KEGG   ENZYME: 2.3.1.50Help
Entry
EC 2.3.1.50                 Enzyme                                 

Name
serine C-palmitoyltransferase;
serine palmitoyltransferase;
SPT;
3-oxosphinganine synthetase;
acyl-CoA:serine C-2 acyltransferase decarboxylating
Class
Transferases;
Acyltransferases;
Transferring groups other than aminoacyl groups
BRITE hierarchy
Sysname
palmitoyl-CoA:L-serine C-palmitoyltransferase (decarboxylating)
Reaction(IUBMB)
palmitoyl-CoA + L-serine = CoA + 3-dehydro-D-sphinganine + CO2 [RN:R01281]
Reaction(KEGG)
Substrate
palmitoyl-CoA [CPD:C00154];
L-serine [CPD:C00065]
Product
CoA [CPD:C00010];
3-dehydro-D-sphinganine [CPD:C02934];
CO2 [CPD:C00011]
Comment
A pyridoxal-phosphate protein.
History
EC 2.3.1.50 created 1976, modified 1982
Pathway
ec00600  Sphingolipid metabolism
ec01100  Metabolic pathways
Orthology
K00654  serine palmitoyltransferase
Genes
HSA: 10558(SPTLC1) 55304(SPTLC3) 9517(SPTLC2)
PTR: 457898(SPTLC2) 464590(SPTLC1) 735328(SPTLC3)
PPS: 100986708(SPTLC1) 100986957(SPTLC3) 100995803(SPTLC2)
GGO: 101135062(SPTLC3) 101145241(SPTLC1) 101148765(SPTLC2)
PON: 100173375(SPTLC1) 100438231(SPTLC3) 100446763(SPTLC2)
NLE: 100601824(SPTLC2) 100603561(SPTLC3) 101176191(SPTLC1)
MCC: 693775(SPTLC3) 705324(SPTLC1) 707625(SPTLC2)
MCF: 101864870(SPTLC1) 102123629(SPTLC3) 102141632(SPTLC2)
CSAB: 103214399(SPTLC3) 103219749(SPTLC1) 103229912(SPTLC2)
RRO: 104655755(SPTLC3) 104670382(SPTLC1) 104677622(SPTLC2)
RBB: 108516811(SPTLC1) 108527781(SPTLC3) 108534968(SPTLC2)
CJC: 100394661(SPTLC1) 100403226(SPTLC2) 100404513(SPTLC3) 103791106
SBQ: 101031025(SPTLC2) 101040902(SPTLC3) 101042218(SPTLC1)
MMU: 20773(Sptlc2) 228677(Sptlc3) 268656(Sptlc1)
RNO: 296188(Sptlc3) 361213(Sptlc1) 366697(Sptlc2)
CGE: 100689326(Sptlc1) 100689415(Sptlc2) 100770263(Sptlc3)
NGI: 103729201(Sptlc3) 103739503(Sptlc2) 103745413(Sptlc1)
HGL: 101702355(Sptlc2) 101702482(Sptlc3) 101716616(Sptlc1)
CCAN: 109683340(Sptlc1) 109685387(Sptlc2) 109688322(Sptlc3)
OCU: 100339302(SPTLC3) 100344536(SPTLC1) 100358555(SPTLC2)
TUP: 102474294(SPTLC2) 102478276(SPTLC1) 102503311(SPTLC3)
CFA: 480403(SPTLC2) 484192(SPTLC1) 485766(SPTLC3)
AML: 100464437(SPTLC2) 100474286(SPTLC1) 100481338(SPTLC3)
UMR: 103663198(SPTLC1) 103674021(SPTLC2) 103674441(SPTLC3)
ORO: 101377713(SPTLC1) 101382423(SPTLC2) 101383465 101386945(SPTLC3)
FCA: 101081055(SPTLC2) 101087947(SPTLC1) 101094257(SPTLC3)
PTG: 102956963(SPTLC3) 102957170(SPTLC2) 102960457(SPTLC1)
AJU: 106974341(SPTLC2) 106981491(SPTLC3) 106984743(SPTLC1)
BTA: 100336940(SPTLC3) 537972(SPTLC2) 614165(SPTLC1)
BOM: 102266630(SPTLC3) 102270429(SPTLC1) 102273673(SPTLC2)
BIU: 109563274(SPTLC1) 109564421(SPTLC2) 109567923(SPTLC3)
PHD: 102316440(SPTLC2) 102339296(SPTLC3) 102343441(SPTLC1)
CHX: 102173567(SPTLC1) 102178736(SPTLC2) 102184072(SPTLC3)
OAS: 101105721(SPTLC1) 101110257(SPTLC3) 101115373(SPTLC2)
SSC: 100158010(SPTLC2) 100519280(SPTLC3) 100739638(SPTLC1)
CDK: 105086060(SPTLC2) 105094537(SPTLC1) 105096266 105101171(SPTLC3)
BACU: 102998165 103002487(SPTLC3) 103010400(SPTLC2)
LVE: 103068541(SPTLC2) 103083497 103088252(SPTLC3)
OOR: 101273901(SPTLC2) 101275360(SPTLC3) 101283585(SPTLC1)
ECB: 100051200(SPTLC3) 100059392(SPTLC2) 100063025(SPTLC1)
EPZ: 103543047(SPTLC1) 103550065(SPTLC3) 103561858(SPTLC2)
EAI: 106834811(SPTLC2) 106839744(SPTLC1) 106846835(SPTLC3)
MYB: 102253057(SPTLC1) 102260066(SPTLC3) 102260758(SPTLC2)
MYD: 102756738(SPTLC3) 102764240(SPTLC2) 102766198(SPTLC1)
HAI: 109378966(SPTLC3) 109381600(SPTLC2) 109396678(SPTLC1)
RSS: 109435459(SPTLC3) 109435791(SPTLC1) 109440779 109448223(SPTLC2)
PALE: 102882430(SPTLC3) 102889080(SPTLC1) 102898066(SPTLC2)
LAV: 100657055(SPTLC2) 100657962(SPTLC1) 100676611(SPTLC3)
MDO: 100022019(SPTLC2) 100027691(SPTLC1) 100031613(SPTLC3)
SHR: 100913568 100916538(SPTLC1) 100926525(SPTLC2) 100929790(SPTLC3)
OAA: 100078603(SPTLC3)
GGA: 423379(SPTLC2) 426145(SPTLC1) 768538(SPTLC3)
MGP: 100546649(SPTLC2) 100546896(SPTLC3) 100549855(SPTLC1)
CJO: 107306308(SPTLC1) 107310991(SPTLC3) 107315139(SPTLC2)
APLA: 101791744(SPTLC1) 101802374(SPTLC3) 101804192(SPTLC2)
ACYG: 106036668(SPTLC3) 106038801 106038845 106045086(SPTLC1)
TGU: 100217964(SPTLC1) 100219990(SPTLC2) 100226142(SPTLC3)
GFR: 102043866(SPTLC3) 102044004(SPTLC2) 102045072(SPTLC1)
FAB: 101806032(SPTLC3) 101812538(SPTLC1) 101815595(SPTLC2)
PHI: 102108467(SPTLC1) 102114223(SPTLC2) 102114737(SPTLC3)
PMAJ: 107198205(SPTLC1) 107202516(SPTLC3) 107205907(SPTLC2)
CCAE: 111926484(SPTLC3) 111929563(SPTLC2) 111941743(SPTLC1)
CCW: 104685489(SPTLC2) 104689808(SPTLC1) 104691532(SPTLC3)
FPG: 101915013(SPTLC2) 101915694(SPTLC1) 101918113(SPTLC3)
FCH: 102051646(SPTLC2) 102053433(SPTLC3) 102057729(SPTLC1)
CLV: 102090568(SPTLC2) 102093122(SPTLC1) 102097238(SPTLC3)
EGZ: 104122518(SPTLC3) 104126928(SPTLC1) 104133268(SPTLC2)
AAM: 106482896(SPTLC2) 106498787(SPTLC3) 106499356(SPTLC1)
ASN: 102370752 102372764(SPTLC2) 102387546(SPTLC1)
AMJ: 102563460(SPTLC2) 102572193(SPTLC1) 106736860(SPTLC3)
PSS: 102446068(SPTLC1) 102446973 102451002(SPTLC2) 102461604
CMY: 102940812(SPTLC1) 102945751(SPTLC2) 102946340(SPTLC3)
CPIC: 101943588(SPTLC1) 101949541(SPTLC3) 101950139(SPTLC2)
ACS: 100553356(sptlc3) 100553895(sptlc1) 100566142(sptlc2)
PVT: 110079368(SPTLC2) 110081111(SPTLC1) 110090457
PBI: 103049823(SPTLC2) 103054067(SPTLC3) 103067129(SPTLC1)
GJA: 107109927(SPTLC1) 107112039 107116452(SPTLC2)
XLA: 108698690 108716572 432022(sptlc1.L) 444190(sptlc2.S) 734997(sptlc3.S)
XTR: 100380000(sptlc2) 100487030(sptlc3) 779626(sptlc1)
DRE: 445168(sptlc3) 553646(sptlc2a) 553981(sptlc1) 557286(sptlc2b)
IPU: 108269990(sptlc2) 108277334(sptlc1)
AMEX: 103027964(sptlc1) 103038357(sptlc2)
TRU: 101061430(sptlc2) 101068684(sptlc3) 101069659 101076263(sptlc1)
LCO: 104918218(sptlc3) 104926954(sptlc2) 104929594 104937435(sptlc1)
MZE: 101470439 101471723(sptlc2) 101473235(sptlc1) 101485928(sptlc3)
OLA: 101156930 101165525 101166657(sptlc3) 101173642(sptlc1)
XMA: 102222928(sptlc1) 102224346 102231219(sptlc3) 102233023
PRET: 103457821 103460525 103473514(sptlc1) 103477233(sptlc3)
NFU: 107375455(sptlc3) 107376248 107378157(sptlc2) 107390274(sptlc1) 107392601
KMR: 108231845(sptlc2) 108233933(sptlc3) 108241723 108246450(sptlc1)
CSEM: 103380703(sptlc2) 103387336(sptlc3) 103389849(sptlc1)
LCF: 108877124(sptlc3) 108897935 108898070 108900720(sptlc1)
SDU: 111220609(sptlc3) 111221174(sptlc1) 111225762 111235747
MALB: 109958840(sptlc3) 109965025 109970535 109970917(sptlc1)
ELS: 105007796(sptlc3) 105015447(sptlc2) 105017682 105020447(sptlc1)
SFM: 108919642 108922330 108927136(sptlc3) 108929865(sptlc1)
LCM: 102354750(SPTLC2) 102363858(SPTLC1) 102365737(SPTLC3)
CMK: 103177917(sptlc3) 103182864(sptlc1) 103186785(sptlc2)
SPU: 579033 581818(sptlc2) 588779
DME: Dmel_CG4016(Spt-I) Dmel_CG4162(lace)
DSI: Dsimw501_GD10944(Dsim_GD10944) Dsimw501_GD24010(Dsim_GD24010)
CEL: CELE_C23H3.4(sptl-1) CELE_F43H9.2(sptl-2) CELE_T22G5.5(sptl-3)
CBR: CBG06999(Cbr-sptl-1) CBG11388(Cbr-sptl-2) CBG11447(Cbr-sptl-3)
ATH: AT3G48780(SPT1) AT3G48790 AT4G36480(LCB1) AT5G23670(LCB2)
CPAP: 110813004
LJA: Lj0g3v0091189.1(Lj0g3v0091189.1) Lj0g3v0091199.1(Lj0g3v0091199.1) Lj0g3v0091199.2(Lj0g3v0091199.2) Lj0g3v0266309.1(Lj0g3v0266309.1) Lj5g3v0290740.1(Lj5g3v0290740.1)
DOSA: Os01t0928600-01(Os01g0928600) Os01t0928700-00(Os01g0928700) Os01t0928800-01(Os01g0928800) Os02t0806900-01(Os02g0806900) Os03t0252800-01(Os03g0252800) Os10t0189600-01(Os10g0189600) Os11t0516000-01(Os11g0516000)
ATS: 109741721(LOC109741721) 109776860(LOC109776860)
SCE: YDR062W(LCB2) YMR296C(LCB1)
KMX: KLMA_10498(LCB1) KLMA_10599(LCB2)
NCS: NCAS_0B04340(NCAS0B04340) NCAS_0F02130(NCAS0F02130)
NDI: NDAI_0A03740(NDAI0A03740) NDAI_0C03660(NDAI0C03660)
TPF: TPHA_0A05510(TPHA0A05510) TPHA_0D04270(TPHA0D04270)
TBL: TBLA_0A08710(TBLA0A08710) TBLA_0C06910(TBLA0C06910)
TDL: TDEL_0B04330(TDEL0B04330) TDEL_0G00530(TDEL0G00530)
KAF: KAFR_0C02730(KAFR0C02730) KAFR_0D01860(KAFR0D01860)
PIC: PICST_84331(LCB2) PICST_90811(LCB1)
CAL: CAALFM_C113900CA(LCB2) CAALFM_CR08640CA(CaO19.6438)
SLB: AWJ20_1307(LCB1) AWJ20_2429(LCB2)
NTE: NEUTE1DRAFT146595(NEUTE1DRAFT_146595) NEUTE1DRAFT147718(NEUTE1DRAFT_147718)
ANG: ANI_1_1308164(An18g03820) ANI_1_186054(An06g01540) ANI_1_596074(An08g04100)
LBC: LACBIDRAFT_184356(SPT-1)
ABP: AGABI1DRAFT114647(AGABI1DRAFT_114647) AGABI1DRAFT75784(AGABI1DRAFT_75784)
ABV: AGABI2DRAFT194831(AGABI2DRAFT_194831) AGABI2DRAFT209409(AGABI2DRAFT_209409)
DDI: DDB_G0268056(sptA) DDB_G0291283(sptB)
DFA: DFA_00623(sptA) DFA_01989(sptB)
EHI: EHI_069310(32.t00018) EHI_152280(6.t00099)
SMIN: v1.2.014331.t2(symbB.v1.2.014331.t2)
GOX: GOX2056
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Taxonomy
Reference
1  [PMID:4388074]
  Authors
Brady RN, Di Mari SJ, Snell EE.
  Title
Biosynthesis of sphingolipid bases. 3. Isolation and characterization of ketonic intermediates in the synthesis of sphingosine and dihydrosphingosine by cell-free extracts of Hansenula ciferri.
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J Biol Chem 244:491-6 (1969)
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  Authors
Stoffel W, LeKim D, Sticht G.
  Title
Biosynthesis of dihydrosphingosine in vitro.
  Journal
Hoppe Seylers Z Physiol Chem 349:664-70 (1968)
Other DBs
ExplorEnz - The Enzyme Database: 2.3.1.50
IUBMB Enzyme Nomenclature: 2.3.1.50
ExPASy - ENZYME nomenclature database: 2.3.1.50
BRENDA, the Enzyme Database: 2.3.1.50
CAS: 62213-50-7

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