KEGG   ORTHOLOGY: K01971Help
Entry
K01971                      KO                                     

Name
ligD
Definition
bifunctional non-homologous end joining protein LigD [EC:6.5.1.1]
Pathway
ko03450  Non-homologous end-joining
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:ko00001]
 09120 Genetic Information Processing
  09124 Replication and repair
   03450 Non-homologous end-joining
    K01971  ligD; bifunctional non-homologous end joining protein LigD
 09180 Brite Hierarchies
  09182 Protein families: genetic information processing
   03400 DNA repair and recombination proteins
    K01971  ligD; bifunctional non-homologous end joining protein LigD
Enzymes [BR:ko01000]
 6. Ligases
  6.5  Forming phosphoric-ester bonds
   6.5.1  Ligases that form phosphoric-ester bonds (only sub-subclass identified to date)
    6.5.1.1  DNA ligase (ATP)
     K01971  ligD; bifunctional non-homologous end joining protein LigD
DNA repair and recombination proteins [BR:ko03400]
 Prokaryotic Type
  DSBR (double strand breaks repair)
   NHEJ (non-homologous end-joining)
    Two-component NHEJ DNA repair complex
     K01971  ligD; bifunctional non-homologous end joining protein LigD
BRITE hierarchy
Other DBs
RN: R00381
COG: COG1793 COG3285
GO: 0003910
Genes
XCC: XCC0105 XCC2307(lig3)
XCB: XC_0109 XC_1808
XCA: xcc-b100_0115(dnl) xcc-b100_1871(lig2)
XCP: XCR_0122(ligD) XCR_2579(ligD)
XCV: XCV2612(lig3)
XAX: XACM_2420(lig3)
XAC: XAC2414(lig3)
XCI: XCAW_02080(cDC9)
XCT: J151_02587
XCJ: J158_02577
XOM: XOO2587(XOO2587)
XOP: PXO_00421
XPH: XppCFBP6546_00915(XppCFBP6546P_00915)
XVA: C7V42_10080(ligD)
SMT: Smal_0026
STEN: CCR98_00115(ligD)
STEM: CLM74_00130(ligD) CLM74_11060(ligD)
PSUW: WQ53_07800
PSD: DSC_15030
LCP: LC55x_2573(ligD)
LGU: LG3211_2416(ligD)
LEZ: GLE_3698(ligD)
LUM: CNR27_02880(ligD)
DKO: I596_2244
PAE: PA2138
PAEV: N297_2205(ligD)
PAEI: N296_2205(ligD)
PAP: PSPA7_3173(ligD)
PAF: PAM18_2902(ligD)
PNC: NCGM2_3118(ligD)
PAEB: NCGM1900_4345(ligD)
PDK: PADK2_14980(ligD)
PSG: G655_14430(ligD)
PRP: M062_11085(ligD)
PAEP: PA1S_15010(ligD)
PAEM: U769_14610(ligD)
PAEL: T223_16290(ligD)
PAEU: BN889_02343(ligD)
PAEG: AI22_18760(ligD)
PAEC: M802_2202(ligD)
PAEO: M801_2204(ligD)
PMY: Pmen_3217
PMK: MDS_2413
PPU: PP_3260(ligD)
PPF: Pput_2501
PPT: PPS_2715
PPB: PPUBIRD1_2515(ligD)
PPX: T1E_5615
PPUH: B479_13240(ligD)
PPUT: L483_11550(ligD) L483_17380(ligD)
PPUN: PP4_30630(ligD)
PPUD: DW66_2974
PMON: X969_12915(ligD)
PMOT: X970_12560(ligD)
POR: APT59_10325(ligD)
PSB: Psyr_3245(ligD)
PSYR: N018_16280(ligD)
PAMG: BKM19_019020(ligD)
PAVL: BKM03_11910(ligD)
PFS: PFLU_2911
PFE: PSF113_2698(ligD) PSF113_2933(ligD2)
PFC: PflA506_1430(ligD_2) PflA506_2574(ligD_1)
PFW: PF1751_v1c25520(ligD)
PFF: PFLUOLIPICF724270(ligD)
PFX: A7318_14040(ligD)
PPZ: H045_08195(ligD)
PFB: VO64_0156
PMAN: OU5_5917
PTV: AA957_01010(ligD)
PAZO: AYR47_21750(ligD)
POI: BOP93_13240(ligD)
PEN: PSEEN2767
PSA: PST_2130
PSZ: PSTAB_2018(ligD)
PSC: A458_10100(ligD)
PSJ: PSJM300_09695(ligD)
PSTU: UIB01_11265(ligD)
PSTT: CH92_11295(ligD)
PSV: PVLB_14550(ligD)
PSK: U771_15340(ligD)
PCH: EY04_14070(ligD)
PCP: JM49_15955(ligD)
PRH: LT40_12535(ligD)
PSW: LK03_18305(ligD)
PPV: NJ69_06730(ligD)
PSES: PSCI_3759(ligD)
PSEM: TO66_14815(ligD)
PKR: AYO71_18905(ligD)
PANR: A7J50_2741
PSIL: PMA3_17285(ligD)
CBU: CBU_1934
CBS: COXBURSA331_A2135(ligD)
CBG: CbuG_0044
CBC: CbuK_0042
LPC: LPC_1974
LPA: lpa_03649
LLO: LLO_1004
LHA: LHA_0995
LOK: Loa_02404 Loa_02538(ligD)
TMC: LMI_2571(ligD)
HBE: BEI_0346(ligD1) BEI_0347(ligD2)
SVA: SVA_1768
RPI: Rpic_0501
RPJ: N234_33275(ligD) N234_37775(ligD)
RMN: TK49_07020(ligD)
REH: H16_B2352(h16_B2352)
CGD: CR3_4453
CCUP: BKK81_30045(ligD)
CUP: BKK80_26310(ligD)
CUH: BJN34_34075(ligD) BJN34_36625(ligD)
BPS: BPSS2211
BPD: BURPS668_A3112(ligD)
BPSE: BDL_5683(ligD)
BPSM: BBQ_3897(ligD)
BPSU: BBN_5703(ligD)
BPSD: BBX_4850(ligD)
BPK: BBK_4987(ligD)
BPSH: DR55_5522(ligD)
BPSA: BBU_3781(ligD)
BPSO: X996_5293(ligD)
BUT: X994_4842(ligD)
BVE: AK36_5227(ligD)
BCN: Bcen_1346
BCEN: DM39_7047(ligD)
BCEW: DM40_5175(ligD)
BCEO: I35_7581
BAM: Bamb_5610
BMU: Bmul_5476
BMK: DM80_5695(ligD)
BMUL: NP80_5544(ligD)
BCED: DM42_7098(ligD)
BDL: AK34_5177(ligD)
BCON: NL30_32850
BLAT: WK25_16550
BTEI: WS51_27065
BSEM: WJ12_16950
BPSL: WS57_15615
BMEC: WJ16_17055
BSTG: WT74_19350
BGU: KS03_2023(ligD)
BGO: BM43_2577(ligD)
BUK: MYA_5305
BXE: Bxe_A2328
BXB: DR64_32(ligD)
BFN: OI25_3429(ligD) OI25_7262(ligD)
PHS: C2L64_08955(ligD) C2L64_44895(ligD) C2L64_48635(ligD)
PTER: C2L65_08420(ligD) C2L65_36455(ligD) C2L65_43735(ligD)
PPNO: DA70_13185
PPNM: LV28_17515
PAPI: SG18_11950
PLG: NCTC10937_02207(ligD)
BBR: BB2845
BBX: BBS798_2675(ligD)
BPT: Bpet3441
BOH: AKI39_06670(ligD)
AXY: AXYL_00438(ligD1) AXYL_06730(ligD2)
AXS: LH59_19425(ligD)
ADT: APT56_19400(ligD)
ASW: CVS48_18805(ligD)
PUT: PT7_1514
AMIM: MIM_c30320
ODI: ODI_R4157
RFR: Rfer_4361
POL: Bpro_3003
AAV: Aave_2519
AJS: Ajs_2523
AAA: Acav_2693
DAC: Daci_4339
DHK: BO996_19460(ligD)
VAA: AX767_14310(ligD)
VBO: CKY39_14585(ligD)
RTA: Rta_07780
OTK: C6570_11240(ligD)
HYB: Q5W_13765(ligD)
DPY: BA022_07305(ligD)
SIMP: C6571_07475(ligD)
MELM: C7H73_09480(ligD)
MPT: Mpe_B0011
JAZ: YQ44_08770(ligD)
JSV: CNX70_19225(ligD)
CFU: CFU_1974
MNR: ACZ75_08315(ligD)
MASW: AM586_12130(ligD)
MASZ: C9I28_12940(ligD)
MTIM: DIR46_02775(ligD)
RGE: RGE_26430(ligD)
MIU: ABE85_05760(ligD)
RGU: A4W93_03945(ligD)
AON: DEH84_14965(ligD)
PBH: AAW51_3125(ligD)
NLC: EBAPG3_007500(ligD)
TBD: Tbd_2247
EBA: ebA6655
AZO: azo1741
AZA: AZKH_2968(ligD)
AOA: dqs_1891
GBM: Gbem_0128(ligD)
GEO: Geob_0336(ligD)
GEM: GM21_0109
GEB: GM18_0111
SUR: STAUR_6997(ligD)
SCL: sce3523
CCRO: CMC5_008840(ligC) CMC5_051300(ligD)
HOH: Hoch_3330
BBA: Bd2252(lig)
BBAT: Bdt_2206(lig)
BBW: BDW_07900
BBAC: EP01_07520
MES: Meso_1150
PLA: Plav_2977
SIX: BSY16_4362(ligD) BSY16_4675(ligD) BSY16_4677(ligD) BSY16_6219(ligD)
ARA: Arad_9488
AVI: Avi_8017(ligD)
AGC: BSY240_2160(ligD)
OAN: Oant_4315
OAH: DR92_3927(ligD)
BJA: bll6773(ligD) blr8022
BRA: BRADO5823
BRS: S23_15390
AOL: S58_17960
BRK: CWS35_34490(ligD)
RPA: RPA3650
RPB: RPB_1876
RPC: RPC_3685
RPE: RPE_3724
NWI: Nwi_0353
OCA: OCAR_6912
XAU: Xaut_4365
AZC: AZC_1006
SNO: Snov_0819
MNO: Mnod_7647
MOR: MOC_5433(ligD) MOC_5434
MAQU: Maq22A_1p35160(cdc9) Maq22A_c23495(cdc9)
BID: Bind_0382
RVA: Rvan_0633
PHL: KKY_1733
MSC: BN69_1443
MMED: Mame_02200
RBM: TEF_06740
CAK: Caul_1769
CSE: Cseg_3113
BVC: CEP68_04590(ligD)
RSP: RSP_2679
PDE: Pden_4186
PYE: A6J80_22380(ligD)
PARU: CYR75_01430(ligD)
PAMN: pAMV3p0281(ykoU2)
CID: P73_3679
MALG: MALG_00291
GEH: HYN69_13965(ligD)
NAR: Saro_1695
SPHP: LH20_17000
SGI: SGRAN_4135(ligD)
SPHO: C3E99_17090(ligD)
SPHD: HY78_04315
SPHM: G432_04400
STAX: MC45_16320
SPHI: TS85_18230
SPHC: CVN68_12350(ligD) CVN68_22110(ligD)
SJP: SJA_C1-12900(lig)
SSY: SLG_04290
SPMI: K663_11060
SPHR: BSY17_3129(ligD) BSY17_3243(ligD) BSY17_64(ligD)
SINB: SIDU_07840
SHYD: CJD35_17960(ligD) CJD35_18040(ligD) CJD35_21155(ligD)
SYA: A6768_22625(ligD)
BLAS: BSY18_2878(ligD)
RDI: CMV14_20985(ligD)
ELI: ELI_04125
EFV: CHH26_13895(ligD)
AAY: WYH_02746(ykoU)
GDI: GDI0169
GDJ: Gdia_2239
GXL: H845_105
KEU: S101446_00724(ligD)
TMO: TMO_a0311
NAO: Y958_29475(ligD) Y958_30480(ligD)
PHR: C6569_04930(ligD)
BSU: BSU13400(ligD)
BSR: I33_1508(ykoU)
BSL: A7A1_1484
BSH: BSU6051_13400(ykoU)
BSY: I653_06870(ligD)
BSUT: BSUB_01458(ykoU)
BSUL: BSUA_01458(ykoU)
BSUS: Q433_07660(ligD)
BSS: BSUW23_06875(ligD)
BST: GYO_1664(ykoU)
BSO: BSNT_07827(ligD)
BSN: BSn5_18735(ligD)
BSQ: B657_13400(ykoU)
BSX: C663_1379(ykoU)
BLI: BL03626(ykoU)
BLD: BLi01494(ykoU)
BLH: BaLi_c15730(ykoU)
BAY: RBAM_013180(ykoU)
BAQ: BACAU_1295(ligD)
BYA: BANAU_1254(ligD)
BAMP: B938_06845(ligD)
BAML: BAM5036_1253(ykoU)
BAMA: RBAU_1296(ykoU)
BAMN: BASU_1275(ykoU)
BAMB: BAPNAU_2446(ligD)
BAMT: AJ82_07560(ligD)
BAMY: V529_12680(ligD)
BMP: NG74_01370(ykoU)
BAO: BAMF_1421(ykoU)
BAZ: BAMTA208_10445(ykoU)
BQL: LL3_01440(ykoU)
BXH: BAXH7_02135(ligD)
BQY: MUS_1417(ligD)
BAMI: KSO_012785(ligD)
BAMC: U471_13370
BAMF: U722_07040(ligD)
BAE: BATR1942_04430(ligD)
BATR: TD68_03940(ligD)
BHA: BH2209
BCL: ABC1601
BPU: BPUM_1666
BPUM: BW16_09190
BPUS: UP12_08580
BPF: BpOF4_18445(ligD)
BCK: BCO26_1265(ligD)
BAG: Bcoa_3265
BCOA: BF29_289(ligD)
BJS: MY9_1468
BACI: B1NLA3E_13055(ligD)
BMET: BMMGA3_09875(ykoU)
BACW: QR42_08520
BACP: SB24_03120(ligD)
BACB: OY17_09685(ligD)
BACO: OXB_3302
BACY: QF06_05715(ligD)
BACL: BS34A_14860(ligD)
BALM: BsLM_1418
BGY: BGLY_1426
BKW: BkAM31D_15790(ykoU)
BALT: CFN77_09130(ligD)
BACS: AUL54_03950(ligD)
OIH: OB3034
HHD: HBHAL_4934(ligD)
VIL: CFK37_12580(ligD)
VNE: CFK40_07975(ligD)
VPN: A21D_01871(ykoU)
PPM: PPSC2_01885(lig) PPSC2_05990(ykoU)
PPO: PPM_0359(lig) PPM_1132(ykoU)
AAD: TC41_1544(lig) TC41_1545(lig)
SIV: SSIL_2188
SOB: CSE16_07755(ligD)
CSS: Cst_c16030(ligD1) Cst_c16040(ligD2) Cst_c16050
CSD: Clst_1549(ligD1) Clst_1550(ligD2)
CCEL: CCDG5_0620
CPY: Cphy_1729
HSD: SD1D_1921
DSY: DSY0616
DHD: Dhaf_0568
DRM: Dred_1986
PTH: PTH_1243(CDC9) PTH_1244
SGY: Sgly_0962
HMO: HM1_3130
TMR: Tmar_1127
SAY: TPY_1568
THX: Thet_1965
TIT: Thit_1868
TKI: TKV_c19040(ligD)
CHY: CHY_0025
MTA: Moth_2082
TPZ: Tph_c08080(ligD1) Tph_c09930(ligD2)
TTM: Tthe_0704
TSH: Tsac_1306
MTU: Rv0938(ligD)
MTV: RVBD_0938
MTC: MT0965
MRA: MRA_0946
MTUR: CFBS_0986
MTD: UDA_0938
MTUB: MT7199_0957(ligD)
MTUC: J113_06570
MTUH: I917_06615
MTUL: TBHG_00923
MTUT: HKBT1_0986
MTUU: HKBT2_0987
MBO: BQ2027_MB0963(ligd)
MBB: BCG_0992
MBT: JTY_0962
MBX: BCGT_0751
MAF: MAF_09470
MMIC: RN08_1046
MPA: MAP_0880
MAO: MAP4_2980
MAVI: RC58_14795
MAVU: RE97_14820
MAV: MAV_1056
MAVD: NF84_04590
MAVR: LA63_04695
MAVA: LA64_04705
MID: MIP_01544
MUL: MUL_4434
MJL: Mjls_4732
MMI: MMAR_4573
MHAD: B586_06195
MVA: Mvan_4915
MGI: Mflv_1828
MFT: XA26_13320(ligD)
MVQ: MYVA_4735
MAB: MAB_1033
MABB: MASS_1028
MABO: NF82_05205
MCHE: BB28_05145
MSTE: MSTE_01004
ASD: AS9A_4180(ligD)
CVA: CVAR_1338(ligD)
REY: O5Y_21290
RHB: NY08_3398
GBR: Gbro_4532
TPR: Tpau_0201
SCO: SCO5308(SC6G9.25) SCO6498(SC1E6.07) SCO7345(SC4G10.24c)
SMA: SAVERM_2946(ligD)
SCT: SCAT_5459
SBH: SBI_06360
STRP: F750_2702(ligD) F750_4841(ligD)
SFI: SFUL_5134
STRM: M444_23395
SLE: sle_12820(sle_12820) sle_24320(sle_24320) sle_65450(sle_65450)
SLAU: SLA_5154
KSK: KSE_05320
CMI: CMM_2074
CMC: CMN_02036(ligD)
MTS: MTES_3162
ART: Arth_0294
ARM: ART_3548
ARX: ARZXY2_3628(lig)
ACH: Achl_0520
BCV: Bcav_0653
XCE: Xcel_2233
IDO: I598_0187
MPH: MLP_04810(ligD) MLP_31940
MGG: MPLG2_2831(ligD)
NDA: Ndas_0258
NAL: B005_3125(ligD)
ACE: Acel_1670
NML: Namu_0128
AMD: AMED_3255(lig) AMED_4189(lig) AMED_4197(lig) AMED_5203(lig) AMED_5275(lig)
AMM: AMES_3220(lig) AMES_4139(lig) AMES_4147(lig) AMES_5141(lig) AMES_5213(lig)
AMZ: B737_3220(lig) B737_4139(lig) B737_4147(lig) B737_5141(lig) B737_5213(lig)
AOI: AORI_1870(lig) AORI_1871(lig) AORI_4401(lig) AORI_4514(lig) AORI_5517(lig)
PSEE: FRP1_24830
AHG: AHOG_12440(ykoU1) AHOG_20405
CWO: Cwoe_4716
ELE: Elen_1951
DFO: Dform_00676(ligD) Dform_01625(ligD)
STI: Sthe_0314
PCU: pc1833
PUV: PUV_10690
PLH: VT85_02045(ykoU)
LIL: LA_0984(cdc9)
LIE: LIF_A0796(cdc9)
LIC: LIC_12677
LIS: LIL_12764(cdc)
LST: LSS_19308
ACA: ACP_3506
FLN: FLA_6428
PHE: Phep_1702
PGS: CPT03_07335(ligD)
MUC: MuYL_0888
CHU: CHU_2837
GFO: GFO_0300
FJO: Fjoh_3303
ZPR: ZPR_3654
MARM: YQ22_16380
CBAL: M667_13175
MLT: VC82_553
FLU: CHH17_05575(ligD)
NMV: NITMOv2_2657(ykoU)
NJA: NSJP_1173(ligD)
AFU: AF_1725
GAH: GAH_01512
MPD: MCP_2125
RCI: RCIX1966
VG: 22109413(PPF1_42) 26737567(AWJ26_gp36)
 » show all
TaxonomyVtaxonomyKoalaUniProt
Reference
  Authors
Weller GR, Kysela B, Roy R, Tonkin LM, Scanlan E, Della M, Devine SK, Day JP, Wilkinson A, d'Adda di Fagagna F, Devine KM, Bowater RP, Jeggo PA, Jackson SP, Doherty AJ.
  Title
Identification of a DNA nonhomologous end-joining complex in bacteria.
  Journal
Science 297:1686-9 (2002)
DOI:10.1126/science.1074584
  Sequence
[bsu:BSU13400]
Reference
  Authors
Wang ST, Setlow B, Conlon EM, Lyon JL, Imamura D, Sato T, Setlow P, Losick R, Eichenberger P
  Title
The forespore line of gene expression in Bacillus subtilis.
  Journal
J Mol Biol 358:16-37 (2006)
DOI:10.1016/j.jmb.2006.01.059
  Sequence
[bsu:BSU13400]
Reference
  Authors
Moeller R, Stackebrandt E, Reitz G, Berger T, Rettberg P, Doherty AJ, Horneck G, Nicholson WL
  Title
Role of DNA repair by nonhomologous-end joining in Bacillus subtilis spore resistance to extreme dryness, mono- and polychromatic UV, and ionizing radiation.
  Journal
J Bacteriol 189:3306-11 (2007)
DOI:10.1128/JB.00018-07
  Sequence
[bsu:BSU13400]

DBGET integrated database retrieval system