KEGG   ENZYME: 3.2.2.10Help
Entry
EC 3.2.2.10                 Enzyme                                 

Name
pyrimidine-5'-nucleotide nucleosidase;
pyrimidine nucleotide N-ribosidase;
Pyr5N
Class
Hydrolases;
Glycosylases;
Hydrolysing N-glycosyl compounds
BRITE hierarchy
Sysname
pyrimidine-5'-nucleotide phosphoribo(deoxyribo)hydrolase
Reaction(IUBMB)
a pyrimidine 5'-nucleotide + H2O = D-ribose 5-phosphate + a pyrimidine base [RN:R02171]
Reaction(KEGG)
Substrate
pyrimidine 5'-nucleotide [CPD:C03536];
H2O [CPD:C00001]
Product
D-ribose 5-phosphate [CPD:C00117];
pyrimidine base [CPD:C00396]
Comment
Also acts on dUMP, dTMP and dCMP.
History
EC 3.2.2.10 created 1972
Pathway
ec00240  Pyrimidine metabolism
Orthology
K06966  pyrimidine/purine-5'-nucleotide nucleosidase
Genes
ECO: b2795(ygdH)
ECJ: JW2766(ygdH)
ECD: ECDH10B_2964(ygdH)
EBW: BWG_2533(ygdH)
ECOK: ECMDS42_2300(ygdH)
ECE: Z4112(ygdH)
ECS: ECs3655
ECF: ECH74115_4059
ETW: ECSP_3747(ygdH)
ELX: CDCO157_3410
EOJ: ECO26_3865(ygdH)
EOI: ECO111_3520(ygdH)
EOH: ECO103_3338(ygdH)
ECOO: ECRM13514_3657(ygdH)
ECOH: ECRM13516_3522(ygdH)
ECG: E2348C_3062(ygdH)
EOK: G2583_3448(ygdH)
ESO: O3O_20130
ESM: O3M_05565
ESL: O3K_05520
ELH: ETEC_2985
ECC: c3361(ygdH)
ECP: ECP_2777
ECI: UTI89_C3165(ygdH)
ECV: APECO1_3736(ygdH)
ECY: ECSE_3055
ECR: ECIAI1_2905(ygdH)
ECQ: ECED1_3248(ygdH)
ECK: EC55989_3074(ygdH)
ECT: ECIAI39_3217(ygdH)
EOC: CE10_3221(ygdH)
EUM: ECUMN_3124(ygdH)
ECZ: ECS88_3064(ygdH)
ESE: ECSF_2586
EBR: ECB_02640(ygdH)
EBD: ECBD_0934
EAB: ECABU_c30640(ygdH)
EDJ: ECDH1ME8569_2705(ygdH)
ELW: ECW_m3005(ygdH)
ELL: WFL_14680
ELC: i14_3086(ygdH)
ELD: i02_3086(ygdH)
EBL: ECD_02640(ygdH)
EBE: B21_02602(ygdH)
ELF: LF82_3157(ygdH)
ECOI: ECOPMV1_03052(ygdH)
ECOJ: P423_15285
ECOS: EC958_3064(ygdH)
EFE: EFER_0265(ygdH)
STY: STY3108(ygdH)
STT: t2877(ygdH)
STM: STM2969(ygdH)
SEO: STM14_3578(ygdH)
SEY: SL1344_2949(ygdH)
SEJ: STMUK_2957(ygdH)
SEB: STM474_3114(ygdh)
SENR: STMDT2_28701(ygdH)
SEND: DT104_29671(ygdH)
SENI: CY43_15490
SPT: SPA2833(ygdH)
SEK: SSPA2638
SEI: SPC_3026(ygdH)
SEC: SCH_2908(ygdH)
SHB: SU5_03458
SENS: Q786_14350
SED: SeD_A3291
SEG: SG2879(ygdH)
SEL: SPUL_2977
SET: SEN2813(ygdH)
SENA: AU38_14285
SENO: AU37_14295
SENV: AU39_14295
SENQ: AU40_16085
SENL: IY59_14890
SEEP: I137_14155
SENE: IA1_14285
SBG: SBG_2584(ygdH)
SBZ: A464_2994
SFL: SF2808(ygdH)
SFX: S3003(ygdH)
SFV: SFV_2662(ygdH)
SFE: SFxv_3080
SFN: SFy_3995
SFS: SFyv_4073
SFT: NCTC1_03088(ygdH)
SSN: SSON_2952(ygdH)
SBO: SBO_2676(ygdH)
SDY: SDY_3012(ygdH)
ENC: ECL_04128
ECLO: ENC_30400
EEC: EcWSU1_03604(ygdH)
ECLX: LI66_18015
ECLY: LI62_19475
ECLZ: LI64_16920
ESA: ESA_00510
CSK: ES15_0770
CTU: CTU_33520(ygdH)
KPN: KPN_02004 KPN_03138(ygdH)
KPR: KPR_3044 KPR_4147(ygdH)
KPX: PMK1_00619(ygdH) PMK1_04348(yvdD)
KPNK: BN49_0976(ygdH) BN49_3100
KOX: KOX_01220
KOE: A225_4705
CKO: CKO_04151
CRO: ROD_28351
HDE: HDEF_0153
EBT: EBL_c08290(ygdH)
YPE: YPO1033
YPK: y3148
YPH: YPC_1067(ygdH)
YPA: YPA_0507
YPN: YPN_2969
YPM: YP_2818
YPZ: YPZ3_0940
YPD: YPD4_0898
YPX: YPD8_1200
YPW: CH59_828
YPJ: CH55_3782
YPV: BZ15_2537
YPL: CH46_4111
YPS: YPTB3013
YPO: BZ17_3607
YPY: YPK_1056
YPB: YPTS_3134
YPQ: DJ40_3468
YPU: BZ21_2327
YPR: BZ20_3152
YPC: BZ23_2607
YPF: BZ19_2391
YEN: YE3296
YEY: Y11_40921
YEW: CH47_249
YET: CH48_744
YAL: AT01_1611
YFR: AW19_2276
YIN: CH53_2710
YKR: CH54_3510
YRO: CH64_1683
YRU: BD65_1205
SPLY: Q5A_014165(yvdD) Q5A_020055(ygdH)
RAA: Q7S_04010
ECA: ECA1019
PATR: EV46_05210
PATO: GZ59_10570
PCT: PC1_0931
SGL: SG1951
SOD: Sant_0885(ygdH) Sant_3987
ETA: ETA_27320(ygdH)
EPY: EpC_28510(ygdH)
EPR: EPYR_03085(ygdH)
EAM: EAMY_0726(ygdH)
EAY: EAM_2715
EBI: EbC_35630
ERJ: EJP617_18860(ygdH)
EGE: EM595_2836(ygdH)
PAM: PANA_3093(ygdH)
PLF: PANA5342_0940(ygdH)
PAJ: PAJ_2368(ygdH)
PVA: Pvag_2476(ygdH)
PSTW: DSJ_05050
TPTY: NCTC11468_00877(ygdH)
XBV: XBW1_4188(ygdH)
XNE: XNC1_1482
XNM: XNC2_1444
XPO: XPG1_2278 XPG1_2741(ygdH)
PRG: RB151_011890(yvdD) RB151_035600(ygdH_1) RB151_035610(ygdH_2)
PHEI: NCTC12003_02869(yvdD) NCTC12003_03069(ygdH)
PSHI: SAMEA2665130_2407(ygdH)
HAP: HAPS_1785
HPAZ: K756_11905
HPAS: JL26_10430
HPAK: JT17_07900
HSO: HS_0850
HSM: HSM_1325
PMU: PM0475
PMV: PMCN06_0496(ygdH)
PMP: Pmu_05440(ygdH)
PMUL: DR93_1255
PDAG: 4362423_00878(ygdH)
MSU: MS1068
MHT: D648_6970
MHAT: B824_7760
MHX: MHH_c12960(ygdH)
MHAE: F382_11590
MHAM: J450_10275
MHAO: J451_11700
MHAL: N220_03710
MHAQ: WC39_10160
MHAY: VK67_10160
MVR: X781_7150
MVE: X875_5280
ASU: Asuc_1200
AAT: D11S_1890
AAN: D7S_00678
AACN: AANUM_1241
BTO: WQG_19450
BTRE: F542_3130
BTRH: F543_3780
BTRA: F544_19270
XFA: XF_0472
XFT: PD_1616
XOM: XOO1922(XOO1922) XOO3036(XOO3036)
XPH: XppCFBP6546_00005(XppCFBP6546P_00005) XppCFBP6546_03770(XppCFBP6546P_03770) XppCFBP6546_22550(XppCFBP6546P_22550)
VCH: VC0899
VCS: MS6_0699
VCI: O3Y_04175
VVU: VV1_0300
VVY: VV0884
VPA: VP0698
VPB: VPBB_0669
VAG: N646_2852
VSP: VS_2393
VAN: VAA_01155
VTA: A2365(ygdH)
VFI: VF_0595(ygdH)
PPR: PBPRA2985(STY3108)
PCQ: PcP3B5_13970(ygdH) PcP3B5_47310(fas6) PcP3B5_56690(yvdD)
PAR: Psyc_1920
PALI: A3K91_2460
PSYA: AOT82_2153
ABH: M3Q_3527
MCT: MCR_0842
MCS: DR90_1035
MCAT: MC25239_00848(yvdD)
SON: SO_1550
SDN: Sden_2557
SFR: Sfri_2775
SAZ: Sama_2419
SBL: Sbal_1372
SLO: Shew_2755
SPL: Spea_2975
SHL: Shal_3065
SWD: Swoo_3459
SWP: swp_3667
SVO: SVI_1143
SPSW: Sps_02226
PHA: PSHAb0469
PAT: Patl_3194
PSM: PSM_B0545
PART: PARC_b0721
PSEN: PNC201_19375(ygdH)
AMAL: I607_04520
AMAE: I876_04730
AMAO: I634_04905
AMAD: I636_04750
AMAI: I635_04725
AMAG: I533_04485
AMAC: MASE_04365
AAUS: EP12_04710
GNI: GNIT_2476
GPS: C427_1661
PIN: Ping_2775
FBL: Fbal_2807
MVS: MVIS_3868
MYA: MORIYA_3574(ygdH)
CJA: CJA_1346
SDE: Sde_1069
MICC: AUP74_01050(yvdD_1) AUP74_02393(yvdD_2) AUP74_02958(ygdH)
LPN: lpg2499
LPH: LPV_2832
LPO: LPO_2695
LPM: LP6_2531
LPF: lpl2422
LPC: LPC_1970
LPA: lpa_03655
LPE: lp12_2492
LLO: LLO_2195
LFA: LFA_3024
LCD: clem_13935(fas6)
LLG: 44548918_00178(yvdD)
FTU: FTT_0781c
FTQ: RO31_0898
FTF: FTF0781c
FTW: FTW_0578
FTT: FTV_0737
FTG: FTU_0821
FTL: FTL_1443
FTH: FTH_1404
FTA: FTA_1530
FTS: F92_08035
FTI: FTS_1415
FTC: DA46_1306
FTV: CH67_1842
FTZ: CH68_1571
FTM: FTM_1057
FTN: FTN_1229
FTX: AW25_778
FTD: AS84_1287
FTY: CH70_701
FPH: Fphi_1459
FPT: BZ13_524
FPI: BF30_1723
FPM: LA56_698
FPX: KU46_1849
FPZ: LA55_1383
FPJ: LA02_1140
FNA: OOM_1599
TCX: Tcr_1882
MEC: Q7C_2179
CYQ: Q91_0198
TIG: THII_1600
NTT: TAO_1351
AEH: Mlg_2861
HHA: Hhal_2422
TGR: Tgr7_0086
TKM: TK90_0045
TNI: TVNIR_2901(ygdH_[H]) TVNIR_3739(ygdH_[C])
TVR: TVD_13010
GAI: IMCC3135_00210(fas6)
HEL: HELO_1347 HELO_2524(ygdH)
HCO: LOKO_00435(ygdH) LOKO_02258(yvdD)
ABO: ABO_0657
APAC: S7S_10165
KKO: Kkor_1075
KGE: TQ33_1236
TOL: TOL_0629
AHA: AHA_1154
ASA: ASA_3181
AVR: B565_3075
AMED: B224_4093
ASR: WL1483_2916(ygdH)
ACAV: VI35_15645
TAU: Tola_0491
OCE: GU3_06945
DNO: DNO_1082
SLIM: SCL_2772
TBN: TBH_C0505
ENM: EBS_2065
NME: NMB0283
NMP: NMBB_0313
NMA: NMA2204
NMW: NMAA_1697
NMC: NMC0289
NMN: NMCC_1862
NMT: NMV_0309
NMI: NMO_1755
NGO: NGO1712
NGK: NGK_2110
NLA: NLA_19800
KKI: KKKWG1_1844(fmt)
ECOR: SAMEA4412678_1911(yvdD)
RSO: RSc2231
RSE: F504_2192
REH: H16_A1025(h16_A1025) H16_A2742(h16_A2742)
PNU: Pnuc_1359
PNE: Pnec_0590
HYF: DTO96_101136(yvdD)
BHO: D560_0755
BHM: D558_0744
BHZ: ACR54_00256(yvdD_1) ACR54_03498(yvdD_2)
BTRM: SAMEA390648701457(yvdD_1) SAMEA390648704077(yvdD_2)
AXX: ERS451415_01689(yvdD_1) ERS451415_05861(yvdD_2)
TEA: KUI_1090
TEG: KUK_0217
TAS: TASI_1129
TAT: KUM_0305
PUT: PT7_0454
AMIM: MIM_c14730
AFQ: AFA_05150
LIM: L103DPR2_01556(fas6) L103DPR2_02133(ygdH)
CFU: CFU_1881
LCH: Lcho_2099
BBAG: E1O_29700
NEU: NE1469
TBD: Tbd_2452
MFA: Mfla_0359
MMB: Mmol_0410
MEH: M301_0400
MEP: MPQ_0406
SLT: Slit_2834
GCA: Galf_0197
BPRC: D521_1145
HCE: HCW_07020
WSU: WS0656
SUA: Saut_1357
SULR: B649_02400
CJE: Cj0054c
CJU: C8J_0051
CJI: CJSA_0048
CJM: CJM1_0059
CJS: CJS3_0053
CJEJ: N564_00049
CJEU: N565_00049
CJEN: N755_00049
CJEI: N135_00056
CJER: H730_00275
CJY: QZ67_00058(ygdH)
CJQ: UC78_0057
CJR: CJE0049
CFZ: CSG_16200
CLA: Cla_0239
CCQ: N149_0052
CCF: YSQ_00285
CCY: YSS_00285
CCOI: YSU_00275
CCOF: VC76_00265
CIS: CINS_0230
CVO: CVOL_0233
CPEL: CPEL_0242
CGRA: CGRAC_1955
CHYO: CHH_1522
CSPF: CSF_0554
CCUN: CCUN_1646
CLX: CLAN_1345
CAVI: CAV_0241
ABU: Abu_1446
ABT: ABED_1350
SDL: Sdel_0299
SMUL: SMUL_0384
SHAL: SHALO_0384
SULJ: SJPD1_0349
NIS: NIS_0928
SUN: SUN_1207
GUR: Gura_3710
GBM: Gbem_2738
GEO: Geob_1537
GEM: GM21_1503
GEB: GM18_2604
PPD: Ppro_3064
DVU: DVU1529
DVL: Dvul_1602
DDS: Ddes_2032
DTR: RSDT_0937
LIP: LI0342(leuB)
LIR: LAW_00354
DRT: Dret_2105
DPS: DP1693
DSF: UWK_03311
ADE: Adeh_2080
MXA: MXAN_4631
SAT: SYN_01766
BBW: BDW_09245
BEX: A11Q_1820
BMX: BMS_3087
RBT: NOVO_05640(yvdD)
PACA: ID47_09125
PLA: Plav_1111
BJA: bll3794
BRA: BRADO4694
BRS: S23_44540
AOL: S58_29800
BRAD: BF49_1256
RPA: RPA2004
RPB: RPB_3369
RPC: RPC_2093
RPD: RPD_2073
RPE: RPE_2006
NWI: Nwi_1232
NHA: Nham_1491
BHE: BH00730
BQU: BQ00660
BQR: RM11_0063
BTR: BT_0076
BGR: Bgr_00700
BANC: PU02_0514
XAU: Xaut_4183
MEX: Mext_4743
MDI: METDI5797
MCH: Mchl_5210
MPO: Mpop_5283
MNO: Mnod_1637
MOR: MOC_2339
META: Y590_24240
BID: Bind_1911
MSL: Msil_0139
HDN: Hden_2087
PHL: KKY_62
MMED: Mame_02644(yvdD)
HDI: HDIA_2390(fas6)
PDE: Pden_2515
KVU: EIO_1360
KRO: BVG79_01215(ygdH)
OTM: OSB_00670 OSB_12750(yvdD)
RHC: RGUI_2142
ZMO: ZMO1679
ZMN: Za10_1540
ZMB: ZZ6_1438
ZMI: ZCP4_1483
SPKC: KC8_11315
AAY: WYH_01601 WYH_03018(yvdD)
GOX: GOX0847
GOH: B932_1333
ACR: Acry_2689
GDI: GDI1310
GDJ: Gdia_2020
GXY: GLX_19070
GXL: H845_3094
ASZ: ASN_1636
RRU: Rru_A0357
RRF: F11_01820
THAL: A1OE_878
EFK: P856_502
MGM: Mmc1_0974
MAI: MICA_68
MAN: A11S_59
AFR: AFE_3095
ACU: Atc_2711
BSU: BSU34640(yvdD)
BSR: I33_3583
BSL: A7A1_2684
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Taxonomy
Reference
1
  Authors
Imada, A.
  Title
Degradation of pyrimidine nucleotides by enzyme systems of Streptomyces. II. Pyrimidine 5'-nucleotide phosphoribo(deoxyribo) hydrolase of Streptomyces virginiae.
  Journal
J Gen Appl Microbiol 13:267-278 (1967)
Reference
2
  Authors
Imada, A., Kuno, M. and Igarasi, S.
  Title
Degradation of pyrimidine nucleotides by enzyme systems of Streptomyces. I. Ribose-5-phosphate formation from pyrimidine nucleotides.
  Journal
J Gen Appl Microbiol 13:255-265 (1967)
Other DBs
ExplorEnz - The Enzyme Database: 3.2.2.10
IUBMB Enzyme Nomenclature: 3.2.2.10
ExPASy - ENZYME nomenclature database: 3.2.2.10
BRENDA, the Enzyme Database: 3.2.2.10
CAS: 9023-31-8

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