KEGG   ENZYME: 5.99.1.2Help
Entry
EC 5.99.1.2                 Enzyme                                 

Name
DNA topoisomerase;
type I DNA topoisomerase;
untwisting enzyme;
relaxing enzyme;
nicking-closing enzyme;
swivelase;
omega-protein;
deoxyribonucleate topoisomerase;
topoisomerase;
type I DNA topoisomerase
Class
Isomerases;
Other isomerases;
Sole sub-subclass for isomerases that do not belong in the other subclasses
BRITE hierarchy
Sysname
DNA topoisomerase
Reaction(IUBMB)
ATP-independent breakage of single-stranded DNA, followed by passage and rejoining
Comment
These enzymes bring about the conversion of one topological isomer of DNA into another, e.g., the relaxation of superhelical turns in DNA, the interconversion of simple and knotted rings of single-stranded DNA, and the intertwisting of single-stranded rings of complementary sequences, cf. EC 5.99.1.3 DNA topoisomerase (ATP-hydrolysing).
History
EC 5.99.1.2 created 1984
Orthology
K03163  DNA topoisomerase I
K03165  DNA topoisomerase III
K03168  DNA topoisomerase I
K03169  DNA topoisomerase III
Genes
HSA: 116447(TOP1MT) 7150(TOP1) 7156(TOP3A) 8940(TOP3B)
PTR: 458252(TOP1) 458682(TOP3B) 472883(TOP1MT)
PPS: 100970853(TOP3A) 100974665(TOP1MT) 100986932(TOP3B) 100994095(TOP1)
GGO: 101124709(TOP3A) 101134131(TOP1) 101141903(TOP3B) 101148334(TOP1MT)
PON: 100433422(TOP1MT) 100434686(TOP3B) 100452064(TOP1)
NLE: 100584749(TOP1) 100586938 100595374(TOP3A) 100596398(TOP1MT) 100604972(TOP3B)
MCC: 696782(TOP1MT) 697300(TOP1) 698317(TOP3B) 700830(TOP3A)
MCF: 101866499(TOP1) 102114926(TOP1MT) 102121306(TOP3A) 102142703(TOP3B)
CSAB: 103222938(TOP3B) 103237562(TOP1MT) 103242491(TOP3A) 103245992(TOP1)
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RBB: 108516623(TOP3A) 108519826(TOP1) 108536067(TOP3B) 108536563(TOP1MT)
CJC: 100397121(TOP1) 100397620(TOP3A) 100401442(TOP3B)
SBQ: 101034350(TOP1) 101042876(TOP3B) 101043545 101045883(TOP3A)
MMU: 21969(Top1) 21975(Top3a) 21976(Top3b) 72960(Top1mt)
RNO: 287930(Top3b) 300029(Top1mt) 303194(Top3a) 64550(Top1)
CGE: 100689046(Top1) 100758653(Top3b) 100759175(Top1mt) 100772501(Top3a)
NGI: 103724829(Top3a) 103735315(Top1mt) 103741435(Top3b) 103747243(Top1)
HGL: 101704241(Top1) 101706019(Top3a) 101708161(Top3b) 101726319(Top1mt)
CCAN: 109684383(Top3b) 109688187(Top3a) 109690815(Top1mt) 109699660(Top1)
OCU: 100338026(TOP3A) 100345272(TOP3B) 100349705(TOP1) 103351810
TUP: 102469229(TOP1) 102472218(TOP3A) 102485935(TOP3B)
CFA: 477229(TOP1) 477576(TOP3B) 489537(TOP3A)
AML: 100472522(TOP3A) 100480296(TOP3B) 100480835(TOP1)
UMR: 103658498(TOP3A) 103669218(TOP3B) 103669892(TOP1)
ORO: 101373640(TOP3B) 101380607(TOP3A) 101381017(TOP1)
FCA: 101086515(TOP3A) 101088117(TOP3B) 101093174(TOP1)
PTG: 102951470(TOP1) 102961701(TOP3B) 102965682(TOP3A)
AJU: 106974475(TOP1) 106981396(TOP3A) 106989999(TOP3B)
BTA: 527411(TOP3A) 534799(TOP1) 537418(TOP3B)
BOM: 102266902(TOP1MT) 102274330(TOP3A) 102284364(TOP3B) 102287771(TOP1)
BIU: 109567452(TOP1) 109571394(TOP3B) 109573577(TOP3A)
PHD: 102324727(TOP1) 102325563 102329123(TOP1MT) 102332491(TOP3A)
CHX: 102181335(TOP3A) 102185767(TOP3B) 102186322(TOP1MT) 102189324(TOP1)
OAS: 101103086(TOP1) 101114532 101114728(TOP3B) 101120422(TOP3A) 105604997
SSC: 100155140(TOP3B) 100518587(TOP1) 100628093(TOP1MT) 110256129(TOP3A)
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CDK: 105085023(TOP1) 105095212(TOP3B) 105100571(TOP3A) 105103879(TOP1MT)
BACU: 102999893(TOP3B) 103006234(TOP1MT) 103008133(TOP3A) 103010155(TOP1)
LVE: 103068649(TOP1) 103070989(TOP3B) 103075880(TOP3A)
OOR: 101273787(TOP3B) 101274866 101280974(TOP3A) 101281164(TOP1)
ECB: 100051153(TOP3B) 100051666(TOP3A) 100065937(TOP1MT) 100070532(TOP1)
EPZ: 103542469(TOP3B) 103559094(TOP3A) 103562281(TOP1) 103566464(TOP1MT)
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MGP: 100541352(TOP1MT) 100543843(TOP3A) 100545231(TOP3B) 100548515(TOP1)
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FCH: 102047306(TOP1MT) 102048395(TOP3B) 102052833(TOP1) 102055011(TOP3A)
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XTR: 100135734(top3a) 100145467(top3b) 100380116(top1.2) 100496521(top1.1) 779551(top1mt)
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CMK: 103186279(top1) 103188678(top3b) 103191003(top3a) 103191122(top1mt)
CIN: 100170067(zf(cchc/grf)-1) 100179759(top3b) 100186905
SPU: 576420 576753(top3a) 588512 591288(top3b)
DME: Dmel_CG10123(Top3alpha) Dmel_CG3458(Top3beta) Dmel_CG6146(Top1)
DSI: Dsimw501_GD16199(Dsim_GD16199) Dsimw501_GD24215(Dsim_GD24215) Dsimw501_GD27752(Dsim_GD27752)
CEL: CELE_M01E5.5(top-1) CELE_Y48C3A.14(Y48C3A.14) CELE_Y56A3A.27(top-3)
CBR: CBG13326(Cbr-top-3) CBG20349(Cbr-top-1) CBG20786
ATH: AT2G32000 AT5G55300(TOP1ALPHA) AT5G55310(TOP1BETA) AT5G63920(TOP3A)
LJA: Lj0g3v0069809.1(Lj0g3v0069809.1) Lj0g3v0069819.1(Lj0g3v0069819.1) Lj3g3v3639920.1(Lj3g3v3639920.1) Lj6g3v0657890.1(Lj6g3v0657890.1) Lj6g3v0657890.2(Lj6g3v0657890.2)
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SCE: YLR234W(TOP3) YOL006C(TOP1)
KMX: KLMA_10269(TOP1) KLMA_40206(TOP3)
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TPF: TPHA_0J00430(TPHA0J00430) TPHA_0L01010(TPHA0L01010)
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PIC: PICST_34564(TOP3) PICST_46944(TOP1)
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DFA: DFA_00218(top3) DFA_11756(top1)
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FCY: FRACYDRAFT_225326(Top1_1) FRACYDRAFT_247872(Top3a_1)
NGD: NGA_0612900(TOP3)
ECO: b1274(topA) b1763(topB)
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ECD: ECDH10B_1389(topA) ECDH10B_1901(topB)
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ECOK: ECMDS42_1069(topA) ECMDS42_1438(topB)
ECE: Z2536(topA) Z2796(topB)
ETW: ECSP_1792(topA) ECSP_2331(topB)
EOJ: ECO26_1838(topA) ECO26_2538(topB)
EOI: ECO111_1653(topA) ECO111_2274(topB)
EOH: ECO103_1435(topA) ECO103_1957(topB)
ECOO: ECRM13514_1692(topA) ECRM13514_2262(topB)
ECG: E2348C_1464(topA) E2348C_1890(topB)
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PLU: plu1037 plu2435(topA) plu2550(topB)
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HIT: NTHI0112(topB2) NTHI0571(topB) NTHI1799(topA)
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PMU: PM0207(topB) PM0615(topA)
PMV: PMCN06_0645(topA) PMCN06_1092(topB)
PMP: Pmu_03290(topB1) Pmu_06820(topA) Pmu_11050(topB2)
PMUL: DR93_1445(topA) DR93_1859(topB)
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MHX: MHH_c20830(topA) MHH_c23040(topB1) MHH_c23670(topB2)
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APJ: APJL_0694(topA) APJL_0746(topB2)
APA: APP7_0738(topA) APP7_0788(topB2)
AACN: AANUM_0968 AANUM_1745(topA)
XFT: PD_1023(traE) PD_1767(topA)
XCC: XCC3755(topA)
XCP: XCR_0550(topA)
XCV: XCV2287(topB) XCV2406(topB2) XCV3932(topA) XCVd0036 XCVd0152(traE)
XAX: XACM_3707(topA)
XAC: XAC2212(topB) XAC3807(topA)
XCI: XCAW_01652(topA) XCAW_04567(topA)
XOO: XOO0579(topA)
XOM: XOO0540(XOO0540)
XOP: PXO_04049(topA)
XOR: XOC_4140(topA)
XAL: XALC_2864(TopA)
XPH: XppCFBP6546_15350(XppCFBP6546P_15350) XppCFBP6546_20945(XppCFBP6546P_20945)
SML: Smlt4184(topA)
SMT: Smal_3591
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SACZ: AOT14_01500(topA_1) AOT14_31770(topA_2)
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PPU: PP_2139(topA) PP_3831 PP_4019(topB)
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