KEGG   ORTHOLOGY: K14284
Entry
K14284                      KO                                     

Name
NXF, TAP, MEX67
Definition
nuclear RNA export factor
Pathway
ko03008  Ribosome biogenesis in eukaryotes
ko03013  RNA transport
ko03015  mRNA surveillance pathway
ko05014  Amyotrophic lateral sclerosis
ko05164  Influenza A
ko05168  Herpes simplex virus 1 infection
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:ko00001]
 09120 Genetic Information Processing
  09122 Translation
   03013 RNA transport
    K14284  NXF, TAP, MEX67; nuclear RNA export factor
   03015 mRNA surveillance pathway
    K14284  NXF, TAP, MEX67; nuclear RNA export factor
   03008 Ribosome biogenesis in eukaryotes
    K14284  NXF, TAP, MEX67; nuclear RNA export factor
 09160 Human Diseases
  09172 Infectious disease: viral
   05164 Influenza A
    K14284  NXF, TAP, MEX67; nuclear RNA export factor
   05168 Herpes simplex virus 1 infection
    K14284  NXF, TAP, MEX67; nuclear RNA export factor
  09164 Neurodegenerative disease
   05014 Amyotrophic lateral sclerosis
    K14284  NXF, TAP, MEX67; nuclear RNA export factor
 09180 Brite Hierarchies
  09182 Protein families: genetic information processing
   03019 Messenger RNA biogenesis
    K14284  NXF, TAP, MEX67; nuclear RNA export factor
   03009 Ribosome biogenesis
    K14284  NXF, TAP, MEX67; nuclear RNA export factor
Messenger RNA biogenesis [BR:ko03019]
 Eukaryotic type
  mRNA surveillance and transport factors
   Transport factors
    Nuclear pore complex
     K14284  NXF, TAP, MEX67; nuclear RNA export factor
   mRNA cycle factors
    Stress granule specific factors
     K14284  NXF, TAP, MEX67; nuclear RNA export factor
Ribosome biogenesis [BR:ko03009]
 Eukaryotic type
  Pre-60S particles
   Export and cytoplasmic maturation factors
    K14284  NXF, TAP, MEX67; nuclear RNA export factor
Other DBs
TC: 3.A.18.1 3.A.22.1 1.I.1.1
Genes
HSA: 10482(NXF1) 55998(NXF5) 56000(NXF3) 56001(NXF2) 728343(NXF2B)
PTR: 100610724(NXF5) 100611904 451267(NXF1) 465774(NXF3) 735423
PPS: 100978865(NXF5) 100985902 100987014(NXF3) 100995719(NXF1)
GGO: 101128539(NXF1) 101143267(NXF5) 101145461 101146896 101154480(NXF3)
PON: 100437514 100449073(NXF1) 100451207(NXF5) 100454300 100460986(NXF3)
NLE: 100582874(NXF1) 100598965 100599996 100604276(NXF3)
MCC: 693880 695351(NXF3) 706140 718420(NXF1)
MCF: 101865792(NXF1) 102132398(NXF2) 102133037(NXF2B) 102133156 102146918(NXF3)
CSAB: 103232373 103232389 103232394 103232396(NXF3) 103233854(NXF1)
RRO: 104657745 104664213 104678266(NXF3) 104679330(NXF1) 115898698
CJC: 100386998 100397387(NXF3) 100399719(NXF1) 100414986(NXF2B)
SBQ: 101032616(NXF3) 101037624(NXF1) 101040989
MMU: 170722(Nxf7) 245610(Nxf3) 53319(Nxf1) 83454(Nxf2)
RNO: 302591(Nxf3) 308653(Nxf2) 501621(Nxf7) 59087(Nxf1) 680025(Nxf5)
HGL: 101699957(Nxf1) 101708221(Nxf2b)
PTG: 102962664 102965530(NXF3) 102965633(NXF1) 102966668(NXF2B)
BTA: 512136(NXF1) 523530(NXF3) 613789(NXF2) 615581(NXF3) 785244
CHX: 102177698 102182285(NXF3) 102183400(NXF2B) 102186192(NXF1)
CDK: 105091509(NXF1)
BACU: 102997145(NXF3) 103009735 103020946(NXF1)
DLE: 111170887(NXF3) 111171143 111183845(NXF1)
EPZ: 103545444 103558948(NXF1) 103559758(NXF3) 103566147(NXF5)
HAI: 109376052(NXF3) 109377472 109384235(NXF1) 109389566(NXF5)
DRO: 112296854 112296855(NXF3) 112317185(NXF1) 112321362(NXF5)
RAY: 107501584(NXF1) 107506262 107519684(NXF3)
MJV: 108392981 108393639(NXF1)
MDO: 100010859(NXF1)
SHR: 100918153(NXF1)
PCW: 110195408(NXF1)
OAA: 103166937(NXF1)
GGA: 101748079(NXF1)
ACYG: 106029518
TGU: 115492082(NXF1)
LSR: 110478856(NXF1)
FPG: 101920344
FCH: 102055536
NNI: 104020654(NXF1)
AAM: 106491461(NXF1)
ASN: 102374093(NXF1)
AMJ: 102564521(NXF1) 106737160
PSS: 102446109(NXF1)
CMY: 102929361(NXF1)
CPIC: 101933834(NXF1)
ACS: 100552817
PVT: 110081002(NXF1)
PBI: 103063999(NXF1)
PMUR: 107292431(NXF1)
TSR: 106553550
PMUA: 114586821(NXF1)
GJA: 107115206(NXF1)
XLA: 108713918(nxf1.L) 108717690 432035(nxf1.S)
XTR: 100490733 734058(nxf1)
NPR: 108794524(NXF1)
DRE: 323865(nxf1) 751719(nxf1a)
PHYP: 113529362 113541528(nxf1)
TRU: 101078622(nxf1)
LCO: 104925535(nxf1)
NCC: 104968006(nxf1)
MZE: 101464671(nxf1)
ONL: 100704151(nxf1)
OLA: 101172252(nxf1)
XMA: 102222705(nxf1)
XCO: 114139402(nxf1)
PRET: 103471442(nxf1)
CVG: 107087912(nxf1)
NFU: 107377521(nxf1)
KMR: 108231413(zgc:153681)
ALIM: 106515852(nxf1)
AOCE: 111576375(nxf1)
CSEM: 103390831(nxf1)
POV: 109640031(nxf1)
LCF: 108872558(nxf1)
SDU: 111232716(nxf1)
SLAL: 111655825(nxf1)
HCQ: 109511958(nxf1)
BPEC: 110158932(nxf1)
MALB: 109955377(nxf1)
ELS: 105010949(nxf1) 105026736
SFM: 108925402(nxf1)
PKI: 111834735(nxf1)
LCM: 102357219(NXF1)
CMK: 103173353(nxf1)
RTP: 109923474(nxf1)
CIN: 100176525
SPU: 586399
APLC: 110979242
SKO: 100373311
DME: Dmel_CG1664(sbr) Dmel_CG31501(nxf4) Dmel_CG32135(Nxf3)
DSE: 6617590
DSI: Dsimw501_GD16011(Dsim_sbr) Dsimw501_GD19931(Dsim_GD19931) Dsimw501_GD29338(Dsim_GD29338)
DVI: 6631403
MDE: 101892060
LCQ: 111684943
DPA: 109536665
HAW: 110376462
BTAB: 109043430
FCD: 110856155
TUT: 107368479
DPTE: 113791563
CSCU: 111639068
PTEP: 107456009
CEL: CELE_C15H11.3(nxf-1) CELE_C15H11.6(nxf-2)
CBR: CBG04621(Cbr-nxf-2) CBG04623(Cbr-nxf-1)
BMY: Bm1_10740
TSP: Tsp_03999
PCAN: 112570102
CRG: 105322156
MYI: 110464295
OBI: 106881596
SHX: MS3_03341
EGL: EGR_04877
NVE: 5510737
EPA: 110233946
ADF: 107345014
AMIL: 114946822
PDAM: 113674180
SPIS: 111339613
DGT: 114522222
HMG: 100214173
AQU: 100640489
QSU: 112013341
SCE: YPL169C(MEX67)
ERC: Ecym_2373
KMX: KLMA_30457(MEX67)
NCS: NCAS_0C01210(NCAS0C01210)
NDI: NDAI_0K01220(NDAI0K01220)
TPF: TPHA_0D01390(TPHA0D01390)
TBL: TBLA_0B03720(TBLA0B03720)
TDL: TDEL_0A06440(TDEL0A06440)
KAF: KAFR_0A03970(KAFR0A03970) KAFR_0B03080(KAFR0B03080)
PIC: PICST_85667(MEX67)
CAL: CAALFM_CR04050CA(MEX67)
SLB: AWJ20_74(MEX67)
NCR: NCU09317
NTE: NEUTE1DRAFT72776(NEUTE1DRAFT_72776)
MGR: MGG_04430
SSCK: SPSK_08711
MAW: MAC_03014
MAJ: MAA_04170
CMT: CCM_06267
MBE: MBM_02565
ANI: AN2737.2
ANG: ANI_1_550014(An01g04310)
ABE: ARB_04614
TVE: TRV_00896
PTE: PTT_09472
SPO: SPBC1921.03c(mex67)
CNE: CNI03520
CNB: CNBH3360
ABP: AGABI1DRAFT114891(AGABI1DRAFT_114891)
ABV: AGABI2DRAFT191117(AGABI2DRAFT_191117)
MGL: MGL_0232
MRT: MRET_1081
DFA: DFA_04663
EHI: EHI_035490(17.t00035) EHI_080900(251.t00008) EHI_182830(28.t00012)
TCR: 506127.20
NGR: NAEGRDRAFT_67690(AM44)
 » show all
Reference
  Authors
Levesque L, Guzik B, Guan T, Coyle J, Black BE, Rekosh D, Hammarskjold ML, Paschal BM
  Title
RNA export mediated by tap involves NXT1-dependent interactions with the nuclear pore complex.
  Journal
J Biol Chem 276:44953-62 (2001)
DOI:10.1074/jbc.M106558200
  Sequence
[mmu:53319]
Reference
  Authors
Hautbergue GM, Hung ML, Golovanov AP, Lian LY, Wilson SA
  Title
Mutually exclusive interactions drive handover of mRNA from export adaptors to TAP.
  Journal
Proc Natl Acad Sci U S A 105:5154-9 (2008)
DOI:10.1073/pnas.0709167105
  Sequence
[hsa:10482]
Reference
  Authors
Braun IC, Rohrbach E, Schmitt C, Izaurralde E
  Title
TAP binds to the constitutive transport element (CTE) through a novel RNA-binding motif that is sufficient to promote CTE-dependent RNA export from the nucleus.
  Journal
EMBO J 18:1953-65 (1999)
DOI:10.1093/emboj/18.7.1953
  Sequence
[hsa:10482]

DBGET integrated database retrieval system