KEGG   ENZYME: 6.3.1.10Help
Entry
EC 6.3.1.10                 Enzyme                                 

Name
adenosylcobinamide-phosphate synthase;
CbiB
Class
Ligases;
Forming carbon-nitrogen bonds;
Acid-D-ammonia (or amine) ligases (amide synthases)
BRITE hierarchy
Sysname
adenosylcobyric acid:(R)-1-aminopropan-2-yl phosphate ligase (ADP-forming)
Reaction(IUBMB)
(1) ATP + adenosylcobyric acid + (R)-1-aminopropan-2-yl phosphate = ADP + phosphate + adenosylcobinamide phosphate [RN:R06529];
(2) ATP + adenosylcobyric acid + (R)-1-aminopropan-2-ol = ADP + phosphate + adenosylcobinamide [RN:R07302]
Reaction(KEGG)
Substrate
ATP [CPD:C00002];
adenosylcobyric acid [CPD:C06507];
(R)-1-aminopropan-2-yl phosphate [CPD:C04122];
(R)-1-aminopropan-2-ol [CPD:C03194]
Product
ADP [CPD:C00008];
phosphate [CPD:C00009];
adenosylcobinamide phosphate [CPD:C06509];
adenosylcobinamide [CPD:C06508]
Comment
One of the substrates for this reaction, (R)-1-aminopropan-2-yl phosphate, is produced by CobD (EC 4.1.1.81, threonine-phosphate decarboxylase).
History
EC 6.3.1.10 created 2004
Pathway
ec00860  Porphyrin and chlorophyll metabolism
ec01100  Metabolic pathways
Orthology
K02227  adenosylcobinamide-phosphate synthase
Genes
STY: STY2239(cbiB)
STT: t0839(cbiB)
SEX: STBHUCCB_8950
SENT: TY21A_04265(cobD)
STM: STM2034(cibB)
SEO: STM14_2522(cbiB)
SEV: STMMW_20651
SEY: SL1344_2010(cbiB)
SEM: STMDT12_C20560(cobD)
SEJ: STMUK_2064(cobD)
SEB: STM474_2119(cbiB)
SEF: UMN798_2199(cbiB)
SENR: STMDT2_20071(cbiB)
SEND: DT104_20921(cbiB)
SENI: CY43_10985
SPT: SPA0837(cbiB)
SEK: SSPA0782
SEI: SPC_1681(cobD)
SEC: SCH_2042(cibB)
SEH: SeHA_C2256(cobD)
SHB: SU5_02628
SEE: SNSL254_A2210(cobD)
SEW: SeSA_A2203(cobD)
SEA: SeAg_B2156(cobD)
SENS: Q786_10040
SED: SeD_A2369(cobD)
SEG: SG2060(cibB)
SEL: SPUL_0866(cibB)
SEGA: SPUCDC_0866(cibB)
SET: SEN2032(cibB)
SENA: AU38_10255
SENO: AU37_10265
SENV: AU39_10265
SENQ: AU40_11510
SENL: IY59_10550
SEEP: I137_03910
SENB: BN855_21190(cobD2)
SENE: IA1_10150
KPN: KPN_03199(cibB)
KPU: KP1_4465
KPP: A79E_0911
KPT: VK055_4327(cobD)
KPE: KPK_0917(cbiB)
KPO: KPN2242_18945(cobD)
KPR: KPR_1835(cobD)
KPJ: N559_1041
KPNU: LI86_05140
KPNK: BN49_0909(cobD2)
KVA: Kvar_0871
KOX: KOX_01425(cobD)
KOE: A225_4749
CKO: CKO_00804
CRO: ROD_21191(cbiB)
CAMA: F384_10380
EBT: EBL_c14770(cbiB)
EBF: D782_1621
YEN: YE2724(cobD)
YEY: Y11_16101
YEW: CH47_2073(cobD)
YET: CH48_3158(cobD)
YEE: YE5303_31571(cbiB)
YAL: AT01_4041(cobD)
YFR: AW19_726(cobD)
YIN: CH53_3373(cobD)
YKR: CH54_936(cobD)
YRO: CH64_86(cobD)
PLU: plu2998(cbiB)
PAY: PAU_01602(cobD)
XBO: XBJ1_0851
XBV: XBW1_1559(cobD)
XNE: XNC1_1150
XNM: XNC2_1130
MMK: MU9_1014
ETR: ETAE_2003(cbiB)
ETD: ETAF_1812
ETE: ETEE_4059(cbiB)
XCC: XCC3062(cobD)
XCB: XC_1096
XCA: xcc-b100_1132(cobD)
XCP: XCR_3400(cobD)
XCV: XCV3319(cobD)
XAX: XACM_3104(cobD)
XAC: XAC3190(cobD)
XCI: XCAW_03477(cbiB)
XFU: XFF4834R_chr14400(cobD)
XPH: XppCFBP6546_18095(XppCFBP6546P_18095)
LAB: LA76x_1222(cobD)
LAQ: GLA29479_1979(cobD)
LCP: LC55x_4228(cobD)
LGU: LG3211_4019(cobD)
LEZ: GLE_4087
LEM: LEN_1113(cobD)
VCH: VC2380
VCS: MS6_2113
VCI: O3Y_11395
VVU: VV1_0559
VVY: VV0634
VPA: VP0478
VPB: VPBB_0457
VAG: N646_2632
VAN: VAA_03698
VSC: VSVS12_02618(cbiB)
VTA: A2636 B1456(cobD)
VFI: VF_2129
PPR: PBPRA0537(VV0634)
PAE: PA1275(cobD)
PAEV: N297_1315(cobD)
PAEI: N296_1315(cobD)
PAU: PA14_47730(cobD)
PAG: PLES_40371(cobD)
PAF: PAM18_3754(cobD)
PNC: NCGM2_2159(cobD)
PAEB: NCGM1900_5299(cobD)
PDK: PADK2_19270(cobD)
PAEP: PA1S_19530
PAEM: U769_19380
PAEL: T223_20625
PAEG: AI22_14430
PAEC: M802_1312(cobD)
PAEO: M801_1314(cobD)
PMY: Pmen_1753
PMK: MDS_3109
PRE: PCA10_18240(cobD)
PPSE: BN5_1586(cobD)
PPU: PP_1675(cobD)
PPF: Pput_4044
PPT: PPS_1326
PPB: PPUBIRD1_3942(cobD)
PPI: YSA_02430
PPX: T1E_3647(cobD)
PPUH: B479_06410
PPUT: L483_05930
PPUN: PP4_40960(cobD)
PMON: X969_04505
PMOT: X970_04480
PST: PSPTO_1711(cobD)
PSB: Psyr_3678(cobD)
PSYR: N018_07020
PSP: PSPPH_3699(cobD)
PFL: PFL_4428(cobD)
PPRC: PFLCHA0_c45010(cobD)
PPRO: PPC_4537(cobD)
PFS: PFLU_4488
PFC: PflA506_3793(cobD)
PFW: PF1751_v1c39820(cobD)
PFB: VO64_5047
PMAN: OU5_5264(cobD)
PEN: PSEEN1381
PSA: PST_1295(cobD)
PSZ: PSTAB_1288(cobD)
PSR: PSTAA_1327(cobD)
PSTT: CH92_07720
PPUU: PputUW4_03772(cobD)
PKC: PKB_1570(cobD)
PSES: PSCI_0380(cobD)
PSEM: TO66_23150
PSEC: CCOS191_1319(cobD)
PSOS: POS17_4500(cobD)
PANR: A7J50_4168
PSET: THL1_1819
PSIL: PMA3_21095
AVN: Avin_33100(cobD)
AVL: AvCA_33100(cobD)
AVD: AvCA6_33100(cobD)
ACX: Achr_16210(cobD)
SON: SO_1321(cobD)
SDN: Sden_2802
SFR: Sfri_2967
SAZ: Sama_0854
SLO: Shew_1026
SPL: Spea_1000
SHL: Shal_1050
SWD: Swoo_1216
SWP: swp_3831
SVO: SVI_0911
SPSW: Sps_02460
PHA: PSHAa0546
PSM: PSM_A0592
PSEO: OM33_13270
PTN: PTRA_a0620(cbiB)
PEA: PESP_a0744(cbiB)
PSPO: PSPO_a2221(cbiB)
PART: PARC_a3294(cbiB)
PTU: PTUN_a1106(cbiB)
PNG: PNIG_a0659(cbiB)
PTD: PTET_a0655(cbiB)
MAQ: Maqu_0271
MHC: MARHY0213(cobD)
MAD: HP15_1309
MBS: MRBBS_0210(cobD)
AMAL: I607_15020
AMAE: I876_15320
AMAO: I634_15265
AMAD: I636_15125
AMAI: I635_15700
AMAG: I533_14815
AMAC: MASE_14855
AAUS: EP12_15550
ASP: AOR13_308
GNI: GNIT_0871(cobD)
GPS: C427_5117
SALH: HMF8227_02530(cbiB)
FBL: Fbal_0649
MVS: MVIS_3511 MVIS_3645(cobD)
CJA: CJA_3769(cobD)
TTU: TERTU_3323(cobD)
MCA: MCA2287(cobD)
MAH: MEALZ_0956(cobD)
MPSY: CEK71_11405(cobD)
MEJ: Q7A_2236
TEE: Tel_06825
AEH: Mlg_2818
HHA: Hhal_1857
TKM: TK90_1458
TNI: TVNIR_3491(cobD_[H])
TVR: TVD_07095
GAI: IMCC3135_08615(cobD_2)
HCH: HCH_06462(cobD)
HEL: HELO_1816(cbiB)
HAM: HALO2032
HHH: CLM76_13560(cobD)
HBE: BEI_1060(cbiB)
EME: CEM_300(cobD)
ABO: ABO_2377(cobD)
ADI: B5T_04145(cobD)
APAC: S7S_16795
AXE: P40_20150
TOL: TOL_0869
OAI: OLEAN_C29790(cobD)
AHA: AHA_1705
ASA: ASA_2654(cbiB)
AVR: B565_1464
AMED: B224_1442
ACAV: VI35_07490
TAU: Tola_1680
OCE: GU3_03895
SLIM: SCL_1002
SVA: SVA_1142
SALN: SALB1_1248
GPB: HDN1F_08160(cobD)
CVI: CV_1002 CV_1575(cobD)
LHK: LHK_02548
PSE: NH8B_1845(cobD) NH8B_3374(cobD)
RSO: RSc0938 RSc2392(cobD)
RSC: RCFBP_11030(cobD) RCFBP_20530(cobD)
RSL: RPSI07_1077(cobD) RPSI07_2445(cobD)
RSM: CMR15_10985(cobD) CMR15_20058(cobD)
REH: H16_A2713(h16_A2713) H16_A2963(cbiB)
RME: Rmet_2578 Rmet_2780(cobD)
CGD: CR3_0449(cobD) CR3_1940(cobD)
BMA: BMA0396 BMA0695(cobD)
BMAL: DM55_1865 DM55_2055(cobD)
BMAE: DM78_1073 DM78_1274(cobD)
BMAQ: DM76_1840 DM76_2030(cobD)
BMAF: DM51_190 DM51_467(cobD)
BMAZ: BM44_1544(cobD) BM44_2757
BMAB: BM45_1107(cobD) BM45_2322
BPS: BPSL0985(cobD) BPSL2485
BPSE: BDL_1050(cobD) BDL_2951
BPSM: BBQ_2461(cobD) BBQ_817
BPSU: BBN_2585(cobD) BBN_945
BPSD: BBX_1352 BBX_2994(cobD)
BPK: BBK_2461 BBK_532(cobD)
BPSH: DR55_147(cobD) DR55_2025
BPSA: BBU_1195(cobD) BBU_3069
BPSO: X996_1671 X996_3215(cobD)
BUT: X994_1749(cobD) X994_3663
BTQ: BTQ_2253 BTQ_860(cobD)
BTJ: BTJ_1581(cobD) BTJ_63
BTZ: BTL_1360 BTL_2850(cobD)
BTD: BTI_1139 BTI_2843(cobD)
BTV: BTHA_1453 BTHA_3066(cobD)
BTHE: BTN_1853(cobD) BTN_48
BTHM: BTRA_1585 BTRA_3175(cobD)
BTHL: BG87_1566 BG87_3055(cobD)
BOK: DM82_2111 DM82_418(cobD)
BOC: BG90_2601 BG90_605(cobD)
BVE: AK36_1460(cobD) AK36_2863
BCEN: DM39_2536(cobD) DM39_910
BCEW: DM40_1735 DM40_85(cobD)
BCEO: I35_0940 I35_2518(cobD)
BMJ: BMULJ_01010(cobD) BMULJ_02412(cobD)
BMK: DM80_2516(cobD) DM80_568
BMUL: NP80_1175 NP80_2592(cobD)
BCED: DM42_2620(cobD) DM42_753
BDL: AK34_2101 AK34_632(cobD)
BUB: BW23_2435(cobD) BW23_659
BGU: KS03_1841 KS03_264(cobD)
BGO: BM43_2370 BM43_642(cobD)
BUL: BW21_1285 BW21_2980(cobD)
BXB: DR64_1197(cobD) DR64_3173
BFN: OI25_2448 OI25_725(cobD)
PNU: Pnuc_0522
PNE: Pnec_1279
ACRA: BSY15_11(cobD) BSY15_2527
VEI: Veis_0320
CBX: Cenrod_1831(cbiB)
LIM: L103DPR2_02368(cbiB)
LIH: L63ED372_01872(cbiB)
MPT: Mpe_A1109 Mpe_B0516(cbiB)
MMS: mma_0596(cobD1) mma_1098(cobD2)
JAG: GJA_4165
HSE: Hsero_1511(cobD) Hsero_2643(cobD)
HRB: Hrubri_1359(cobD) Hrubri_2732(cobD)
CFU: CFU_1172(cbiB)
CARE: LT85_3633
OFO: BRW83_0633(cobD)
LCH: Lcho_0686
TIN: Tint_1018
THI: THI_1274
RGE: RGE_13520(cbiB) RGE_28900(cobD)
BBAG: E1O_06220
PBH: AAW51_2408(cbiB) AAW51_3750(cbiB)
MMB: Mmol_0268
MEH: M301_0166
MEP: MPQ_0150(cbiB) MPQ_2541
MBAC: BN1209_1685(cobD)
SLT: Slit_1036
GCA: Galf_2068
EBA: ebA2136(cobD) ebA5199(cbiB)
AZO: azo2173(cobD1) azo3518(cobD2)
AZA: AZKH_2985(cbiB_cobD) AZKH_4149(cbiB_cobD)
BPRC: D521_1453
SUA: Saut_0085
ARC: ABLL_2638
SMUL: SMUL_1543(cbiB)
SHAL: SHALO_1507
SULJ: SJPD1_1520
GSU: GSU2990(cbiB)
GSK: KN400_2933(cbiB)
GME: Gmet_0486(cbiB)
GUR: Gura_0042
GLO: Glov_3553
GBM: Gbem_3538(cbiB)
GEO: Geob_0039(cbiB)
GEM: GM21_3604
GEB: GM18_0551
PCA: Pcar_0483(cbiB)
PPD: Ppro_0870
DES: DSOUD_0631(cbiB)
DEU: DBW_3084
DVU: DVU2237
DVL: Dvul_1005
DVM: DvMF_0833
DDE: Dde_1529
DDS: Ddes_2140
DMA: DMR_17050(cobD)
DHY: DESAM_22027(cobD)
DGG: DGI_2974
DAS: Daes_1505
DPI: BN4_10519
PPRF: DPRO_0365(cobD)
DBA: Dbac_2886
DPS: DP1949
DSF: UWK_02953
DOL: Dole_1233
DML: Dmul_32270(cobD2)
DAL: Dalk_0457
DAT: HRM2_45650(cbiB)
DTO: TOL2_C39900(cbiB)
SCL: sce0211(cobD)
SFU: Sfum_1738
DBR: Deba_1766
MLO: mlr1304
SME: SMc04279(cobD)
SMX: SM11_chr1387(cobD)
SMI: BN406_01672(cobD)
SMEL: SM2011_c04279(cobD)
SMER: DU99_10555
SMD: Smed_1743(cobD)
RHI: NGR_c18120(cobD)
SFH: SFHH103_01740(cobD)
SFD: USDA257_c42230(cobD)
SIX: BSY16_795(cobD)
SAME: SAMCFNEI73_Ch2186(cobD)
EAD: OV14_3179(cobD)
ATU: Atu2809(cobD)
ARA: Arad_2783(cobD)
ATF: Ach5_26930(cobD)
AVI: Avi_2621(cobD)
AGR: AGROH133_09262(cobD)
AGC: BSY240_441(cobD)
RET: RHE_CH02481(cobD)
REC: RHECIAT_CH0002584(cobD)
REL: REMIM1_CH02504(cobD)
REP: IE4803_CH02531(cobD)
REI: IE4771_CH02618(cobD)
RLE: RL2821(cobD)
RLG: Rleg_2363
RTR: RTCIAT899_CH10555(cobD)
RIR: BN877_I2897(cobD)
RHL: LPU83_2128(cobD)
RGA: RGR602_CH02269(cobD)
RHN: AMJ98_CH02542(cobD)
RPHA: AMC79_CH02611(cobD)
RHT: NT26_3114
RHX: AMK02_CH02556(cobD)
NGL: RG1141_CH38920(cobD)
NGG: RG540_CH39480(cobD)
SHZ: shn_10415
BME: BMEI0707
BMEL: DK63_719(cobD)
BMEE: DK62_135(cobD)
BMF: BAB1_1314(cobD)
BMB: BruAb1_1295(cobD)
BABO: DK55_1289(cobD)
BABR: DO74_602(cobD)
BABT: DK49_1045(cobD)
BABB: DK48_831(cobD)
BABU: DK53_1272(cobD)
BABS: DK51_188(cobD)
BABC: DO78_1193(cobD)
BMS: BR1294(cobD)
BSI: BS1330_I1290(cobD)
BSF: BSS2_I1261(cobD)
BMT: BSUIS_A1344(cobD)
BSZ: DK67_1005(cobD)
BSV: BSVBI22_A1290(cobD)
BOV: BOV_1256(cobD-1)
BCS: BCAN_A1317(cobD)
BOL: BCOUA_I1294(cobD)
BCAR: DK60_1332(cobD)
BCAS: DA85_06210
BMR: BMI_I1307(cobD)
BPP: BPI_I1346(cobD)
BPV: DK65_87(cobD)
BCET: V910_100702(cobD)
BCEE: V568_100777(cobD_1)
BVL: BF3285c1_2105(cobD)
OAN: Oant_1891
OAH: DR92_1380(cobD)
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CPSE: CPTA_02089
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CUL: CULC22_01597(cobD)
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CUE: CULC0102_1716(cobD)
CUN: Cul210932_1668(cobD)
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CUZ: Cul05146_1639(cobD)
CUJ: CUL131002_1591c(cobD)
COA: DR71_374(cobD)
CKU: UL82_03805(cobD)
CMV: CMUST_11315(cobD)
CEI: CEPID_08795(cobD)
CAQU: CAQU_08825
NFA: NFA_16270
NCY: NOCYR_1679(cobD)
NNO: NONO_c21440(cobD)
NSR: NS506_03096(cbiB)
RER: RER_36650(cobD)
REY: O5Y_16835
ROP: ROP_09130(cobD)
REQ: REQ_28830(cobD)
RFA: A3L23_03857(cobD)
RHS: A3Q41_04391(cobD)
RHU: A3Q40_01123(cobD)
GBR: Gbro_3102
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GOR: KTR9_3089
TPR: Tpau_2715
SCO: SCO1847(cobD)
SMA: SAVERM_6417(cobD)
SGR: SGR_5645
SGB: WQO_07090
SCB: SCAB_70881(cobD)
SCT: SCAT_1046(cobD)
SFA: Sfla_4968
SBH: SBI_08145(cobD)
SHY: SHJG_3305
SVE: SVEN_1494
SDV: BN159_6673(cobD)
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SALS: SLNWT_6023
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PACC: PAC1_02120
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PBO: PACID_08790(cobD)
MPH: MLP_03070(cobD)
NCA: Noca_2885
NDK: I601_3851
KFL: Kfla_3118
PSIM: KR76_17110
MGG: MPLG2_3515(cobD)
TFU: Tfu_2224
NDA: Ndas_3443
NAL: B005_0550
TCU: Tcur_1287
SRO: Sros_7401
FAL: FRAAL2886
NML: Namu_0174
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MHI: Mhar_2332
MHU: Mhun_2321
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MEMA: MMAB1_0009(cobD)
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MBN: Mboo_0007
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RCI: RCIX2654(cbiB)
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MWO: MWSIV6_1789(cobD)
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NBV: T478_1307(cobD)
NDV: NDEV_1950(cobD)
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Taxonomy
Reference
1  [PMID:11939774]
  Authors
Cheong CG, Bauer CB, Brushaber KR, Escalante-Semerena JC, Rayment I.
  Title
Three-dimensional structure of the L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase (CobD) enzyme from Salmonella enterica.
  Journal
Biochemistry 41:4798-808 (2002)
DOI:10.1021/bi012111w
Reference
2  [PMID:12195810]
  Authors
Warren MJ, Raux E, Schubert HL, Escalante-Semerena JC.
  Title
The biosynthesis of adenosylcobalamin (vitamin B12).
  Journal
Nat Prod Rep 19:390-412 (2002)
Other DBs
ExplorEnz - The Enzyme Database: 6.3.1.10
IUBMB Enzyme Nomenclature: 6.3.1.10
ExPASy - ENZYME nomenclature database: 6.3.1.10
BRENDA, the Enzyme Database: 6.3.1.10
CAS: 905988-16-1

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