KEGG   ORTHOLOGY: K03016
Entry
K03016                      KO                                     

Name
RPB8, POLR2H
Definition
DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC3
Pathway
ko03020  RNA polymerase
ko04623  Cytosolic DNA-sensing pathway
ko05016  Huntington disease
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:ko00001]
 09120 Genetic Information Processing
  09121 Transcription
   03020 RNA polymerase
    K03016  RPB8, POLR2H; DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC3
 09150 Organismal Systems
  09151 Immune system
   04623 Cytosolic DNA-sensing pathway
    K03016  RPB8, POLR2H; DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC3
 09160 Human Diseases
  09164 Neurodegenerative disease
   05016 Huntington disease
    K03016  RPB8, POLR2H; DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC3
 09180 Brite Hierarchies
  09182 Protein families: genetic information processing
   03021 Transcription machinery
    K03016  RPB8, POLR2H; DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC3
   03400 DNA repair and recombination proteins
    K03016  RPB8, POLR2H; DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC3
Transcription machinery [BR:ko03021]
 Eukaryotic type
  RNA polymerase II system
   RNA polymerase II
    Pol I, II, III common subunits
     K03016  RPB8, POLR2H; DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC3
  RNA polymerase III system
   RNA polymerase III
    Pol I, II, III common subunits
     K03016  RPB8, POLR2H; DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC3
  RNA polymerase I system
   RNA polymerase I
    Pol I, II, III common subunits
     K03016  RPB8, POLR2H; DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC3
DNA repair and recombination proteins [BR:ko03400]
 Eukaryotic type
  SSBR (single strand breaks repair)
   NER (nucleotide excision repair)
    TCR (transcription coupled repair) factors
     DNA-directed RNA polymerase II complex
      K03016  RPB8, POLR2H; DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC3
Genes
HSA: 5437(POLR2H)
PTR: 471027(POLR2H)
PPS: 100980213(POLR2H)
PON: 100452428(POLR2H)
NLE: 100582655(POLR2H)
MCC: 100429040(POLR2H)
MCF: 102140336(POLR2H)
CSAB: 103221131(POLR2H)
RRO: 104664622(POLR2H)
RBB: 108525206(POLR2H)
CJC: 100394075(POLR2H)
SBQ: 101046822(POLR2H)
MMU: 245841(Polr2h)
MCAL: 110311143(Polr2h)
MPAH: 110329787(Polr2h)
RNO: 100912534 498109(Polr2h)
MUN: 110549397(Polr2h)
CGE: 100769706(Polr2h)
NGI: 103732659(Polr2h)
HGL: 101706663(Polr2h)
CCAN: 109694099(Polr2h)
OCU: 100347834(POLR2H)
TUP: 106736235(POLR2H)
CFA: 478656(POLR2H)
VVP: 112926268(POLR2H)
AML: 100470168(POLR2H)
UMR: 103676079(POLR2H)
UAH: 113254312(POLR2H)
ORO: 101373084(POLR2H)
ELK: 111148606
FCA: 101084389(POLR2H)
PTG: 102968963(POLR2H)
PPAD: 109275232(POLR2H)
AJU: 106983811(POLR2H)
BTA: 505599(POLR2H)
BOM: 102275957(POLR2H)
BIU: 109557349(POLR2H)
BBUB: 102407019(POLR2H)
CHX: 102182068(POLR2H)
OAS: 101119867(POLR2H)
SSC: 100628241(POLR2H)
CFR: 102521897(POLR2H)
CDK: 105085875(POLR2H)
BACU: 103001378(POLR2H)
LVE: 103088960(POLR2H)
OOR: 101275030(POLR2H)
DLE: 111173227(POLR2H)
PCAD: 102977584(POLR2H)
ECB: 100059115(POLR2H)
EPZ: 103554737(POLR2H)
EAI: 106834516(POLR2H)
MYB: 102245238(POLR2H)
MYD: 102769153(POLR2H)
MNA: 107543117(POLR2H)
HAI: 109396799(POLR2H)
DRO: 112305134(POLR2H)
PALE: 102878376(POLR2H)
RAY: 107504910(POLR2H)
MJV: 108395273(POLR2H) 108400990
LAV: 100676232(POLR2H)
TMU: 101356817
MDO: 100013916(POLR2H)
SHR: 100933932(POLR2H)
PCW: 110221304(POLR2H)
OAA: 100089660(POLR2H)
GGA: 424954(POLR2H)
MGP: 100545178(POLR2H)
CJO: 107318259(POLR2H)
NMEL: 110397886(POLR2H)
LSR: 110478152(POLR2H)
SCAN: 103815332(POLR2H)
GFR: 102031433(POLR2H)
FAB: 101806753(POLR2H)
PHI: 102109122(POLR2H)
PMAJ: 107209007(POLR2H)
CCAE: 111933392(POLR2H)
CCW: 104687986(POLR2H)
ETL: 114060801(POLR2H)
FPG: 101913371(POLR2H)
FCH: 102060193(POLR2H)
CLV: 102089188(POLR2H)
EGZ: 104122290(POLR2H)
NNI: 104015624(POLR2H)
ACUN: 113483578(POLR2H)
PADL: 103925628(POLR2H)
AAM: 106482255 106494211(POLR2H)
ASN: 102380713(POLR2H)
AMJ: 102574727(POLR2H)
PSS: 102459209(POLR2H)
CMY: 102935557(POLR2H)
CPIC: 101948266(POLR2H)
ACS: 100555951(polr2h)
PVT: 110089822(POLR2H)
PBI: 103062347(POLR2H)
PMUR: 107298410(POLR2H)
TSR: 106556135(POLR2H)
PMUA: 114598049(POLR2H)
GJA: 107123682(POLR2H)
XLA: 108718026(polr2h.S) 443896(polr2h.L)
XTR: 548867(polr2h)
NPR: 108804657(POLR2H)
DRE: 550263(polr2h)
SRX: 107731657(polr2h) 107732651
CCAR: 109080980(polr2h)
IPU: 100528377(polr2h)
PHYP: 113536669(polr2h)
AMEX: 103046918(polr2h)
EEE: 113585743(polr2h)
TRU: 101079851(polr2h)
LCO: 104927504(polr2h)
NCC: 104961920(polr2h)
MZE: 101486540(polr2h)
ONL: 100711485(polr2h)
OLA: 101159426(polr2h)
XMA: 102229592(polr2h)
XCO: 114151213(polr2h)
PRET: 103463459(polr2h)
CVG: 107083666(polr2h)
NFU: 107392756(polr2h)
KMR: 108234305(polr2h)
ALIM: 106510851(polr2h)
AOCE: 111574902(polr2h)
CSEM: 103394099(polr2h)
POV: 109636641(polr2h)
LCF: 108881225(polr2h)
SDU: 111240292(polr2h)
SLAL: 111652428(polr2h)
BPEC: 110160197(polr2h)
MALB: 109958237(polr2h)
SASA: 100286712(polr2h)
OTW: 112253288(polr2h)
SALP: 111957308(polr2h)
ELS: 105026920(polr2h)
SFM: 108921679(polr2h)
PKI: 111853565(polr2h)
LCM: 102364801(POLR2H)
CMK: 103184435(polr2h)
RTP: 109936978(polr2h)
BFO: 118430028
CIN: 100178283
SPU: 591688
APLC: 110983881
SKO: 100370657
DME: Dmel_CG11246(Rpb8)
DER: 6543997
DSE: 6616497
DSI: Dsimw501_GD14989(Dsim_GD14989)
DAN: 6507791
DSR: 110177507
DPE: 6595763
DMN: 108152744
DWI: 6639203
DAZ: 108614015
DNV: 108651571
DHE: 111600961
DVI: 6624180
MDE: 101895411
LCQ: 111687485
AAG: 5565447
AALB: 109426039
AME: 102655904
BIM: 105680630
BTER: 105665726
CCAL: 108631712
OBB: 114876500
MPHA: 105835853
AEC: 105143874
ACEP: 105620560
PBAR: 105431087
VEM: 105566722
HST: 105185593
DQU: 106748084
CFO: 105252932
LHU: 105675987
PGC: 109859413
OBO: 105282978
PCF: 106787253
NVI: 100115406
CSOL: 105367095
MDL: 103578682
TCA: 658676
DPA: 109542690
ATD: 109597514
NVL: 108560253
BMOR: 101744611
BMAN: 114241662
PMAC: 106713416
PRAP: 111002451
HAW: 110382505
API: 100169136(Polr2h)
DNX: 107162624
AGS: 114128922
RMD: 113554784
CLEC: 106662971
ZNE: 110827651
FCD: 110843124
PVM: 113817375
DPTE: 113791220
CSCU: 111621523
PTEP: 107447028
CEL: CELE_F26F4.11(rpb-8)
CBR: CBG18189(Cbr-rpb-8)
BMY: Bm1_26995
TSP: Tsp_00326
PCAN: 112567979
CRG: 105330854
MYI: 110464273
OBI: 106867543
LAK: 106179848
SHX: MS3_01594
EGL: EGR_04064
NVE: 5511656
EPA: 110237977
ADF: 107341034
AMIL: 114963011
PDAM: 113668806
SPIS: 111331653
DGT: 114527138
HMG: 100203045
ATH: AT1G54250(NRPB8A) AT3G59600(NRPB8B)
BRP: 103841806
BOE: 106309990
RSZ: 108805380
LJA: Lj0g3v0150319.1(Lj0g3v0150319.1) Lj0g3v0150319.2(Lj0g3v0150319.2) Lj0g3v0150319.3(Lj0g3v0150319.3) Lj0g3v0270299.1(Lj0g3v0270299.1) Lj0g3v0270299.2(Lj0g3v0270299.2) Lj5g3v0975900.1(Lj5g3v0975900.1) Lj5g3v0975900.2(Lj5g3v0975900.2)
RCU: 8263166
CANN: 107868305
BVG: 104889864
NNU: 104605253
DOSA: Os03t0845700-01(Os03g0845700) Os06t0697400-01(Os06g0697400)
ATS: 109737850(LOC109737850) 109783265(LOC109783265)
ZMA: 100281008(pco144871)
PDA: 103699115
EGU: 105060651
MUS: 103998751
DCT: 114578826
PEQ: 110027243
AOF: 109832463
ATR: 18448978
PPP: 112295370
CRE: CHLREDRAFT_126483(RPB8)
MNG: MNEG_7835
APRO: F751_6084
SCE: YOR224C(RPB8)
ERC: Ecym_8331
KMX: KLMA_20792(RPB8)
NCS: NCAS_0B01380(NCAS0B01380)
NDI: NDAI_0E01380(NDAI0E01380)
TPF: TPHA_0F03280(TPHA0F03280)
TBL: TBLA_0J00350(TBLA0J00350)
TDL: TDEL_0A05920(TDEL0A05920)
KAF: KAFR_0G01860(KAFR0G01860)
PIC: PICST_87046(RPB8)
CAL: CAALFM_CR04780WA(RPB8)
SLB: AWJ20_18(RPB8)
NCR: NCU08030
MGR: MGG_07080
SSCK: SPSK_08032
MAJ: MAA_02710
CMT: CCM_00394
BFU: BCIN_12g02760(Bcrpb8)
MBE: MBM_06705
ANI: AN0192.2
ANG: ANI_1_286014(An01g02200)
ABE: ARB_03020
TVE: TRV_04927
PTE: PTT_04001
SPO: SPBC14C8.12(rpb8)
CNE: CNI02630
CNB: CNBH2490
TASA: A1Q1_03009
MRR: Moror_107
ABP: AGABI1DRAFT117227(AGABI1DRAFT_117227)
ABV: AGABI2DRAFT197624(AGABI2DRAFT_197624)
MGL: MGL_3267
MRT: MRET_2426
DDI: DDB_G0278039(rpb8)
DFA: DFA_08762(rpb8)
EHI: EHI_038570(7.t00016)
PCB: PCHAS_143140(PC000459.03.0)
TAN: TA19535
TPV: TP01_0233
BBO: BBOV_IV005100(23.m06188)
CPV: cgd1_2260
TGO: TGME49_233720(POLR2H)
SMIN: v1.2.027601.t1(symbB.v1.2.027601.t1)
TPS: THAPSDRAFT_38815(Rpb8)
SPAR: SPRG_12350
TCR: 506933.80
 » show all
Reference
PMID:8524256
  Authors
McKune K, Moore PA, Hull MW, Woychik NA
  Title
Six human RNA polymerase subunits functionally substitute for their yeast counterparts.
  Journal
Mol Cell Biol 15:6895-900 (1995)
DOI:10.1128/mcb.15.12.6895
  Sequence
[hsa:5437]
Reference
PMID:9852112
  Authors
Kershnar E, Wu SY, Chiang CM
  Title
Immunoaffinity purification and functional characterization of human transcription factor IIH and RNA polymerase II from clonal cell lines that conditionally express epitope-tagged subunits of the multiprotein complexes.
  Journal
J Biol Chem 273:34444-53 (1998)
DOI:10.1074/jbc.273.51.34444
  Sequence
[hsa:5437]
Reference
  Authors
Engel C, Sainsbury S, Cheung AC, Kostrewa D, Cramer P
  Title
RNA polymerase I structure and transcription regulation.
  Journal
Nature 502:650-5 (2013)
DOI:10.1038/nature12712
  Sequence
[sce:YOR224C]

DBGET integrated database retrieval system