KEGG   ENZYME: 5.3.3.2Help
Entry
EC 5.3.3.2                  Enzyme                                 

Name
isopentenyl-diphosphate Delta-isomerase;
isopentenylpyrophosphate Delta-isomerase;
methylbutenylpyrophosphate isomerase;
isopentenylpyrophosphate isomerase
Class
Isomerases;
Intramolecular oxidoreductases;
Transposing C=C bonds
BRITE hierarchy
Sysname
isopentenyl-diphosphate Delta3-Delta2-isomerase
Reaction(IUBMB)
isopentenyl diphosphate = dimethylallyl diphosphate [RN:R01123]
Reaction(KEGG)
Substrate
isopentenyl diphosphate [CPD:C00129]
Product
dimethylallyl diphosphate [CPD:C00235]
Comment
The enzyme from Streptomyces sp. strain CL190 requires FMN and NAD(P)H as cofactors. Activity is reduced if FMN is replaced by FAD, but the enzyme becomes inactive when NAD(P)H is replaced by NAD+ or NADP+. That enzyme also requires Mg2+, Mn2+ or Ca2+ for activity.
History
EC 5.3.3.2 created 1961, modified 2002
Pathway
ec00900  Terpenoid backbone biosynthesis
ec01100  Metabolic pathways
ec01110  Biosynthesis of secondary metabolites
ec01130  Biosynthesis of antibiotics
Orthology
K01823  isopentenyl-diphosphate Delta-isomerase
Genes
HSA: 3422(IDI1) 91734(IDI2)
PTR: 104008078(IDI1) 450262(IDI2)
PPS: 100975839(IDI2) 100976186(IDI1)
GGO: 101130797(IDI2) 101131151(IDI1)
PON: 100173020(IDI1) 112135224(IDI2)
NLE: 100596156(IDI2) 100596497(IDI1)
MCC: 710052(IDI1)
MCF: 101864943(IDI1)
CSAB: 103237761 103237763(IDI1)
RRO: 104661413(IDI1) 104661559(IDI2)
RBB: 108538009(IDI1) 108538010(IDI2)
CJC: 100400892(IDI1)
SBQ: 101052843(IDI1)
MMU: 102635781(Gm38481) 319554(Idi1) 320581(Idi2)
RNO: 502143(Idi2) 689872(RGD1564999) 89784(Idi1)
CGE: 100752366(Idi1) 100752668(Idi2)
HGL: 101702441(Idi2) 101710989 101712767(Idi1)
CCAN: 109689187(Idi1)
OCU: 100343510(IDI1) 100346274
CFA: 100687634(IDI1)
AML: 100484118(IDI1)
UMR: 103673985
ORO: 101370766(IDI1)
FCA: 102901899
PTG: 102963077(IDI1)
AJU: 106977733
BTA: 514293(IDI1)
BOM: 102268825(IDI1)
BIU: 109568102
PHD: 102335323(IDI1)
CHX: 102191533(IDI1)
OAS: 101108851
SSC: 100625049
CFR: 102512168(IDI1)
CDK: 105100506(IDI1)
BACU: 103007308(IDI1)
LVE: 103069484(IDI1) 103074472
OOR: 101274614
ECB: 100630801(IDI1)
EPZ: 103554347(IDI1)
EAI: 106840621
MYD: 102754130(IDI1)
HAI: 109374227(IDI1) 109387067
PALE: 102891875
LAV: 100659532(IDI2) 100662282(IDI1)
OAA: 100080658(IDI1)
GGA: 420459(IDI1)
MGP: 100549470
CJO: 107308912
APLA: 101792434(IDI1)
ACYG: 106038922
TGU: 100190360
GFR: 102034589(IDI1)
FAB: 101810852(IDI1)
PHI: 102100807(IDI1)
PMAJ: 107200649
CCW: 104686447
FPG: 101910858(IDI1)
FCH: 102059807(IDI1)
CLV: 102097071
EGZ: 104128533
AAM: 106492689(IDI1)
ASN: 102370886
AMJ: 102565794(IDI1)
PSS: 102458644
CMY: 102939414(IDI1)
CPIC: 101932042(IDI1)
ACS: 100559198
PVT: 110071890
PBI: 103058764
GJA: 107120493
XLA: 108719834(idi1.S) 494671(idi1.L)
XTR: 496783(idi1)
NPR: 108785151
DRE: 553513(idi1)
SANH: 107683492 107687547(idi1)
CCAR: 109049368
IPU: 100528109(idi1)
AMEX: 103029033(idi1)
TRU: 101062403(idi1)
LCO: 104924701(idi1)
NCC: 104949244(idi1)
MZE: 101471443(idi1)
OLA: 101164516(idi1)
XMA: 102223825(idi1)
PRET: 103482260(idi1)
NFU: 107382663(idi1)
CSEM: 103377048(idi1)
LCF: 108898279(idi1)
HCQ: 109507828(idi1)
BPEC: 110158663(idi1)
SASA: 106578532(idi1)
ELS: 105019445(idi1)
SFM: 108927665(idi1)
LCM: 102365989(IDI1)
CMK: 103183617
CIN: 100186921
SPU: 586184
APLC: 110976532
SKO: 100371937
DME: Dmel_CG5919(CG5919)
DSI: Dsimw501_GD19412(Dsim_GD19412)
MDE: 101892320
AAG: 5567538
AME: 725363
BIM: 100747227
BTER: 100646012
SOC: 105205600
AEC: 105153881
ACEP: 105618406
PBAR: 105433970
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CFO: 105259245
LHU: 105675073
PGC: 109857387
NVI: 100116989
TCA: 660176
DPA: 109534110
NVL: 108557256
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PRAP: 110994308
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ZNE: 110839997
FCD: 110858446
TUT: 107359805
CEL: CELE_K06H7.9(idi-1)
CBR: CBG22969(Cbr-idi-1)
BMY: Bm1_16940
CRG: 105328611
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OBI: 106879292
EGL: EGR_04743
EPA: 110232779
ADF: 107345157
HMG: 105843263
AQU: 100634933
ATH: AT3G02780(IPP2) AT5G16440(IPP1)
CPAP: 110813290
CIT: 102624321
TCC: 18599322
GRA: 105792720
VRA: 106759584
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CCAJ: 109802969
CAM: 101509488
LJA: Lj1g3v2823900.1(Lj1g3v2823900.1)
ADU: 107485966
AIP: 107635147
FVE: 101313998
PPER: 18772960
PMUM: 103318795
PAVI: 110760426
RCU: 8274290
JCU: 105644876
POP: 7455211
VVI: 100241072
SLY: 100134905(IPI) 101255683(IDI1)
DCR: 108215692
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SOE: 110791428
NNU: 104599644
DOSA: Os05t0413400-01(Os05g0413400) Os07t0546000-01(Os07g0546000)
ATS: 109738366(LOC109738366) 109755070(LOC109755070)
ZMA: 100502421 103630362 541901(umc1301)
EGU: 105061297
ATR: 18430011
PPP: 112284088
CRE: CHLREDRAFT_24471(IDI1)
MNG: MNEG_5921
MIS: MICPUN_54661(IPI)
CVR: CHLNCDRAFT_53578(IDI)
APRO: F751_2524
SCE: YPL117C(IDI1)
ERC: Ecym_8293
KMX: KLMA_50036(IDI1)
NCS: NCAS_0C01740(NCAS0C01740)
NDI: NDAI_0E02450(NDAI0E02450)
TPF: TPHA_0A01080(TPHA0A01080)
TBL: TBLA_0B04230(TBLA0B04230)
TDL: TDEL_0A05550(TDEL0A05550)
KAF: KAFR_0H02800(KAFR0H02800)
PIC: PICST_68990(IDI1)
CAL: CAALFM_C402280WA(IDI1)
CAUR: QG37_06374
SLB: AWJ20_636(IDI1)
NCR: NCU07719
NTE: NEUTE1DRAFT145121(NEUTE1DRAFT_145121)
MGR: MGG_07125
SSCK: SPSK_03467
MAW: MAC_00651
MAJ: MAA_06452
CMT: CCM_04017
BFU: BCIN_12g01780(Bcidi1)
MBE: MBM_03281
ANI: AN0579.2
ANG: ANI_1_1076074(An08g07570)
ABE: ARB_06329
TVE: TRV_01416
PTE: PTT_15622
ZTR: MYCGRDRAFT_62428(IDI1)
SPO: SPBC106.15(idi1)
CNE: CNA02550
CNB: CNBA2380
ABP: AGABI1DRAFT110499(AGABI1DRAFT_110499)
ABV: AGABI2DRAFT189600(AGABI2DRAFT_189600)
MGL: MGL_1929
DDI: DDB_G0290011(ipi)
DFA: DFA_11602(ipi)
EHI: EHI_194410(46.t00025)
SPAR: SPRG_14352
ECO: b2889(idi)
ECJ: JW2857(idi)
ECD: ECDH10B_3063(idi)
EBW: BWG_2614(idi)
ECOK: ECMDS42_2388(idi)
ECE: Z4227
ECS: ECs3761
ECF: ECH74115_4179(idi)
ETW: ECSP_3858(idi)
EOJ: ECO26_3978(idi)
EOI: ECO111_3627(idi)
EOH: ECO103_3464(idi)
ECG: E2348C_3142(idi)
EOK: G2583_3542(idi)
ECW: EcE24377A_3215(idi)
ELH: ETEC_3082
EUN: UMNK88_3581(idi)
ECC: c3467
ECP: ECP_2882
ECX: EcHS_A3048(idi)
ECM: EcSMS35_3022(idi)
ECY: ECSE_3152
ECR: ECIAI1_3008(idi)
ECQ: ECED1_3348(idi)
ECK: EC55989_3175(idi)
ECT: ECIAI39_3305(idi)
EOC: CE10_3328(idi)
EUM: ECUMN_3231(idi)
ECZ: ECS88_3169(idi)
ESE: ECSF_2684
EBR: ECB_02721(idi)
EBD: ECBD_0848
EKF: KO11_08320(idi)
EAB: ECABU_c31690(idi)
EDJ: ECDH1ME8569_2791(idi)
EIH: ECOK1_3275(idi)
ELW: ECW_m3142(idi)
ELL: WFL_15345(idi)
ELC: i14_3186
ELD: i02_3186
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EBE: B21_02684(idi)
ELF: LF82_1088(idi)
ECOI: ECOPMV1_03161(idi)
ECOJ: P423_15855
ECOS: EC958_3170
EFE: EFER_2824(idi)
EAL: EAKF1_ch3108c(idi)
STY: STY3195
STT: t2957
STM: STM3039(idi)
SEO: STM14_3671(idi)
SEY: SL1344_3015(idi)
SEJ: STMUK_3027(idi)
SEB: STM474_3186(idi)
SEF: UMN798_3303(idi)
SENR: STMDT2_29351(idi)
SEND: DT104_30351(idi)
SENI: CY43_15845
SPT: SPA2907(idi)
SEK: SSPA2708
SEI: SPC_3098(idi)
SEC: SCH_2979(idi)
SEH: SeHA_C3270(idi)
SHB: SU5_03540
SEE: SNSL254_A3273(idi)
SEW: SeSA_A3207(idi)
SEA: SeAg_B3195(idi)
SENS: Q786_14705
SED: SeD_A3375(idi)
SEG: SG2934(idi)
SEL: SPUL_3038(idi)
SEGA: SPUCDC_3024(idi)
SET: SEN2882(idi)
SENA: AU38_14645
SENO: AU37_14655
SENV: AU39_14650
SENQ: AU40_16485
SENL: IY59_15250
SEEP: I137_14505
SENB: BN855_31030(idi)
SENE: IA1_14645
SBG: SBG_2633
SBZ: A464_3049
SFL: SF2875
SFX: S3074
SFV: SFV_2937
SFE: SFxv_3153(idi)
SFN: SFy_4092
SFS: SFyv_4171
SFT: NCTC1_03164(idi)
SSN: SSON_3042
SBO: SBO_3103
SBC: SbBS512_E3308(idi)
SDY: SDY_3193
ENC: ECL_04214
ECLO: ENC_31230
EEC: EcWSU1_03686(idi)
ECLX: LI66_18435
ECLY: LI62_19890
ECLZ: LI64_17330
ESA: ESA_00346
CSK: ES15_0621
CTU: CTU_35400(fni)
KPN: KPN_03317(idi)
KPU: KP1_4604(idi)
KPP: A79E_0788
KPT: VK055_4165(idi)
KPE: KPK_0781(idi)
KPR: KPR_4584(idi)
KPJ: N559_0918
KPX: PMK1_00805(idi)
KPNU: LI86_04505
KPNK: BN49_0771(idi)
KVA: Kvar_0748
KOX: KOX_02365
KOE: A225_4911
EAE: EAE_02790
EAR: CCG33431
CKO: CKO_04250
CRO: ROD_49441(idi)
CAMA: F384_15920
EBT: EBL_c04740(idi)
EBF: D782_0824
PSTS: E05_09120
SPE: Spro_2201
SPLY: Q5A_011235(idi_1) Q5A_011550(idi_2)
SMAF: D781_1550
SMW: SMWW4_v1c05450(idi)
RAA: Q7S_23711
ECA: ECA2789
PATR: EV46_13650
PATO: GZ59_17690
PCT: PC1_1548
PEC: W5S_2899
SOD: Sant_2700
ETA: ETA_22390(idi)
EPY: EpC_23710(idi)
EPR: EPYR_02563(mvaD)
EAM: EAMY_1238(mvaD)
EAY: EAM_1238(idi)
EBI: EbC_13810(idi)
ERJ: EJP617_23570(idi)
EGE: EM595_0221(fni)
PAM: PANA_1249(idi)
PLF: PANA5342_3037(idi)
PAJ: PAJ_0571(idi)
PVA: Pvag_0631(mvaD)
PSTW: DSJ_08970
TPTY: NCTC11468_01283(idi)
PAY: PAU_01283(idi) PAU_03622(idi2)
PMR: PMI2767
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PRG: RB151_005990(idi)
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MMK: MU9_649
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VFI: VF_0403(idi)
VFM: VFMJ11_0393(idi)
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PPR: PBPRA0469(MVAD)
PEN: PSEEN4850
PSA: PST_3876
AVN: Avin_20640(idi)
AVL: AvCA_20640(idi)
AVD: AvCA6_20640(idi)
PSEN: PNC201_12015(idi)
MBS: MRBBS_1943(idi)
GNI: GNIT_0396
GPS: C427_1919
TTU: TERTU_3249(idi)
LPN: lpg2051
LPH: LPV_2354(fni)
LPO: LPO_2154(fni)
LPM: LP6_2031
LPF: lpl2029
LPP: lpp2034
LPC: LPC_1537(fni)
LPA: lpa_02993
LPE: lp12_1992
LLO: LLO_0238(fni)
LFA: LFA_1199(idi) LFA_2261(fni)
LHA: LHA_2669(fni)
LOK: Loa_02633
LCD: clem_02915(fni)
LLG: 44548918_02235(fni)
TMC: LMI_2740(fni)
TCX: Tcr_1718
HHA: Hhal_1623
GAI: IMCC3135_09485(idi_1) IMCC3135_12320(idi_2)
DNO: DNO_0798
SALN: SALB1_2159
BMU: Bmul_5942
BMJ: BMULJ_05584(idi)
BMK: DM80_6389(idi)
TCL: Tchl_3083
DVU: DVU1679(idi)
DVL: Dvul_1408
DVM: DvMF_0346
DDE: Dde_1991
DMA: DMR_18290
DGG: DGI_0334
DTR: RSDT_0268
DAS: Daes_1560
DPI: BN4_10445
PPRF: DPRO_0436
LIP: LI1134
LIR: LAW_01176
DBA: Dbac_0666
DRT: Dret_1553
DTO: TOL2_C15920(idi) TOL2_C27020(idi2) TOL2_C27190(idi3) TOL2_C27390(idi4) TOL2_C27580(idi5) TOL2_C27790(idi6)
MXA: MXAN_5021(fni)
CCX: COCOR_02445(fni)
SUR: STAUR_5826(fni)
SCL: sce1761(idi)
CCRO: CMC5_031470(fni)
HOH: Hoch_3410
BBA: Bd1626
BBAT: Bdt_1615
BBW: BDW_05670
BBAC: EP01_04335
BEX: A11Q_1501
BMX: BMS_1476
RPR: RP452
RPO: MA1_02200
RPW: M9W_02200
RPZ: MA3_02225
RPG: MA5_03560
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NCV: NCAV_1518(fni)
NBV: T478_0245(idi)
NDV: NDEV_0279(idi)
MARH: Mia14_0809
KCR: Kcr_1016
BARC: AOA65_2114(fni)
BARB: AOA66_1067(fni)
LOKI: Lokiarch_22780(fni)
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Taxonomy
Reference
1  [PMID:11158573]
  Authors
Kaneda K, Kuzuyama T, Takagi M, Hayakawa Y, Seto H.
  Title
An unusual isopentenyl diphosphate isomerase found in the mevalonate pathway gene cluster from Streptomyces sp. strain CL190.
  Journal
Proc Natl Acad Sci U S A 98:932-7 (2001)
DOI:10.1073/pnas.020472198
  Sequence
Reference
2  [PMID:6351725]
  Authors
Bishop JM.
  Title
Cellular oncogenes and retroviruses.
  Journal
Annu Rev Biochem 52:301-54 (1983)
DOI:10.1146/annurev.bi.52.070183.001505
Reference
3  [PMID:13792054]
  Authors
AGRANOFF BW, EGGERER H, HENNING U, LYNEN F.
  Title
Biosynthesis of terpenes. VII. Isopentenyl pyrophosphate isomerase.
  Journal
J Biol Chem 235:326-32 (1960)
Other DBs
ExplorEnz - The Enzyme Database: 5.3.3.2
IUBMB Enzyme Nomenclature: 5.3.3.2
ExPASy - ENZYME nomenclature database: 5.3.3.2
BRENDA, the Enzyme Database: 5.3.3.2
CAS: 9033-27-6

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