KEGG   ORTHOLOGY: K00135Help
Entry
K00135                      KO                                     

Name
gabD
Definition
succinate-semialdehyde dehydrogenase / glutarate-semialdehyde dehydrogenase [EC:1.2.1.16 1.2.1.79 1.2.1.20]
Pathway
ko00250  Alanine, aspartate and glutamate metabolism
ko00310  Lysine degradation
ko00350  Tyrosine metabolism
ko00650  Butanoate metabolism
ko00760  Nicotinate and nicotinamide metabolism
ko01100  Metabolic pathways
ko01120  Microbial metabolism in diverse environments
Module
M00027  GABA (gamma-Aminobutyrate) shunt
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:ko00001]
 09100 Metabolism
  09101 Carbohydrate metabolism
   00650 Butanoate metabolism
    K00135  gabD; succinate-semialdehyde dehydrogenase / glutarate-semialdehyde dehydrogenase
  09105 Amino acid metabolism
   00250 Alanine, aspartate and glutamate metabolism
    K00135  gabD; succinate-semialdehyde dehydrogenase / glutarate-semialdehyde dehydrogenase
   00310 Lysine degradation
    K00135  gabD; succinate-semialdehyde dehydrogenase / glutarate-semialdehyde dehydrogenase
   00350 Tyrosine metabolism
    K00135  gabD; succinate-semialdehyde dehydrogenase / glutarate-semialdehyde dehydrogenase
  09108 Metabolism of cofactors and vitamins
   00760 Nicotinate and nicotinamide metabolism
    K00135  gabD; succinate-semialdehyde dehydrogenase / glutarate-semialdehyde dehydrogenase
KEGG modules [BR:ko00002]
 Pathway module
  Nucleotide and amino acid metabolism
   Other amino acid metabolism
    M00027  GABA (gamma-Aminobutyrate) shunt
     K00135  gabD; succinate-semialdehyde dehydrogenase / glutarate-semialdehyde dehydrogenase
Enzymes [BR:ko01000]
 1. Oxidoreductases
  1.2  Acting on the aldehyde or oxo group of donors
   1.2.1  With NAD+ or NADP+ as acceptor
    1.2.1.16  succinate-semialdehyde dehydrogenase [NAD(P)+]
     K00135  gabD; succinate-semialdehyde dehydrogenase / glutarate-semialdehyde dehydrogenase
    1.2.1.20  glutarate-semialdehyde dehydrogenase
     K00135  gabD; succinate-semialdehyde dehydrogenase / glutarate-semialdehyde dehydrogenase
    1.2.1.79  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NADP+)
     K00135  gabD; succinate-semialdehyde dehydrogenase / glutarate-semialdehyde dehydrogenase
BRITE hierarchy
Other DBs
RN: R00713 R00714 R02401
COG: COG1012
GO: 0009013 0036243 0047949
Genes
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CCP: CHC_T00008575001
SCE: YBR006W(UGA2)
AGO: AGOS_AER007W
ERC: Ecym_5303
KLA: KLLA0_E17491g KLLA0_F12628g
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ECY: ECSE_2914
ECR: ECIAI1_2757(gabD)
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ECK: EC55989_2929(gabD)
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ECOI: ECOPMV1_02913(gabD)
ECOJ: P423_14580(gabD)
ECOS: EC958_2925(gabD)
EFE: EFER_0411(gabD)
EAL: EAKF1_ch3336c(gabD)
STY: STY2911(gabD)
STT: t2686(gabD)
SENT: TY21A_13605(gabD)
STM: STM2791(gabD) STM4519
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SPT: SPA2648(gabD) SPA4340
SEI: SPC_2834(gabD)
SEC: SCH_2723(gabD)
SENS: Q786_13405(gabD) Q786_22445
SEG: SG2697(gabD)
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SEGA: SPUCDC_2771(gabD)
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SENO: AU37_13380(gabD) AU37_22090
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SENQ: AU40_15060(gabD) AU40_24715
SENL: IY59_13965(gabD) IY59_22665
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SBG: SBG_2416(gabD) SBG_3935
SFT: NCTC1_02955(gabD_1) NCTC1_02956(gabD_2)
SSN: SSON_2805(gabD)
SHQ: A0259_16900(gabD)
EEC: EcWSU1_00536(ssdA) EcWSU1_04045(gabD)
ECLX: LI66_02980 LI66_20265(gabD)
ECLY: LI62_03450 LI62_22250(gabD)
ECLZ: LI64_02955 LI64_19350(gabD)
ESA: ESA_03627
CSK: ES15_3576(gabD)
CCON: AFK62_01985(gabD)
CDM: AFK67_01960(gabD)
CMJ: AFK66_018130(gabD)
CUI: AFK65_01895(gabD)
CMW: AFK63_16660(gabD)
CTU: CTU_03500(gabD)
KPK: A593_13915 A593_15685(gabD) A593_19560(gabD)
KPI: D364_01250(gabD) D364_05265(gabD) D364_24325
KPX: PMK1_02228(sad_1) PMK1_02561(gabD_1) PMK1_03352(gabD_2)
KPB: FH42_00915(gabD) FH42_20390 FH42_22135(gabD)
KPNU: LI86_17015(gabD) LI86_21400(gabD) LI86_23250
KPNK: BN49_1224(gabD) BN49_2099(ssdH) BN49_4420
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CEN: LH86_01445(gabD) LH86_03055(gabD)
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PAE: PA0265(gabD)
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PAG: PLES_02611(gabD)
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PNC: NCGM2_0348(gabD)
PAEB: NCGM1900_0258(gabD)
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PSG: G655_01335(gabD)
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PAEP: PA1S_01330(gabD)
PAEM: U769_01360(gabD)
PAEL: T223_01315(gabD)
PAEU: BN889_00318(gabD)
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PAEC: M802_270
PAEO: M801_271
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PPU: PP_0213(gabD-I) PP_2488(sad-I) PP_4422(gabD-II)
PPF: Pput_0228
PPB: PPUBIRD1_0236(gabD)
PPI: YSA_05409
PPUH: B479_01495(gabD)
PPUT: L483_00800(gabD) L483_11455(gabD) L483_12015 L483_19505(gabD)
PPUN: PP4_02310 PP4_20680(gabD)
PPUD: DW66_0214
PMON: X969_27240(gabD)
PMOT: X970_26855(gabD)
PMOS: O165_009760(gabD) O165_022195(gabD) O165_024210(gabD)
POR: APT59_10615(gabD) APT59_11900(gabD) APT59_18150(gabD)
PST: PSPTO_0257(gabD-1) PSPTO_0300(gabD-2) PSPTO_2680(gabD-3)
PSP: PSPPH_0096(gabD1) PSPPH_2572(gabD2)
PFL: PFL_0185(gabD)
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PPRO: PPC_0193
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BTQ: BTQ_5401(gabD)
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BTV: BTHA_5355(gabD)
BTHE: BTN_4526(gabD)
BTHM: BTRA_4791(gabD)
BTHA: DR62_4638(gabD)
BTHL: BG87_4858(gabD)
BOK: DM82_3950 DM82_4282(gabD)
BOC: BG90_3735(gabD) BG90_4077
BCJ: BCAM1542 BCAM2562(gabD) BCAS0381(gabD)
BCEO: I35_5396 I35_5966 I35_6459(gabD) I35_7400(gabD)
BMJ: BMULJ_05506(gabD)
BMK: DM80_3389 DM80_4397(gabD) DM80_4742(gabD) DM80_6471(gabD)
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BTEI: WS51_00900(gabD) WS51_05260 WS51_09725(gabD) WS51_28775(gabD)
BPSL: WS57_01290(gabD) WS57_03555(gabD) WS57_06460 WS57_17690(gabD) WS57_24875(gabD)
BSTG: WT74_19140(gabD) WT74_27000 WT74_31645(gabD)
BUL: BW21_3971(gabD) BW21_4432
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PRB: X636_01475(gabD) X636_03115(gabD) X636_14255 X636_15815(gabD)
PPUL: RO07_01290(gabD) RO07_03925 RO07_14575(gabD)
PAPI: SG18_01475(gabD) SG18_14415(gabD) SG18_17035
PVE: UC34_05095(gabD) UC34_05720(gabD) UC34_12600 UC34_17515(gabD)
BPE: BP0757(gabD) BP0919(gabD) BP1976(gabD) BP3624
BPC: BPTD_0759(gabD) BPTD_1946(gabD) BPTD_3570
BPER: BN118_0466(gabD) BN118_0985(gabD) BN118_3000
BPET: B1917_1749(gabD) B1917_3065(gabD) B1917_3636
BPEU: Q425_15320(gabD) Q425_33430(gabD) Q425_38240
BPA: BPP0040 BPP0319(gabD) BPP1286(gabG) BPP2356(gabD) BPP3160(gabD)
BPAR: BN117_0040 BN117_0316(gabD) BN117_1509(gabD) BN117_2266(gabG)
BBR: BB0040 BB0322(gabD) BB1806(gabD) BB2351(gabG) BB3561(gabD)
BBM: BN115_0038 BN115_0308(gabD) BN115_1708(gabD)
BBH: BN112_0175(gabG) BN112_1709(gabD) BN112_3095(gabD) BN112_3372
BPT: Bpet0472(gabD1) Bpet2435 Bpet3404(gabD2) Bpet4942
BAV: BAV0042 BAV0968(gabD) BAV2549(gabD)
BHZ: ACR54_00048(araE_1) ACR54_00264(davD) ACR54_01262(gabD_2) ACR54_03172(araE_2)
AXY: AXYL_03185(gabD1) AXYL_03893(gabD2) AXYL_04470 AXYL_06439(gabD4)
AXX: ERS451415_03653(gabD_1) ERS451415_04346(gabD_2) ERS451415_06126(gabD_4)
TEA: KUI_0836 KUI_0979(gabD)
TEG: KUK_0674 KUK_1307(gabD)
TAT: KUM_0064 KUM_0427(gabD)
AMIM: MIM_c17500(gabD1) MIM_c20730(gabD2) MIM_c27410(gabD3) MIM_c31020(gabD4) MIM_c39220
BPSI: IX83_00025(gabD) IX83_08365
AFQ: AFA_13865(gabD) AFA_18145
PHN: PAEH1_03500(gabD)
RFR: Rfer_0598
RSB: RS694_12610(gabD)
RAC: RA876_11325(gabD)
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ACIN: CBP34_10290(gabD)
RTA: Rta_11430(gabD)
OTO: ADJ79_03625(gabD)
LIM: L103DPR2_02250(gabD)
LIH: L63ED372_01317(gabD) L63ED372_02658(araE)
HYB: Q5W_07075(gabD) Q5W_22615
HYL: LPB072_08435(gabD)
CBAA: SRAA_1381(gabD3)
CBAB: SMCB_0767
MPT: Mpe_A2324
HAR: HEAR2670(gabD)
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TaxonomyKoalaUniProt
Reference
PMID:2254272
  Authors
Bartsch K, von Johnn-Marteville A, Schulz A
  Title
Molecular analysis of two genes of the Escherichia coli gab cluster: nucleotide sequence of the glutamate:succinic semialdehyde transaminase gene (gabT) and characterization of the succinic semialdehyde dehydrogenase gene (gabD).
  Journal
J Bacteriol 172:7035-42 (1990)
DOI:10.1128/JB.172.12.7035-7042.1990
  Sequence
[eco:b2661]
Reference
  Authors
Yamanishi Y, Mihara H, Osaki M, Muramatsu H, Esaki N, Sato T, Hizukuri Y, Goto S, Kanehisa M
  Title
Prediction of missing enzyme genes in a bacterial metabolic network. Reconstruction of the lysine-degradation pathway of Pseudomonas aeruginosa.
  Journal
FEBS J 274:2262-73 (2007)
DOI:10.1111/j.1742-4658.2007.05763.x
  Sequence
[pae:PA0265]

DBGET integrated database retrieval system