlmD)
HIN: HI0333(rumA)
HIT: NTHI0451(rumA)
HIF: HIBPF_02830(rumA)
HIU: HIB_04470
HIE: R2846_0248(rumA)
HIZ: R2866_0240(rumA)
HIK: HifGL_000112(rlmD)
HIA: H733_0228(rumA)
HIW: NTHI477_01377(rlmD)
HIC: NTHIC486_00656(rlmD)
HIX: NTHI723_01353(rlmD)
HDU: HD_1765(rumA)
HAP: HAPS_0935(rumA)
HPAZ: K756_01985(rumA)
HPAS: JL26_01525
HPAK: JT17_10410
HSO: HS_0094(rumA)
HSM: HSM_1985
PMU: PM1866
PMV: PMCN06_1506(rumA)
PMP: Pmu_14680(rumA)
PMUL: DR93_69(rumA)
PDAG: 4362423_01491(rumA)
MSU: MS0240(trmA)
MHT: D648_7850
MHAT: B824_8510
MHX: MHH_c13870(rlmD)
MHAE: F382_12015
MHAM: J450_10980
MHAO: J451_12135
MHAL: N220_04145
MHAQ: WC39_09745
MHAY: VK67_09745
MVR: X781_8700
MVI: X808_7490
MVG: X874_7620
APL: APL_0312(rumA)
APJ: APJL_0327(rumA)
APA: APP7_0317(rumA)
ASU: Asuc_0192
ASI: ASU2_05470(rumA)
ASS: ASU1_05540(rumA)
AAT: D11S_0609
AAN: D7S_01064
AACN: AANUM_0786
BTO: WQG_4070
BTRE: F542_17890
BTRH: F543_19770
BTRA: F544_4440
XFA: XF_2358
XFT: PD_1385(trmA)
XFF: XFLM_01060(rumA)
XCC: XCC1277(rumA)
XCB: XC_2964
XCP: XCR_1532(rumA)
XCV: XCV1381(rumA)
XAX: XACM_1312(rumA)
XAC: XAC1329
XCI: XCAW_03019(trmA)
XFU: XFF4834R_chr31720(rumA)
XAO: XAC29_06700(rumA)
XOO: XOO1859
XOM: XOO1755(XOO1755)
XOP: PXO_01722(rumA)
XOR: XOC_3177(rumA)
XAL: XALC_2537(rumA)
XPH: XppCFBP6546_04790(XppCFBP6546P_04790)
SML: Smlt3541
SMT: Smal_2971
SMZ: SMD_3122(rumA)
SACZ: AOT14_12950(rumA)
PSUW: WQ53_01375
PSD: DSC_11540(rumA)
LAB: LA76x_3477(rumA)
LAQ: GLA29479_4721(rumA)
LCP: LC55x_3425(rumA)
LGU: LG3211_1760(rumA)
LEZ: GLE_1716(rumA)
LEM: LEN_3252(rumA)
DKO: I596_502
VCH: VC2452(rumA)
VCF: IR04_17350(rumA)
VCS: MS6_2183
VCE: Vch1786_I1944(rumA)
VCQ: EN18_15300(rumA)
VCI: O3Y_11755(rumA)
VCO: VC0395_A2030(rumA)
VCX: VAA049_443(rumA)
VCZ: VAB027_3078(rumA)
VVU: VV1_1574(rumA)
VVY: VV2822
VVL: VV93_v1c25310(rumA)
VPA: VP2566(rumA)
VPB: VPBB_2389
VPK: M636_09085(rumA)
VPF: M634_15255(rumA)
VCA: M892_13460(rumA)
VAG: N646_1659
VNA: PN96_01055(rumA)
VOW: A9237_11015(rumA)
VRO: BSZ04_10640(rumA)
VSP: VS_2612
VEJ: VEJY3_13235(rumA)
VNI: VIBNI_A0125(rumA)
VAN: VAA_03768
LAG: N175_03790(rumA)
VAU: VANGNB10_cI2215c(rumA)
VCY: IX92_01800(rumA)
VCT: JV59_36915(rumA)
VTU: IX91_12795(rumA)
VBR: A6E01_10870(rumA)
VSC: VSVS12_02643(rumA)
VGA: BSQ33_11365(rumA)
VSH: BSZ05_08690(rumA)
VQI: CCZ37_10745(rumA)
VTA: A0080(rumA)
VFI: VF_2081(rumA)
VFM: VFMJ11_2186(rumA)
VSA: VSAL_I2519(rumA)
AWD: AWOD_I_2160(rumA)
PPR: PBPRA3083(VP2566)
PDS: CAY62_11655(rumA)
PAE: PA0933(ygcA)
PAEV: N297_965(rumA)
PAEI: N296_965(rumA)
PAU: PA14_52190(ygcA)
PAP: PSPA7_4577(rumA)
PAG: PLES_43831(ygcA)
PAF: PAM18_4106(rumA)
PNC: NCGM2_1716(rumA)
PAEB: NCGM1900_1785(rumA)
PDK: PADK2_21040(rumA)
PSG: G655_20690(rumA)
PAEP: PA1S_21755
PAEM: U769_21125
PAEL: T223_22390
PAEU: BN889_00979(rumA_1) BN889_00980(rumA_2)
PAEG: AI22_12185
PAEC: M802_961(rumA)
PAEO: M801_965(rumA)
PMY: Pmen_1734
PMK: MDS_3127
PRE: PCA10_44590(rumA)
PPSE: BN5_1559(rumA)
PCQ: PcP3B5_48320(rlmD)
PPU: PP_1655(rlmD)
PPF: Pput_4063
PPT: PPS_1307
PPB: PPUBIRD1_3962(rumA)
PPI: YSA_02469
PPUH: B479_06315(rumA)
PPUT: L483_05845
PPUN: PP4_41130(rumA)
PMON: X969_04405
PMOT: X970_04380
PSB: Psyr_3696(rumA)
PSYR: N018_06930
PSP: PSPPH_3717(rumA)
PFL: PFL_4447(rumA)
PPRC: PFLCHA0_c45200(rumA)
PPRO: PPC_4556(rumA)
PFO: Pfl01_4218(rumA)
PFS: PFLU_4506
PFC: PflA506_3815(rumA)
PFW: PF1751_v1c40020(rumA)
PPZ: H045_13445(rumA)
PFB: VO64_5030
PMAN: OU5_5076(rumA)
PEN: PSEEN1363(rumA)
PSA: PST_2670(ygcA)
PSZ: PSTAB_2653(rumA)
PSR: PSTAA_2792(rumA)
PSC: A458_08990(rumA)
PSJ: PSJM300_12405(rumA)
PSTT: CH92_14550
PPUU: PputUW4_04106(rumA)
PDR: H681_07905(rumA)
PSV: PVLB_05980(rumA)
PKC: PKB_1357(rlmD)
PSES: PSCI_0397(rumA)
PSEM: TO66_23240
PSEC: CCOS191_1301(rlmD)
PSOS: POS17_4519(rumA)
PANR: A7J50_4188
PSET: THL1_4503
PSIL: PMA3_05945
AVN: Avin_37070(rumA)
AVL: AvCA_37070(rumA)
AVD: AvCA6_37070(rumA)
ACX: Achr_12590(rumA)
PAR: Psyc_0344(ygcA)
PALI: A3K91_0436
PSYC: DABAL43B_0440(rumA)
PSYA: AOT82_1367
ABM: ABSDF2942(rumA)
ABY: ABAYE3182(rumA)
ABN: AB57_0682
ABB: ABBFA_002982(rumA)
ABX: ABK1_0618
ABZ: ABZJ_00616(rlmD)
ABH: M3Q_826
ABAD: ABD1_05840(rumA)
ABAZ: P795_14530
ABAU: IX87_17385
ABAA: IX88_05095
ACC: BDGL_003485(rumA)
ACD: AOLE_16570(rumA)
ACI: ACIAD3069(rumA)
ASJ: AsACE_CH02328(rlmD)
MCT: MCR_0150(rumA)
MCS: DR90_1751(rumA)
MCAT: MC25239_00181(rlmD)
SON: SO_3456(rumA)
SDN: Sden_1192
SFR: Sfri_1048
SAZ: Sama_1032
SBL: Sbal_3147
SLO: Shew_1201
SSE: Ssed_1286
SPL: Spea_1181
SHL: Shal_1218
SWD: Swoo_3354
SWP: swp_1352
SVO: SVI_3179(rumA)
SPSW: Sps_04111
ILO: IL0805
CPS: CPS_4116(rumA)
PHA: PSHAa0738(rumA)
PSM: PSM_A2330
PSEO: OM33_06925
PTN: PTRA_a0837(rumA)
PEA: PESP_a2940(rumA)
PSPO: PSPO_a0849(rumA)
PART: PARC_a1005(rumA)
PTU: PTUN_a3212(rumA)
PNG: PNIG_a0894(rumA)
PTD: PTET_a2634(rumA)
PSEN: PNC201_05545(rlmD)
MAQ: Maqu_2239
MHC: MARHY0988(rumA)
MAD: HP15_790
MBS: MRBBS_2645(rumA)
MARA: D0851_17715(rlmD)
AMAA: amad1_03745(rumA)
AMAL: I607_03640(rumA)
AMAE: I876_03850(rumA)
AMAD: I636_03735(rumA)
AMAI: I635_03710(rumA)
AMAG: I533_03575(rumA)
AMAC: MASE_03240(rumA)
AMB: AMBAS45_03495(rumA)
AMG: AMEC673_03450(rumA)
AMK: AMBLS11_03415(rumA)
GNI: GNIT_0723(rumA)
SALH: HMF8227_00521(rumA)
PIN: Ping_0529
FBL: Fbal_0841
MVS: MVIS_0431(rumA)
MYA: MORIYA_2535(rumA)
CJA: CJA_2576(rumA)
SAGA: M5M_03300(rumA)
MICC: AUP74_00387(rlmD)
LPN: lpg1456(rumA)
LPH: LPV_1577(rumA)
LPO: LPO_1456(rumA)
LPM: LP6_1437(rumA)
LPF: lpl1572(rumA)
LPP: lpp1412(rumA)
LPC: LPC_0871(rumA)
LPA: lpa_02123
LPE: lp12_1394
LLO: LLO_1757(rumA)
LFA: LFA_1400(rlmD)
LHA: LHA_1644(rumA)
LOK: Loa_01762(rumA)
LCD: clem_06665(rlmD)
LSH: CAB17_13340(rlmD)
LLG: 44548918_01471(rlmD)
TMC: LMI_1558(rumA)
MCA: MCA1898(rumA)
MAH: MEALZ_2246(rumA)
FTU: FTT_0705(rumA)
FTQ: RO31_0803(rumA)
FTF: FTF0705(rumA)
FTW: FTW_1538(rumA)
FTR: NE061598_04020(rumA)
FTT: FTV_0663(rumA)
FTG: FTU_0747(rumA)
FTL: FTL_1531
FTH: FTH_1481(trmA)
FTA: FTA_1615(rumA)
FTS: F92_08480(rumA)
FTI: FTS_1494(rumA)
FTC: DA46_1220(rumA)
FTV: CH67_1928(rumA)
FTZ: CH68_1658(rumA)
FTM: FTM_1378
FTN: FTN_0616
FTX: AW25_1411(rumA)
FTD: AS84_60(rumA)
FTY: CH70_1441(rumA)
FPH: Fphi_0226
FPT: BZ13_1850(rumA)
FPI: BF30_400(rumA)
FPM: LA56_92(rumA)
FPX: KU46_1152(rumA)
FPZ: LA55_627(rumA)
FPJ: LA02_1835(rumA)
FNA: OOM_1192
TCX: Tcr_2194
MEJ: Q7A_1387
MEC: Q7C_410
CYQ: Q91_0829(rumA)
NOC: Noc_0801
NHL: Nhal_2445
NWA: Nwat_2309
TEE: Tel_08705
AEH: Mlg_1354
HHA: Hhal_0028
TGR: Tgr7_1102
TKM: TK90_0590
TNI: TVNIR_0835(rumA_[H])
TVR: TVD_04350
GAI: IMCC3135_21770(rlmD)
HCH: HCH_01806(rumA)
CSA: Csal_1637
HEL: HELO_3013(rlmD)
HAM: HALO2845
HCO: LOKO_02157(rlmD)
HBE: BEI_1296(rumA)
ABO: ABO_1624(ruma)
ADI: B5T_01545(rumA)
APAC: S7S_12355
AXE: P40_07175
KKO: Kkor_0842
KGE: TQ33_1478
TOL: TOL_0928
OAI: OLEAN_C14690(rumA)
RFO: REIFOR_02217(rumA)
OME: OLMES_1252(rlmD)
AHA: AHA_0817(rumA) AHA_3694(rumA-2)
ASA: ASA_3479(rumA) ASA_3662
OCE: GU3_04490 GU3_04655(rumA)
DNO: DNO_1083
SOK: D0B54_06635(rlmD)
SLIM: SCL_1464
SVA: SVA_1704
SALN: SALB1_2777
TBN: TBH_C1135
VOK: COSY_0298(rumA)
EBH: BSEPE_0580(rumA)
GPB: HDN1F_09460(rumA)
ENM: EBS_1174(rumA)
NLA: NLA_5070
NWE: SAMEA3174300_1418(rlmD)
KKI: KKKWG1_0062(rlmD)
ECOR: SAMEA4412678_0738(rlmD)
CVI: CV_1932
LHK: LHK_01852(rumA)
PSE: NH8B_1157
RSO: RSc1209
RSC: RCFBP_20224(rumA)
RSL: RPSI07_2168(rumA)
RSN: RSPO_c02160(rumA)
RSM: CMR15_20414(rumA)
RSE: F504_1235(rumA)
RPI: Rpic_1053
RIN: ACS15_2157(rumA)
REH: H16_A2370(trmA)
CNC: CNE_1c22800(rumA)
RME: Rmet_2112(rumA)
CTI: RALTA_A1915(rumA)
CGD: CR3_1706(rumA)
BMA: BMA1350(rumA)
BMV: BMASAVP1_A1840(rumA)
BML: BMA10229_A0057(rumA)
BMN: BMA10247_1112(rumA)
BMAL: DM55_3196(rumA)
BMAE: DM78_1680(rumA)
BMAQ: DM76_3180(rumA)
BMAI: DM57_3059
BMAF: DM51_1068(rumA)
BMAZ: BM44_1985(rumA)
BMAB: BM45_1549(rumA)
BPS: BPSL1508(rumA)
BPM: BURPS1710b_2360(rumA)
BPL: BURPS1106A_2233(rumA)
BPD: BURPS668_2195(rumA)
BPR: GBP346_A2303(rumA)
BPSE: BDL_55(rumA)
BPSM: BBQ_1378(rumA)
BPSU: BBN_1502(rumA)
BPSD: BBX_1989(rumA)
BPZ: BP1026B_I1443(rumA)
BPK: BBK_3005(rumA)
BPSH: DR55_2623(rumA)
BPSA: BBU_204(rumA)
BPSO: X996_2214(rumA)
BUT: X994_641(rumA)
BTE: BTH_I2229(rumA)
BTQ: BTQ_1690(rumA)
BTJ: BTJ_665(rumA)
BTZ: BTL_1904(rumA)
BTD: BTI_1722(rumA)
BTV: BTHA_2059(rumA)
BTHE: BTN_2862(rumA)
BTHM: BTRA_2187(rumA)
BTHA: DR62_3007
BTHL: BG87_2129(rumA)
BOK: DM82_1497(rumA)
BOC: BG90_3213(rumA)
BVE: AK36_2100(rumA)
BCN: Bcen_6262
BCJ: BCAL1889
BCEN: DM39_1779(rumA)
BCEW: DM40_2415(rumA)
BCEO: I35_1808(rumA)
BAM: Bamb_1755
BMU: Bmul_1456
BMK: DM80_3210(rumA)
BMUL: NP80_1877(rumA)
BCT: GEM_1609
BCED: DM42_3283(rumA)
BDL: AK34_1307(rumA)
BCON: NL30_13745
BUB: BW23_3168(rumA)
BLAT: WK25_08790
BTEI: WS51_19485
BSEM: WJ12_09110
BPSL: WS57_27400
BMEC: WJ16_09315
BSTG: WT74_09535
BGU: KS03_2413(rumA)
BGO: BM43_3612(rumA)
BYI: BYI23_A015510(trmA)
BUK: MYA_1608
BUE: BRPE67_ACDS15990(trmA)
BUL: BW21_1814(rumA)
BGP: BGL_1c22450(rumA)
BXE: Bxe_A2348
BXB: DR64_52(rumA)
BPH: Bphy_0965
BPX: BUPH_02268(rlmD)
BFN: OI25_3387(rumA)
PNU: Pnuc_1295
PNE: Pnec_0660
PPNO: DA70_06405
PPNM: LV28_24295
PSPU: NA29_18590
PAPI: SG18_26540
PLG: NCTC10937_04044(rumA)
HYF: DTO96_102260(rlmD)
BPE: BP1725(rumA)
BPC: BPTD_1703(rumA)
BPER: BN118_2135
BPET: B1917_2110(rumA)
BPEU: Q425_19020(rumA)
BPA: BPP3051
BPAR: BN117_2749
BBR: BB3014
BBX: BBS798_2844(rumA)
BPT: Bpet2543(rumA)
BAV: BAV1976(rumA)
BHO: D560_3697(rumA)
BHM: D558_3672(rumA)
BHZ: ACR54_02179(rlmD)
BTRM: SAMEA390648703141(rumA)
AXY: AXYL_03408(rumA)
AXX: ERS451415_02630(rlmD)
TEA: KUI_0940(rumA)
TEG: KUK_1268(rumA)
TAS: TASI_0740
TAT: KUM_0816(rumA)
AKA: TKWG_12210(rumA)
AMIM: MIM_c21380(rumA)
AFQ: AFA_10590
ODI: ODI_R2089
RFR: Rfer_2778
POL: Bpro_3057
PNA: Pnap_2576
AAV: Aave_3318
AJS: Ajs_2413
AAA: Acav_1937
ACK: C380_14300(rumA)
ACRA: BSY15_3975(rumA)
VEI: Veis_3067
DAC: Daci_4629
VPD: VAPA_1c18880(rlmD)
CTES: O987_18780
RTA: Rta_24370(rumA)
LIM: L103DPR2_02115(rlmD)
LIH: L63ED372_01625(rlmD)
HYR: BSY239_2100(rumA)
HYB: Q5W_08195
CBAA: SRAA_1406(rumA)
CBAB: SMCB_0750(rumA)
MPT: Mpe_A1256
HAR: HEAR1258(rumA)
MMS: mma_2133(ygcA)
JAG: GJA_3471(rumA)
HSE: Hsero_2958(rumT)
HRB: Hrubri_2981(rumT)
CFU: CFU_1910(rumA)
CARE: LT85_2711(rumA)
CPRA: CPter91_2476(rumA)
OFO: BRW83_2120(rlmD)
LCH: Lcho_1919
TIN: Tint_0406
THI: THI_0425
RGE: RGE_33320(rumA)
RBN: RBXJA2T_09642(rumA)
BBAG: E1O_09930
PBH: AAW51_2207(rumA)
NEU: NE1857(ygcA)
METR: BSY238_3020(rumA)
TBD: Tbd_0970
MFA: Mfla_1851
MMB: Mmol_0711
MEH: M301_1925
MEP: MPQ_1002(trmA)
MBAC: BN1209_0656(rlmD)
MBAT: BN1208_0436(rlmD)
SLT: Slit_2298
GCA: Galf_1849
SDR: SCD_n01050(rumA)
EBA: ebA771(rumA)
DSU: Dsui_1981
DAR: Daro_0851
DEY: HYN24_03895(rlmD)
AZO: azo1100
AZA: AZKH_3517(rumAa)
AOA: dqs_1210
TCL: Tchl_2084
KCI: CKCE_0357(rumA)
KCT: CDEE_0518
KBL: CKBE_00393(rumA)
KBT: BCUE_0502
KDE: CDSE_0510
KGA: ST1E_0563
KON: CONE_0491
BPRC: D521_1080
DMA: DMR_07760(rumA)
DGG: DGI_1523
DAS: Daes_2764
DPI: BN4_11583
PPRF: DPRO_2713
LIR: LAW_00595
DBA: Dbac_1610
DRT: Dret_1755
DPS: DP1443
DSF: UWK_03534
DOL: Dole_1585
DML: Dmul_21040(rumA)
DAL: Dalk_4863
DAT: HRM2_26600(trmA)
DTO: TOL2_C22450(rumA)
ADE: Adeh_2360
MXA: MXAN_3787(rumA)
CCX: COCOR_04196(rumA)
SUR: STAUR_4331(rumA)
SCL: sce7294(traM)
CCRO: CMC5_076650(smtA)
HOH: Hoch_3690
SAT: SYN_01023
SFU: Sfum_0289
DBR: Deba_1933
BBA: Bd3828(ygcA)
BBAT: Bdt_3699(ygcA)
BBAC: EP01_11640
BMX: BMS_2963
RBT: NOVO_01870(rlmCD)
PACA: ID47_08680
MLO: mlr7480
MES: Meso_0737
AMIH: CO731_04566(rlmD)
PLA: Plav_0783
RBS: RHODOSMS8_00323(rlmD)
SME: SMc00974
SMER: DU99_04530
SMD: Smed_0490
EAD: OV14_1814
ATU: Atu0735
ARA: Arad_1191(rumA)
ATF: Ach5_06570(rumA)
AVI: Avi_0991(rumA)
REC: RHECIAT_CH0001002(rumA)
RLE: RL0969(rumA)
RLG: Rleg_0603
RHL: LPU83_1022(rumA)
RHT: NT26_0479
NGL: RG1141_CH05450(rumA)
NGG: RG540_CH05040(rumA)
SHZ: shn_04060
BME: BMEI1496
BMEL: DK63_1994
BMEE: DK62_960
BMF: BAB1_0464
BABO: DK55_473
BABR: DO74_1414
BABT: DK49_236
BABB: DK48_1653
BABU: DK53_463
BABS: DK51_999
BABC: DO78_380
BMS: BR0438
BSUI: BSSP1_I1265(rumA)
BSUP: BSPT1_I1277(rumA)
BSUV: BSPT2_I1261(rumA)
BSUC: BSSP2_I0453(rumA)
BMT: BSUIS_A0464(rumA)
BSZ: DK67_1369
BOV: BOV_0445
BCS: BCAN_A0442(rumA)
BCAR: DK60_522
BCAS: DA85_02090
BMR: BMI_I441
BPP: BPI_I468
BPV: DK65_920
OAN: Oant_0549
OAH: DR92_2392
BJA: bll2648
BRA: BRADO2158
BBT: BBta_2476
BRS: S23_53240
AOL: S58_53690
BRAD: BF49_2079
RPA: RPA0948
RPB: RPB_4463
RPC: RPC_1145
RPD: RPD_4309
RPE: RPE_1062
RPT: Rpal_1018
NWI: Nwi_0631
NHA: Nham_0776
OCA: OCAR_6897
VGO: GJW-30_1_00903(rlmD)
BHE: BH04370
BQR: RM11_0343
BTR: BT_0651
BGR: Bgr_04690
BAUS: BAnh1_03630(rumA)
BVN: BVwin_03350(rumA)
BANC: PU02_1245
XAU: Xaut_4164
AZC: AZC_3107
SNO: Snov_4444
MEX: Mext_4312
MEA: Mex_1p4709(rumA)
MDI: METDI5315(rumA)
MCH: Mchl_4681
MPO: Mpop_4829
MET: M446_2376
MNO: Mnod_2835
MOR: MOC_4364(rumA)
META: Y590_21550
MAQU: Maq22A_c16840(trmA)
BID: Bind_1814
MSL: Msil_0719
HDN: Hden_1974
HMC: HYPMC_2951(rumA)
RVA: Rvan_0341
PHL: KKY_3531
DEQ: XM25_16340(RumA)
BVR: BVIR_1958
MSC: BN69_2024
MMED: Mame_03802(rlmD)
MCG: GL4_1083
HDI: HDIA_1205(rlmD)
RBM: TEF_21035
CCR: CC_1326
CAK: Caul_2157
CSE: Cseg_1622
PZU: PHZ_c1348
SIL: SPO0029(rumA)
RSP: RSP_1202(TrmA)
JAN: Jann_0086
RDE: RD1_0406
PDE: Pden_2577
DSH: Dshi_3492(rumA)
KVU: EIO_2732(rumA)
KVL: KVU_2230(rumA)
KRO: BVG79_02333(rumA)
PSF: PSE_1651
PGD: Gal_03549
OTM: OSB_31860(rlmD)
CID: P73_0243
MALG: MALG_03554
RSU: NHU_04020
RHC: RGUI_2502
SPSE: SULPSESMR1_03132(rlmD)
RMM: ROSMUCSMR3_02090(rlmD)
LVS: LOKVESSMR4R_03551(rlmD)
AHT: ANTHELSMS3_01001(rlmD)
ZMO: ZMO1179
ZMN: Za10_0150
ZMM: Zmob_0151
ZMB: ZZ6_0153
ZMI: ZCP4_0155
ZMC: A265_00155(rlmD)
ZMR: A254_00155(rlmD)
NAR: Saro_1787
SAL: Sala_1192
SPHP: LH20_11560
SMAZ: LH19_07780
SGI: SGRAN_1971(rumA)
SPHU: SPPYR_1853
SWI: Swit_4660
SPHD: HY78_01835
SPHM: G432_16190
STAX: MC45_02830
SPHI: TS85_06140
SSAN: NX02_16925
SPKC: KC8_01230
SJP: SJA_C1-17270(ygcA)
SSY: SLG_24460
SPMI: K663_07880
SPHB: EP837_00145(rumA)
SPHR: BSY17_228
SINB: SIDU_05705
SPHT: K426_13360
SFLA: SPHFLASMR4Y_00837(rlmD)
BLAS: BSY18_978
ELI: ELI_06895
AAY: WYH_00669(rlmD)
ANH: A6F65_01852(rlmD)
ADO: A6F68_02289(rlmD)
GOX: GOX0093
GOH: B932_2427
ACR: Acry_0533
GDI: GDI3050(rumA)
GDJ: Gdia_3318
GXY: GLX_08860
GXL: H845_2057
KEU: S101446_01339(rumA)
APK: APA386B_577(rumA)
ASZ: ASN_3076(rumA)
ABG: Asbog_01097(rumA)
RRU: Rru_A2107
RRF: F11_10835
RCE: RC1_2750
MAG: amb0328
MAGX: XM1_1256
MAGN: WV31_14395
AZL: AZL_003330(ygcA)
TMO: TMO_0938
TXI: TH3_02750
MAGQ: MGMAQ_3132
MGM: Mmc1_3618
MAI: MICA_993
MAN: A11S_956
AFR: AFE_2828(rumA)
ACU: Atc_0245
BSU: BSU06730(yefA) BSU08020(yfjO)
BSH: BSU6051_06730(yefA) BSU6051_08020(yfjO)
BSUT: BSUB_00744(rlmCD) BSUB_00876(yfjO)
BSUL: BSUA_00744(rlmCD) BSUA_00876(yfjO)
BSS: BSUW23_03415(yefA) BSUW23_04065(yfjO)
BSQ: B657_06730(rlmCD) B657_08020(yfjO)
BSX: C663_0697(yefA) C663_0825(yfjO)
BLI: BL02629(yefA) BL03091(yfjO)
BLD: BLi00742(yefA) BLi00832(yfjO)
BLH: BaLi_c08300(yefA) BaLi_c09360(yfjO)
BAY: RBAM_007130(yefA) RBAM_008250(yfjO)
BAQ: BACAU_0684(trmA1) BACAU_0795(trmA3)
BYA: BANAU_0629(trmA) BANAU_0746(yfjO)
BAML: BAM5036_0634(rlmCD) BAM5036_0737(yfjO)
BAMA: RBAU_0693(rlmCD) RBAU_0801(yfjO)
BAMN: BASU_0665(rlmCD) BASU_0777(yfjO)
BAMB: BAPNAU_0640(trmA) BAPNAU_0757(yfjO)
BAMY: V529_06390(yefA) V529_07690
BMP: NG74_00701(rlmCD_1) NG74_00823(rlmCD_2)
BAO: BAMF_0668(yefA) BAMF_0775(yfjO)
BAZ: BAMTA208_03145(yefA) BAMTA208_03680(yfjO)
BQL: LL3_00717(yefA) LL3_00827(yfjO)
BQY: MUS_0690(yefA) MUS_0828(yfjO)
BHA: BH0687
BAN: BA_0333
BAR: GBAA_0333
BAT: BAS0318
BAI: BAA_0390
BANT: A16_03700
BANR: A16R_03750
BANS: BAPAT_0310
BANV: DJ46_4770(rumA)
BCE: BC0364
BCA: BCE_0363
BCZ: BCE33L0305(trmA)
BCQ: BCQ_0383(trmA)
BCX: BCA_0407
BNC: BCN_0329
BCF: bcf_01890
BCER: BCK_06245
BTL: BALH_0324(trmA)
BTT: HD73_0375
BTHI: BTK_02035
BTM: MC28_5048
BTG: BTB_c03830(rumA1)
BTI: BTG_19270
BTW: BF38_1617(rumA)
BWW: bwei_5148
BMYO: BG05_135(rumA)
BMYC: DJ92_2960(rumA)
BCL: ABC1101
BPF: BpOF4_09920(yefA)
BMQ: BMQ_0302(rumA) BMQ_0388(rumA)
BMD: BMD_0296(rumA) BMD_0389(rumA)
BMH: BMWSH_4935(trmA)
BMEG: BG04_2586(rumA)
BCOA: BF29_1832(rumA) BF29_3115(rumA)
BJS: MY9_0764
BMET: BMMGA3_01880(rlmCD)
BACO: OXB_0318
BACL: BS34A_07700(yefA) BS34A_08980(yfjO)
BEO: BEH_01965
BGY: BGLY_0753(rlmCD) BGLY_0857(yfjO)
BKW: BkAM31D_02115(rlmCD_1)
BBEV: BBEV_0832(ygcA-1) BBEV_2565(ygcA-2)
OIH: OB0768
GKA: GK0342
GTN: GTNG_0298
GEA: GARCT_00387(rlmCD_1)
ANM: GFC28_2194(rumA)
AAMY: GFC30_776(rumA)
ANL: GFC29_3242(rumA)
LSP: Bsph_0237
VPN: A21D_01023 A21D_02254(rlmCD)
SAU: SA1713
SAV: SAV1897
SAW: SAHV_1882
SAM: MW1838
SAS: SAS1819
SAR: SAR1988
SAC: SACOL1957
SAA: SAUSA300_1878(rumA)
SAE: NWMN_1835
SAD: SAAV_1963(rumA)
SUE: SAOV_1996
SUC: ECTR2_1768(rumA)
SUQ: HMPREF0772_11246(rumA)
SUZ: MS7_1932(rumA)
SUG: SAPIG1990(rumA)
SAUA: SAAG_02416
SAUS: SA40_1737
SAUU: SA957_1821
SAUG: SA268_1893
SAUF: X998_1952
SAB: SAB1829c
SAUB: C248_1971
SAUC: CA347_1984(rumA)
SAUR: SABB_02322
SAUI: AZ30_10115
SAUD: CH52_09440
SEP: SE1582
SER: SERP1435
SEPP: SEB_01568
SEPS: DP17_526(rumA)
SHA: SH1056
SSP: SSP0894
SCA: SCA_1469
SPAS: STP1_0417(rumA)
SSCH: LH95_04230
SSCZ: RN70_04445
SAGQ: EP23_05660
MCL: MCCL_1629
MCAK: MCCS_20840(rlmCD)
LMO: lmo1751
LMOE: BN418_2102
LMOB: BN419_2103
LMOD: LMON_1818
LMOW: AX10_02965
LMOQ: LM6179_2511(rlmCD)
LMR: LMR479A_1856(rlmCD)
LMOM: IJ09_01100
LMP: MUO_08995
LMOX: AX24_06480
LMH: LMHCC_0813(rumA)
LMQ: LMM7_1839(rsmF)
LMS: LMLG_1486
LMOK: CQ02_09090
LIN: lin1863
LWE: lwe1768
LSG: lse_1723
LIV: LIV_1728
ESI: Exig_2506
EAN: Eab7_2351
BBE: BBR47_07090(rumA) BBR47_09920(rumA)
BLR: BRLA_c005420(rlmCD)
PPY: PPE_00813
PPM: PPSC2_04475(yefA)
PPO: PPM_0838(yefA)
PPOL: X809_04035
PPQ: PPSQR21_008790(trmA)
PPOY: RE92_07510
PMW: B2K_34405
PLV: ERIC2_c08410(rlmCD)
PSAB: PSAB_03295
PRI: PRIO_0817
PSWU: SY83_02370
ASOC: CB4_04078(rlmCD_2)
AAC: Aaci_0690
AAD: TC41_0658
BTS: Btus_2798
SIV: SSIL_0532
KUR: ASO14_423(rumA) ASO14_472(rumA)
LLA: L193873(yljE)
LLK: LLKF_1203(rumA)
LLT: CVCAS_1154(rumA1)
LLS: lilo_1081(yljE)
LLX: NCDO2118_1177(rumA)
LLC: LACR_1354
LLM: llmg_1315
LLR: llh_6850
LLW: kw2_1150(rumA1)
LLJ: LG36_1209(rumA1)
LGR: LCGT_1008
LGV: LCGL_1032
SPY: SPy_1346
SPYA: A20_1132c(rumA)
SPS: SPs0836
SPF: SpyM50761
STG: MGAS15252_1037(trmA.1)
STX: MGAS1882_1033(trmA.1)
SPYH: L897_05480
SPN: SP_1029
SPD: SPD_0914(rumA-1)
SPR: spr0932
SPW: SPCG_1007
SJJ: SPJ_0967(rumA1)
SPX: SPG_0953
SNT: SPT_1080(rumA1)
SND: MYY_1087
SPNN: T308_05035
SPV: SPH_1131(rumA)
SNC: HMPREF0837_11450(rumA)
SNM: SP70585_1067(rumA1)
SPP: SPP_1034(rumA1)
SPNG: HMPREF1038_01158(rumA1)
SNP: SPAP_1170
SAG: SAG0633
SAN: gbs0613
SAK: SAK_0718(rumA)
SGC: A964_0602(rumA)
SAGL: GBS222_0531(rumA)
SAGM: BSA_6550
SAGI: MSA_7020
SAGR: SAIL_6780
SAGP: V193_03065
SAGC: DN94_03065
SAGE: EN72_03585
SAGG: EN73_03700
SAGN: W903_0745
SMU: SMU_788
SMUA: SMUFR_0684(rumA)
STC: str0653
STL: stu0653
STE: STER_0702
STN: STND_0652
STW: Y1U_C0627
STHE: T303_04435
SSA: SSA_1459
SSI: SSU0561
SUP: YYK_02650
SSUY: YB51_3780
SSUT: TL13_1177
SSUI: T15_1378(rumA)
SGO: SGO_1364(rumA-2)
SEZ: Sez_0703
SEQ: SZO_12990
SEQU: Q426_05790
SEU: SEQ_0729
SUB: SUB1189
SDS: SDEG_1350
SDA: GGS_1263
SDC: SDSE_1428(rumA)
SGG: SGGBAA2069_c14540(rumA)
SGT: SGGB_1422
SMB: smi_1119
SOR: SOR_1046
STK: STP_1034
STB: SGPB_1333
SCP: HMPREF0833_10336(rumA)
SCF: Spaf_0874(trmA)
SSR: SALIVB_1415(yljE)
STF: Ssal_01495(rumA)
SMN: SMA_1435
SIE: SCIM_0627
SIB: SIR_1003(rumA1)
SIU: SII_1022(rumA1)
SANG: SAIN_1185(rumA1)
SANC: SANR_1373(rumA1)
SANS: DK43_03675
SCG: SCI_1322(rumA1)
SCON: SCRE_1279(rumA1)
SCOS: SCR2_1279(rumA1)
SIK: K710_0684
SLU: KE3_1320
STRN: SNAG_1050(rlmCD_2)
LPL: lp_1151(rumA)
LPJ: JDM1_0946
LPZ: Lp16_0923
LJO: LJ_1698
LJF: FI9785_1492(rumA2)
LJH: LJP_1447c
LAC: LBA0539
LAD: LA14_0566
LAF: SD55_0563
LSA: LCA_1544
LSL: LSL_1341(trmA)
LSI: HN6_01118(trmA)
LSJ: LSJ_1370c(trmA)
LDB: Ldb0473
LBU: LBUL_0421
LDL: LBU_0391
LBR: LVIS_1627
LCA: LSEI_1061
LPAP: LBPC_0997
LCB: LCABL_12260(trmA)
LCS: LCBD_1201
LCE: LC2W_1222
LGA: LGAS_1493
LRE: Lreu_1438
LRF: LAR_1349
LRU: HMPREF0538_20545(rumA)
LRT: LRI_0536
LHL: LBHH_1576
LHV: lhe_0640
LHH: LBH_0454
LHD: HUO_09315
LFE: LAF_1469
LFR: LC40_0942
LFF: LBFF_1613
LRH: LGG_01022(rumA)
LRG: LRHM_0980
LRL: LC705_01101(rumA)
LRA: LRHK_1063(rumA)
LCR: LCRIS_00553(rumA1)
LBH: Lbuc_1682
LBN: LBUCD034_1751(trmA)
LKE: WANG_0573(rumA1) WANG_1129
LRM: LRC_05130(rumA)
LSN: LSA_10850
LAE: LBAT_1301
PPE: PEPE_1366
PPEN: T256_06755
PCE: PECL_1262(rumA)
EFA: EF0728
EFL: EF62_1114(rumA)
EFI: OG1RF_10465(rumA)
EFS: EFS1_0574(trmA)
EFN: DENG_00777(rumA)
EFQ: DR75_2684(rumA)
ENE: ENT_23930
EFU: HMPREF0351_11603(trmA2)
EFM: M7W_1265
EHR: EHR_10815
ECAS: ECBG_02168
EMU: EMQU_1601
EDU: LIU_09365
MPS: MPTP_0666
MPX: MPD5_1262
THL: TEH_14620
OOE: OEOE_1674
LME: LEUM_1577
LCI: LCK_01338(rumA3)
WKO: WKK_01610
AUR: HMPREF9243_1944(rumA)
CRN: CAR_c16250(yefA)
CML: BN424_2666(rumA)
CARC: NY10_1014
JDA: BW727_100086(rlmCD_1) BW727_100146(rlmCD_2)
CAC: CA_C0523
CAE: SMB_G0533
CAY: CEA_G0534
CPE: CPE0367
CPF: CPF_0357(rumA)
CPR: CPR_0348(rumA_1)
CTC: CTC_02481
CNO: NT01CX_1299(rumA)
CBO: CBO3369
CBA: CLB_3425(rumA-2)
CBH: CLC_3312(rumA-2)
CBY: CLM_3829(rumA)
CBL: CLK_2801(rumA)
CBK: CLL_A3330(rumA)
CBB: CLD_1140(rumA)
CBI: CLJ_B3672(rumA_2)
CBN: CbC4_0448(rumA)
CBT: CLH_3084(rumA)
CBF: CLI_3552(rumA-2)
CBM: CBF_3535
CBE: Cbei_4850
CBZ: Cbs_4850
CBEI: LF65_05454
CKL: CKL_3557
CKR: CKR_3136
CLS: CXIVA_18240(TrmA)
CSR: Cspa_c55040(rumA2)
CPAS: Clopa_3569
CPAT: CLPA_c27600(rumA2)
CPAE: CPAST_c27600(rumA2)
CBV: U729_758(rumA)
CSQ: CSCA_4436
CLD: CLSPO_c35250(rumA2)
CACE: CACET_c32230(rumA2)
CTYK: CTK_C27640
AMT: Amet_4060
AOE: Clos_0590
ASF: SFBM_0085
ASB: RATSFB_0086(rumA)
CLO: HMPREF0868_0113(rumA)
CTH: Cthe_1751
HSC: HVS_14005(rlmCD)
CCE: Ccel_2868
CSS: Cst_c19540(rumA)
CSD: Clst_1873
CCEL: CCDG5_1191
RCH: RUM_06700
RUS: RBI_I01274(rumA1) RBI_II00223(rumA2)
BPB: bpr_I2830
BFI: CIY_03760
RIM: ROI_14370
RTO: RTO_00530
CPY: Cphy_0159
BPRL: CL2_04560
HSD: SD1D_0211
CPRO: CPRO_20040(rlmCD_2)
CDF: CD630_33930(rumA)
PDC: CDIF630_03698(rumA)
STH: STH2818
SWO: Swol_2225
SLP: Slip_1159
DSY: DSY3765
DHD: Dhaf_1583
DRM: Dred_2261
DAE: Dtox_2249
PTH: PTH_1518(TrmA)
DAU: Daud_0535
SGY: Sgly_0731
HMO: HM1_2983(rumA)
ELM: ELI_1536
OVA: OBV_12370
TMR: Tmar_0489
SAY: TPY_0989
CTHM: CFE_2503
TTE: TTE1812(TrmA2)
THX: Thet_1713
TIT: Thit_1627
CHY: CHY_1112(rumA)
TAE: TepiRe1_0939(rlmCD)
MTA: Moth_1912
ADG: Adeg_1295
TPZ: Tph_c23500(rumA)
CSC: Csac_0465
ATE: Athe_0455
TOC: Toce_1553
TTM: Tthe_0774
TSH: Tsac_1366
APR: Apre_0678
PMIC: NW74_04720
CAD: Curi_c20170(rumA2)
VPR: Vpar_0714
VRM: 44547418_00735(rlmCD)
MED: MELS_2021
MHG: MHY_08370
PUF: UFO1_1447
PFT: JBW_02882
AIN: Acin_1868
ERH: ERH_0163(rumA)
EUC: EC1_10500
MSY: MS53_0111
MAA: MAG6630
MAL: MAGa7590
MAT: MARTH_orf754(trmA)
MHO: MHO_4570
MCD: MCRO_0637
MHR: MHR_0512(trmA)
MHH: MYM_0541
MHM: SRH_03280
MHS: MOS_582
MHV: Q453_0582(rumA)
MFR: MFE_00910(trmA)
MFM: MfeM64YM_0089(trmA)
MFP: MBIO_0125
MBV: MBOVPG45_0757(rumA)
MBH: MMB_0714
MBI: Mbov_0749
MCY: MCYN_0471(MCYN0471)
MCR: MCFN_00330(rumA)
MCM: MCAL160_0962(trmA)
MCAN: MCAN360_0144(trmA)
MARG: MARG145_0467(trmA)
ABRA: BN85309750(rumA) BN85312430(trmA)
APAL: BN85405710(rumA) BN85407960(rumA) BN85410450(rumA) BN85410580(rumA)
AOC: Aocu_05180(rumA1) Aocu_07080(rumA4)
MBJ: KQ51_00571(rlmCD_1)
CWO: Cwoe_0782
AEQ: AEQU_0872
SYN: sll1967
SYZ: MYO_18360
SYY: SYNGTS_0831(sll1967)
SYT: SYNGTI_0831(sll1967)
SYS: SYNPCCN_0830(sll1967)
SYQ: SYNPCCP_0830(sll1967)
SYW: SYNW1228
SYC: syc1272_c
SYG: sync_1340(rumA)
SYP: SYNPCC7002_A0557(rumA)
CYA: CYA_0025(rumA)
CYB: CYB_0500(rumA)
SYNR: KR49_02195
SYND: KR52_09785
SYH: Syncc8109_1322(rumA)
SYNW: SynWH8103_01361(rumA)
TEL: tlr0942
THN: NK55_11275(rumA)
LET: O77CONTIG1_00313(rlmCD)
PMA: Pro_0965(trmA)
PMT: PMT_0737
PMF: P9303_14811(trmA)
AMR: AM1_5265(rumA)
MAR: MAE_35680
MPK: VL20_5664
CYL: AA637_11215(rumA)
CYT: cce_1338
TER: Tery_4802
GVI: gll3134
GLJ: GKIL_1337(rumA)
ANA: alr3654
AVA: Ava_3634
NAZ: Aazo_3654
ANB: ANA_C20029(rumA)
CALH: IJ00_11775
CTHE: Chro_0289
CEO: ETSB_1941
DET: DET1065
DEH: cbdbA1043
DEV: DhcVS_936(ygcA)
DMC: btf_1019
DMD: dcmb_1002
DMG: GY50_0951
DEW: DGWBC_0770(maf)
DFO: Dform_01044(rumA)
RCA: Rcas_0552
CAU: Caur_1235
CAG: Cagg_2200
HAU: Haur_0615
TRO: trd_0216(rumA)
STI: Sthe_2682
ATM: ANT_24820
DRA: DR_0238
DGE: Dgeo_1777
TRA: Trad_2165
TTH: TT_C0988
TTJ: TTHA1353
TAQ: TO73_0588
MRB: Mrub_1636
TTR: Tter_2704
PCU: pc0248 pc1998(rumA)
PUV: PUV_20330
WCH: wcw_1838(rumA2)
OTE: Oter_0855
OBG: Verru16b_01072(rlmCD)
CAA: Caka_2482
AMU: Amuc_0850
AGL: PYTT_1933
MIN: Minf_0133(trmA)
TDE: TDE2619
TPED: TPE_2298
LIL: LA_0292(trmA)
LIE: LIF_A0246(trmA)
LIC: LIC_10249
LIS: LIL_10248(trmA2)
LBJ: LBJ_0657(trmA-2)
LBL: LBL_2422(trmA-2)
LBF: LBF_0091(trmA-2)
LST: LSS_15931
BRM: Bmur_0451
BPJ: B2904_orf983(ygcA)
BPW: WESB_1704(ygcA)
BIP: Bint_1086(ygcA)
ACA: ACP_2578(rumA)
ABAS: ACPOL_6095
SUS: Acid_5841
ABAC: LuPra_04487(rlmCD)
FNU: FN1713
FVA: FV113G1_08970(rlmCD)
LBA: Lebu_1565
SMF: Smon_0571
TAI: Taci_0963
TLI: Tlie_0959
FSC: FSU_2767
GAU: GAU_1781
GBA: J421_3416
BTH: BT_0643
BTHO: Btheta7330_02159(rlmCD)
BFR: BF2539
BVU: BVU_3357
BOA: Bovatus_01066(rlmCD)
BCEL: BcellWH2_00475(rlmCD)
BACC: BRDCF_p1030(ygcA)
PGI: PG_1095
PGN: PGN_1190
PCRE: NCTC12858_01662(rlmCD)
PDI: BDI_1030
TFO: BFO_2974(rumA)
PSAC: PSM36_3153
PRU: PRU_1513(rumA)
PMZ: HMPREF0659_A5566(rumA)
PDN: HMPREF9137_2299(rumA)
PIT: PIN17_A1528(rumA)
AFD: Alfi_1623
ASH: AL1_16990
DORI: FH5T_02500
BLQ: L21SP5_03316(rlmCD)
MBAS: ALGA_2444
RMR: Rmar_2557
CPI: Cpin_0862
FLN: FLA_5627
PHE: Phep_3623
SMIZ: 4412673_03664(rlmCD)
MUC: MuYL_3924
MGOT: MgSA37_01463(rlmCD)
CHU: CHU_2518(rumA)
DFE: Dfer_1077
SLI: Slin_1688
LBY: Lbys_0761
FAE: FAES_4265
PSEZ: HME7025_01542(rumA)
HSW: Hsw_2819
FLM: MY04_1113
AAS: Aasi_0005
GFO: GFO_1887(trmA)
GFL: GRFL_3619
FJO: Fjoh_2500
FJG: BB050_00154(rlmCD)
FPS: FP0734(trmA)
FBR: FBFL15_2163(trmA)
FIN: KQS_03130(trmA)
COC: Coch_2157
ZPR: ZPR_1855
RAI: RA0C_1335
RAR: RIA_1152
RAG: B739_0823
RAE: G148_0543
RAT: M949_1285
MARM: YQ22_14295
CBAL: M667_10265
CBAT: M666_10255
DDO: I597_1615(rlmCD)
ZGA: ZOBELLIA_3131(rumA)
MLT: VC82_2408
NDO: DDD_0372
EAO: BD94_0320
ELB: VO54_02272(rlmCD)
MYR: MYRA21_3160(rumA)
MPW: MPR_1988
CHZ: CHSO_4472(rumA)
CTAK: 4412677_01265(rlmCD)
AALG: AREALGSMS7_04885(rlmCD)
OAQ: DZC78_03440(rlmD)
SPON: HME9304_02617(rumA)
KOS: KORDIASMS9_04381(rlmCD)
MARF: CJ739_2923
AQB: D1818_24110(rlmD)
AQA: D1815_08115(rlmD)
FBA: FIC_01972
FBU: UJ101_02480(rumA)
CTE: CT0009
CPC: Cpar_2082
CCH: Cag_2028
CLI: Clim_2518
PVI: Cvib_1769
PLT: Plut_2126
PPH: Ppha_2909
PAA: Paes_2332
PROC: Ptc2401_02293(rlmCD)
CTS: Ctha_1954
IAL: IALB_2968
MRO: MROS_1145
CACI: CLOAM1144(trmA)
AAE: aq_257(ygcA)
HTH: HTH_0023(trmA)
TAL: Thal_1171
SAF: SULAZ_0371(rumA)
PMX: PERMA_1601(rumA)
TTK: TST_0901(rumA)
TMA: TM1094
TMW: THMA_1117
TMQ: THMB_1117
TMX: THMC_1117
TPT: Tpet_1649
TRQ: TRQ2_1722
TNP: Tnap_1672
THER: Y592_08330
MARN: LN42_00880
DTN: DTL3_1272
CABY: Cabys_3297
DTH: DICTH_0542(rumA)
DTU: Dtur_0703
TYE: THEYE_A1400(rumA)
CTHI: THC_1345
SAAL: L336_0909
 » show all
Taxonomy
Reference
1  [PMID:11779873]
  Authors
Agarwalla S, Kealey JT, Santi DV, Stroud RM
  Title
Characterization of the 23 S ribosomal RNA m5U1939 methyltransferase from Escherichia coli.
  Journal
J Biol Chem 277:8835-40 (2002)
DOI:10.1074/jbc.M111825200
  Sequence
[eco:b2785]
Reference
2  [PMID:15016356]
  Authors
Lee TT, Agarwalla S, Stroud RM
  Title
Crystal structure of RumA, an iron-sulfur cluster containing E. coli ribosomal RNA 5-methyluridine methyltransferase.
  Journal
Structure 12:397-407 (2004)
DOI:10.1016/j.str.2004.02.009
  Sequence
[eco:b2785]
Reference
3  [PMID:12907714]
  Authors
Madsen CT, Mengel-Jorgensen J, Kirpekar F, Douthwaite S
  Title
Identifying the methyltransferases for m(5)U747 and m(5)U1939 in 23S rRNA using MALDI mass spectrometry.
  Journal
Nucleic Acids Res 31:4738-46 (2003)
  Sequence
[eco:b2785]
Reference
4  [PMID:20067766]
  Authors
Persaud C, Lu Y, Vila-Sanjurjo A, Campbell JL, Finley J, O'Connor M
  Title
Mutagenesis of the modified bases, m(5)U1939 and psi2504, in Escherichia coli 23S rRNA.
  Journal
Biochem Biophys Res Commun 392:223-7 (2010)
DOI:10.1016/j.bbrc.2010.01.021
Reference
5  [PMID:15181002]
  Authors
Agarwalla S, Stroud RM, Gaffney BJ
  Title
Redox reactions of the iron-sulfur cluster in a ribosomal RNA methyltransferase,  RumA: optical and EPR studies.
  Journal
J Biol Chem 279:34123-9 (2004)
DOI:10.1074/jbc.M405702200
Reference
6  [PMID:15766524]
  Authors
Lee TT, Agarwalla S, Stroud RM
  Title
A unique RNA Fold in the RumA-RNA-cofactor ternary complex contributes to substrate selectivity and enzymatic function.
  Journal
Cell 120:599-611 (2005)
DOI:10.1016/j.cell.2004.12.037
  Sequence
[eco:b2785]
Other DBs
ExplorEnz - The Enzyme Database: 2.1.1.190
IUBMB Enzyme Nomenclature: 2.1.1.190
ExPASy - ENZYME nomenclature database: 2.1.1.190
BRENDA, the Enzyme Database: 2.1.1.190

DBGET integrated database retrieval system