KEGG   ENZYME: 4.6.1.16Help
Entry
EC 4.6.1.16                 Enzyme                                 

Name
tRNA-intron lyase;
transfer ribonucleate intron endoribonuclease;
tRNA splicing endonuclease;
splicing endonuclease;
tRNATRPintron endonuclease;
transfer splicing endonuclease
Class
Lyases;
Phosphorus-oxygen lyases;
Phosphorus-oxygen lyases (only sub-subclass identified to date)
BRITE hierarchy
Sysname
pretRNA lyase (intron-removing; cyclic-2',3'-phosphate-forming)
Reaction(IUBMB)
pretRNA = a 3'-half-tRNA molecule with a 5'-OH end + a 5'-half-tRNA molecule with a 2',3'-cyclic phosphate end + an intron with a 2',3'-cyclic phosphate and a 5'-hydroxyl terminus
Substrate
pretRNA
Product
3'-half-tRNA molecule with a 5'-OH end;
5'-half-tRNA molecule with a 2',3'-cyclic phosphate end;
intron with a 2',3'-cyclic phosphate-hydroxyl terminus;
a 5'-hydroxyl terminus
Comment
The enzyme catalyses the final stage in the maturation of tRNA molecules.
History
EC 4.6.1.16 created 1992 as EC 3.1.27.9, transferred 2014 to EC 4.6.1.16
Orthology
K01170  tRNA-intron endonuclease, archaea type
K15322  tRNA-splicing endonuclease subunit Sen2
K15323  tRNA-splicing endonuclease subunit Sen34
Genes
HSA: 79042(TSEN34) 80746(TSEN2)
PTR: 107969802(TSEN34) 460179(TSEN2)
PPS: 100973820(TSEN2) 100982064(TSEN34)
GGO: 101135727(TSEN2) 101147239(TSEN34)
PON: 100441887(TSEN2) 100458036(TSEN34)
NLE: 100579209(TSEN34) 100582041(TSEN2)
MCC: 693919(TSEN34) 695083(TSEN2)
MCF: 102122734(TSEN2) 102125835(TSEN34)
CSAB: 103228028(TSEN2) 103235258(TSEN34)
RRO: 104673296(TSEN2) 104676013(TSEN34)
RBB: 108517987(TSEN2) 108521211(TSEN34)
CJC: 100400705(TSEN2) 100408514(TSEN34)
SBQ: 101029770(TSEN34) 101050096(TSEN2)
MMU: 381802(Tsen2) 66078(Tsen34)
RNO: 100909510(Tsen34l1) 292534(Tsen34) 312649(Tsen2)
CGE: 100766729(Tsen34) 100768441(Tsen2)
NGI: 103729678(Tsen34) 103751447(Tsen2)
HGL: 101709309(Tsen2) 101723932(Tsen34)
CCAN: 109684000(Tsen34) 109694951(Tsen2)
OCU: 100328906(TSEN34) 100340660(TSEN2)
TUP: 102486393(TSEN34) 102496344(TSEN2)
CFA: 484651(TSEN2) 611457(TSEN34)
AML: 100467521(TSEN34) 100482508(TSEN2)
UMR: 103669542(TSEN2) 103672909(TSEN34)
ORO: 101366515(TSEN34) 101370958(TSEN2)
FCA: 101081426(TSEN34) 101095562(TSEN2)
PTG: 102956902(TSEN2) 102958753(TSEN34)
AJU: 106977132(TSEN2) 106980906(TSEN34)
BTA: 505571(TSEN34) 515511(TSEN2)
BOM: 102264887(TSEN2) 102284029(TSEN34)
BIU: 109572052(TSEN34) 109576365(TSEN2)
PHD: 102338942(TSEN34) 102344177(TSEN2)
CHX: 102174830(TSEN34) 108633358(TSEN2)
OAS: 101104017(TSEN2) 101107041(TSEN34)
SSC: 100518973(TSEN34) 100525362(TSEN2)
CFR: 102514410(TSEN34) 102517106(TSEN2)
CDK: 105093102(TSEN2) 105105505(TSEN34)
BACU: 103013689(TSEN2) 103014838(TSEN34)
LVE: 103083701(TSEN34) 103086567(TSEN2)
OOR: 101272154(TSEN2) 101273756(TSEN34)
ECB: 100051185(TSEN2) 100052851(TSEN34)
EPZ: 103554545(TSEN2) 103566288(TSEN34)
EAI: 106829343(TSEN2) 106840874(TSEN34)
MYB: 102250980(TSEN34) 102253891(TSEN2) 102253916
MYD: 102762902(TSEN34) 102772072(TSEN2)
HAI: 109372504(TSEN34) 109384572(TSEN2)
RSS: 109437021(TSEN34) 109447919(TSEN2)
PALE: 102885482(TSEN34) 102892691(TSEN2)
LAV: 100656005(TSEN2) 100672885(TSEN34)
MDO: 100015319(TSEN2) 100028470(TSEN34)
SHR: 100915334(TSEN34) 100934412(TSEN2)
OAA: 100082384(TSEN34) 100084471(TSEN2)
GGA: 415965(TSEN2)
MGP: 100541113(TSEN2) 104916189(TSEN34)
CJO: 107307642(TSEN34) 107319678(TSEN2)
APLA: 101796145(TSEN2)
ACYG: 106040083(TSEN2)
TGU: 100225007(TSEN2)
GFR: 102035151(TSEN2)
FAB: 101815935(TSEN2)
PHI: 102104182(TSEN2) 102105466(TSEN34)
PMAJ: 107210131(TSEN2)
CCAE: 111935236(TSEN2)
CCW: 104695744(TSEN2)
FPG: 101911585(TSEN2)
FCH: 102051667(TSEN2)
CLV: 102096969(TSEN2)
EGZ: 104124308(TSEN2)
AAM: 106488857(TSEN2)
ASN: 102374816(TSEN2) 102385627(TSEN34)
AMJ: 102569538(TSEN2) 102573374(TSEN34)
PSS: 102459854(TSEN2)
CMY: 102948333(TSEN2)
CPIC: 101931169(TSEN2) 101943912(TSEN34)
ACS: 100556601(tsen34) 100557220(tsen2)
PVT: 110081827(TSEN34) 110083811(TSEN2)
PBI: 103055120(TSEN2) 103067013(TSEN34)
GJA: 107113162(TSEN34) 107118027(TSEN2)
XLA: 108696774(tsen34.L) 444131(tsen2.L)
XTR: 100380139(tsen34)
NPR: 108785467(TSEN2) 108798534(TSEN34)
DRE: 565995(tsen34) 767713(tsen2)
SANH: 107684621 107687311(tsen2)
IPU: 108255280(tsen2) 108263924(tsen34)
AMEX: 103027745(tsen34) 103029398(tsen2)
LCO: 104934178(tsen34) 104939399(tsen2)
NCC: 104951203(tsen2)
MZE: 101463853 101487350(tsen34)
OLA: 101158936(tsen2)
XMA: 102217470(tsen2) 102236933(tsen34)
PRET: 103464243(tsen2) 103475262(tsen34)
NFU: 107379923(tsen34) 107384861(tsen2)
KMR: 108228892(tsen34) 108229168(tsen2)
CSEM: 103382643(tsen34) 103386832(tsen2)
LCF: 108890700(tsen2) 108902926(tsen34)
SDU: 111216846(tsen34) 111219446(tsen2)
HCQ: 109518463(tsen34) 109522632(tsen2)
BPEC: 110172160(tsen34) 110173969(tsen2)
MALB: 109966928(tsen2) 109972728(tsen34)
SASA: 106580657(tsen34) 106583863(tsen2)
OTW: 112255110(tsen2) 112265036(tsen34)
ELS: 105013054(tsen2) 105029766(tsen34)
SFM: 108929770(tsen2) 108932117(tsen34)
LCM: 102361724(TSEN2) 102364899(TSEN34)
CMK: 103185019(tsen2)
CIN: 100186340
DME: Dmel_CG31812(CG31812) Dmel_CG33260(CG33260)
DPE: 6589077
DSI: Dsimw501_GD12603(Dsim_GD12603) Dsimw501_GD24075(Dsim_GD24075)
CEL: CELE_K08D10.12(tsen-34) CELE_Y56A3A.11(tsen-2)
CBR: CBG13974
SHX: MS3_01136
ATH: AT3G45577 AT3G45590(SEN1) AT5G60230(SEN2)
CPAP: 110825942
CIT: 102624537
TCC: 18590103
DZI: 111286478
EGR: 104421824
VRA: 106756438
VAR: 108339643
CCAJ: 109796672
CAM: 101495092
LJA: Lj1g3v3948040.1(Lj1g3v3948040.1) Lj1g3v4290130.1(Lj1g3v4290130.1)
ADU: 107495181
AIP: 107648458
LANG: 109348249
PPER: 18772630
PMUM: 103324489
PAVI: 110752760
PXB: 103938294
CSV: 101217688
CMO: 103501916
MCHA: 111015540
RCU: 8285995
HBR: 110632295
POP: 7472137
JRE: 108988579
VVI: 100255233
SLY: 101260236
SPEN: 107021337
NTO: 104089445
INI: 109193005
SIND: 105170333
OEU: 111405910
HAN: 110895201
CCAV: 112520621
NNU: 104594762
DOSA: Os06t0530700-01(Os06g0530700) Os11t0602400-01(Os11g0602400)
BDI: 100821766
ATS: 109736754(LOC109736754) 109787478(LOC109787478)
SBI: 110431285
SITA: 101782287
PDA: 103703484
EGU: 105052648
MUS: 103993602
DCT: 110112228
PEQ: 110035048
ATR: 18443300
PPP: 112278533
APRO: F751_1507
SCE: YAR008W(SEN34) YLR105C(SEN2)
KMX: KLMA_10456(SEN34) KLMA_40167(SEN2)
NCS: NCAS_0C03440(NCAS0C03440) NCAS_0J01130(NCAS0J01130)
NDI: NDAI_0G02770(NDAI0G02770) NDAI_0J01870(NDAI0J01870)
TPF: TPHA_0A01660(TPHA0A01660) TPHA_0F00810(TPHA0F00810)
TBL: TBLA_0C04020(TBLA0C04020) TBLA_0D03980(TBLA0D03980)
TDL: TDEL_0F02290(TDEL0F02290) TDEL_0F04210(TDEL0F04210)
KAF: KAFR_0A06460(KAFR0A06460) KAFR_0B02910(KAFR0B02910)
CAL: CAALFM_C205670CA(CaO19.6879) CAALFM_C402640CA(SEN2)
SLB: AWJ20_2855(SEN34) AWJ20_3977(SEN2)
NTE: NEUTE1DRAFT121324(NEUTE1DRAFT_121324) NEUTE1DRAFT76608(NEUTE1DRAFT_76608)
ANG: ANI_1_1532084(An09g06160) ANI_1_292014(An01g02220)
PBN: PADG_05478 PADG_12304(PADG_07457)
SPO: SPAPB17E12.07c(sen2) SPBC19C7.07c(sen34)
ABP: AGABI1DRAFT34260(AGABI1DRAFT_34260)
ABV: AGABI2DRAFT148968(AGABI2DRAFT_148968)
EHI: EHI_042160(26.t00017) EHI_092410(11.t00018)
PCB: PCHAS_132110(PC001224.02.0)
CPV: cgd4_1260
SMIN: v1.2.010174.t1(symbB.v1.2.010174.t1)
SPAR: SPRG_00845
MJA: MJ_1424
MMP: MMP1132(endA)
MMD: GYY_06510
MAE: Maeo_1014
MVO: Mvol_0825
MTH: MTH_250
MMG: MTBMA_c07000(endA)
METC: MTCT_0213
MWO: MWSIV6_0662(endA)
METE: tca_00230
MST: Msp_0652(endA)
MSI: Msm_0217
MRU: mru_1495(endA)
MEB: Abm4_0704(endA)
MMIL: sm9_0833(endA)
MEYE: TL18_06135
MOL: YLM1_0996
METH: MBMB1_1369
MFC: BRM9_0594(endA)
MCUB: MCBB_1609(endA)
MFV: Mfer_1195
MKA: MK0341(sen2_1)
AFU: AF_0900
FPL: Ferp_1234
GAC: GACE_1315
GAH: GAH_01098
TAC: Ta1191
TVO: TVG0390826(TVG0390826)
PTO: PTO0518
FAI: FAD_1775
CDIV: CPM_0500
MEAR: Mpt1_c12130(endA)
MARC: AR505_1808
ABI: Aboo_0572
PHO: PH0295(PH0295)
PAB: PAB1099(endA)
PFU: PF0266
PFI: PFC_00385
PYN: PNA2_0910
PYS: Py04_0418
TKO: TK2215
TON: TON_1417
TGA: TGAM_2056(endA)
TSI: TSIB_0099
THE: GQS_08490
THA: TAM4_257
THM: CL1_1310
TLT: OCC_06851
THS: TES1_0569
TNU: BD01_1239
TEU: TEU_01100
THH: CDI07_07750(endA)
PPAC: PAP_03720
MAC: MA_3624(endA)
MBAR: MSBR2_1809
MBAK: MSBR3_2864
MMA: MM_0512
MMAC: MSMAC_0773
METM: MSMTP_0884
MTHE: MSTHC_0829
MTHR: MSTHT_2453
MHOR: MSHOH_0897
MBU: Mbur_1040(endA)
MMET: MCMEM_1522
MMH: Mmah_1415
MPY: Mpsy_0954
MTP: Mthe_0700
MCJ: MCON_2907(endA)
MHI: Mhar_1241
MHU: Mhun_1733
MLA: Mlab_1368
MBG: BN140_1711(endA)
MEMA: MMAB1_2202(endA)
MPI: Mpet_2568
MBN: Mboo_0655
MPL: Mpal_0572
MPD: MCP_1408(endA)
MEZ: Mtc_1791(endA)
RCI: RRC215(endA)
HAL: VNG_2210G(endA)
HSL: OE_4102R(endA)
HHB: Hhub_1024(endA)
HALH: HTSR_0185
HHSR: HSR6_0183(endA)
HSU: HLASF_2030(endA)
HSF: HLASA_2064(endA)
HMA: rrnAC2964(endA)
HHI: HAH_0224(endA)
NPH: NP_0444A(endA)
NMO: Nmlp_3562(endA)
HUT: Huta_1669
HTI: HTIA_1388
HMU: Hmuk_0666
HARC: HARCEL1_10365(endA)
HWA: HQ_1047A(endA)
HWC: Hqrw_1053(endA)
HVO: HVO_2952(endA)
HME: HFX_2946(endA)
HLA: Hlac_2070
HTU: Htur_3615
NMG: Nmag_1687(endA)
NAT: NJ7G_0061
SALI: L593_11235
APE: APE_0685 APE_1646.1(endA)
ACJ: ACAM_0509 ACAM_1032(endA)
SMR: Smar_0987
TAG: Tagg_0817
STO: STK_03225 STK_03580(endA)
CMA: Cmaq_0348
TTN: TTX_1594(endA) TTX_1893
NCT: NMSP_0593(endA_1) NMSP_1275(endA_2)
NGA: Ngar_c17700(endA1) Ngar_c18600(endA2)
NVN: NVIE_0359(endA1) NVIE_0473(endA2)
NCV: NCAV_0531(endA) NCAV_0899
NBV: T478_0428(endA) T478_0867(endA)
MARH: Mia14_0003
KCR: Kcr_1478
BARC: AOA65_0349(endA_1) AOA65_0846(endA_2)
BARB: AOA66_0074(endA_1) AOA66_0677(endA_2)
LOKI: Lokiarch_07920(endA_1) Lokiarch_33240(endA_2) Lokiarch_38890(endA_3)
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Taxonomy
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  Title
A tRNA(Trp) intron endonuclease from Halobacterium volcanii. Unique substrate recognition properties.
  Journal
J Biol Chem 263:17951-9 (1988)
Other DBs
ExplorEnz - The Enzyme Database: 4.6.1.16
IUBMB Enzyme Nomenclature: 4.6.1.16
ExPASy - ENZYME nomenclature database: 4.6.1.16
BRENDA, the Enzyme Database: 4.6.1.16
CAS: 117444-13-0

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