KEGG   ENZYME: 5.3.1.3Help
Entry
EC 5.3.1.3                  Enzyme                                 

Name
D-arabinose isomerase;
D-arabinose(L-fucose) isomerase;
L-fucose isomerase;
D-arabinose ketol-isomerase;
arabinose isomerase (misleading)
Class
Isomerases;
Intramolecular oxidoreductases;
Interconverting aldoses and ketoses, and related compounds
BRITE hierarchy
Sysname
D-arabinose aldose-ketose-isomerase
Reaction(IUBMB)
D-arabinose = D-ribulose [RN:R01577]
Reaction(KEGG)
R01577;
(other) R03163
Show
Substrate
D-arabinose [CPD:C00216]
Product
D-ribulose [CPD:C00309]
Comment
Requires a divalent metal ion (the enzyme from the bacterium Escherichia coli prefers Mn2+). The enzyme binds the closed form of the sugar and catalyses ring opening to generate a form of open-chain conformation that facilitates the isomerization reaction, which proceeds via an ene-diol mechanism [3]. The enzyme catalyses the aldose-ketose isomerization of several sugars. Most enzymes also catalyse the reaction of EC 5.3.1.25, L-fucose isomerase [3]. The enzyme from the bacterium Falsibacillus pallidus also converts D-altrose to D-psicose [4]. cf. EC 5.3.1.4, L-arabinose isomerase.
History
EC 5.3.1.3 created 1961, modified 2013
Orthology
K01818  L-fucose/D-arabinose isomerase
Genes
ECO: b2802(fucI)
ECJ: JW2773(fucI)
ECD: ECDH10B_2971(fucI)
EBW: BWG_2540(fucI)
ECOK: ECMDS42_2307(fucI)
ECE: Z4119(fucI)
ECS: ECs3662(fucI)
ECF: ECH74115_4066(fucI)
ETW: ECSP_3754(fucI)
ELX: CDCO157_3417(fucI)
EOJ: ECO26_3872(fucI)
EOI: ECO111_3527(fucI)
EOH: ECO103_3345(fucI)
ECOO: ECRM13514_3666(fucI)
ECOH: ECRM13516_3530(fucI)
ECG: E2348C_3069(fucI)
EOK: G2583_3455(fucI)
ELR: ECO55CA74_16475(fucI)
ESO: O3O_20165(fucI)
ESM: O3M_05530(fucI)
ESL: O3K_05485(fucI)
ECW: EcE24377A_3107(fucI)
ELH: ETEC_2992
EUN: UMNK88_3487(fucI)
ECC: c3371(fucI)
ECP: ECP_2785
ECI: UTI89_C3174(fucI)
ECV: APECO1_3729(fucI)
ECX: EcHS_A2946(fucI)
ECM: EcSMS35_2943(fucI)
ECY: ECSE_3062
ECR: ECIAI1_2912(fucI)
ECQ: ECED1_3255(fucI)
ECK: EC55989_3081(fucI)
ECT: ECIAI39_3224(fucI)
EOC: CE10_3229(fucI)
EUM: ECUMN_3131(fucI)
ECZ: ECS88_3071(fucI)
ELO: EC042_3001(fucI)
ELN: NRG857_13725(fucI)
ESE: ECSF_2593
EBR: ECB_02653(fucI)
EBD: ECBD_0920
EKF: KO11_08945(fucI)
EAB: ECABU_c30720(fucI)
EDJ: ECDH1ME8569_2712(fucI)
EIH: ECOK1_3178(fucI)
ENA: ECNA114_2842(fucI)
ELU: UM146_02555(fucI)
ELW: ECW_m3012(fucI)
ELL: WFL_14715(fucI)
ELC: i14_3095(fucI)
ELD: i02_3095(fucI)
ELP: P12B_c2901(fucI)
EBL: ECD_02653(fucI)
EBE: B21_02614(fucI)
ELF: LF82_0770(fucI)
ECOA: APECO78_17630(fucI)
ECOL: LY180_14240(fucI)
ECOI: ECOPMV1_03059(fucI)
ECOJ: P423_15320(fucI)
ECOS: EC958_3072(fucI)
EAL: EAKF1_ch3211c(fucI)
EMA: C1192_21640(fucI)
STY: STY3116(fucI)
STT: t2884(fucI)
SENT: TY21A_14590(fucI)
STM: STM2976(fucI)
SEO: STM14_3590(fucI)
SEY: SL1344_2956(fucI)
SEM: STMDT12_C30280(fucI)
SEJ: STMUK_2964(fucI)
SEB: STM474_3122(fucI)
SEF: UMN798_3235(fucI)
SETU: STU288_15055(fucI)
SETC: CFSAN001921_02190(fucI)
SENR: STMDT2_28771(fucI)
SEND: DT104_29741(fucI)
SENI: CY43_15525(fucI)
SEEN: SE451236_20975(fucI)
SPT: SPA2840(fucI)
SEK: SSPA2646
SEI: SPC_3035(fucI)
SEC: SCH_2916(fucI)
SEH: SeHA_C3186(fucI)
SHB: SU5_03466
SENH: CFSAN002069_17340(fucI)
SEEH: SEEH1578_00940(fucI)
SEE: SNSL254_A3201(fucI)
SEW: SeSA_A3138(fucI)
SEA: SeAg_B3121(fucI)
SENS: Q786_14385(fucI)
SED: SeD_A3301(fucI)
SEG: SG2886(fucI)
SEL: SPUL_2986(fucI)
SEGA: SPUCDC_2972(fucI)
SET: SEN2820(fucI)
SENA: AU38_14320(fucI)
SENO: AU37_14330(fucI)
SENV: AU39_14330(fucI)
SENQ: AU40_16135(fucI)
SENL: IY59_14925(fucI)
SENJ: CFSAN001992_18685(fucI)
SEEC: CFSAN002050_21235(fucI)
SEEB: SEEB0189_005245(fucI)
SEEP: I137_14190(fucI)
SENB: BN855_30380(fucI)
SENE: IA1_14320(fucI)
SENC: SEET0819_21745(fucI)
SFL: SF2816(fucI)
SFX: S3011(fucI)
SFV: SFV_2881(fucI)
SFE: SFxv_3089(fucI)
SFN: SFy_4007
SFS: SFyv_4086
SFT: NCTC1_03096(fucI)
SBO: SBO_2685(fucI)
SDY: SDY_3020(fucI)
SHQ: A0259_17615(fucI)
ECLO: ENC_23210
ECLE: ECNIH2_05850(fucI)
ECLI: ECNIH5_04950(fucI)
ECLX: LI66_04850(fucI)
ECLY: LI62_05370(fucI)
ECLZ: LI64_05055(fucI)
EHM: AB284_20035(fucI)
ECLA: ECNIH3_04960(fucI)
ECLC: ECR091_04940(fucI)
KPN: KPN_03153(fucI)
KPU: KP1_4433(fucI)
KPP: A79E_0941
KPK: A593_05965(fucI)
KPH: KPNIH24_07640(fucI)
KPZ: KPNIH27_20490(fucI)
KPV: KPNIH29_21260(fucI)
KPW: KPNIH30_21280(fucI)
KPY: KPNIH31_20545(fucI)
KPG: KPNIH32_22140(fucI)
KPC: KPNIH10_21070(fucI)
KPQ: KPR0928_20555(fucI)
KPT: VK055_4358(fucI)
KPE: KPK_0964(fucI)
KPO: KPN2242_18800(fucI)
KPR: KPR_4167(fucI)
KPI: D364_16080(fucI)
KPX: PMK1_00636(fucI)
KPB: FH42_11795(fucI)
KPNE: KU54_005290(fucI)
KPNU: LI86_05300(fucI)
KPNK: BN49_0959(fucI)
KVA: Kvar_0900
KOX: KOX_01280(fucI)
KOE: A225_4717
KOY: J415_08415(fucI)
KOM: HR38_27400(fucI)
KOK: KONIH1_23695(fucI)
KOC: AB185_12685(fucI)
KQV: B8P98_05305(fucI)
CKO: CKO_04161
CRO: ROD_28471(fucI)
CFD: CFNIH1_00970(fucI)
CBRA: A6J81_22040(fucI)
CWE: CO701_03365(fucI)
CYO: CD187_04845(fucI)
CAMA: F384_15190(fucI)
CAF: AL524_07775(fucI)
CIF: AL515_18615(fucI)
CFAR: CI104_20160(fucI)
CIR: C2U53_14760(fucI)
CIE: AN232_09390(fucI)
GQU: AWC35_09890(fucI)
ROR: RORB6_23515(fucI)
RON: TE10_22730(fucI)
RAO: DSD31_05000(fucI)
CNT: JT31_11940(fucI)
KLE: AO703_05105(fucI)
YEE: YE5303_24981(fucI)
YAL: AT01_3336(fucI)
YIN: CH53_843(fucI)
YAK: ACZ76_13230(fucI)
YMA: DA391_17720(fucI)
SFO: Z042_19235(fucI)
SGL: SG0181
SOD: Sant_3737(fucI)
PAY: PAU_00702(fucI)
ETR: ETAE_0290(fucI)
ETD: ETAF_0252
ETE: ETEE_2045(fucI)
ETC: ETAC_01240(fucI)
EDW: QY76_01440(fucI)
EDL: AAZ33_01305(fucI)
HAV: AT03_02805(fucI)
OPO: DSM2777_00210(fucI)
PSHI: SAMEA2665130_0773(fucI)
HIN: HI0614(fucI)
HIT: NTHI0871(fucI)
HIU: HIB_07420
HIE: R2846_0402(fucI)
HIZ: R2866_1684(fucI)
HIK: HifGL_001603(fucI)
HIA: H733_0496
HIH: NF38_01395(fucI)
HIW: NTHI477_00998(fucI)
HIC: NTHIC486_00795(fucI)
HIX: NTHI723_00954(fucI)
HAP: HAPS_1526(fucI)
HPAZ: K756_10620(fucI)
HPAS: JL26_09155(fucI)
HPAK: JT17_07195(fucI)
HSO: HS_1448(fucI)
HSM: HSM_0583
PDAG: 4362423_01534(fucI)
MHT: D648_940(fucI)
MHQ: D650_27190(fucI)
MHAT: B824_700(fucI)
MHX: MHH_c06290(fucI)
MHAE: F382_07670(fucI)
MHAM: J450_07360(fucI)
MHAO: J451_08300(fucI)
MHAL: N220_00400(fucI)
MHAQ: WC39_13655(fucI)
MHAY: VK67_13660(fucI)
MVR: X781_370
MVE: X875_500
APL: APL_1684(fucI)
APJ: APJL_1716(fucI)
APA: APP7_1745(fucI)
APOR: DDU33_03445(fucI)
AAZ: ADJ80_04685(fucI)
VVY: VV2179
VVL: VV93_v1c19200(fucI)
VNA: PN96_21540(fucI)
VTA: A1786(fucI)
AHY: AHML_07125(fucI)
AHR: V428_07345(fucI)
AHP: V429_07350(fucI)
AHJ: V469_16150(fucI)
GDI: GDI2657(fucI)
GDJ: Gdia_0870
BCR: BCAH187_A3213(fucI)
BCQ: BCQ_2997
BNC: BCN_3011
BTF: YBT020_15780(fucI)
LIV: LIV_0083
LII: JL52_00675(fucI)
LIW: AX25_00685(fucI)
PMS: KNP414_04703(fucI)
PMW: B2K_21345(fucI)
PBD: PBOR_25135(fucI)
PGM: PGRAT_12455(fucI)
POD: PODO_07700(fucI)
PAEN: P40081_25180(fucI)
PAEF: R50345_07805(fucI)
PAEQ: R50912_23380(fucI)
PAEA: R70723_25775(fucI)
PAEE: R70331_24485(fucI)
PAEH: H70357_13745(fucI)
PAEJ: H70737_07520(fucI)
PRI: PRIO_2692(fucI)
PSWU: SY83_14245(fucI)
PVO: PVOR_21089(fucI)
AAD: TC41_0681(fucI)
SPN: SP_2158(fucI)
SPD: SPD_1986(fucI)
SPR: spr1964(fucI)
SPW: SPCG_2126(fucI)
SJJ: SPJ_2184(fucI)
SNV: SPNINV200_19690(fucI)
SNT: SPT_2171(fucI)
SND: MYY_2078(fucI)
SPNN: T308_10345(fucI)
SNE: SPN23F21900(fucI)
SPV: SPH_2352(fucI)
SNC: HMPREF0837_10161(fucI)
SNM: SP70585_2284(fucI)
SPP: SPP_2209(fucI)
SNI: INV104_18620(fucI)
SPNG: HMPREF1038_02168(fucI)
SNB: SP670_2303(fucI)
SNP: SPAP_2207
SNX: SPNOXC19030(fucI)
SNU: SPNA45_02011(fucI)
SPNE: SPN034156_09830(fucI)
SPNU: SPN034183_19060(fucI)
SPNM: SPN994038_18950(fucI)
SPNO: SPN994039_18960(fucI)
SSUI: T15_1048(fucI)
LRH: LGG_02685(fucI)
LRG: LRHM_2579
LGN: ABM34_08335(fucI)
LHI: JP39_03040(fucI)
EHR: EHR_02425(fucI)
CPE: CPE0318
CPF: CPF_1048(fucI)
CBV: U729_291(fucI)
ESR: ES1_21670
ESU: EUS_08540
RUM: CK1_20510
RTO: RTO_10570
CPY: Cphy_3155
ELM: ELI_2938
CSC: Csac_1339
ATE: Athe_2073
SELE: ADJ74_04975(fucI)
SELO: AXE86_04975(fucI)
MHG: MHY_09600
PUF: UFO1_2984
LPIL: LIP_2039
CMV: CMUST_02300(fucI)
CUT: CUTER_09895(fucI)
SALS: SLNWT_6165
PAW: PAZ_c06460(fucI1) PAZ_c06470(fucI2)
PPC: HMPREF9154_0923(fucI)
SEN: SACE_0948
SNA: Snas_3126
TPY: CQ11_03115(fucI)
TPYO: X956_04570(fucI)
AMY: ADJ76_05940(fucI)
AOS: AXE84_00180(fucI)
ARD: AXF14_12455(fucI)
RXY: Rxyl_0832
CWO: Cwoe_3985
CAP: CLDAP_22400(fucI)
AMU: Amuc_1832
AGL: PYTT_0473
PLH: VT85_19500(fucI)
PBOR: BSF38_01279(fucI)
PBU: L21SP3_01499(fucI)
PBAS: SMSP2_02093(fucI)
PBP: STSP1_01497(fucI)
TAZ: TREAZ_3084(fucI)
BRM: Bmur_2489
BPIP: BPP43_02430(fucI)
BPW: WESB_1306
BIP: Bint_1824
ABAC: LuPra_05002(fucI)
BTH: BT_1273(fucI)
BTHO: Btheta7330_01956(fucI)
BFR: BF0253
BFS: BF9343_0209(fucI)
BFG: BF638R_0265(fucI)
BFB: VU15_00605(fucI)
BVU: BVU_1373
BXY: BXY_00350
BDO: EL88_01240(fucI)
BDH: GV66_04575(fucI)
BOA: Bovatus_01281(fucI)
BCEL: BcellWH2_03053(fucI_1) BcellWH2_05278(fucI_2)
BCAC: CGC64_09830(fucI)
PBT: ING2E5B_2254(fucI)
PMUC: ING2E5A_2964(fucI)
TFO: BFO_0306(fucI)
BVS: BARVI_11195(fucI)
PSAC: PSM36_0006(fucI1) PSM36_3369(fucI3)
PRU: PRU_2781(fucI)
DORI: FH5T_00930(fucI)
NSO: NIASO_00520(fucI)
SMIZ: 4412673_01335(fucI)
RTI: DC20_21485(fucI)
FLM: MY04_4462
AHZ: APS56_15060(fucI)
WFU: AXE80_08920(fucI)
SALT: AO058_17505(fucI)
AALG: AREALGSMS7_01724(fucI)
MARF: CJ739_2283
MRO: MROS_1587
TMA: TM0307
TMW: THMA_0314
TMQ: THMB_0314
TMX: THMC_0314
TPT: Tpet_0610
TRQ: TRQ2_0624
TNA: CTN_0381
TNP: Tnap_0946
TLE: Tlet_0019
PMO: Pmob_1608
DTN: DTL3_1051
DTH: DICTH_0292(fucI)
DTU: Dtur_0410(fucI)
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Taxonomy
Reference
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Structure and mechanism of L-fucose isomerase from Escherichia coli.
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X-ray structures of Bacillus pallidus d-arabinose isomerase and its complex with  l-fucitol.
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DOI:10.1016/j.bbapap.2010.01.018
Other DBs
ExplorEnz - The Enzyme Database: 5.3.1.3
IUBMB Enzyme Nomenclature: 5.3.1.3
ExPASy - ENZYME nomenclature database: 5.3.1.3
BRENDA, the Enzyme Database: 5.3.1.3
CAS: 9023-81-8

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