KEGG   ORTHOLOGY: K03008
Entry
K03008                      KO                                     

Name
RPB11, POLR2J
Definition
DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB11
Pathway
ko03020  RNA polymerase
ko05016  Huntington disease
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:ko00001]
 09120 Genetic Information Processing
  09121 Transcription
   03020 RNA polymerase
    K03008  RPB11, POLR2J; DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB11
 09160 Human Diseases
  09164 Neurodegenerative disease
   05016 Huntington disease
    K03008  RPB11, POLR2J; DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB11
 09180 Brite Hierarchies
  09182 Protein families: genetic information processing
   03021 Transcription machinery
    K03008  RPB11, POLR2J; DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB11
   03400 DNA repair and recombination proteins
    K03008  RPB11, POLR2J; DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB11
Transcription machinery [BR:ko03021]
 Eukaryotic type
  RNA polymerase II system
   RNA polymerase II
    Core subunits
     K03008  RPB11, POLR2J; DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB11
DNA repair and recombination proteins [BR:ko03400]
 Eukaryotic type
  SSBR (single strand breaks repair)
   NER (nucleotide excision repair)
    TCR (transcription coupled repair) factors
     DNA-directed RNA polymerase II complex
      K03008  RPB11, POLR2J; DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB11
Other DBs
COG: COG1761
Genes
HSA: 246721(POLR2J2) 5439(POLR2J) 548644(POLR2J3)
PTR: 100609886(POLR2J) 100610062
GGO: 101130526(POLR2J) 101130894 109027627 115933167 115935376
PON: 100445567(POLR2J)
NLE: 115830998(POLR2J)
MCC: 106997590(POLR2J)
MCF: 102125950(POLR2J)
CSAB: 103246673(POLR2J)
RRO: 104681202(POLR2J)
RBB: 108518910(POLR2J)
CJC: 100387557(POLR2J)
SBQ: 101039719(POLR2J)
MMU: 20022(Polr2j)
MCAL: 110294658(Polr2j)
MPAH: 110312947(Polr2j)
RNO: 288588(Polr2j)
MUN: 110557245(Polr2j)
CGE: 100766101
NGI: 103733480(Polr2j)
HGL: 101721550(Polr2j)
CCAN: 109681588(Polr2j)
OCU: 100358757(POLR2J)
TUP: 102469604(POLR2J)
CFA: 100686835(POLR2J)
VVP: 112935797(POLR2J)
AML: 100481699(POLR2J)
UMR: 103670139(POLR2J)
UAH: 113267821(POLR2J)
ORO: 101386582(POLR2J)
FCA: 101083132(POLR2J)
PTG: 102948583(POLR2J)
AJU: 106980698(POLR2J)
BTA: 540428(POLR2J)
BOM: 102279637(POLR2J)
BIU: 109578701(POLR2J)
BBUB: 102411604(POLR2J)
CHX: 100861038(POLR2J)
OAS: 101118844(POLR2J)
SSC: 100521614(POLR2J)
CFR: 102507771(POLR2J)
CDK: 105089639(POLR2J)
BACU: 103014406
LVE: 103087252
OOR: 101269538(POLR2J)
DLE: 111182011(POLR2J)
PCAD: 102982194(POLR2J)
ECB: 100059695(POLR2J)
EPZ: 103551703(POLR2J)
EAI: 106839285(POLR2J)
MYB: 102242312(POLR2J)
MYD: 102768098(POLR2J)
MNA: 107526523(POLR2J)
HAI: 109385055(POLR2J)
DRO: 112314922(POLR2J)
PALE: 102897120(POLR2J)
RAY: 107511792(POLR2J)
MJV: 108383780(POLR2J)
LAV: 100669494(POLR2J)
TMU: 101347535
MDO: 100017767(POLR2J)
SHR: 100930889(POLR2J)
PCW: 110221199(POLR2J)
OAA: 100083768(POLR2J)
GGA: 107049063(POLR2J)
MGP: 100542963(POLR2J)
CJO: 107322463
NMEL: 110407781(POLR2J)
APLA: 101795435(POLR2J)
ACYG: 106041445(POLR2J)
TGU: 100190465(POLR2J)
LSR: 110482079
SCAN: 103820072(POLR2J)
GFR: 102035236(POLR2J)
FAB: 101819581(POLR2J)
PHI: 102109728(POLR2J)
PMAJ: 107212851(POLR2J)
CCAE: 111937698
ETL: 114056706(POLR2J)
FPG: 101924231(POLR2J)
CLV: 106145670(POLR2J)
NNI: 104016142(POLR2J)
ACUN: 113487342(POLR2J)
PADL: 103912921
ASN: 112551830(POLR2J)
AMJ: 102573191(POLR2J)
PSS: 102453643
CMY: 102947998
CPIC: 101941150(POLR2J)
ACS: 100553019(polr2j)
PVT: 110085145
PBI: 103067977(POLR2J)
PMUR: 107297548(POLR2J)
TSR: 106549871(POLR2J)
PMUA: 114585801(POLR2J)
GJA: 107107714(POLR2J)
XLA: 108708305(polr2j.L) 496260(polr2j.S)
XTR: 733914(polr2j)
NPR: 108791280(POLR2J)
DRE: 554099(polr2j)
SRX: 107710717(polr2j)
IPU: 100528516(polr2j)
PHYP: 113531519(polr2j)
AMEX: 103025271(polr2j)
EEE: 113573764(polr2j)
TRU: 101066975(polr2j)
LCO: 104933136(polr2j)
MZE: 101486043(polr2j)
ONL: 100705637(polr2j)
OLA: 101172727(polr2j)
XMA: 102235689(polr2j)
XCO: 114135293(polr2j)
PRET: 103460351(polr2j)
CVG: 107103550(polr2j)
NFU: 107384855(polr2j)
KMR: 108250721(polr2j)
ALIM: 106531745(polr2j)
AOCE: 111571421(polr2j)
CSEM: 103386825(polr2j)
POV: 109648018(polr2j)
LCF: 108890708(polr2j)
SDU: 111219379(polr2j)
SLAL: 111656540(polr2j)
HCQ: 109522404(polr2j)
SASA: 106567670(RPB11) 106603417
OTW: 112257932
SALP: 111982040(polr2j)
ELS: 105011089(polr2j)
SFM: 108928135(polr2j)
PKI: 111847866(polr2j)
CMK: 103180526(polr2j)
RTP: 109922194(polr2j)
BFO: 118407354
CIN: 100181341
SPU: 581204
SKO: 100374275
DME: Dmel_CG6840(Rpb11)
DER: 6549404
DSE: 6614475
DSI: Dsimw501_GD21874(Dsim_GD21874)
DAN: 6497920
DPE: 6589839
DMN: 108162029
DWI: 6643847
DAZ: 108610800
DNV: 108649697
DHE: 111595203
DVI: 6635735
MDE: 101889923
LCQ: 111676866
AGA: AgaP_AGAP009209(RPB11_ANOGA)
AAG: 5578426
AALB: 109417715
AME: 551607
BIM: 100743624
BTER: 100651555
CCAL: 108633027
OBB: 114873235
SOC: 105202108
MPHA: 105840574
AEC: 105151447
ACEP: 105627107
PBAR: 105424174
VEM: 105562457
HST: 105182963
DQU: 106743377
CFO: 105258669
PGC: 109861777
OBO: 105280969
PCF: 106786259
NVI: 100114414
CSOL: 105364388
MDL: 103572092
TCA: 655304
DPA: 109539093
ATD: 109605334
NVL: 108560310
BMOR: 101737649
PMAC: 106720146
PRAP: 110999444
HAW: 110372607
TNL: 113491701
PXY: 105380425
API: 100166977 100167410(Polr2j)
AGS: 114125624
BTAB: 109039291
CLEC: 106669707
ZNE: 110827505
FCD: 110856194
PVM: 113829158
TUT: 107371399
DPTE: 113795240
CSCU: 111632027
CEL: CELE_W01G7.3(rpb-11)
CBR: CBG20834(Cbr-rpb-11)
BMY: Bm1_34005
TSP: Tsp_01995
PCAN: 112561581
CRG: 105338495
MYI: 110460929
OBI: 106874013
SHX: MS3_02572
EGL: EGR_06173
NVE: 5508737
EPA: 110253561
ADF: 107333688
AMIL: 114961855
PDAM: 113672605
SPIS: 111342203
DGT: 114522528
HMG: 100198493
AQU: 100632797
ATH: AT3G52090(NRPB11)
ALY: 9312192
CRB: 17885410
THJ: 104801974
CPAP: 110809333
CIT: 102612486
TCC: 18614612
EGR: 104454646
VRA: 106755651
VAR: 108339721
VUN: 114168677
CCAJ: 109798857
LJA: Lj3g3v3690050.1(Lj3g3v3690050.1)
ADU: 107477449
AIP: 107629693
LANG: 109341119
FVE: 101305416
RCN: 112169207
PPER: 18768832
PMUM: 103335510
PAVI: 110756314
PXB: 103964138
RCU: 8259315
JCU: 105636823
POP: 7475018
PEU: 105110733
VVI: 100259467
SLY: 101244156
SPEN: 107003164
SOT: 102581010
CANN: 107848467
NAU: 109234008
INI: 109181169
SIND: 105168750
HAN: 110872777
CCAV: 112515436
BVG: 104889793
SOE: 110795392
NNU: 104597389
OSA: 4342517
DOSA: Os07t0172500-01(Os07g0172500)
ATS: 109732580(LOC109732580) 109773714(LOC109773714)
PDA: 103706776
EGU: 105053143
DCT: 110108565
PEQ: 110023054
ATR: 18447448
CRE: CHLREDRAFT_182662(RPB11)
MNG: MNEG_2353
APRO: F751_5285
SCE: YOL005C(RPB11)
KMX: KLMA_10271(RPB11)
NCS: NCAS_0D02120(NCAS0D02120)
NDI: NDAI_0C02670(NDAI0C02670)
TPF: TPHA_0J00410(TPHA0J00410)
TBL: TBLA_0E03150(TBLA0E03150)
TDL: TDEL_0G04390(TDEL0G04390)
KAF: KAFR_0A05110(KAFR0A05110)
PIC: PICST_62535(RBP11)
CAL: CAALFM_C100940WA(RPB11)
NCR: NCU03782
NTE: NEUTE1DRAFT58240(NEUTE1DRAFT_58240)
MGR: MGG_02463
SSCK: SPSK_05588
MAW: MAC_05932
MAJ: MAA_07862
CMT: CCM_03153
MBE: MBM_07778
ANI: AN4269.2
ANG: ANI_1_32114(An13g00280)
ABE: ARB_00903
TVE: TRV_02570
PTE: PTT_14569
SPO: SPAC3A12.07(rpb11)
CNE: CNB02280
CNB: CNBB3430
TASA: A1Q1_00886
ABP: AGABI1DRAFT115317(AGABI1DRAFT_115317)
ABV: AGABI2DRAFT194279(AGABI2DRAFT_194279)
MGL: MGL_0942
MRT: MRET_3207
DDI: DDB_G0277677(rpb11)
EHI: EHI_087360(169.t00023)
PCB: PCHAS_140530(PC000833.03.0)
TAN: TA02635
TPV: TP03_0027
BBO: BBOV_III004050(17.m07372)
CPV: cgd7_4370
TGO: TGME49_315920(POLR2J)
SMIN: v1.2.012085.t1(symbB.v1.2.012085.t1)
TPS: THAPSDRAFT_36330(RpbY)
NGD: NGA_0127000(RPB11)
SPAR: SPRG_01664
 » show all
Reference
PMID:9852112
  Authors
Kershnar E, Wu SY, Chiang CM
  Title
Immunoaffinity purification and functional characterization of human transcription factor IIH and RNA polymerase II from clonal cell lines that conditionally express epitope-tagged subunits of the multiprotein complexes.
  Journal
J Biol Chem 273:34444-53 (1998)
DOI:10.1074/jbc.273.51.34444
  Sequence
[hsa:5439]

DBGET integrated database retrieval system