KEGG   ENZYME: 5.4.3.2Help
Entry
EC 5.4.3.2                  Enzyme                                 

Name
lysine 2,3-aminomutase
Class
Isomerases;
Intramolecular transferases;
Transferring amino groups
BRITE hierarchy
Sysname
L-lysine 2,3-aminomutase
Reaction(IUBMB)
L-lysine = (3S)-3,6-diaminohexanoate [RN:R00461]
Reaction(KEGG)
Substrate
L-lysine [CPD:C00047]
Product
(3S)-3,6-diaminohexanoate [CPD:C01142]
Comment
This enzyme is a member of the 'AdoMet radical' (radical SAM) family. It contains pyridoxal phosphate and a [4Fe-4S] cluster and binds an exchangeable S-adenosyl-L-methionine molecule. Activity in vitro requires a strong reductant such as dithionite and strictly anaerobic conditions. A 5'-deoxyadenosyl radical is generated during the reaction cycle by reductive cleavage of S-adenosyl-L-methionine, mediated by the iron-sulfur cluster. S-adenosyl-L-methionine is regenerated at the end of the reaction.
History
EC 5.4.3.2 created 1972
Pathway
ec00310  Lysine degradation
Orthology
K01843  lysine 2,3-aminomutase
Genes
NCR: NCU02663
NTE: NEUTE1DRAFT114872(NEUTE1DRAFT_114872)
SMP: SMAC_04322
PAN: PODANSg2033
TTT: THITE_2143087
MTM: MYCTH_40990
CTHR: CTHT_0009280
TMN: UCRPA7_7715
SSCK: SPSK_02426
CFJ: CFIO01_10739
MBE: MBM_05562
PTE: PTT_01221
SRL: SOD_c38740(kamA)
SPLY: Q5A_020785(kamA)
XBO: XBJ1_1660
XBV: XBW1_mp0176(kamA)
SSE: Ssed_1818
FBL: Fbal_1216
TGR: Tgr7_1231
GAI: IMCC3135_04800(kamA)
DNO: DNO_0590(kamA)
BCN: Bcen_5091
BCEW: DM40_3467
BLAT: WK25_19760
RFR: Rfer_3891
PBH: AAW51_0404(kamA)
AZA: AZKH_1573
GSU: GSU1754(yjeK)
GSK: KN400_1778(yjeK)
GME: Gmet_1840(yjeK)
GUR: Gura_2149
GLO: Glov_2103
GBM: Gbem_2398(yjeK)
GEO: Geob_2781(yjeK)
GEM: GM21_1821
GEB: GM18_1771
PCA: Pcar_1401(ablA) Pcar_2520(yjeK)
DPI: BN4_11171(kamA)
PPRF: DPRO_1391(ablA)
DRT: Dret_0696
DML: Dmul_00080(kamA) Dmul_00460(kamA) Dmul_08000
DAT: HRM2_03800(kamA1) HRM2_13250(kamA2) HRM2_29300
MXA: MXAN_4698(kamA) MXAN_4699
CCX: COCOR_02697(kamA1) COCOR_02698(kamA)
SCL: sce2448(kamA1) sce7261(kamA2)
DBR: Deba_0212
BBA: Bd3344(kamA)
BBAT: Bdt_3265(kamA)
BBW: BDW_12350
BBAC: EP01_01940
BEX: A11Q_599
SME: SMc00355
SMX: SM11_chr3752(kamA) SM11_pC1246(kamA)
SMEL: SM2011_c00355(kamA)
SMER: DU99_01495
SMD: Smed_3476
EAD: OV14_1148
ATU: Atu2555(kamA)
ARA: Arad_4637(kamA)
ATF: Ach5_24420(kamA)
AVI: Avi_6024(kamA)
AGR: AGROH133_08690(kamA)
RET: RHE_CH04042(kamA)
REC: RHECIAT_CH0004331(kamA)
REL: REMIM1_CH04140(kamA)
REP: IE4803_CH04427(kamA)
REI: IE4771_CH04377(kamA)
RLE: RL4598
RLG: Rleg_4126
RHL: LPU83_4051(kamA)
RGA: RGR602_CH03920(kamA)
RHN: AMJ98_CH04270(kamA)
RPHA: AMC79_CH04262(kamA)
RHT: NT26_3104
RHX: AMK02_CH04168(kamA)
RHK: Kim5_CH04407(kamA)
LAS: CLIBASIA_04835(kamA)
LAA: WSI_04665
LAT: CGUJ_04835(kamA)
LSO: CKC_04210
LAR: lam_712(kamA)
SHZ: shn_20820
BJA: blr4388
BRA: BRADO3588
BBT: BBta_4014
BRS: S23_38880
AOL: S58_37480
BRAD: BF49_0658
BRO: BRAD285_3733(kamA)
RPA: RPA2515(kamA)
RPB: RPB_2954
RPC: RPC_2807
RPD: RPD_2506
RPE: RPE_2928
RPT: Rpal_2794
NWI: Nwi_1641
NHA: Nham_2300
OCA: OCAR_6026
OCG: OCA5_c20010(kamA)
OCO: OCA4_c20000(kamA)
VGO: GJW-30_1_01602(kamA)
XAU: Xaut_3908
AZC: AZC_2928
SNO: Snov_2125
MEX: Mext_3003
MDI: METDI3775
MCH: Mchl_3228
MPO: Mpop_3192
MET: M446_0377
MNO: Mnod_1886
MOR: MOC_3107
META: Y590_14570
MAQU: Maq22A_c26075(kamA)
BID: Bind_3223
MSL: Msil_0453
HDN: Hden_1435
BVR: BVIR_2978
MSC: BN69_3386
MMED: Mame_04292(kamA)
HDI: HDIA_4097(kamA)
CCR: CC_0716
CAK: Caul_0763
CSE: Cseg_3667
PZU: PHZ_c2669
RSP: RSP_3227
RCP: RCAP_rcc00394(kamA)
PDE: Pden_1666
PAMN: pAMV3p0305
KVU: EIO_2476
KVL: KVU_1996
KRO: BVG79_02123(kamA)
RSU: NHU_02235
HNE: HNE_3138
HBA: Hbal_0029
GOX: GOX0234
GOH: B932_2161
GOY: GLS_c02560(kamA)
ACR: Acry_2376
AMV: ACMV_27020(kamA)
GDI: GDI0508
GDJ: Gdia_1499
GXY: GLX_20910
GXL: H845_2883
KEU: S101446_02575(kamA)
APK: APA386B_1759(kamA)
ASZ: ASN_2285
RRU: Rru_A0224
RRF: F11_01125
RCE: RC1_2506(kamA)
RPM: RSPPHO_02161(kamA)
MAG: amb1284
MGY: MGMSRv2__0234(kamA)
MAGX: XM1_1909(kamA)
MAGN: WV31_17310
AZL: AZL_026200(kamA)
ALI: AZOLI_0074(kamA)
ABS: AZOBR_10301(kamA)
BSU: BSU19690(kamA)
BSR: I33_2212
BSL: A7A1_2840
BSH: BSU6051_19690(kamA)
BSUT: BSUB_02121(kamA)
BSUL: BSUA_02121(kamA)
BSUS: Q433_11725
BSS: BSUW23_10535(kamA)
BST: GYO_2377
BSO: BSNT_08542(kamA)
BSQ: B657_19690(kamA)
BSX: C663_2027(kamA)
BLI: BL01430(kamA)
BLD: BLi02294(kamA)
BLH: BaLi_c23790(kamA)
BAY: RBAM_019520(kamA)
BAQ: BACAU_1953(kamA)
BYA: BANAU_2076(kamA)
BAMP: B938_10115
BAML: BAM5036_1884(kamA)
BAMA: RBAU_1921(kamA)
BAMN: BASU_1901(kamA)
BAMB: BAPNAU_1793(kamA)
BAMT: AJ82_11080
BAMY: V529_19850 V529_21750(kamA)
BMP: NG74_02031(kamA)
BAO: BAMF_2048(kamA)
BAZ: BAMTA208_07265(kamA)
BQL: LL3_02151(kamA)
BXH: BAXH7_01477(kamA)
BQY: MUS_2330(kamA)
BAMI: KSO_009585
BAMC: U471_20150
BAMF: U722_10645
BATR: TD68_07735
BHA: BH2255
BAN: BA_2300(kamA)
BAR: GBAA_2300(kamA)
BAT: BAS2145
BAH: BAMEG_2294(kamA)
BAI: BAA_2364(kamA)
BANT: A16_23380
BANR: A16R_23640
BANS: BAPAT_2200
BANV: DJ46_1097(ablA)
BCE: BC2251
BCA: BCE_2334(kamA)
BCZ: BCE33L2079(kamA)
BCR: BCAH187_A2408(kamA)
BCB: BCB4264_A2281(kamA)
BCU: BCAH820_2325(kamA)
BCG: BCG9842_B3042(kamA)
BCQ: BCQ_2234(kamA)
BCX: BCA_2381(kamA)
BAL: BACI_c22610(kamA)
BNC: BCN_2228
BCF: bcf_11520
BCER: BCK_23340
BTK: BT9727_2083(kamA)
BTL: BALH_2062
BTB: BMB171_C2029(kamA)
BTT: HD73_2540
BTHI: BTK_12595
BTC: CT43_CH2217(kamA)
BTM: MC28_1470
BTG: BTB_c23330(kamA)
BTI: BTG_08620
BTW: BF38_3501(ablA)
BWW: bwei_2744(ablA)
BMYO: BG05_3743(ablA)
BMYC: DJ92_4852(ablA)
BPU: BPUM_1892
BPUM: BW16_10370
BPUS: UP12_09665
BPF: BpOF4_18615(yodO)
BMQ: BMQ_2377(kamA) BMQ_4040
BMD: BMD_2339(kamA) BMD_4025
BMEG: BG04_4750(ablA) BG04_954(ablA)
BJS: MY9_2157
BMET: BMMGA3_10130(kamA)
BACW: QR42_09615
BACP: SB24_18940
BACB: OY17_12885
BACY: QF06_08980
BACL: BS34A_21850(kamA)
BALM: BsLM_2095
BEO: BEH_06230
BGY: BGLY_2547(kamA)
BKW: BkAM31D_12430(kamA)
BKO: CKF48_19605(ablA)
BALT: CFN77_10190(ablA)
ANM: GFC28_581(ablA)
AAMY: GFC30_1859(ablA)
ANL: GFC29_1043(ablA)
LSP: Bsph_3298
VPN: A21D_02435(kamA)
BBE: BBR47_55020(kamA)
ASOC: CB4_00002(kamA)
LFB: C1X05_16415(ablA)
CTC: CTC_00890
CPAS: Clopa_3776
CPAT: CLPA_c31480(kamA)
CPAE: CPAST_c31480(kamA)
CLD: CLSPO_c15740(kamA)
CACE: CACET_c36840(kamA2)
CTAE: BGI42_06415(ablA)
AMT: Amet_4552
AOE: Clos_0418
HSC: HVS_06550(kamA)
CSS: Cst_c16010(kamA2)
CSD: Clst_1547
CTHD: CDO33_18475(ablA)
CPY: Cphy_1643
EAC: EAL2_808p00710(kamA)
CST: CLOST_1382(kamA)
STH: STH35
DRM: Dred_0740
DAE: Dtox_0600
DAU: Daud_0171
DEC: DCF50_p81
OVA: OBV_12600(kamA)
TTE: TTE0723(KamA)
PUF: UFO1_1645
PFT: JBW_02720
MBJ: KQ51_00863(kamA)
MVQ: MYVA_5154(kamA)
SRW: TUE45_pSRc_0464(kamA)
SRN: A4G23_04375(kamA)
SLX: SLAV_34285(kamA1) SLAV_37380(kamA2)
KSK: KSE_60550
SERJ: SGUI_0352
MPH: MLP_08640
NCA: Noca_2661
NDK: I601_3302(kamA)
KFL: Kfla_3605
TCU: Tcur_2339
MMAR: MODMU_2628(kamA)
AMD: AMED_4735(kamA)
AMN: RAM_24100
AMM: AMES_4676(kamA)
AMZ: B737_4676(kamA)
AOI: AORI_3992(kamA)
AMQ: AMETH_3497(kamA)
SESP: BN6_43320
KAL: KALB_4423
ALL: CRK56461
SAQ: Sare_2381
MIL: ML5_5276
ASE: ACPL_2806
ACTN: L083_3925
AFS: AFR_21825
ACTS: ACWT_2740
SNA: Snas_3953
LET: O77CONTIG1_01249(kamA)
DEH: cbdbA219(kamA) cbdbA615(kamA)
DEV: DhcVS_197(ablAB) DhcVS_569
DMG: GY50_0220(kamA) GY50_0554(kamA)
DUC: UCH007_02500(kamA) UCH007_05500(kamA)
DFO: Dform_01067(kamA)
ATM: ANT_25010(kamA)
ABAT: CFX1CAM_1824(kamA)
PBF: CFX0092_A2674(kamA)
DRA: DR_A0027
DGE: Dgeo_0988
PCU: pc0230(yodO)
PUV: PUV_00320(yjeK)
WCH: wcw_0323(kamA)
SNG: SNE_A22020(kamA)
OTE: Oter_1916
OBG: Verru16b_00738(kamA)
CAA: Caka_2005
AGL: PYTT_0636
XII: AMD24_00730(kamA)
MIN: Minf_0017(kamA)
RBA: RB1214(kamA)
TTF: THTE_0350
GES: VT84_18250(kamA)
SACI: Sinac_6204
PBU: L21SP3_01568(kamA)
PBAS: SMSP2_01924(kamA)
PBP: STSP1_01893(kamA)
VBL: L21SP4_01269(kamA)
TDE: TDE0069
TPED: TPE_0544(kamA)
LIL: LA_2701(kamA) LB_298
LIE: LIF_A2208(kamA) LIF_B239(kamA)
LIC: LIC_11303 LIC_20230(kamA)
LIS: LIL_11427(kamA) LIL_20244(kamA1) LIL_20285(kamA2)
LBJ: LBJ_2006(kamA) LBJ_4222(kamA)
LBL: LBL_1044(kamA) LBL_4236(kamA)
LBI: LEPBI_I1797(kamA) LEPBI_II0202(kamA)
LBF: LBF_1744(kamA) LBF_4195(kamA)
FNU: FN1866
FPD: CTM68_06735(ablA)
FVA: FV113G1_13780(kamA)
FUL: C4N20_15455(ablA)
FGO: C4N16_05145(ablA)
FSC: FSU_3101
BTH: BT_4474
BTHO: Btheta7330_03611(eam)
BFR: BF3578
BVU: BVU_2729
BXY: BXY_35830
BOA: Bovatus_04693(eam)
BCEL: BcellWH2_04542(eam)
BACC: BRDCF_p1071 BRDCF_p677(kamA)
PGI: PG_1070(kamA)
PGN: PGN_1166
PGT: PGTDC60_1138(kamA)
PCRE: NCTC12858_01516(kamA)
PDI: BDI_0607
TFO: BFO_1787
PSAC: PSM36_1053(kamA)
AFD: Alfi_1114
ASH: AL1_22930
BLQ: L21SP5_02659(kamA)
ASX: CDL62_14115(ablA)
MBAS: ALGA_2257
SRU: SRU_1133
SRM: SRM_01310(kamA)
RMR: Rmar_0136
CPC: Cpar_1400
CLI: Clim_1455
PVI: Cvib_1367
PLT: Plut_1576
PAA: Paes_0802
PROC: Ptc2401_01487(kamA)
IAL: IALB_3087(kamA)
MRO: MROS_1826
CACI: CLOAM1349(kamA)
AAE: aq_454
HTH: HTH_0327(kamA)
TAL: Thal_0524
TTK: TST_1566
TLE: Tlet_0488
TME: Tmel_0192
TAF: THA_424
THER: Y592_02100
FNO: Fnod_0207
PMO: Pmob_1080
MARN: LN42_02765
KOL: Kole_0963
MINF: MESINF_1636(kamA)
DDF: DEFDS_1850(kamA)
NDE: NIDE3574(kamA)
NMV: NITMOv2_4079(kamA)
NIO: NITINOP_0187(kamA)
NJA: NSJP_0425(kamA)
LFC: LFE_0653
MJA: MJ_0634
MMP: MMP0861(kamA)
MMD: GYY_05000
MAE: Maeo_0240
GAC: GACE_1289
TON: TON_1269
THS: TES1_0278
MAC: MA_3979
MBAR: MSBR2_3216
MMA: MM_0934
MMAC: MSMAC_0391
METM: MSMTP_0453
MHOR: MSHOH_0463
MBU: Mbur_0274
MPY: Mpsy_1921
MCJ: MCON_3114
MLA: Mlab_0345
MEMA: MMAB1_0138(kamA)
MPI: Mpet_1464
MPD: MCP_1919
RCI: RRC148
IHO: Igni_1382
IIS: EYM_06940
 » show all
Taxonomy
Reference
1  [PMID:5452674]
  Authors
Zappia V, Barker HA.
  Title
Studies on lysine-2,3-aminomutase. Subunit structure and sulfhydryl groups.
  Journal
Biochim Biophys Acta 207:505-13 (1970)
DOI:10.1016/S0005-2795(70)80013-7
Reference
2
  Authors
Aberhart, D.J., Lim, H.-J. and Weiller, B.H.
  Title
Stereochemistry of lysine 2,3-aminomutase.
  Journal
J Am Chem Soc 103:6750-6752 (1981)
Reference
3  [PMID:8500691]
  Authors
Frey PA
  Title
Lysine 2,3-aminomutase: is adenosylmethionine a poor man's adenosylcobalamin?
  Journal
FASEB J 7:662-70 (1993)
Reference
4  [PMID:9485408]
  Authors
Lieder KW, Booker S, Ruzicka FJ, Beinert H, Reed GH, Frey PA
  Title
S-Adenosylmethionine-dependent reduction of lysine 2,3-aminomutase and observation of the catalytically functional iron-sulfur centers by electron paramagnetic resonance.
  Journal
Biochemistry 37:2578-85 (1998)
DOI:10.1021/bi972417w
Reference
5  [PMID:16166264]
  Authors
Lepore BW, Ruzicka FJ, Frey PA, Ringe D
  Title
The x-ray crystal structure of lysine-2,3-aminomutase from Clostridium subterminale.
  Journal
Proc Natl Acad Sci U S A 102:13819-24 (2005)
DOI:10.1073/pnas.0505726102
Reference
6  [PMID:21435400]
  Authors
Frey PA, Reed GH
  Title
Pyridoxal-5'-phosphate as the catalyst for radical isomerization in reactions of  PLP-dependent aminomutases.
  Journal
Biochim Biophys Acta 1814:1548-57 (2011)
DOI:10.1016/j.bbapap.2011.03.005
Other DBs
ExplorEnz - The Enzyme Database: 5.4.3.2
IUBMB Enzyme Nomenclature: 5.4.3.2
ExPASy - ENZYME nomenclature database: 5.4.3.2
BRENDA, the Enzyme Database: 5.4.3.2
CAS: 9075-20-1

DBGET integrated database retrieval system