KEGG   ENZYME: 3.4.19.12
Entry
EC 3.4.19.12                Enzyme                                 

Name
ubiquitinyl hydrolase 1;
ubiquitin C-terminal hydrolase;
yeast ubiquitin hydrolase
Class
Hydrolases;
Acting on peptide bonds (peptidases);
Omega peptidases
Reaction(IUBMB)
Thiol-dependent hydrolysis of ester, thioester, amide, peptide and isopeptide bonds formed by the C-terminal Gly of ubiquitin (a 76-residue protein attached to proteins as an intracellular targeting signal)
Reaction(KEGG)
(other) R02418
Comment
Links to polypeptides smaller than 60 residues are hydrolysed more readily than those to larger polypeptides. Isoforms exist with quantitatively different specificities, amongst the best known being UCH-L1 and UCH-L3, which are major proteins of the brain of mammals [1]. Inhibited by ubiquitin aldehyde (in which Gly76 is replaced by aminoacetaldehyde). Ubiquitinyl hydrolase 1 is the type example of peptidase family C12, with a similar protein fold to papain and catalytic amino acids Cys, His and Asp. There is a separate family (C19) of enzymes that also hydrolyse ubiquitinyl bonds, and it is thought that all the ubiquitinyl hydrolases are also ubiquitin thiolesterases (EC 3.1.2.15)
History
EC 3.4.19.12 created 2000
Orthology
K01309  ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase MINDY-1/2
K05609  ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase L3
K05610  ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase L5
K05611  ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase L1
K08588  ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase BAP1
K08601  ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase CYLD
K09602  ubiquitin thioesterase protein OTUB1
K09603  ubiquitin thioesterase protein OTUB2
K11366  ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 22/27/51
K11832  ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 1
K11833  ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 2
K11834  ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 44/49
K11835  ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 4/11
K11836  ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 5/13
K11837  ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 6/32
K11838  ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 7
K11839  ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 8
K11840  ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 9/24
K11841  ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 10
K11842  ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 12/46
K11843  ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 14
K11844  ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 16/45
K11845  ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 17
K11846  ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 18/41
K11847  ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 19
K11848  ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 20/33
K11849  ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 25
K11850  ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 26/29/37
K11851  ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 30
K11852  ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 31
K11853  ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 34
K11854  ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 35/38
K11855  ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 36/42
K11856  ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 43
K11857  ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 47
K11858  ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 48
K11859  tumor necrosis factor, alpha-induced protein 3
K11860  OTU domain-containing protein 7
K11861  deubiquitinating protein VCIP135
K11862  ubiquitin thioesterase ZRANB1
K11866  STAM-binding protein
K11867  AMSH-like protease
K11869  ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 40
K11870  ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 1
K11871  ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 7/11
K11872  ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 9/13
K11873  ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 10
K11874  ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 16
K11986  ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 3
K12655  OTU domain-containing protein 5
K13716  OTU domain-containing protein 1
K13717  OTU domain-containing protein 3
K13718  OTU domain-containing protein 4
K15235  josephin
K18342  OTU domain-containing protein 6
K18343  ubiquitin thioesterase otulin
K21075  Herpesviridae large tegument protein deneddylase
K21122  ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 28
K21343  ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 15
K21634  ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 21
K22647  ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase MINDY-3/4
K22763  deubiquitinase DESI2
K22972  EBV large tegment protein deneddylase
K24134  zinc finger-containing ubiquitin peptidase 1
K25013  SARS coronavirus non-structural protein 3
K25347  Orthonairovirus RNA-dependent RNA polymerase L
Genes
HSA: 100287327(USP17L17) 100287513(USP17L22) 10600(USP16) 10617(STAMBP) 10868(USP20) 10869(USP19) 11274(USP18) 124739(USP43) 126119(JOSD2) 139562(OTUD6A) 1540(CYLD) 158880(USP51) 161725(OTUD7A) 219333(USP12) 220213(OTUD1) 221302(ZUP1) 23032(USP33) 23252(OTUD3) 23326(USP22) 23358(USP24) 25862(USP49) 27005(USP21) 29761(USP25) 373856(USP41) 377630(USP17L2) 389856(USP27X) 51029(DESI2) 51377(UCHL5) 51633(OTUD6B) 54629(MINDY2) 54726(OTUD4) 54764(ZRANB1) 55031(USP47) 55230(USP40) 55593(OTUD5) 55611(OTUB1) 55793(MINDY1) 56957(OTUD7B) 57478(USP31) 57558(USP35) 57559(STAMBPL1) 57602(USP36) 57646(USP28) 57663(USP29) 57695(USP37) 646951(MINDY4B) 64854(USP46) 7128(TNFAIP3) 728369(USP17L24) 728373(USP17L25) 728379(USP17L26) 728386(USP17L5) 728393(USP17L27) 728400(USP17L28) 728405(USP17L29) 728419(USP17L30) 7345(UCHL1) 7347(UCHL3) 7375(USP4) 7398(USP1) 7874(USP7) 78990(OTUB2) 80013(MINDY3) 80124(VCPIP1) 8078(USP5) 8237(USP11) 8239(USP9X) 8287(USP9Y) 8314(BAP1) 83844(USP26) 84101(USP44) 84132(USP42) 84182(MINDY4) 84196(USP48) 84640(USP38) 84669(USP32) 84749(USP30) 85015(USP45) 8975(USP13) 90268(OTULIN) 9097(USP14) 9098(USP6) 9099(USP2) 9100(USP10) 9101(USP8) 9736(USP34) 9929(JOSD1) 9958(USP15) 9960(USP3)
PTR: 100609286(OTUD6A) 100610501(USP31) 100611292(USP34) 100611877(USP26) 100614099(USP27X) 104001450 104006803 107967429 107973963(USP40) 112207418 112207665 112208076 112208677(MINDY4B) 450324(MINDY3) 450809(ZRANB1) 451029(USP47) 451448(USP35) 451610(USP2) 451798(USP5) 452035(USP15) 452142(USP44) 452215(USP30) 453287(OTUD7A) 453474(MINDY2) 453499(USP3) 453907(USP7) 453931(USP8) 454287(USP10) 454511(USP22) 454806(USP32) 455080(USP43) 455325(USP14) 456482(OTUD3) 456602(USP48) 456881(USP24) 456901(USP1) 456965(USP33) 457596(UCHL5) 458497(USP16) 458834(JOSD1) 459944(USP37) 460364(USP19) 460367(USP4) 460426(BAP1) 461185(UCHL1) 461329(USP46) 461515(USP38) 461733(OTULIN) 462686(USP49) 462896(USP45) 462962(ZUP1) 464282(OTUD6B) 464795(USP20) 465165(CYLD) 465582(USP9X) 465604(USP11) 465660(USP51) 465985(USP9Y) 466024(OTUD1) 466147(STAMBPL1) 466787(USP28) 466922(OTUD4) 467539(OTUB2) 469031(USP29) 469483(MINDY1) 469556(USP21) 471009(USP13) 472136(TNFAIP3) 472287(USP42) 472339(MINDY4) 472782(VCPIP1) 473918(USP25) 735835(USP12) 736112(DESI2) 739448(STAMBP) 742797(OTUB1) 742929(USP18) 742992(USP36) 747924(JOSD2) 748219 748542(USP6) 749087(OTUD7B) 750731
PPS: 100967331(USP4) 100967337(USP5) 100967486(USP15) 100967683(UCHL5) 100968481(FAM63A) 100969003(STAMBP) 100969247(ZUFSP) 100969397(OTUD6A) 100969657 100969973(USP13) 100969982(USP19) 100970653(USP31) 100971299(USP3) 100971570(USP49) 100971796(USP9X) 100972729(USP22) 100973064(USP42) 100973287(ZRANB1) 100973818(OTUD7A) 100974018(OTULIN) 100975336(USP36) 100975349(USP10) 100976531 100978798(UCHL1) 100979063(USP46) 100979081(USP7) 100979276(USP35) 100979514(USP27X) 100979558(USP21) 100979806(USP26) 100980786(JOSD1) 100981159(FAM63B) 100981245(USP33) 100981644(USP14) 100981716(USP8) 100981738(USP34) 100981844(USP16) 100982030(USP1) 100983014(OTUD5) 100983324(OTUD6B) 100983504(OTUB1) 100983567(USP28) 100983795(OTUD1) 100984284(USP6) 100984339 100984445(OTUD7B) 100984682(USP37) 100985001(FAM188B) 100985439(BAP1) 100986340(USP2) 100986446(CYLD) 100986757(VCPIP1) 100986971(USP40) 100987273(USP44) 100987666(USP30) 100988131(OTUB2) 100988185(STAMBPL1) 100988629(USP45) 100989025(USP25) 100989106(USP48) 100989185(USP29) 100989264(USP51) 100989275(USP20) 100989765(USP11) 100990061(USP38) 100990144(OTUD4) 100990675 100990853 100991032(JOSD2) 100991287(USP12) 100992171(OTUD3) 100992310(USP47) 100993407(DESI2) 100994023(USP24) 100994153(USP43) 100994248(USP32) 100994346(USP18) 100994797(TNFAIP3) 100996213(FAM188A)
GGO: 101123735(OTULIN) 101124390(USP1) 101125016(UCHL5) 101125045(BAP1) 101125869(USP34) 101126783 101127042(OTUD3) 101127507(USP45) 101127524 101127889(USP26) 101127919(OTUB1) 101128527(OTUD7B) 101129120(USP30) 101129252(USP12) 101129963(USP15) 101129990(OTUD7A) 101130037 101130166(OTUD6B) 101130233(CYLD) 101131429(USP19) 101131709(JOSD1) 101132417(USP49) 101132796(ZUP1) 101133330(USP24) 101133404 101133444(USP9X) 101133445(VCPIP1) 101133598(USP5) 101133630(USP8) 101133813(OTUD1) 101134191(USP4) 101134614(MINDY3) 101134939(USP29) 101135667(USP27X) 101135723(USP37) 101136041(USP48) 101136564(STAMBP) 101137096(USP43) 101138355(USP42) 101138427(UCHL3) 101138526(USP47) 101139406(USP31) 101141299(USP16) 101141692(DESI2) 101142739(USP10) 101142763(MINDY4) 101143664(USP2) 101143810(OTUB2) 101144048(USP40) 101144455(USP14) 101144509(ZRANB1) 101144968(USP25) 101145981(USP20) 101146789(MINDY1) 101146892(USP51) 101147100(USP36) 101147647(USP35) 101148524(USP46) 101149274(TNFAIP3) 101149958(USP38) 101149970(USP22) 101150085(USP6) 101150317(USP3) 101150793(UCHL1) 101150795(MINDY2) 101150852 101151989(USP44) 101152379 101152862(USP7) 101152934(USP33) 101153050(USP21) 101153212(OTUD4) 101153896(USP28) 101154006(STAMBPL1) 101154346(OTUD6A) 101154413(USP13) 109024700(USP11) 109025157(OTUD5) 109029252 115931902(USP18) 115931958(USP41) 115934062(MINDY4B)
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