KEGG   ENZYME: 4.99.1.3Help
Entry
EC 4.99.1.3                 Enzyme                                 

Name
sirohydrochlorin cobaltochelatase;
CbiK;
CbiX;
CbiXS;
anaerobic cobalt chelatase;
cobaltochelatase [ambiguous];
sirohydrochlorin cobalt-lyase (incorrect)
Class
Lyases;
Other lyases;
Sole sub-subclass for lyases that do not belong in the other subclasses
BRITE hierarchy
Sysname
cobalt-sirohydrochlorin cobalt-lyase (sirohydrochlorin-forming)
Reaction(IUBMB)
cobalt-sirohydrochlorin + 2 H+ = sirohydrochlorin + Co2+ [RN:R05807]
Reaction(KEGG)
Substrate
cobalt-sirohydrochlorin [CPD:C11538];
H+ [CPD:C00080]
Product
sirohydrochlorin [CPD:C05778];
Co2+ [CPD:C00175]
Comment
This enzyme is a type II chelatase, being either a monomer (CbiX) or a homodimer (CibK) and being ATP-independent. CbiK from Salmonella enterica uses precorrin-2 as the substrate to yield cobalt-precorrin-2. The enzyme contains two histidines at the active site that are thought to be involved in the deprotonation of the tetrapyrrole substrate as well as in metal binding. CbiX from Bacillus megaterium inserts cobalt at the level of sirohydrochlorin (factor-II) rather than precorrin-2.
History
EC 4.99.1.3 created 2004
Pathway
ec00860  Porphyrin and chlorophyll metabolism
ec01100  Metabolic pathways
Orthology
K02190  sirohydrochlorin cobaltochelatase
K03795  sirohydrochlorin cobaltochelatase
K22011  sirohydrochlorin cobalto/nickelchelatase
Genes
SEX: STBHUCCB_9050
SENT: TY21A_04315
STM: STM2025(cbiK)
SEO: STM14_2513(cbiK)
SEV: STMMW_20561
SEY: SL1344_2001(cbiK)
SEM: STMDT12_C20470
SEJ: STMUK_2055(cbiK)
SEB: STM474_2110(cbiK)
SEF: UMN798_2190(cbiK)
SENR: STMDT2_19981(cbiK)
SEND: DT104_20831(cbiK)
SENI: CY43_10940
SPT: SPA0846(cbiK)
SEK: SSPA0791
SEI: SPC_1690(cbiK)
SEC: SCH_2033(cbiK)
SHB: SU5_02619
SENS: Q786_09995
SED: SeD_A2360
SEG: SG2050(cbiK)
SEL: SPUL_0875(cbiK)
SEGA: SPUCDC_0875(cbiK)
SET: SEN2023(cbiK)
SENA: AU38_10210
SENO: AU37_10220
SENV: AU39_10220
SENQ: AU40_11465
SENL: IY59_10505
SEEP: I137_03955
SENE: IA1_10105
KPN: KPN_03190(cbiK)
KPU: KP1_4455
KPP: A79E_0920
KPE: KPK_0926(cbiK)
KPR: KPR_1844(cbiK)
KPJ: N559_1051
KPX: PMK1_00671(cbiK)
KPNU: LI86_05185
KPNK: BN49_0918(cbiK)
KVA: Kvar_0880
KOX: KOX_01380
KOE: A225_4740
CKO: CKO_00813
CRO: ROD_21101(cbiK)
CAMA: F384_10335
EBT: EBL_c14860(cbiK)
EBF: D782_1630
YEN: YE2716(cbiK)
YEY: Y11_16011
YEW: CH47_2064(cbiK)
YET: CH48_3167(cbiK)
YEE: YE5303_31471(cbiK)
YAL: AT01_4050(cbiK)
YFR: AW19_735(cbiK)
YIN: CH53_3382(cbiK)
YKR: CH54_927
YRO: CH64_95(cbiK)
PLU: plu2989(cbiK)
PAY: PAU_01611(cbiK)
XBO: XBJ1_0842
XBV: XBW1_1568(cbiK)
XNE: XNC1_1159
XNM: XNC2_1139
MMK: MU9_1005
ETR: ETAE_1994(cbiK)
ETD: ETAF_1803(cbiK)
ETE: ETEE_4050(cbiK)
VSP: VS_2666
VTA: B1453
SSE: Ssed_2085
MAQ: Maqu_1136
MHC: MARHY2144
MAD: HP15_1504
MVS: MVIS_3628
MCA: MCA2299
HHA: Hhal_1350
CSA: Csal_0467
HEL: HELO_1273
HBE: BEI_3394(cbiX)
ADI: B5T_04076
AXE: P40_19800
TOL: TOL_2806
OAI: OLEAN_C02900(cbiX) OLEAN_C29540(cbiX)
TAU: Tola_1671
SALN: SALB1_0870
RSO: RSc2418
RSC: RCFBP_11008(cbiX)
RSL: RPSI07_1056(cbiX)
RSN: RSPO_c01033(cbiX)
RSM: CMR15_10961(cbiX)
RSE: F504_2376
RPI: Rpic_2682
REH: H16_A2993(cbiX)
CNC: CNE_1c29430(cbiX)
RME: Rmet_2810(cbiX)
CTI: RALTA_A2467(cbiX)
CGD: CR3_0413(cbiX)
BMA: BMA0669
BMAL: DM55_2031
BMAE: DM78_1250
BMAQ: DM76_2006
BMAI: DM57_2672
BMAF: DM51_443
BMAZ: BM44_1520
BMAB: BM45_1083
BPS: BPSL0962
BPR: GBP346_A1006(cbiX)
BPSE: BDL_1074
BPSM: BBQ_2484
BPSU: BBN_2608
BPSD: BBX_3019
BPK: BBK_555
BPSH: DR55_169
BPSA: BBU_1217
BPSO: X996_3238
BUT: X994_1772
BTE: BTH_I0820
BTQ: BTQ_838
BTJ: BTJ_1603
BTZ: BTL_2872
BTD: BTI_2865
BTV: BTHA_3088
BTHE: BTN_1831
BTHM: BTRA_3197
BTHA: DR62_2032
BTHL: BG87_3077
BOK: DM82_395
BOC: BG90_633
BVE: AK36_1441
BCN: Bcen_1858
BCJ: BCAL2679
BCEN: DM39_2557
BCEW: DM40_107
BCEO: I35_2539
BAM: Bamb_2518
BMU: Bmul_0825
BMJ: BMULJ_02433(cbiX)
BMK: DM80_2494
BMUL: NP80_2613
BCT: GEM_0959
BCED: DM42_2599
BDL: AK34_610
BCON: NL30_30590
BUB: BW23_2413
BLAT: WK25_11985
BTEI: WS51_22615
BSEM: WJ12_12415
BPSL: WS57_31090
BMEC: WJ16_12695
BSTG: WT74_13220
BGU: KS03_284
BGO: BM43_664
BYI: BYI23_A005810(cbiX)
BUK: MYA_2240
BUE: BRPE67_ACDS05760(cbiX)
BUL: BW21_3002
BGP: BGL_1c29870(cbiX)
BXE: Bxe_A3641
BXB: DR64_1334
BPH: Bphy_2228
BFN: OI25_749
PNU: Pnuc_0340
PPNO: DA70_10355
PPNM: LV28_20735
PPUL: RO07_14945
PSPU: NA29_22080
PAPI: SG18_14940
RFR: Rfer_2113
AAV: Aave_3165
AJS: Ajs_1918
ACRA: BSY15_3363
VEI: Veis_4925
DAC: Daci_3536
VPD: VAPA_1c28320(cbiX)
CTES: O987_17320
RTA: Rta_19390
LIM: L103DPR2_01734(cbiX)
LIH: L63ED372_01334(sirB)
HYB: Q5W_12655
CBAA: SRAA_0414
CBAB: SMCB_0298
MPT: Mpe_A1945 Mpe_B0439(cbiX) Mpe_B0474(cbiX)
HAR: HEAR2398
MMS: mma_2458
JAG: GJA_3934
CFU: CFU_3517(cbiX)
CARE: LT85_4036
LCH: Lcho_2598
THI: THI_3603
RGE: RGE_29170(cbiX)
BBAG: E1O_29820
PBH: AAW51_0534(cbiX) AAW51_3109(cbiX)
METR: BSY238_839
EBA: ebA3869
AZO: azo3377 azo3530(cbiX)
AZA: AZKH_3941(cbiX) AZKH_4156(cbiX)
SSDC: SSDC_01705
BPRC: D521_0331
ABU: Abu_1192
ABT: ABED_1121
SMUL: SMUL_1551(cbiK)
SHAL: SHALO_1515
SULJ: SJPD1_1528
GLO: Glov_3653
PCA: Pcar_0478(cbiK)
DMA: DMR_00730(cbiK) DMR_15530(cbiK)
DTR: RSDT_0425(cbiKp) RSDT_1017(cbiKc)
PPRF: DPRO_3922(cbiKc) DPRO_3927
LIP: LI1067
LIR: LAW_01107
DRT: Dret_0160
DML: Dmul_03740(cbiK1) Dmul_21120(cbiK2)
DAT: HRM2_07680(cbiK1) HRM2_07700(cbiK2) HRM2_45790(cbiK3)
DTO: TOL2_C34190(cbiK) TOL2_C34310(cbiK2)
HOH: Hoch_5277
AVI: Avi_2641
AOL: S58_68120
HCI: HCDSEM_005(cbiX)
HCT: HCTETULN_005(cbiX)
RBM: TEF_16265
DSH: Dshi_0171(cbiX2)
PSF: PSE_0823(cbiX) PSE_2208
OAT: OAN307_c02760(cbiX)
OAR: OA238_c01930(cbiX)
OTM: OSB_01900(cbiX)
PTP: RCA23_c25940(cbiX)
RMM: ROSMUCSMR3_03051(cbiX)
LVS: LOKVESSMR4R_00333(cbiX)
TMO: TMO_2777(cbiX)
TXI: TH3_20630
MAGQ: MGMAQ_0066(sirB) MGMAQ_2124
MGM: Mmc1_3135
AFR: AFE_3127
BMQ: BMQ_2618(cbiX)
BMD: BMD_2605(cbiX)
BMEG: BG04_5074(cbiX)
BACO: OXB_1231
BEO: BEH_20910
BKW: BkAM31D_06045(cbiX_1) BkAM31D_09045(cbiX_2)
GKA: GK1804
GTN: GTNG_1693(cbiX)
GGH: GHH_c18470(cbiX)
GEA: GARCT_01822(cbiX)
AFL: Aflv_2179
ANM: GFC28_881(cbiX)
AAMY: GFC30_2118(cbiX)
ANL: GFC29_745(cbiX)
LSP: Bsph_3445
LMO: lmo1202(cbiK)
LMN: LM5578_1275(cbiK)
LMY: LM5923_1228(cbiK)
LMOC: LMOSLCC5850_1191(cbiK)
LMOE: BN418_1413
LMOB: BN419_1409
LMOD: LMON_1195(cbiK)
LMOW: AX10_14515
LMOQ: LM6179_1509(cbiK)
LMR: LMR479A_1223(cbiK)
LMOM: IJ09_04325
LMF: LMOf2365_1211(cbiK)
LMC: Lm4b_01206(cbiK)
LMOG: BN389_12200(cbiK)
LMP: MUO_06200
LMOL: LMOL312_1189(cbiK)
LMOX: AX24_03390
LMH: LMHCC_1449(cbiK)
LMQ: LMM7_1207(cbiK)
LML: lmo4a_1184(cbiK)
LMS: LMLG_1058
LMW: LMOSLCC2755_1194(cbiK)
LMX: LMOSLCC2372_1198(cbiK)
LMZ: LMOSLCC2482_1242(cbiK)
LMON: LMOSLCC2376_1153(cbiK)
LMOS: LMOSLCC7179_1169(cbiK)
LMOO: LMOSLCC2378_1207(cbiK)
LMOY: LMOSLCC2479_1199(cbiK)
LMOT: LMOSLCC2540_1181(cbiK)
LMOA: LMOATCC19117_1201(cbiK)
LMOK: CQ02_06170
LIN: cbiK
LWE: lwe1159(cbiK)
LSG: lse_1081(cbiK)
LIV: LIV_1133(cbiK)
BBE: BBR47_12460(cbiX)
PPY: PPE_04547
PPM: PPSC2_23690(cbiX)
PPO: PPM_4708(cbiX)
PPOL: X809_40245
PPOY: RE92_13570
PMW: B2K_32625
PLV: ERIC2_c32330(cbiK)
PSAB: PSAB_08890
ASOC: CB4_00363(cbiX)
AAD: TC41_2709(sirB)
BTS: Btus_0412
SIV: SSIL_2474
KUR: ASO14_1787(cbiX)
SSA: SSA_0475
LRE: Lreu_1711
LRF: LAR_1599
LRU: HMPREF0538_20898(cbiK)
PCE: PECL_1389(cbiK) PECL_1391(cbiK)
AUR: HMPREF9243_1731(cbiK)
CAC: CA_C1373(cbiK)
CAE: SMB_G0597 SMB_G1396(cbiK)
CPE: CPE1228
CPF: CPF_1436(cbiK)
CPR: CPR_1242(cbiK)
CTC: CTC_00743(cbiK)
CTET: BN906_00779(cbiK)
CNO: NT01CX_0573(cbiK)
CBO: CBO0952(cbiK)
CBA: CLB_0994(cbiK)
CBH: CLC_1008(cbiK)
CBY: CLM_1103(cbiK)
CBL: CLK_0390(cbiK)
CBK: CLL_A2939
CBB: CLD_3608(cbiK)
CBI: CLJ_B1003(cbiK)
CBN: CbC4_2306(cbiK)
CBT: CLH_2685
CBF: CLI_1042(cbiK)
CBM: CBF_1011(cbiK)
CBE: Cbei_2309
CBZ: Cbs_2309
CBEI: LF65_03228
CKL: CKL_0720(cbiK)
CKR: CKR_0642
CLJ: CLJU_c31850(cbiK)
CSR: Cspa_c36280(cbiK)
CPAS: Clopa_1203
CPAT: CLPA_c12520(cbiK)
CPAE: CPAST_c12520(cbiK)
CSB: CLSA_c32520(cbiK)
CSQ: CSCA_5075
CLD: CLSPO_c09510(cbiK)
CTYK: CTK_C09510(cbiK)
AOE: Clos_0323
RUM: CK1_12360
CCT: CC1_20470
ROB: CK5_24160
CPY: Cphy_1387
CSO: CLS_16520
CDF: CD630_34220(cbiK)
PDC: CDIF630_03730(cbiKP)
CDC: CD196_3198(cbiK)
CDL: CDR20291_3244(cbiK)
PDF: CD630DERM_34220(cbiK)
EAC: EAL2_808p00660(cbiX)
CST: CLOST_0268(cbiK)
SLP: Slip_0928
DRM: Dred_2730
DAE: Dtox_0558
SGY: Sgly_1337
HMO: HM1_0528(cbiK)
ELM: ELI_0774
EHL: EHLA_0208
AWO: Awo_c30260(cbiK)
SAY: TPY_1364(cbiX)
BPRS: CK3_27580
THX: Thet_0350
TIT: Thit_0350
TKI: TKV_c03200(cbiX)
TOC: Toce_0309
TTM: Tthe_1847
TSH: Tsac_2646
CAD: Curi_c24920(cbiX)
VRM: 44547418_01200(cbiKp) 44547418_01201(cbiK_1) 44547418_01205(cbiK_2)
MED: MELS_0465
SRI: SELR_08950(cbiK) SELR_17050(cbiK)
MHG: MHY_04300
CTER: A606_10980
REQ: REQ_45400
SCO: SCO1858(SCI39.05)
SMA: SAVERM_6405(cbiX)
SCT: SCAT_1055(cbiX)
SFA: Sfla_4855
SBH: SBI_08139
SHY: SHJG_3317
SDV: BN159_6661(cbiX)
SALU: DC74_2359
SALL: SAZ_13150
SGU: SGLAU_08285(cbiX)
STRE: GZL_06644
SLD: T261_6288
SAMB: SAM23877_1931(cbiX)
SRW: TUE45_02337(cbiX_1)
SLE: sle_52750(sle_52750)
STRD: NI25_29920
SMAL: SMALA_1817
SALF: SMD44_02007(cbiX)
KSK: KSE_63540
PFR: PFREUD_07710(cysG_cbiX)
PFRE: RM25_0738
PPC: HMPREF9154_0395(cbiX_1)
TCU: Tcur_1320
SRO: Sros_7366
FAL: FRAAL1021
SAQ: Sare_2699
CAI: Caci_6031
TBI: Tbis_2563
RXY: Rxyl_0646
AFO: Afer_0799
GPA: GPA_01640
CBAC: JI75_02755
SYN: sll0037
SYY: SYNGTS_2831(sll0037)
SYT: SYNGTI_2830(sll0037)
SYS: SYNPCCN_2829(sll0037)
SYQ: SYNPCCP_2829(sll0037)
SYW: SYNW0837
SYG: sync_1195(cbiX)
SYR: SynRCC307_0990(cbiX)
SYX: SynWH7803_1422(cbiX)
CYA: CYA_2373(cbiX)
CYB: CYB_2347(cbiX)
SYNR: KR49_04190
SYND: KR52_07380
SYNW: SynWH8103_00951(cbiX)
TEL: tll1398
THN: NK55_02440(cbiK)
LET: O77CONTIG1_03670(cbiX_1)
HHG: XM38_006540(cbiX_1)
PMA: Pro_0806
PMT: PMT_0901
PRM: EW15_0753
AMR: AM1_2009
CYT: cce_4308
TER: Tery_4741
GVI: gll4193
CTHE: Chro_3008
CAU: Caur_2572
CAG: Cagg_1271
HAU: Haur_2923
CAP: CLDAP_23930(cbiX)
DGE: Dgeo_0274
AGL: PYTT_2522
MIN: Minf_0288
PSL: Psta_4162
PIR: VN12_19855(cbiX)
SACI: Sinac_1606
TDE: TDE2656(cbiK)
TPED: TPE_1168(cbiK)
FNU: FN1263
LBA: Lebu_0022
TAI: Taci_0054
SBR: SY1_17900
BFR: BF2511
BVU: BVU_3107
BCEL: BcellWH2_00346(cbiKp) BcellWH2_00350(cbiK_1) BcellWH2_00357(cbiK_2)
PGI: PG_0669(fetB)
PGN: PGN_0705
PGT: PGTDC60_1794(fetB)
PCRE: NCTC12858_00966(cbiK)
TFO: BFO_2214
PSAC: PSM36_1723
PRU: PRU_1084
MBAS: ALGA_3500
CPI: Cpin_4473
CTE: CT0389
CPC: Cpar_1479
CLI: Clim_1010
PAA: Paes_1292
PROC: Ptc2401_01277(cbiKp)
CTS: Ctha_2223
MRO: MROS_1427
TTK: TST_0126(cbiK)
TME: Tmel_0696
TAF: THA_1066(cbiX)
DDF: DEFDS_2060(cbiK)
LFC: LFE_1750(cbiX)
LFI: LFML04_0866(cbiX)
MJA: MJ_0970
MMP: MMP0164(cbiX(s))
MMD: GYY_00840
MAE: Maeo_1381
MVO: Mvol_1554
MTH: MTH_1397
MMG: MTBMA_c17830(cbiX)
METC: MTCT_1270
MWO: MWSIV6_1777(cbiX)
METE: tca_01350(cbiX)
MST: Msp_1561 Msp_1563(cbiX)
MRU: mru_0895(cbiK) mru_2200(cbiX)
MEB: Abm4_0618(cbiX1) Abm4_0619(cbiX2)
MMIL: sm9_2307(cbiX1) sm9_2308(cbiX2)
METH: MBMB1_1943
MFC: BRM9_0750(cbiX) BRM9_2283
MCUB: MCBB_2224(cbiX)
MFV: Mfer_0962
MKA: MK0428
AFU: AF_0721
FPL: Ferp_0608
MEAR: Mpt1_c07010(cbiX1) Mpt1_c08040(cbiX2) Mpt1_c08050(cbiX3)
MAC: MA_3631(cbiX)
MBAR: MSBR2_1804
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MTHE: MSTHC_0834
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MBU: Mbur_1035(cbiXS)
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MCJ: MCON_0747(cbiK) MCON_1928(cbiX) MCON_2896(cbiK)
MBG: BN140_0720(cbiX)
MBN: Mboo_1417
MPL: Mpal_0681
MPD: MCP_0361(cbiX-1) MCP_2528(cbiX-2)
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RCI: RCIX2006(cbiX-1) RCIX98(cbiX-2)
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HUT: Huta_1760
HTI: HTIA_1349
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HWA: HQ_1656A(cbiX2)
HWC: Hqrw_1771(cbiX2)
HVO: HVO_1128(cbiX2)
HME: HFX_1136(cbiX)
HLA: Hlac_0262
HTU: Htur_1053
NMG: Nmag_3212(cbiX)
NAT: NJ7G_3119
SALI: L593_00020
IHO: Igni_0537
IIS: EYM_03130
STO: STK_03830(cbiXS)
SSO: SSO0410
SOL: Ssol_1387
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SAI: Saci_0830
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NCV: NCAV_1643
NBV: T478_0091(cbiX)
NDV: NDEV_0110
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Taxonomy
Reference
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  Authors
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Common chelatase design in the branched tetrapyrrole pathways of heme and anaerobic cobalamin synthesis.
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Brindley AA, Raux E, Leech HK, Schubert HL, Warren MJ.
  Title
A story of chelatase evolution: identification and characterization of a small 13-15-kDa "ancestral" cobaltochelatase (CbiXS) in the archaea.
  Journal
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  Sequence
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  Authors
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The biosynthesis of adenosylcobalamin (vitamin B12).
  Journal
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IUBMB Enzyme Nomenclature: 4.99.1.3
ExPASy - ENZYME nomenclature database: 4.99.1.3
BRENDA, the Enzyme Database: 4.99.1.3

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