KEGG   ORTHOLOGY: K01148
Entry
K01148                      KO                                     

Name
PARN, PNLDC1
Definition
poly(A)-specific ribonuclease [EC:3.1.13.4]
Pathway
ko03018  RNA degradation
Disease
H00507  Dyskeratosis congenita
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:ko00001]
 09120 Genetic Information Processing
  09123 Folding, sorting and degradation
   03018 RNA degradation
    K01148  PARN, PNLDC1; poly(A)-specific ribonuclease
 09180 Brite Hierarchies
  09182 Protein families: genetic information processing
   03019 Messenger RNA biogenesis
    K01148  PARN, PNLDC1; poly(A)-specific ribonuclease
Enzymes [BR:ko01000]
 3. Hydrolases
  3.1  Acting on ester bonds
   3.1.13  Exoribonucleases producing 5'-phosphomonoesters
    3.1.13.4  poly(A)-specific ribonuclease
     K01148  PARN, PNLDC1; poly(A)-specific ribonuclease
Messenger RNA biogenesis [BR:ko03019]
 Eukaryotic type
  mRNA degradation factors
   3'-5' decay
    Other 3'-5' decay factors
     K01148  PARN, PNLDC1; poly(A)-specific ribonuclease
Other DBs
GO: 0004535
Genes
HSA: 154197(PNLDC1) 5073(PARN)
PTR: 453936(PARN) 463111(PNLDC1)
PPS: 100986002(PARN) 100992111(PNLDC1)
GGO: 101146526(PNLDC1) 101150804(PARN)
PON: 100172259(PARN) 100173475(PNLDC1)
NLE: 100586640(PNLDC1) 100598246(PARN)
MCC: 707835(PNLDC1) 712984(PARN)
MCF: 102118442(PNLDC1) 102119460(PARN)
CSAB: 103228729(PARN) 103240827(PNLDC1)
RRO: 104664873 104666420(PNLDC1) 104670120 104670340
RBB: 108516170(PNLDC1) 108523758(PARN)
CJC: 100388797(PNLDC1) 100394289(PARN)
SBQ: 101034109(PARN) 101052910(PNLDC1)
MMU: 240023(Pnldc1) 74108(Parn)
MCAL: 110284098(Pnldc1) 110311785(Parn)
MPAH: 110329518(Parn) 110338358(Pnldc1)
RNO: 360464(Parn) 361478(Pnldc1)
MUN: 110547874(Pnldc1) 110556852(Parn)
CGE: 100762328(Pnldc1) 100771839(Parn)
NGI: 103731559(Parn) 103734800(Pnldc1)
HGL: 101709845(Pnldc1) 101715275(Parn)
CCAN: 109682986(Pnldc1) 109694360(Parn)
OCU: 100351489(PARN) 100357330(PNLDC1)
TUP: 102473091(PARN) 102498089(PNLDC1)
CFA: 479839(PARN) 484065(PNLDC1)
VVP: 112923341(PARN) 112935142(PNLDC1)
AML: 100469832(PARN) 100478756(PNLDC1)
UMR: 103660901(PNLDC1) 103668616(PARN)
UAH: 113259622(PNLDC1) 113270774(PARN)
ORO: 101370054(PARN) 101382142(PNLDC1)
FCA: 101097241(PNLDC1) 101100021(PARN)
PTG: 102950961(PNLDC1) 102959344(PARN)
PPAD: 109245389(PNLDC1) 109278360(PARN)
AJU: 106965974(PNLDC1) 106970567(PARN)
BTA: 524155(PARN) 615807(PNLDC1)
BOM: 102283407(PNLDC1) 102287848(PARN)
BIU: 109563599(PNLDC1) 109578580(PARN)
BBUB: 102391386(PARN) 102411464(PNLDC1)
CHX: 102171479(PARN) 102183329(PNLDC1)
OAS: 101111555(PNLDC1) 101112185(PARN)
SSC: 100152694(PNLDC1) 100515887(PARN)
CFR: 102505693(PARN) 102510511(PNLDC1)
CDK: 105091385(PARN) 105100384(PNLDC1)
BACU: 103009247(PNLDC1) 103017586(PARN)
LVE: 103076055(PARN) 103076640(PNLDC1)
OOR: 101285176(PARN) 101286303(PNLDC1)
DLE: 111163471(PARN) 111167578(PNLDC1)
ECB: 100050655(PARN) 100058786(PNLDC1)
EPZ: 103551167(PARN) 103558455(PNLDC1)
EAI: 106842041(PNLDC1) 106847167(PARN)
MYB: 102243649(PARN) 102262108(PNLDC1)
MYD: 102753760(PARN) 102756543(PNLDC1)
MNA: 107524349(PARN) 107535724(PNLDC1)
HAI: 109394002(PNLDC1) 109395237(PARN)
DRO: 112297413(PNLDC1) 112314903(PARN)
PALE: 102887262(PNLDC1) 102891690(PARN)
RAY: 107502512(PARN) 107514732(PNLDC1)
MJV: 108396280(PARN) 108400565(PNLDC1)
LAV: 100654816(PARN) 100663740(PNLDC1)
MDO: 100024540(PARN) 100032453(PNLDC1)
SHR: 100915402(PARN) 100925885(PNLDC1)
PCW: 110198320(PARN) 110208610(PNLDC1)
OAA: 100074145(PARN) 100078828(PNLDC1)
GGA: 416423(PARN) 428595(PNLDC1)
MGP: 100544728(PARN) 100550227(PNLDC1)
CJO: 107311529(PNLDC1) 107320526(PARN)
NMEL: 110395867(PNLDC1) 110405678(PARN)
APLA: 101793853(PARN) 101795326(PNLDC1)
ACYG: 106039548(PNLDC1) 106041221(PARN)
TGU: 100219669(PARN) 100225677(PNLDC1)
LSR: 110474528(PARN) 110476045(PNLDC1)
SCAN: 103817721(PARN) 103820559(PNLDC1)
GFR: 102035929(PNLDC1) 102040201(PARN)
FAB: 101813477(PNLDC1) 101816393(PARN)
PHI: 102100419(PARN) 102104864(PNLDC1)
PMAJ: 107201941(PNLDC1) 107211023(PARN)
CCAE: 111927668(PNLDC1) 111935952(PARN)
CCW: 104684717(PARN) 104690370(PNLDC1)
ETL: 114058254(PARN) 114059591(PNLDC1)
FPG: 101913740(PARN) 101917319(PNLDC1)
FCH: 102047367(PNLDC1) 102055624(PARN)
CLV: 102086728(PARN) 102087047(PNLDC1)
EGZ: 104124818(PNLDC1) 104126964(PARN)
NNI: 104013808(PNLDC1) 104023454(PARN)
ACUN: 113478669(PNLDC1) 113485578(PARN)
PADL: 103917573(PARN) 103918332(PNLDC1)
AAM: 106482599(PARN) 106486820(PNLDC1)
ASN: 102378208(PNLDC1) 102379982(PARN)
AMJ: 102562455(PARN) 102564350(PNLDC1)
PSS: 102445710(PNLDC1) 102459670(PARN)
CMY: 102934548(PARN) 102934939(PNLDC1)
CPIC: 101944137(PNLDC1) 101945694(PARN)
ACS: 100560800(parn) 100561016(pnldc1)
PVT: 110087522(PNLDC1) 110089115(PARN)
PBI: 103052772(PARN) 103065585 112542099(PNLDC1)
PMUR: 107283983(PARN) 107297600(PNLDC1)
TSR: 106537701(PNLDC1) 106551929(PARN)
PMUA: 114584148(PARN) 114594305(PNLDC1)
GJA: 107109308(PARN) 107111944(PNLDC1)
XLA: 108703108(parn.S) 394409(parn.L)
XTR: 733861(parn)
NPR: 108791728(PARN)
DRE: 791461(parn)
SRX: 107758387(parn)
SANH: 107678313(parn)
CCAR: 109056816(parn)
IPU: 108258427
PHYP: 113546251
AMEX: 103033684(parn)
EEE: 113591422(parn)
TRU: 101073849(parn)
LCO: 104921157(parn)
NCC: 104965444(parn)
MZE: 101487719(parn)
ONL: 100696935(parn)
OLA: 101157188(parn)
XMA: 102229964(parn)
XCO: 114144717(parn)
PRET: 103482010(parn)
CVG: 107097054(parn)
NFU: 107390028(parn)
KMR: 108242963(parn)
ALIM: 106535143(parn)
AOCE: 111587654(parn)
CSEM: 103383457(parn)
POV: 109639601(parn)
LCF: 108901174
SDU: 111216593(parn)
SLAL: 111651291(parn)
HCQ: 109511437(parn)
BPEC: 110168537(parn)
MALB: 109973316(parn)
OTW: 112238771
SALP: 112076703(parn)
ELS: 105029847(parn)
SFM: 108929598(parn)
PKI: 111836889(parn)
LCM: 102359649(PARN)
CMK: 103187090(parn)
RTP: 109927693(parn)
CIN: 100177286
AGA: AgaP_AGAP007399(PARN)
AALB: 109418078
PCF: 106784599
NVI: 100123255
CSOL: 105362171
BMOR: 100301509(Parn) 101738496
PVM: 113802336
DPTE: 113796902
CEL: CELE_K10C8.1(parn-1)
CBR: CBG08556
OBI: 106868305
HMG: 100200659
AQU: 109580255
ATH: AT1G55870(AHG2) AT3G25430 AT3G25440(LOH1)
LJA: Lj0g3v0302439.1(Lj0g3v0302439.1) Lj1g3v3597190.1(Lj1g3v3597190.1) Lj1g3v3597190.2(Lj1g3v3597190.2) Lj6g3v0497370.1(Lj6g3v0497370.1)
DOSA: Os04t0492900-01(Os04g0492900) Os08t0440200-01(Os08g0440200)
MNG: MNEG_3922
APRO: F751_5277
MIS: MICPUN_64130(CAF1.1)
NCR: NCU07559
NTE: NEUTE1DRAFT82678(NEUTE1DRAFT_82678)
MGR: MGG_05172
SSCK: SPSK_05164
MBE: MBM_03354
ANG: ANI_1_1346184(An04g09062)
ABE: ARB_03295
TVE: TRV_02523
PTE: PTT_06908
PCB: PCHAS_131060(PC000337.02.0)
TAN: TA14515
TPV: TP02_0676
BBO: BBOV_II007020(18.m06581)
SMIN: v1.2.019042.t1(symbB.v1.2.019042.t1) v1.2.031103.t1(symbB.v1.2.031103.t1)
SPAR: SPRG_10440
 » show all
Reference
  Authors
Gao M, Fritz DT, Ford LP, Wilusz J
  Title
Interaction between a poly(A)-specific ribonuclease and the 5' cap influences mRNA deadenylation rates in vitro.
  Journal
Mol Cell 5:479-88 (2000)
DOI:10.1016/S1097-2765(00)80442-6
  Sequence
[hsa:5073]
Reference
  Authors
Anastasakis D, Skeparnias I, Shaukat AN, Grafanaki K, Kanellou A, Taraviras S, Papachristou DJ, Papakyriakou A, Stathopoulos C
  Title
Mammalian PNLDC1 is a novel poly(A) specific exonuclease with discrete expression during early development.
  Journal
Nucleic Acids Res 44:8908-8920 (2016)
DOI:10.1093/nar/gkw709
  Sequence
[hsa:154197]

DBGET integrated database retrieval system