KEGG   ENZYME: 3.4.23.51Help
Entry
EC 3.4.23.51                Enzyme                                 

Name
HycI peptidase;
HycI;
HycE processing protein
Class
Hydrolases;
Acting on peptide bonds (peptidases);
Aspartic endopeptidases
BRITE hierarchy
Reaction(IUBMB)
This enzyme specifically removes a 32-amino acid peptide from the C-terminus of the precursor of the large subunit of hydrogenase 3 in Escherichia coli by cleavage at the C-terminal side of Arg537.
Comment
The reaction requires nickel to be bound to the precursor of the large subunit of hydrogenase 3. The endopeptidase uses the metal in the large subunit of [NiFe]-hydrogenases as a recognition motif [1]. In peptidase family A31.
History
EC 3.4.23.51 created 2009
Orthology
K08315  hydrogenase 3 maturation protease
Genes
ECO: b2717(hycI)
ECJ: JW2687(hycI)
ECD: ECDH10B_2885(hycI)
EBW: BWG_2453(hycI)
ECOK: ECMDS42_2222(hycI)
ECE: Z4025(hycI)
ECS: ECs3573(hycI)
ECF: ECH74115_3968(hycI)
ETW: ECSP_3665(hycI)
ELX: CDCO157_3333(hycI)
EOJ: ECO26_3782(hycI)
EOI: ECO111_3437(hycI)
EOH: ECO103_3255(hycI)
ECOO: ECRM13514_3568(hycI)
ECOH: ECRM13516_3434(hycI)
ECG: E2348C_2982(hycI)
EOK: G2583_3365(hycI)
ELR: ECO55CA74_16020(hycI)
ESO: O3O_19670(hycI)
ESM: O3M_06020(hycI)
ESL: O3K_05975(hycI)
ECW: EcE24377A_3005(hycI)
ELH: ETEC_2908
EUN: UMNK88_3390(hycI)
ECC: c3277(hycI)
ECP: ECP_2680
ECI: UTI89_C3080(hycI)
ECV: APECO1_3808(hycI)
ECX: EcHS_A2853(hycI)
ECM: EcSMS35_2842(hycI)
ECY: ECSE_2965
ECR: ECIAI1_2811(hycI)
ECQ: ECED1_3168(hycI)
ECK: EC55989_2983(hycI)
ECT: ECIAI39_2905(hycI)
EOC: CE10_3142(hycI)
EUM: ECUMN_3039(hycI)
ECZ: ECS88_2982(hycI)
ELO: EC042_2911(hycI)
ELN: NRG857_13300(hycI)
ESE: ECSF_2510
EBR: ECB_02567(hycI)
EBD: ECBD_1008
EKF: KO11_09420(hycI)
EAB: ECABU_c29880(hycI)
EDJ: ECDH1ME8569_2627(hycI)
EIH: ECOK1_3091(hycI)
ENA: ECNA114_2751(hycL)
ELU: UM146_02995(hycI)
ELW: ECW_m2918(hycI)
ELL: WFL_14240(hycI)
ELC: i14_3006(hycI)
ELD: i02_3006(hycI)
ELP: P12B_c2819(hycI)
EBL: ECD_02567(hycI)
EBE: B21_02532(hycI)
ELF: LF82_1071(hycI)
ECOL: LY180_13775(hycI)
ECOI: ECOPMV1_02974(hycI)
ECOJ: P423_14885(hycI)
ECOS: EC958_2984(hycI)
EFE: EFER_0360(hycI)
EAL: EAKF1_ch3283(hycI)
STY: STY2967(hycI)
STT: t2747(hycI)
SENT: TY21A_13885(hycI)
STM: STM2845(hycI)
SEO: STM14_3439(hycI)
SEY: SL1344_2825(hycI)
SEM: STMDT12_C28940(hycI)
SEJ: STMUK_2834(hycI)
SEB: STM474_2983(hycI)
SEF: UMN798_3090(hycI)
SETU: STU288_14380(hycI)
SETC: CFSAN001921_02850(hycI)
SENR: STMDT2_27461(hycI)
SEND: DT104_28421(hycI)
SENI: CY43_14865(hycI)
SEEN: SE451236_20325(hycI)
SPT: SPA2703(hycI)
SEK: SSPA2517
SEI: SPC_2886(hycI)
SEC: SCH_2778(hycI)
SEH: SeHA_C3032(hycI)
SHB: SU5_03326
SENH: CFSAN002069_18040(hycI)
SEEH: SEEH1578_23025(hycI)
SEE: SNSL254_A3048(hycI)
SEW: SeSA_A2997(hycI)
SEA: SeAg_B2966(hycI)
SENS: Q786_13685(hycI)
SED: SeD_A3155(hycI)
SEG: SG2748(hycI)
SEL: SPUL_2840(hycI)
SEGA: SPUCDC_2826(hycI)
SET: SEN2687(hycI)
SENA: AU38_13645(hycI)
SENO: AU37_13655(hycI)
SENV: AU39_13655(hycI)
SENQ: AU40_15390(hycI)
SENL: IY59_14245(hycI)
SENJ: CFSAN001992_19310(hycI)
SEEC: CFSAN002050_20525(hycI)
SEEB: SEEB0189_005945(hycI)
SEEP: I137_13535(hycI)
SENB: BN855_28830(hycI)
SENE: IA1_13600(hycI)
SENC: SEET0819_21045(hycI)
SBG: SBG_2465(hycI)
SBZ: A464_2866
SBV: N643_12055(hycI)
SFV: SFV_2786(hycI)
SSN: SSON_2864(hycI)
SBO: SBO_2801(hycI)
SBC: SbBS512_E3159(hycI)
SDY: SDY_2914(hycI)
SHQ: A0259_17180(hycI)
ENC: ECL_04056
ENO: ECENHK_17535(hycI)
ECLO: ENC_29700
EEC: EcWSU1_03534(hycI)
ENL: A3UG_17825(hycI)
ECLE: ECNIH2_18005(hycI)
ECLN: ECNIH4_05140(hycI)
ECLI: ECNIH5_16775(hycI)
ECLX: LI66_17665(hycI)
ECLY: LI62_19145(hycI)
ECLZ: LI64_16480(hycI)
EHM: AB284_08105(hycI)
ECLA: ECNIH3_16860(hycI)
ECLC: ECR091_16795(hycI)
EAU: DI57_01665(hycI)
ECLS: LI67_018845(hycI)
ENR: H650_09830(hycI)
ENX: NI40_017440(hycI)
ESA: ESA_02061
CSK: ES15_2219(hycI)
CCON: AFK62_08720(hycI)
CDM: AFK67_08845(hycI)
CMJ: AFK66_010835(hycI)
CUI: AFK65_08705(hycI)
CMW: AFK63_09785(hycI)
CTU: CTU_19020(hycI)
KPN: KPN_03054(hycI)
KPU: KP1_4320(hycI)
KPP: A79E_1043
KPH: KPNIH24_08145(hycI)
KPZ: KPNIH27_19925(hycI)
KPV: KPNIH29_20745(hycI)
KPW: KPNIH30_20755(hycI)
KPY: KPNIH31_19970(hycI)
KPG: KPNIH32_21615(hycI)
KPC: KPNIH10_20565(hycI)
KPQ: KPR0928_20050(hycI)
KPT: VK055_4461(hycI)
KPE: KPK_1069(hycI)
KPO: KPN2242_18230(hycI)
KPR: KPR_1233(hycI)
KPJ: N559_1181
KPI: D364_15570(hycI)
KPX: PMK1_00531(hycI)
KPB: FH42_11290(hycI)
KPNE: KU54_005815(hycI)
KPNU: LI86_05825(hycI)
KPNK: BN49_1073(hycI)
KVA: Kvar_1012
KPK: A593_05455(hycI)
KOX: KOX_00655(hycI)
KOE: A225_4581
KOY: J415_09050(hycI)
KOM: HR38_26760(hycI)
KMI: VW41_23395(hycI)
KOK: KONIH1_22985(hycI)
KOC: AB185_13285(hycI)
EAE: EAE_01635(hycI)
EAR: CCG33666
CKO: CKO_04072
CRO: ROD_30941(hycI)
CFD: CFNIH1_00595(hycI)
CAMA: F384_14780(hycI)
EBT: EBL_c01090(hycI)
ROR: RORB6_23970(hycI)
RON: TE10_22145(hycI)
CNT: JT31_12660(hycI)
CEM: LH23_05070(hycI)
CEN: LH86_05015(hycI)
PGE: LG71_09720(hycI)
KLE: AO703_16605(hycI)
KOR: AWR26_05340(hycI)
KRD: A3780_18670(hycI)
LAX: APT61_05025(hycI)
EBF: D782_0980
YEN: YE2808(hycI)
YEY: Y11_17111
YEW: CH47_2159(hycI)
YET: CH48_3064(hycI)
YEE: YE5303_32371(hyfK)
YAL: AT01_3942(hycI)
YFR: AW19_644(hycI)
YIN: CH53_3277(hycI)
YKR: CH54_1018(hycI)
YRO: CH64_18(hycI)
YRB: UGYR_00650(hycI)
YAK: ACZ76_02070(hycI)
SPE: Spro_2426
SRL: SOD_c40280(hycI)
SRY: M621_21945(hycI)
SPLY: Q5A_021915(hycI)
SLQ: M495_12090(hycI)
SFW: WN53_18425(hycI)
SFG: AV650_13640(hycI)
RAA: Q7S_05540(hycI)
ECA: ECA1237(hycI)
PATR: EV46_06225(hycI)
PATO: GZ59_12650(hycI)
DDD: Dda3937_00737(hycI)
DZC: W909_07175(hycI)
DSO: A4U42_16480(hycI)
CED: LH89_04665(hycI)
DDQ: DDI_1218
BGJ: AWC36_10675(hycI)
PMR: PMI2518(hycI)
PMIB: BB2000_2584(hycI)
PVL: AOB99_14225(hycI)
PHEI: NCTC12003_01137(hycI)
MMK: MU9_3446
ETR: ETAE_2899(hycI)
ETD: ETAF_2634
ETE: ETEE_1124
ETC: ETAC_13960(hycI)
EDW: QY76_05820(hycI)
EDL: AAZ33_15425(hycI)
HAV: AT03_04665(hycI)
OPO: DSM2777_21605(hycI)
LRI: NCTC12151_03353(hycI)
KIN: AB182_04825(hycI)
PDAG: 4362423_00445(hycI)
AAZ: ADJ80_09690(hycI)
AAT: D11S_1747(hycI)
AAN: D7S_02167(hycI)
AACN: AANUM_2160
AACT: ACT75_10010(hycI)
PSY: PCNPT3_12235(hycI)
AHA: AHA_2506(hycI)
AHY: AHML_13300(hycI)
AHD: AI20_06875(hycI)
AHR: V428_13755(hycI)
AHP: V429_13770(hycI)
AHJ: V469_09345(hycI)
AHH: RY45_13015(hycI)
AHI: VU14_09280(hycI)
ASA: ASA_1808(hycI)
AVR: B565_2127
AVO: AMS64_10280(hycI)
LCH: Lcho_1347
WSU: WS1834
CFT: CFF04554_0125(hycI)
CFV: CFVI03293_0125(hycI)
CFX: CFV97608_0125(hycI)
CFZ: CSG_1250
CAMP: CFT03427_0130(hycI)
CCV: CCV52592_1639(hycI)
CCO: CCC13826_0715(hycI)
CCOC: CCON33237_1585(hycI)
CAJ: CIG1485E_0137(hycI)
CGRA: CGRAC_0885(hycI)
CHYO: CHH_0129(hycI)
CSPF: CSF_0867(hycI)
CPIN: CPIN18020_0372(hycI)
SDL: Sdel_1870
SMUL: SMUL_2392(hyfK)
SHAL: SHALO_2141
SAT: SYN_02223
RPC: RPC_4566
RRU: Rru_A0322
RRF: F11_01625
AZL: AZL_b04330(hycI)
ALI: AZOLI_p30020(hycI)
ABQ: ABAZ39_23405(hycI)
ATI: AL072_26565(hycI)
PTL: AOT13_13350(hycI)
TTE: TTE1696(HyaD)
MTA: Moth_2182(hycI)
TPZ: Tph_c26370(hycI)
AEQ: AEQU_0313
CBAC: JI75_01380
ATM: ANT_22000
EMI: Emin_1127
EPO: Epro_0042(hycI)
TLI: Tlie_0595
BLQ: L21SP5_01247(hycI)
KOL: Kole_0560
MJA: MJ_0631
MMP: MMP1185
MMD: GYY_06750
MAE: Maeo_1351
MVO: Mvol_1002
MTH: MTH_737
MMG: MTBMA_c11320(hycI)
METC: MTCT_0658
METE: tca_00706(hycI)
MSI: Msm_0362
MRU: mru_1039(hycI)
MEB: Abm4_0986(hycI)
MMIL: sm9_0667(hycI)
MEYE: TL18_03185
MOL: YLM1_0584
METH: MBMB1_0514
MFC: BRM9_1779(hycI)
MCUB: MCBB_0441
MFV: Mfer_1048
ABI: Aboo_0694
PHO: PH0979(PH0979)
PAB: PAB0576
PFU: PF0617
PFI: PFC_02225
PYN: PNA2_1655
PYS: Py04_0975
TKO: TK2004
TON: TON_0263
TGA: TGAM_0236(hybD)
TSI: TSIB_1002
THE: GQS_04225
THM: CL1_0483
TLT: OCC_08425
THS: TES1_1385
TNU: BD01_0133
TEU: TEU_06230
PPAC: PAP_09005
MHU: Mhun_2728
MLA: Mlab_1136
MPI: Mpet_1563
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LOKI: Lokiarch_07900(hycI)
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Taxonomy
Reference
1  [PMID:10727938]
  Authors
Theodoratou E, Paschos A, Magalon A, Fritsche E, Huber R, Bock A
  Title
Nickel serves as a substrate recognition motif for the endopeptidase involved in  hydrogenase maturation.
  Journal
Eur J Biochem 267:1995-9 (2000)
DOI:10.1046/j.1432-1327.2000.01202.x
Reference
2  [PMID:17150961]
  Authors
Yang F, Hu W, Xu H, Li C, Xia B, Jin C
  Title
Solution structure and backbone dynamics of an endopeptidase HycI from Escherichia coli: implications for mechanism of the [NiFe] hydrogenase maturation.
  Journal
J Biol Chem 282:3856-63 (2007)
DOI:10.1074/jbc.M609263200
  Sequence
[eco:b2717]
Other DBs
ExplorEnz - The Enzyme Database: 3.4.23.51
IUBMB Enzyme Nomenclature: 3.4.23.51
ExPASy - ENZYME nomenclature database: 3.4.23.51
BRENDA, the Enzyme Database: 3.4.23.51

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