KEGG   ENZYME: 5.3.1.17Help
Entry
EC 5.3.1.17                 Enzyme                                 

Name
5-dehydro-4-deoxy-D-glucuronate isomerase;
4-deoxy-L-threo-5-hexulose uronate isomerase;
4-deoxy-L-threo-5-hexosulose-uronate ketol-isomerase;
kduI (gene name)
Class
Isomerases;
Intramolecular oxidoreductases;
Interconverting aldoses and ketoses, and related compounds
BRITE hierarchy
Sysname
5-dehydro-4-deoxy-D-glucuronate aldose-ketose-isomerase
Reaction(IUBMB)
5-dehydro-4-deoxy-D-glucuronate = 3-deoxy-D-glycero-2,5-hexodiulosonate [RN:R04383]
Reaction(KEGG)
Substrate
5-dehydro-4-deoxy-D-glucuronate [CPD:C04053]
Product
3-deoxy-D-glycero-2,5-hexodiulosonate [CPD:C04349]
Comment
The enzyme is involved in the degradation of polygalacturonate, a later stage in the degradation of pectin by many microorganisms.
History
EC 5.3.1.17 created 1972, modified 2012
Pathway
ec00040  Pentose and glucuronate interconversions
Orthology
K01815  4-deoxy-L-threo-5-hexosulose-uronate ketol-isomerase
Genes
ECO: b2843(kduI)
ECJ: JW2811(kduI)
ECD: ECDH10B_3015(kduI)
EBW: BWG_2579(kduI)
ECOK: ECMDS42_2351(kduI)
ECE: Z4163(kduI)
ECS: ECs3700
ECF: ECH74115_4112(kduI)
ETW: ECSP_3796(kduI)
ELX: CDCO157_3455
EOJ: ECO26_3916(kduI)
EOI: ECO111_3572(kduI)
EOH: ECO103_3403(kduI)
ECOO: ECRM13514_3708(kduI)
ECOH: ECRM13516_3571(kduI)
ECG: E2348C_3114(kduI)
EOK: G2583_3500(kduI)
ESO: O3O_20355
ESM: O3M_05340
ESL: O3K_05295
ELH: ETEC_3030
ECC: c3440(kduI)
ECP: ECP_2856
ECI: UTI89_C3246(kduI)
ECV: APECO1_3663(kduI)
ECX: EcHS_A2990(kduI)
ECM: EcSMS35_2991(kduI)
ECY: ECSE_3100
ECR: ECIAI1_2953(kduI)
ECQ: ECED1_3300(kduI)
ECK: EC55989_3120(kduI)
ECT: ECIAI39_3263(kduI)
EOC: CE10_3271(kduI)
EUM: ECUMN_3171(kduI)
ECZ: ECS88_3140(kduI)
ELO: EC042_3041(kduI)
ESE: ECSF_2658
EBR: ECB_02691(kduI)
EBD: ECBD_0879
EKF: KO11_08590(kduI)
EAB: ECABU_c31420(kduI)
EDJ: ECDH1ME8569_2750(kduI)
ENA: ECNA114_2903(kduI)
ELW: ECW_m3088(kduI)
ELL: WFL_15070(kduI)
ELC: i14_3159(kduI)
ELD: i02_3159(kduI)
ELP: P12B_c2935(kduI)
EBL: ECD_02691(kduI)
EBE: B21_02654(kduI)
ELF: LF82_1155(kduI)
ECOI: ECOPMV1_03133(kduI)
ECOJ: P423_15715
ECOS: EC958_3143(kduI)
STY: STY3163(kduI)
STT: t2928(kduI)
STM: STM3018(kduI)
SEO: STM14_3644(kduI)
SEY: SL1344_2996(kduI)
SEJ: STMUK_3006(kduI)
SEB: STM474_3165(kduI)
SEF: UMN798_3279(kduI)
SENR: STMDT2_29171(kduI)
SEND: DT104_30151(kdui)
SENI: CY43_15735
SPT: SPA2885(kduI)
SEK: SSPA2688
SEI: SPC_3077(kduI)
SEC: SCH_2957(kduI)
SEH: SeHA_C3234(kduI)
SHB: SU5_03507
SEE: SNSL254_A3249(kduI)
SEW: SeSA_A3186(kduI)
SEA: SeAg_B3169(kduI)
SENS: Q786_14600
SED: SeD_A3350(kduI)
SEG: SG2927(kduI)
SEL: SPUL_3031(kduI)
SET: SEN2861(kduI)
SENA: AU38_14535
SENO: AU37_14545
SENV: AU39_14540
SENQ: AU40_16370
SENL: IY59_15140
SENB: BN855_30820(kduI)
SENE: IA1_14535
SBG: SBG_2623(kduI)
SBZ: A464_3036
SFL: SF2853(kduI)
SFX: S3051(kduI)
SFV: SFV_2921(kduI)
SFE: SFxv_3127(kduI)
SFN: SFy_4063
SFS: SFyv_4140
SFT: NCTC1_03141(kduI)
SSN: SSON_3003(kduI)
SBO: SBO_2735(kduI)
SBC: SbBS512_E3017(kduI)
ENC: ECL_04176
EEC: EcWSU1_03655(kduI)
ECLX: LI66_18270
ECLY: LI62_19730
ECLZ: LI64_17175
ESA: ESA_00137
CSK: ES15_0450(kduI)
CTU: CTU_37240(kduI)
EAE: EAE_13155
EAR: CCG31341
CKO: CKO_04220
CRO: ROD_28921(kduI)
CAMA: F384_15410
EBT: EBL_c07860(kduI)
EBF: D782_0861
YPE: YPO1725(kduI)
YPK: y1887(kduI)
YPH: YPC_2091(kduI)
YPA: YPA_1793
YPN: YPN_1905
YPM: YP_1750(kduI)
YPG: YpAngola_A2642(kduI)
YPZ: YPZ3_1980(kduI)
YPD: YPD4_1535(kduI)
YPX: YPD8_2017(kduI)
YPW: CH59_109(kduI)
YPJ: CH55_523(kduI)
YPV: BZ15_1824(kduI)
YPL: CH46_3398(kduI)
YPS: YPTB2356(kduI)
YPO: BZ17_100(kduI)
YPI: YpsIP31758_1694(kduI)
YPY: YPK_1804
YPB: YPTS_2430
YPQ: DJ40_4217(kduI)
YPU: BZ21_1642(kduI)
YPR: BZ20_3851(kduI)
YPC: BZ23_1928(kduI)
YPF: BZ19_1719
YEN: YE1888(kduI)
YEY: Y11_07601
YEW: CH47_1322(kduI)
YET: CH48_3595(kduI)
YEE: YE5303_20661(kduI)
YFR: AW19_1429(kduI)
YIN: CH53_4260(kduI)
YKR: CH54_233
YRO: CH64_773(kduI)
YRU: BD65_2443(kduI)
SPLY: Q5A_010730(kduI)
SMAF: D781_1952
RAA: Q7S_14330
ECA: ECA2400(kduI1) ECA4125(kduI2)
PATO: GZ59_21570(kduI1) GZ59_41800(kduI2)
SOD: Sant_2090(kduI)
DDD: Dda3937_03727(kduI)
DDQ: DDI_2099
EGE: EM595_1653(kduI)
PAM: PANA_0582(kduI)
PLF: PANA5342_3732(kduI)
PAJ: PAJ_3723(kduI)
PVA: Pvag_1129(kduI)
PMR: PMI2133(kduI)
PMIB: BB2000_2206(kduI)
PRG: RB151_031620(kduI)
ETR: ETAE_1898(kduI)
ETD: ETAF_1711
ETE: ETEE_3941(kduI)
XCC: XCC0151(kduI)
XCB: XC_0160
XCA: xcc-b100_0168(kduI)
XCP: XCR_4388
XCV: XCV0152(kduI)
XAX: XACM_0153(kduI)
XAC: XAC0168(kduI)
XCI: XCAW_00562(kduI)
XFU: XFF4834R_chr00850(kduI)
XOM: XOO0167(XOO0167) XOO0168(XOO0168)
XPH: XppCFBP6546_11085(XppCFBP6546P_11085)
PSUW: WQ53_07960
LAQ: GLA29479_2989(kduI1)
VNI: VIBNI_B0398(kduI) VIBNI_B0647(kduI)
VFI: VF_A0998(kduI)
AMAL: I607_11585
AMAE: I876_11960
AMAO: I634_11815
AMAC: MASE_11275
AAUS: EP12_12290
SALH: HMF8227_02584(kduI)
MYA: MORIYA_3543(kduI)
CJA: CJA_0169
GAI: IMCC3135_20265(kduI1)
HEL: HELO_2960(kduI)
AVR: B565_2111
TAU: Tola_3048
BCJ: BCAM0154(kduI)
BCEO: I35_4135(kduI)
BCED: DM42_5025(kduI)
BCON: NL30_24760
BSEM: WJ12_21245
BGO: BM43_123(kduI)
BGP: BGL_1c25490(kduI)
BPH: Bphy_5760
BFN: OI25_3741
RGE: RGE_05460(kduI)
SME: SM_b21349 SMa0214(kduI)
SMI: BN406_04964(kduI1) BN406_05736(kduI2)
SMD: Smed_4744
SFH: SFHH103_05450(kduI)
SFD: USDA257_c13150(kduI1) USDA257_c17020(kduI2)
ATU: Atu3142(kduI)
ATF: Ach5_29970(kduI)
AVI: Avi_3894
REL: REMIM1_PD00421(kduI)
REP: IE4803_PA00360(kduI)
REI: IE4771_PC00373(kduI)
RLE: pRL110530
RLG: Rleg_6603
RIR: BN877_II0126(kduI)
RHL: LPU83_pLPU83d1431(kduI2)
RGA: RGR602_PC01294(kduI)
RHN: AMJ98_PD00415(kduI)
RPHA: AMC79_PB00323(kduI)
RHT: NT26_2979(kduI) NT26_3660(kduI)
RHX: AMK02_PE00422(kduI)
RHK: Kim5_PB00391(kduI)
AZC: AZC_3335
SNO: Snov_3259
MET: M446_1710
PHL: KKY_3037
MMED: Mame_01907(kduI1)
HDI: HDIA_4607(kduI)
CCR: CC_1491
CAK: Caul_1757
CSE: Cseg_1552
PZU: PHZ_c2451(kduI)
RSP: RSP_0482(kduI)
PSF: PSE_2878(kduI)
OTM: OSB_21270(kduI)
MALG: MALG_00189
LVS: LOKVESSMR4R_01872(kduI)
SPHK: SKP52_01825(kduI1) SKP52_19515(kduI2)
SPHP: LH20_18795
SMAZ: LH19_23310
SPHU: SPPYR_3521(kduI) SPPYR_3767(kduI)
SPHI: TS85_17600
AZL: AZL_d01450(kduI)
ALI: AZOLI_p20544(kduI1) AZOLI_p40492(kduI2)
ABS: AZOBR_p420029(kduI)
TXI: TH3_14130
BSU: BSU22130(kduI)
BSR: I33_2273
BSL: A7A1_2899
BSH: BSU6051_22130(kduI)
BSUT: BSUB_02379(kduI)
BSUL: BSUA_02379(kduI)
BSUS: Q433_12065
BSS: BSUW23_10845(kduI)
BST: GYO_2439
BSO: BSNT_08607(kduI)
BSQ: B657_22130(kduI)
BSX: C663_2086(kduI)
BLD: BLi03829(kduI)
BLH: BaLi_c38410(kduI)
BHA: BH2166(kduI)
BCZ: pE33L466_0343(kduI)
BCL: ABC0994(kduI)
BPU: BPUM_3246
BPUM: BW16_17315
BPUS: UP12_16805
BAG: Bcoa_2244
BCOA: BF29_1332(kduI1)
BJS: MY9_2217
BACW: QR42_16315
BACY: QF06_09270
BACL: BS34A_24400(kduI)
BALM: BsLM_2156
BGY: BGLY_4227(kduI)
BKW: BkAM31D_06465(kduI)
OIH: OB2813
BSE: Bsel_0460
PPY: PPE_04632
PPM: PPSC2_24105(kduI)
PPO: PPM_4786(kduI)
PPOL: X809_40645
PPQ: PPSQR21_048800(kduI)
PPOY: RE92_13170
PMS: KNP414_06588(kduI)
PMW: B2K_31420
PLV: ERIC2_c02900(kduI)
PRI: PRIO_3971(kduI)
PSWU: SY83_21025
SIV: SSIL_2364(kduI)
SUB: SUB1606(kduI)
STK: STP_0090
LBR: LVIS_0127
LCA: LSEI_2671
LPAP: LBPC_2644
LCB: LCABL_28610(kduI)
LCS: LCBD_2887
LCE: LC2W_2861
LCW: BN194_28080(kduI)
LRL: LC705_02691(kduI)
LRA: LRHK_2800(kduI1)
EFA: EF0425(kduI-1) EF2264(kduI-2)
EFL: EF62_0758
EFI: OG1RF_10312(kduI1)
EFS: EFS1_0306(kduI)
EFN: DENG_00414(kduI)
EFQ: DR75_2418(kduI1)
ENE: ENT_25640
EFC: EFAU004_00255(kduI1)
EFAU: EFAU085_00213(kduI1)
EFU: HMPREF0351_10220(kduI)
EFM: M7W_442
ECAS: ECBG_02094
EMU: EMQU_0236(kduI)
EDU: LIU_00205
MPS: MPTP_1700
MPX: MPD5_0361
CPF: CPF_0395(kduI) CPF_0399(kduI)
CPR: CPR_0391(kduI_1) CPR_0395(kduI_2)
CBN: CbC4_0767
CSR: Cspa_c24170(kduI)
CBV: U729_2509(kduI1) U729_2959(kduI1)
AMT: Amet_0900
CSS: Cst_c08810(kduI)
CSD: Clst_0846
FPR: FP2_23270
FPA: FPR_14540
BPB: bpr_I0929(kduI)
BHU: bhn_I0816
RIX: RO1_13480
RIM: ROI_24050
CPY: Cphy_2738
OVA: OBV_11520(kduI)
BPRS: CK3_23870
TIT: Thit_1734
TAE: TepiRe1_2310(kduI)
ATE: Athe_2384
TTM: Tthe_2383
TSH: Tsac_0144
SRI: SELR_01440(kduI)
PUF: UFO1_3805
PFT: JBW_01060
MCD: MCRO_0401(kduI)
MFR: MFE_04680(kduI)
MFM: MfeM64YM_0604(kduI)
MFP: MBIO_0029
ABRA: BN85308580
APAL: BN85406280(kduI)
AOC: Aocu_11490(kduI)
SCLA: SCLARK_001255(kduI)
MTS: MTES_2097
BCV: Bcav_0643
XCE: Xcel_2539
IDO: I598_2660(kduI1)
CFI: Celf_3346
KRA: Krad_0197
KAL: KALB_340
ACTI: UA75_21595
ACAD: UA74_21115
OTE: Oter_4263
OBG: Verru16b_01543(kduI)
PBU: L21SP3_00432(kduI)
PBP: STSP1_00066(kduI)
VBL: L21SP4_02421(kduI)
FVA: FV113G1_28550(kduI)
SMF: Smon_0119
GBA: J421_0369
BTHO: Btheta7330_04117(kduI_1) Btheta7330_05072(kduI_2)
BFR: BF0071
BOA: Bovatus_03315(kduI_1) Bovatus_04355(kduI_2)
BCEL: BcellWH2_02924(kduI)
PBT: ING2E5B_2323(kduI)
PMUC: ING2E5A_0092(kduI)
TFO: BFO_2288
PSAC: PSM36_3436(kduI)
PRU: PRU_1290(kduI)
ASH: AL1_00940
DORI: FH5T_01815
MBAS: ALGA_0105
RMR: Rmar_2302
CPI: Cpin_6827
FLN: FLA_0522
PHE: Phep_2944
MUC: MuYL_2120
MGOT: MgSA37_02537(kduI)
DFE: Dfer_2839
SLI: Slin_3403
LBY: Lbys_1642
FAE: FAES_3726
PSEZ: HME7025_01206(kduI)
HSW: Hsw_1539
FLM: MY04_3506
FJO: Fjoh_4264
FJG: BB050_03220(kduI)
FBR: FBFL15_2676(kduI)
ZPR: ZPR_2962
MARM: YQ22_02060
CBAL: M667_19765
CBAT: M666_19745
ZGA: ZOBELLIA_189(kduI1) ZOBELLIA_255(kduI2) ZOBELLIA_3459(kduI3) ZOBELLIA_3807(kduI4)
NDO: DDD_0340
EAO: BD94_1189
ELB: VO54_01341(kduI)
AALG: AREALGSMS7_02521(kduI)
MARF: CJ739_3742
FBA: FIC_01892
MRO: MROS_2335
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Taxonomy
Reference
1
  Authors
Preiss, J.
  Title
4-Deoxy-L-threo-5-hexosulose uronic acid isomerase.
  Journal
Methods Enzymol 9:602-604 (1966)
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  Authors
Condemine G, Robert-Baudouy J
  Title
Analysis of an Erwinia chrysanthemi gene cluster involved in pectin degradation.
  Journal
Mol Microbiol 5:2191-202 (1991)
DOI:10.1111/j.1365-2958.1991.tb02149.x
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Reference
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  Authors
Dunten P, Jaffe H, Aksamit RR
  Title
Crystallization of 5-keto-4-deoxyuronate isomerase from Escherichia coli.
  Journal
Acta Crystallogr D Biol Crystallogr 54:678-80 (1998)
  Sequence
[eco:b2843]
Reference
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  Authors
Crowther RL, Georgiadis MM
  Title
The crystal structure of 5-keto-4-deoxyuronate isomerase from Escherichia coli.
  Journal
Proteins 61:680-4 (2005)
DOI:10.1002/prot.20598
  Sequence
[eco:b2843]
Other DBs
ExplorEnz - The Enzyme Database: 5.3.1.17
IUBMB Enzyme Nomenclature: 5.3.1.17
ExPASy - ENZYME nomenclature database: 5.3.1.17
BRENDA, the Enzyme Database: 5.3.1.17
CAS: 37318-44-8

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