KEGG   ORTHOLOGY: K01982Help
Entry
K01982            RNA       KO                                     

Name
LSUrRNA
Definition
large subunit ribosomal RNA
Pathway
ko03008  Ribosome biogenesis in eukaryotes
ko03010  Ribosome
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:ko00001]
 Genetic Information Processing
  Translation
   03010 Ribosome
    K01982  LSUrRNA; large subunit ribosomal RNA
   03008 Ribosome biogenesis in eukaryotes
    K01982  LSUrRNA; large subunit ribosomal RNA
Ribosome [BR:ko03011]
 Ribosomal RNAs
  Eukaryotes
   K01982  LSUrRNA; large subunit ribosomal RNA
Non-coding RNAs [BR:ko03100]
 Ribosomal RNA
  Large subunit rRNA
   K01982  LSUrRNA; large subunit ribosomal RNA
BRITE hierarchy
Genes
HSA: 4550(RNR2)
PTR: 16S_rRNA
PPS: l-rRNA
GGO: l-rRNA
PON: l-rRNA
NLE: 16S_rRNA
MCC: l-rRNA
MCF: LSU_rRNA
CSAB: l-rRNA
RRO: l-rRNA
CJC: 16S_rRNA
SBQ: l-rRNA
MMU: 17725(mt-Rnr2) 236598(Rn28s1)
RNO: 100861535(Rn28s) 170603(Rnr2)
CGE: l-rRNA
NGI: l-rRNA
HGL: l-rRNA
OCU: 16S_rRNA
CFA: l-rRNA
AML: l-rRNA
UMR: 16S_rRNA
FCA: l-rRNA
PTG: 102950713
BTA: l-rRNA
BOM: 16S_rRNA
PHD: l-rRNA
CHX: l-rRNA
OAS: 16S_rRNA
SSC: 16S_rRNA
CFR: l-rRNA
LVE: l-rRNA
ECB: l-rRNA
MYB: 16S_rRNA
MYD: 16S_rRNA
PALE: l-rRNA
LAV: l-rRNA
MDO: 16S_rRNA
SHR: l-rRNA
OAA: 16S_rRNA
MGP: l-rRNA
CJO: 16S_rRNA
APLA: l-rRNA
TGU: l-rRNA
FAB: l-rRNA
PHI: l-rRNA
CCW: l-rRNA
FPG: 16S_rRNA
FCH: 16S_rRNA
CLV: l-rRNA
ASN: 16S_rRNA
AMJ: 16S_rRNA
PSS: l-rRNA
CMY: l-rRNA
ACS: l-rRNA
PBI: l-rRNA
GJA: 26044417(APQ53_gr01)
XLA: 16S_rRNA
XTR: l-rRNA
DRE: 140506(mt-rnr2)
TRU: 16S_rRNA
TNG: 16S_rRNA
MZE: 26037632(APK84_gr01)
OLA: l-rRNA
XMA: l-rRNA
SASA: 16S_rRNA
LCM: l-rRNA
CMK: l-rRNA
BFO: l-rRNA
CIN: 10251010(rrnL)
SPU: l-rRNA
SKO: l-rRNA
DME: Dmel_CR45844(28SrRNA:CR45844) lrRNA
DER: Dere_GG26129(Dere_28SrRNA:GG26129)
DSE: l-rRNA
DSI: l-rRNA
DYA: l-rRNA
MDE: 16S_rRNA
AGA: l-rRNA
CQU: l-rRNA
SOC: l-rRNA
TCA: l-rRNA
BMOR: l-rRNA
PXY: 16S_rRNA
API: l-rRNA
DPX: LSU_rRNA
CEL: CELE_F31C3.9(rrn-3.1) l-rRNA
CBR: l-rRNA
BMY: LSU_rRNA
LOA: l-rRNA
TSP: l-rRNA
CRG: l-rRNA-2
SMM: l-rRNA
ADF: l-rRNA
HMG: 6904232(lsu-rRNA)
TAD: TradoM_r01(rnl) TradoM_r02(rnl)
AQU: l-rRNA
ATH: ArthCr087(rrn23S) ArthCr089 ArthMr001(rrn26)
EUS: ASK66_gr002(rrn23S) ASK66_gr007(rrn23S)
BNA: 11542100(rrn23S) 4237953(rrn26)
CIT: 4271152(CisiCr007) 4271178(CisiCr002)
GRA: 11538529(A6772_cr002) 11538541(A6772_cr007) 27429563(rrn26) 27429586(rrn26)
EGR: 9829711(rrn23) 9845767(EucgrC_r007)
GMX: 15308569(rrnL) 3989348(rrn23) 3989371(rrn23)
PVU: PhvuCr108(rrn23) PhvuCr118(rrn23)
MTR: A0S16_gr03(rrnL) MetrCr003
CAM: 6797497(CiarC_r002)
FVE: 10251573(rrn23) 10251596(rrn23)
PMUM: 18681167(CP95_r007) 18681173(CP95_r002)
MDM: 13630222(26rrn) 13630223(26rrn)
CSV: 11123881(rrnL) 11123916(rrnL) 3429367(23SrRNA) 3429368(23SrRNA)
RCU: 10221390(rrn26) 11542372(rrn23) 11542395(rrn23)
JCU: 7636394(rrn23) 7636405(rrn23)
VVI: 4025070(ViviCr002) 4025079(ViviCr007) 7498722(26Srrn)
SLY: 108175346 3950431(LyesC2r002) 3950432(LyesC2r007)
SOT: 4099938(SotuCr002) 4099943(SotuCr007)
INI: 29200393(rrnL) 29200425(rrn23) 29200428(rrn23)
SIND: 11452467(rrn23) 11452491(rrn23)
BVG: 809469(rrn26) 809541(rrn26) 809567(rrn26)
NNU: 20964224(rrn23) 20964235(rrn23) 28482640(rRNA26) 28482679(rRNA26)
OSA: 3131367(OrsajCr114) 3131377(OrsajCr119) 6450145(rrn26)
BDI: 6439784(BrdiC_r002) 6439831(BrdiC_r007)
ZMA: 100275739 1466351(ZemaCr114) 1466356(ZemaCr119)
SITA: 19526841(W841_r002) 19526863(W841_r007)
PDA: 26S_rRNA 8890584(rrn23) 8890609(rrn23)
EGU: 12079453(rrn23) 12079480(rrn23)
ATR: 2546493(AmtrCr002) 2546556(rrn23S)
SMO: SemoP_r002(rrn23) SemoP_r007(rrn23)
CRE: ChreCr004(rrnL) ChreCr007(rrnL)
OTA: OstapCr02(rrl) OstapCr05(rrl) OstapMr03(rrl) OstapMr04(rrl)
MIS: MicpuN_chl56(rrl2) MicpuN_chl9(rrl1) MicpuN_mit11(rrl_1) MicpuN_mit41(rrl_2)
CSL: CospCoM_r01(rrnL) CospP_r001(rrl)
CVR: ChvaP_r001(rrnL) OJ20_r02(rrnL)
APRO: CP73_r001(rrn23) ChprMr001(rnl)
GSL: JL72_r002(rrn5) JL72_r005(rrn23) JL72_r01(rrnL)
CCP: CHC_180(rrl) ChcroMr26(rnl)
CGR: CAGL0L13365r CaglfMr13(21S_rRNA)
KAF: KAFR_RDN25-1(RDN25-1)
DHA: LSU_rRNA(LSU)
CAL: CAALFM_CR08810WA(RDN25) CaalfMr16(rnl)
YLI: YalifMr30
PAN: PoanfMr55(rnl)
ANI: ANID_20049(rnl)
ANG: Asnifr02
PNO: SNOGr01
DDI: DidioMr42(rnlA)
PCB: BN827_A500(rrl) MAL9_28S_rRNA(MAL9_28S:rRNA) chab5_28s_rRNA(chab5_28s:rRNA)
TPV: TP05_0046
TET: TepyoMr47(rnl_b_1) TepyoMr50(rnl_b_2)
AAF: AuanCr002(rrn23S)
PSOJ: PhsooMr01
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TaxonomyKoalaUniProt
Reference
  Authors
Poll G, Braun T, Jakovljevic J, Neueder A, Jakob S, Woolford JL Jr, Tschochner H, Milkereit P
  Title
rRNA maturation in yeast cells depleted of large ribosomal subunit proteins.
  Journal
PLoS One 4:e8249 (2009)
DOI:10.1371/journal.pone.0008249

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