KEGG   ORTHOLOGY: K03007
Entry
K03007                      KO                                     

Name
RPB10, POLR2L
Definition
DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC5
Pathway
ko03020  RNA polymerase
ko04623  Cytosolic DNA-sensing pathway
ko05016  Huntington disease
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:ko00001]
 09120 Genetic Information Processing
  09121 Transcription
   03020 RNA polymerase
    K03007  RPB10, POLR2L; DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC5
 09150 Organismal Systems
  09151 Immune system
   04623 Cytosolic DNA-sensing pathway
    K03007  RPB10, POLR2L; DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC5
 09160 Human Diseases
  09164 Neurodegenerative disease
   05016 Huntington disease
    K03007  RPB10, POLR2L; DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC5
 09180 Brite Hierarchies
  09182 Protein families: genetic information processing
   03021 Transcription machinery
    K03007  RPB10, POLR2L; DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC5
   03400 DNA repair and recombination proteins
    K03007  RPB10, POLR2L; DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC5
Transcription machinery [BR:ko03021]
 Eukaryotic type
  RNA polymerase II system
   RNA polymerase II
    Pol I, II, III common subunits
     K03007  RPB10, POLR2L; DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC5
  RNA polymerase III system
   RNA polymerase III
    Pol I, II, III common subunits
     K03007  RPB10, POLR2L; DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC5
  RNA polymerase I system
   RNA polymerase I
    Pol I, II, III common subunits
     K03007  RPB10, POLR2L; DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC5
DNA repair and recombination proteins [BR:ko03400]
 Eukaryotic type
  SSBR (single strand breaks repair)
   NER (nucleotide excision repair)
    TCR (transcription coupled repair) factors
     DNA-directed RNA polymerase II complex
      K03007  RPB10, POLR2L; DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC5
Other DBs
COG: COG1644
Genes
HSA: 5441(POLR2L)
PTR: 740555(POLR2L)
GGO: 101147395(POLR2L)
PON: 100437794(POLR2L)
NLE: 100607673(POLR2L)
MCC: 114677647 701181(POLR2L)
CSAB: 103234512(POLR2L)
RRO: 104681208(POLR2L) 115892323
RBB: 108513014(POLR2L) 108542211
CJC: 108589652(POLR2L)
MMU: 66491(Polr2l)
MCAL: 110297261(Polr2l)
MPAH: 110316393(Polr2l) 110336652
RNO: 100911840 502374(Polr2l) 681193
MUN: 110553909(Polr2l)
NGI: 103726234 103751096(Polr2l)
HGL: 101723718(Polr2l)
CCAN: 109698129(Polr2l)
OCU: 108176664(POLR2L)
TUP: 102472085(POLR2L) 102477366
VVP: 112923954(POLR2L)
AML: 105238376
UMR: 103671102(POLR2L)
ORO: 101377974(POLR2L)
FCA: 111556775(POLR2L)
PTG: 102957457(POLR2L)
AJU: 106965311 113596797(POLR2L)
BTA: 617375(POLR2L)
BBUB: 102413082(POLR2L)
CHX: 106503769(POLR2L)
OAS: 105604154(POLR2L)
SSC: 100156985 100511241(POLR2L)
CFR: 116666566(POLR2L)
CDK: 105105448(POLR2L)
LVE: 103083434
DLE: 111170304(POLR2L)
PCAD: 112065025 112066994(POLR2L)
ECB: 100629865(POLR2L) 111776015(POLR2L)
EPZ: 103542549
EAI: 106824959(POLR2L) 106834686
MYB: 102263501(POLR2L)
HAI: 109375642(POLR2L) 109383460
DRO: 112317192(POLR2L)
PALE: 102878984(POLR2L)
RAY: 107507363(POLR2L)
LAV: 111751383(POLR2L)
TMU: 101345422
SHR: 116419918(POLR2L)
PCW: 110202964(POLR2L) 110216369
OAA: 114810046(POLR2L)
GGA: 770704(POLR2L)
MGP: 100548895(POLR2L)
CJO: 107314500(POLR2L)
NMEL: 110401535(POLR2L)
APLA: 101794932(POLR2L)
ACYG: 106031766(POLR2L)
TGU: 100227696(POLR2L)
LSR: 110484453(POLR2L)
SCAN: 108963526(POLR2L)
GFR: 106631785(POLR2L)
FAB: 101819559(POLR2L)
PHI: 106628146(POLR2L)
PMAJ: 107205246(POLR2L)
CCAE: 111930738(POLR2L)
CCW: 104689917(POLR2L)
ETL: 114070897(POLR2L)
FPG: 106112447(POLR2L)
FCH: 106631408(POLR2L)
CLV: 106145857(POLR2L)
ACUN: 113481105(POLR2L)
AAM: 106490052(POLR2L)
ASN: 106722464(POLR2L)
AMJ: 106737945 106737959(POLR2L)
PSS: 106731425(POLR2L)
CPIC: 103306457(POLR2L)
PVT: 110074155(POLR2L) 110078469
PBI: 107326298(POLR2L)
TSR: 106546586(POLR2L)
PMUA: 114582287 114599491(POLR2L)
XLA: 108696737 108713863 734578(polr2l.1.L)
XTR: 549097(polr2l.1) 734135(polr2l.2)
NPR: 108792634 108794586(POLR2L)
DRE: 553705(polr2l)
IPU: 100528513(polr2l)
PHYP: 113524550(polr2l)
AMEX: 103027770(polr2l)
EEE: 113569872(polr2l)
TRU: 101065823(polr2l)
LCO: 104919212(polr2l)
NCC: 104962082(polr2l)
MZE: 101474549(polr2l)
ONL: 100695910(polr2l)
OLA: 101163886(polr2l)
XMA: 106699821(polr2l)
XCO: 114143156(polr2l)
PRET: 103462428(polr2l)
CVG: 107102602(polr2l)
NFU: 107381449(polr2l)
KMR: 108229775(polr2l)
ALIM: 106530757(polr2l)
AOCE: 111574616(polr2l)
CSEM: 103378754(polr2l)
POV: 109636783(polr2l)
LCF: 108889659(polr2l)
SDU: 111238384(polr2l)
SLAL: 111654829(polr2l)
HCQ: 109514356(polr2l)
BPEC: 110173061(polr2l)
MALB: 109964897(polr2l)
SASA: 106562324(RPAB5) 106587512(RPAB5)
ELS: 105022256(polr2l)
SFM: 108940984(polr2l)
PKI: 111847969(polr2l)
RTP: 109934226(polr2l)
BFO: 118413271
DME: Dmel_CG13628(Rpb10)
DER: 6554690
DSE: 6607789
DSI: Dsimw501_GD21123(Dsim_GD21123)
DAN: 6500009
DSR: 110190868
DPE: 6594807
DMN: 108157207
DWI: 6650946
DAZ: 108617228
DNV: 108659975
DHE: 111593682
DVI: 6630602
MDE: 101897460
LCQ: 111676461
AAG: 5565337
AME: 724625
BIM: 100749211
BTER: 100644091
CCAL: 108629522
OBB: 114872374
SOC: 105208210
MPHA: 105839858
AEC: 105145864
ACEP: 105618935
PBAR: 105432740
VEM: 105562779
HST: 105189533
DQU: 106748931
CFO: 105249389
LHU: 105674240
PGC: 109855195
OBO: 105274730
PCF: 106791091
NVI: 100118960(Rpb10)
CSOL: 105365024
MDL: 103575708
TCA: 100240683(Rpb10)
DPA: 109534449
NVL: 108566265
BMOR: 101739452
BMAN: 114239632
PMAC: 106715327
PRAP: 110998967
HAW: 110382944
TNL: 113497881
PXY: 105393696
API: 100168005
DNX: 107161784
AGS: 114119687
RMD: 113556036
CLEC: 106663243
DPTE: 113794002
CEL: CELE_Y37E3.3(rpb-10)
CBR: CBG22047(Cbr-rpb-10)
BMY: Bm1_00170
TSP: Tsp_09153
SHX: MS3_10771
EGL: EGR_03086
ATH: AT1G11475(NRPB10) AT1G61700
CPAP: 110820688
CIT: 102624903
DZI: 111287455
EGR: 104439661
CCAJ: 109797574
CAM: 101494736
LJA: Lj0g3v0199369.1(Lj0g3v0199369.1) Lj2g3v1414960.1(Lj2g3v1414960.1) Lj2g3v1468350.1(Lj2g3v1468350.1) Lj2g3v1758390.1(Lj2g3v1758390.1)
FVE: 101307391
PPER: 18788912
PMUM: 103321790
PAVI: 110753209
RCU: 8279042
JCU: 105644364
VVI: 100267114
SLY: 101251196
SPEN: 107021381
NTO: 104104682
SIND: 105176177
DCR: 108220874
BVG: 104908813
DOSA: Os11t0194800-01(Os11g0194800) Os12t0180400-01(Os12g0180400)
OBR: 102713947
ATS: 109773739(LOC109773739) 109782667(LOC109782667)
ZMA: 100286035(pco151371)
SITA: 101768486
EGU: 109506288
PEQ: 110026622
ATR: 18424114
PPP: 112284346
CRE: CHLREDRAFT_127606(RPB10)
MNG: MNEG_0306
APRO: F751_3708
SCE: YOR210W(RPB10)
ERC: Ecym_8313
KMX: KLMA_20809(RPB10)
NCS: NCAS_0B01680(NCAS0B01680)
NDI: NDAI_0E01530(NDAI0E01530)
TPF: TPHA_0G01880(TPHA0G01880)
TBL: TBLA_0B04110(TBLA0B04110)
TDL: TDEL_0A05730(TDEL0A05730)
KAF: KAFR_0H02670(KAFR0H02670)
PIC: PICST_37912(RPB10)
NCR: NCU02605
NTE: NEUTE1DRAFT119050(NEUTE1DRAFT_119050)
MGR: MGG_15646
SSCK: SPSK_10002
MAW: MAC_06247
MAJ: MAA_00683
CMT: CCM_05455
MBE: MBM_03528
PTE: PTT_19937
SPO: SPAC1B3.12c(rpb10)
CNE: CNB00680
CNB: CNBB5020
ABP: AGABI1DRAFT86027(AGABI1DRAFT_86027)
ABV: AGABI2DRAFT138476(AGABI2DRAFT_138476)
MGL: MGL_1639
MRT: MRET_0736
DDI: DDB_G0272036(rpb10)
DFA: DFA_07321(rpb10)
PCB: PCHAS_080570(PC000255.04.0)
TPV: TP02_0237
BBO: BBOV_III004290(17.m07387)
CPV: cgd4_3260
TGO: TGME49_217560(POLR2L)
SMIN: v1.2.033812.t1(symbB.v1.2.033812.t1)
SPAR: SPRG_07688
VG: 15766100(PGCG_00211) 16512508(pdul_cds_557) 19738761(177R) 20041512(JO84_gp204) 26049146(ceV_279) 3654681(EhV167)
 » show all
Reference
PMID:8524256
  Authors
McKune K, Moore PA, Hull MW, Woychik NA
  Title
Six human RNA polymerase subunits functionally substitute for their yeast counterparts.
  Journal
Mol Cell Biol 15:6895-900 (1995)
DOI:10.1128/mcb.15.12.6895
  Sequence
[hsa:5441]
Reference
PMID:9852112
  Authors
Kershnar E, Wu SY, Chiang CM
  Title
Immunoaffinity purification and functional characterization of human transcription factor IIH and RNA polymerase II from clonal cell lines that conditionally express epitope-tagged subunits of the multiprotein complexes.
  Journal
J Biol Chem 273:34444-53 (1998)
DOI:10.1074/jbc.273.51.34444
  Sequence
[hsa:5441]

DBGET integrated database retrieval system