KEGG T04556: AMR72

Flavobacterium psychrophilum Z2: AMR72_16910

Entry

AMR72_16910       CDS       T04556

Name

(GenBank) hypothetical protein

K20276

large repetitive protein

Organism

fpsz Flavobacterium psychrophilum Z2

Pathway

fpsz02024

Quorum sensing

Brite

KEGG Orthology (KO) [BR:fpsz00001]
09140 Cellular Processes
  09145 Cellular community - prokaryotes
   02024 Quorum sensing
    AMR72_16910

SSDB

Motif

Pfam:

Ig_7 Por_Secre_tail fn3 Reelin_subrepeat-B Pur_ac_phosph_N

Other DBs

NCBI-ProteinID:

ALM50416

Position

3801904..3807624

AA seq 1906 aa
MKKITLLITMMLFFVTGSFAQASLYTFAQSAGTFVPITGGTLVTSATDYTPVIDDFRSTL
LTFPTPFEFGGVSYTNFSVTSNGQLGLGTTLASAGNYRVLSSNTGGNVFFAPFSVDLTAG
ASGLAEIRFEQVGNEIVVQWLNFRRYDTSESFSFQVRLNTVTKEIKFVYDGTPPFSAETS
DYPQIGIKTSNNAGNAIALTVAAGGSWNTPTVVNTTVTNGSVATLTDATGFTSGLTYTFT
PPTGCPPILSGGAASPEALSACLGNAPAAISVSGNAYIYSGIAYQWQQSAITTPATWVNA
VGGAGANSLSYVPPVFNGTAIQYRLKMTCGNTEVFSTPTVVSTQLAPTTAASALTSSNIF
NYGFSTSWTNGNGNRRVVIISPNSITDPAESGPAFEVNNVYAGSGQQIVYDGTGSSVTIT
GLTCGTAYNVKVYEYFRCGSTSPYNNLYAPAGTTNAITVSTASIVTAPLPVANNFTGFTG
TNLGTAVPGWYESAVSTPNGSTPVLAAPVTLNSAWTGSVAFANTVSAKINLFASNKNEWI
ISPKINITAASGIKFKAAITAANGSGAHATKMDGTDDKVYVMISTDGCGRTWTPLHIFSA
ANTTTLTNVLQDFTVAIPETYAGQTVQIAFVATDGTVDNDNNYDFHIANVFIDVTPQCDT
PSVTAATNVTKNSATINWTEPATGTPTGYEYIVSTTDTLPTGVGTPVTGTITSASITALA
NATTYYVFVRTVCNTDFSDWSVVGTFETFCDYQDLAGTTPGERCGAGTVDLSANSPGALY
WFTAQTGGDFLGTGTTLTTPIIQETTNFYVSSTSPVTGKNFAVGEGLATSNTNGNPFYSN
WSNMHTQHLISAQELIAAGITAGPINSIALDITSAGTLPMIDLSIKIGASTATSMTEFTD
NTGFANAYASASYMPTVGVNTFTFSTPFTWDGTSNIVVEFCHGNPSSESTMSRTIKMDPT
SFVSTVKAHVADNTAASVVCGNTSTSLASLSSRPKFIFNATGVCLSPRVAVAAVVNTPPA
FTLSADPVTICVGESTAPVTVTTGAADYTDFVWTPNTGVSGSADAGWIFNPSVTTTYTFQ
ASSATCNAVPVSVVVNVSDLPTAITLADASYCSGSVSASVGLTPFGGTNTTVLLTENFNA
ATNNWTTVNNSIGGTPANAAWTLQPNGHVYSGNVFRSNDNSQFYISNSDKQDGGDTETIL
TSPAFSTVNYQAVTVSFYHVFYDPSSESVGSVEFSSNGTDWVESNAFTGSTGSFTSFALG
TAIVPANLMNEPVVYVRFRYVAPYTYQWAIDNVTISGQKSYGYTWSPATGLYTDAAATTP
YVAGTAAAKVYAKPIVETEYTITATNPAGCISTATATVSPTSTAAPTVQAPVQTVCDAAT
VANLVATGIGIKWYTEATGGFSLSPSTLLTNGAVYYGTQTVEGCESSERVALTANIVVAS
APVVTAPTQAICTSGTVADLEAEGTGIKWYAAATGGTALAEDIVLVDGTIYYASQTLDTC
ESLTRTALTVSITLNSAPTVDAPSQIFCNEGTIADLVVTGTQVQWYTTETGGTALAEDAA
LINGTTYYASQTINGCESVTRTPKSVVFNTVTAPTGDEEQEFCASATLAQLTATGTGVKW
YSDATATTVLAPDTALVSGTTYYASQTINDCEGVSRLGVLVFIYNVVADAPADVASCNEY
VLPELENGGYFTQPNGEGTEVAAGTVVSETTTFYVYTSEGNSIVCDDENSFQVIITSVPA
PGGNTTQTINAATADTATIEDIEIIQILGSTVTWYASQEDAESGTDPLPAGTLLEEGVTY
YATQTVGECTSAAILAVTVDIVLGRDNFDSKAFTYHPNPVTDILNISYSFEITSVTVYNL
LGQQVVNKKTNANEVKIDMSGLADAAYIVNVVAGNTAKTIKVIKKQ

NT seq 5721 nt +upstreamnt +downstreamnt
atgaaaaaaattactttactaattactatgatgttatttttcgtcaccggaagtttcgca
caggcttcgctctatacctttgcgcaatctgccggaacttttgttcctattacaggagga
acacttgtaacttctgcgacagactatacccctgtaattgatgatttcagatcgacactt
ttaacatttcctaccccctttgaatttggcggtgtaagctatacaaatttttcagtaacc
agtaatggtcagttaggccttggtactactttggcatcagcgggaaattacagggtttta
agttctaacactggtgggaatgttttttttgcgcctttctctgtcgatcttactgccggt
gcaagcgggcttgctgagatcaggtttgagcaggtaggtaacgaaatagttgtacaatgg
cttaattttaggcgatatgatacatcagaatcatttagctttcaggtgagattaaacaca
gtaacaaaagaaattaaatttgtgtatgatggcacgcctccttttagtgcagagacttct
gattatccgcagatcggtataaaaacgagtaacaacgccggtaatgctattgcacttacg
gtagctgcaggtggttcatggaatacgccaaccgttgtaaatactacggtaaccaatgga
agtgttgcgacattaacagatgcaacaggttttacaagtggattaacatacacatttact
ccgcccacaggttgtcctccgattttatcaggtggtgctgccagcccggaagcattgtcg
gcatgtttaggaaatgctcctgcggcaatcagcgtttcgggtaatgcttatatttattcg
ggaattgcataccaatggcaacaatcagcaataacaacacctgcaacatgggtaaatgct
gttgggggtgcaggggctaacagcctatcttacgtgccacctgtgtttaacggtacggcg
atacaatatagattaaaaatgacatgtggaaatacagaagtattttcaactcctacagta
gtaagtacccaattagctccaactacggccgcatcggcacttacttcatccaatatattt
aattacggttttagtacttcatggactaatggcaacggaaatagaagggtagttataata
agtccaaattcaattacagatccggctgaaagtggacctgcttttgaagtaaacaatgtt
tatgccggttcaggtcagcaaattgtatatgacggaacaggaagtagtgttaccattaca
ggtttaacctgtggtaccgcttacaatgttaaagtatatgaatattttcgttgtggtagt
acaagtccgtacaataatctgtacgcacctgcgggtactacaaatgctattactgtatct
acagctagtatagtaaccgctccactacccgtagcaaataattttacaggatttacaggt
acaaatttaggtacagcagtaccgggatggtatgagtcggctgtatctacacctaatgga
agtactcccgtacttgcagccccagttactttaaattctgcatggactggcagcgttgct
tttgctaatacagtttctgccaagataaacctctttgccagcaataagaacgaatggatt
attagtcctaagataaatataacggctgcatcgggaataaagtttaaagcggccattaca
gcggctaacggatctggtgcgcatgcaactaaaatggatggtactgatgataaggtttat
gtaatgatttctacagatggatgtgggagaacctggacgcccctgcatatatttagtgca
gcaaacacgacaacacttacaaatgtattacaggattttacagtcgccattcctgaaacc
tacgcgggccaaacagtgcaaattgcatttgttgcgacagacggtactgttgacaatgat
aataactatgatttccatatagcaaacgtatttatagatgtaacgcctcagtgtgatacc
ccttcagttactgctgcaacaaatgttactaaaaattcagcaactataaactggacagaa
cctgctacagggacacctacaggatatgaatatatagtttctacaactgatactttgcct
acaggtgtaggtactccagttacaggaactattaccagtgctagtattactgccctggca
aatgctacgacatattatgtttttgtgagaacagtatgtaatactgattttagtgactgg
tctgtggtaggaacatttgaaactttctgcgattatcaagatcttgcaggaacaactccg
ggcgaaagatgtggcgcaggtacagtagatttatcggcgaattcgccgggagctctttat
tggtttacagctcaaaccggcggggattttctaggtacaggtactacacttacaacgccc
attatacaggagacaactaatttttatgtgagtagtacttctccggttacagggaagaat
ttcgctgtaggtgaaggtttagctacatctaatacaaatggaaatcctttttattctaac
tggagtaatatgcatacacagcacctaatatctgcacaggagttgattgcagcgggtatt
acagccggacctatcaattcaattgctcttgatataacatcggcaggtacgctgcctatg
atagatctatcaattaagataggtgcaagtacagcgacttcaatgactgaatttacagat
aatacaggtttcgcgaatgcgtacgccagtgcgtcgtatatgcctacggttggcgtaaat
acatttactttttcgacaccgtttacatgggacggaacatcaaatattgtagtagagttt
tgtcatggtaatccttcatcagaatctaccatgagcaggacaattaagatggatcctaca
agctttgtatcaacggtaaaagctcacgtggctgataatacagctgcttcagttgtatgt
ggaaacacatcaactagtctggcatcgctttcttcaaggccgaaatttatatttaatgca
accggtgtatgtctttcaccacgcgtagctgtcgctgctgttgtaaacactccacctgca
tttacgcttagtgcagatcctgtaactatttgtgtaggcgagtctacagcacctgttaca
gtcacaacaggtgctgctgattatactgatttcgtatggacaccaaatacaggtgtaagc
ggatcggctgatgcaggatggatatttaacccttccgtaactacgacatatacttttcag
gcgtcttcagctacttgtaatgctgtcccggtgtcagtcgttgttaacgtaagcgactta
cctacagcaataacgttagcagatgcaagttactgttcaggttcagtttcagcttctgta
ggattgactccttttggaggaacaaatacaactgttctgcttacagagaactttaacgct
gctactaataactggacaaccgtaaataattctataggcggtacacctgcaaatgctgca
tggacattacagccaaacgggcatgtttattcaggtaatgttttccgtagtaatgataat
tctcaattttatatatctaatagtgataaacaagatggtggtgatacagaaacaatctta
acttcgccggcattcagcaccgttaattatcaagcggtaacggtttcattttatcatgtt
ttttatgatccatctagcgaaagtgtcggatctgttgaattctcgtctaacgggacagat
tgggtagaatccaacgcctttacgggatcgacaggtagttttacgtcatttgctttagga
actgctattgtacctgcaaatttaatgaacgagcctgttgtttatgtccgatttagatat
gtagcaccatatacttatcaatgggctatagataatgtaactatatcaggtcagaaaagt
tatggttacacatggtctcctgctacagggttgtatacagatgctgcggctacaacaccg
tatgtggcaggtacagcagctgcaaaagtatatgctaagcctatagtagaaacagaatat
actattactgctactaatcctgccggatgtataagcactgctaccgctacggtttcacca
actagtacagctgcaccaacggtacaggctcctgtacaaacggtttgtgacgctgctacg
gttgctaatctcgttgctacaggtataggtattaaatggtatacggaagcaactggaggc
ttttctttatcgccatcaacattgcttaccaacggtgcggtttattacggcacacaaacg
gtagaagggtgtgaaagttcagagagggttgctttaactgcgaatatcgttgtggcttcc
gcgcctgtcgtaacagctccaacacaggccatatgtacttcgggtacggttgctgatttg
gaagctgaaggtactggtattaaatggtatgctgccgctacaggcggaactgctctggct
gaagatatagttctggtagatggcactatctactacgcgtcacaaactttagatacatgt
gaaagtttaacaaggacagcgcttacagttagcataacgttaaacagcgctccgacagtg
gatgctccgtctcaaatattttgtaatgaaggtactatagccgacttggttgttacgggg
acgcaagttcaatggtatacaactgaaacagggggaactgcgcttgcagaagatgcagcc
cttattaacggaactacctattatgcttcacaaactatcaacggatgcgaaagtgttacc
agaactcctaaaagtgtagtgtttaatactgttacagctccaacaggcgatgaagaacag
gaattttgtgcttctgctacacttgcacagcttactgctacaggtacaggcgtaaaatgg
tatagtgatgctacagcaacaactgttctggcaccggatacagctcttgtaagcggaact
acctattatgcttcccaaacaataaatgattgtgagggtgtttcaagattaggagtactt
gtatttatatataatgttgttgcagatgctccagcagacgtagccagctgtaatgagtac
gttcttcctgagctggaaaacggaggctattttacacaaccaaatggtgaaggaactgaa
gttgctgcaggtactgtggttagcgagactacaacattctacgtatatacttctgaaggt
aatagtatcgtttgtgatgatgaaaattcatttcaggttattataacatctgttccggct
cccggcggaaatactacgcagactataaacgctgctacagctgatactgcaacaattgag
gatattgagattattcagattttaggtagtacagtaacatggtatgcttctcaggaagat
gctgaatcaggaaccgatccgcttccggctggcacgctacttgaagaaggcgtcacttac
tatgcaacacaaacggtaggcgaatgtacaagtgctgcaatattagcagtaacggtagat
atcgttcttggtagggataattttgatagtaaagcattcacatatcatccaaatccggta
acagacatactgaatatttcttactcgtttgagattacttcggtaaccgtttacaatttg
ttaggacaacaggttgtaaataaaaaaactaatgctaatgaggttaagatagatatgtcg
ggtcttgcagatgctgcttacatagtaaatgtagtcgcaggcaacacggcaaaaacaatt
aaagtcattaaaaagcaatag

All links

Ontology (1)   
   KEGG BRITE (1)   
Pathway (1)   
   KEGG PATHWAY (1)   
Genome (1)   
   KEGG GENOME (1)   
Gene (78)   
   KEGG ORTHOLOGY (1)   
   RefGene (75)   
   NCBI-PROTEINID (1)   
   OC (1)   
Protein domain (5)   
   Pfam (5)   
All databases (86)   

Download RDF

DBGET integrated database retrieval system