KEGG   ORTHOLOGY: K12126
Entry
K12126                      KO                                     
Symbol
PIF3
Name
phytochrome-interacting factor 3
Pathway
map04075  Plant hormone signal transduction
map04712  Circadian rhythm - plant
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:ko00001]
 09130 Environmental Information Processing
  09132 Signal transduction
   04075 Plant hormone signal transduction
    K12126  PIF3; phytochrome-interacting factor 3
 09150 Organismal Systems
  09159 Environmental adaptation
   04712 Circadian rhythm - plant
    K12126  PIF3; phytochrome-interacting factor 3
 09180 Brite Hierarchies
  09182 Protein families: genetic information processing
   03000 Transcription factors
    K12126  PIF3; phytochrome-interacting factor 3
Transcription factors [BR:ko03000]
 Eukaryotic type
  Basic helix-loop-helix (bHLH)
   HLH domain only
    K12126  PIF3; phytochrome-interacting factor 3
Genes
ATH: AT1G09530(PIF3)
ALY: 9328571
CRB: 17897209
CSAT: 104739545 104755147 104767826
EUS: EUTSA_v10007343mg
BRP: 103843349 103871725
BNA: 106346269 106397555 106419805 125578610
BOE: 106307202 106343710
RSZ: 108815296 108856167 130508993
THJ: 104820437 104823710
CPAP: 110814175
CIT: 102608210 102621125
CIC: CICLE_v10019786mg CICLE_v10027890mg
PVY: 116109775 116119657 116143263
MINC: 123196852 123216759 123221777 123222501
TCC: 18600647 18613821
GRA: 105761152 105795211 105802905
GHI: 107912232 107922999 107927211 107953017 107954397 107955422
GAB: 108457881 108474109 108479827
HSYR: 120163899
DZI: 111277137 111294151 111297995 111304928
EGR: 104431553 104434287 104456902
GMX: 100794974 100804665 100818543 100820151 102659557
GSJ: 114370212 114372651 114399010 114403093 114407482
PVU: PHAVU_001G218800g PHAVU_007G206000g PHAVU_007G208500g
VRA: 106756809 106757404 106772189
VAR: 108325538 108326247 108327124 108328010
VUN: 114168622 114181698 114192043
VUM: 124822896 124822966 124826571
CCAJ: 109797206 109808333 109809145
APRC: 113863341 113871065 113873753
MTR: 11406493 11427226 11430037
TPRA: 123891011 123891040 123902210
CAM: 101490374 101501589
PSAT: 127093121 127128915 127132501 127132546
VVO: 131610485 131612762 131622687 131627334 131644011
LJA: Lj0g3v0276629.1(Lj0g3v0276629.1) Lj1g3v4830130.1(Lj1g3v4830130.1) Lj5g3v1533330.1(Lj5g3v1533330.1)
ADU: 107465071 107465093 107492248 107492316
AIP: 107617992 107619574 107645992 107646015
AHF: 112695628 112695653 112710631 112710671 112757529 112757971 112775424 112779460
LANG: 109328952 109329450 109335282 109335978 109345863 109346242
PCIN: 129288775
QSA: O6P43_007332 O6P43_007367
FVE: 101314290
RCN: 112192990
PPER: 18774504
PMUM: 103344515
PAVI: 110770588
PDUL: 117631021
MDM: 103433823 103450807
MSYL: 126594072 126619539
PXB: 103928262 103955304 103955840
ZJU: 107411687 107426221 112492854
MNT: 21405471
CSAV: 115719625
CSV: 101216738
CMO: 103493865
BHJ: 120079649
MCHA: 111023303
CMAX: 111468592 111493939
CMOS: 111444298 111450526
CPEP: 111804719
RCU: 8265863 8274969
JCU: 105642714 105647368
HBR: 110633971 110634469 110644015 110653382 110661711
MESC: 110615566 110621032 110622868
POP: 18098446 7478869 7486837
PEU: 105120049 105125228 105135723 105136420
PALZ: 118034932 118041138 118060868
JRE: 109000498 109007770 109018735
CILL: 122304074 122317167
CAVE: 132170919 132186813
QSU: 111988490 112000967
QLO: 115972550 115979922
TWL: 120011465
VVI: 100247781 100253874
VRI: 117918322 117930702
SLY: 101267355
SPEN: 107008621
SOT: 102604891
SSTN: 125868220
SDUL: 129886015
CANN: 107839757
LBB: 132598527
NTA: 107784593 107795081 107827926
NSY: 104224933 104241015
NTO: 104086604
NAU: 109234067 109236817
INI: 109165868 109174582
ITR: 116028090 116032601
SIND: 105169008
OEU: 111382213 111384888 111410790
EGT: 105978175
SSPL: 121742142 121743530 121755927 121755985 121758898
SMIL: 131022088
SHIS: 125190705 125222959
APAN: 127252512
HAN: 110885065 110915563
ECAD: 122595537
LSV: 111890722
CCAV: 112517443
DCR: 108202420
CSIN: 114266873 114307536
RVL: 131308746 131326497
AEW: 130758899 130779665 130785452 130785909
BVG: 104890618
SOE: 110787251
CQI: 110701254 110736579
ATRI: 130817811 130828424
MOF: 131152949
NNU: 104585579 104607195
MING: 122063719
PSOM: 113334522 113358034
OSA: 4327916
DOSA: Os01t0286100-01(Os01g0286100)
OBR: 102711850
OGL: 127777410
BDI: 100823250 100844358
ATS: 109750422
TDC: 119323988 119364251
TAES: 123110986 123180361 123190549
LPER: 127342591 127346894
LRD: 124646530 124647683 124664805
SBI: 110433966 8071295
ZMA: 100382453 103641361
SITA: 101757582 101773457
SVS: 117847462
PVIR: 120672004 120697388 120706604
PHAI: 112884077 112894423
PDA: 103697220 103714720 103720128
EGU: 105035562 105040114 105059744
MUS: 103985843 103993869
DCT: 110113204
PEQ: 110022360
AOF: 109843010 109848277
MSIN: 131224765 131230212
NCOL: 116262366
ATR: 18430168
SMO: SELMODRAFT_114141(PIF3)
PPP: 112275291 112286119 112291418 112294434
 » show all
Reference
PMID:9845368
  Authors
Ni M, Tepperman JM, Quail PH.
  Title
PIF3, a phytochrome-interacting factor necessary for normal photoinduced signal transduction, is a novel basic helix-loop-helix protein.
  Journal
Cell 95:657-67 (1998)
DOI:10.1016/S0092-8674(00)81636-0
  Sequence
[ath:AT1G09530]
Reference
PMID:10797009
  Authors
Martinez-Garcia JF, Huq E, Quail PH
  Title
Direct targeting of light signals to a promoter element-bound transcription factor.
  Journal
Science 288:859-63 (2000)
DOI:10.1126/science.288.5467.859
  Sequence
[ath:AT1G09530]

  All links  
Ontology (2)   
   KEGG BRITE (2)   
Pathway (4)   
   KEGG PATHWAY (4)   
Gene (315)   
   KEGG GENES (305)   
   KEGG MGENES (3)   
   RefGene (5)   
   OC (2)   
Literature (2)   
   PubMed (2)   
All databases (323)   

Download RDF
DBGET integrated database retrieval system