KEGG   ORTHOLOGY: K03469Help
Entry
K03469                      KO                                     

Name
rnhA, RNASEH1
Definition
ribonuclease HI [EC:3.1.26.4]
Pathway
ko03030  DNA replication
Disease
H01118  Progressive external ophthalmoplegia (PEO)
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:ko00001]
 09120 Genetic Information Processing
  09124 Replication and repair
   03030 DNA replication
    K03469  rnhA, RNASEH1; ribonuclease HI
 09180 Brite Hierarchies
  09182 Protein families: genetic information processing
   03032 DNA replication proteins
    K03469  rnhA, RNASEH1; ribonuclease HI
Enzymes [BR:ko01000]
 3. Hydrolases
  3.1  Acting on ester bonds
   3.1.26  Endoribonucleases producing 5'-phosphomonoesters
    3.1.26.4  ribonuclease H
     K03469  rnhA, RNASEH1; ribonuclease HI
DNA replication proteins [BR:ko03032]
 Eukaryotic Type
  DNA Replication Elongation Factors
   RNase H
    K03469  rnhA, RNASEH1; ribonuclease HI
 Prokaryotic Type
  DNA Replication Elongation Factors
   Elongation factors (bacterial)
    RNase H
     K03469  rnhA, RNASEH1; ribonuclease HI
   Elongation factors (archaeal)
    RNase H
     K03469  rnhA, RNASEH1; ribonuclease HI
BRITE hierarchy
Other DBs
COG: COG0328
GO: 0004523
Genes
HSA: 246243(RNASEH1)
PTR: 743012(RNASEH1)
PPS: 100976623(RNASEH1)
GGO: 101128405(RNASEH1)
PON: 100451030(RNASEH1)
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RBB: 108520802(RNASEH1)
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SBQ: 101028347(RNASEH1)
MMU: 19819(Rnaseh1)
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CDK: 105094024(RNASEH1)
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LVE: 103090364(RNASEH1)
OOR: 101276346(RNASEH1) 101283005
ECB: 100072832(RNASEH1)
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EAI: 106847500(RNASEH1)
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MYD: 102775519(RNASEH1)
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MGP: 100547875(RNASEH1)
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CPIC: 101954070(RNASEH1)
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ECX: EcHS_A0219(rnhA)
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ECY: ECSE_0210
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ECK: EC55989_0213(rnhA)
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ECOJ: P423_01140
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EFE: EFER_0243(rnhA)
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STY: HCM2.0109c STY0284(rnhA)
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STM: STM0263(rnhA)
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SEJ: STMUK_0265(rnhA)
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SEF: UMN798_0287(rnhA)
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SENR: STMDT2_02591(rnhA)
SEND: DT104_02621(rnhA)
SENI: CY43_01320
SPT: SPA2506(rnhA)
SEK: SSPA2337
SEI: SPC_0273(rnhA)
SEC: SCH_0259(rnhA)
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SHB: SU5_0906
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SEE: SNSL254_A0288(rnhA)
SEW: SeSA_A0293(rnhA)
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SENS: Q786_01375
SED: SeD_A0286(rnhA)
SEG: SG0261(rnhA)
SEL: SPUL_2719(rnhA)
SEGA: SPUCDC_2705(rnhA)
SET: SEN0265(rnhA)
SENA: AU38_01340
SENO: AU37_01340
SENV: AU39_01340
SENQ: AU40_01515
SENL: IY59_01365
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SFX: S0208(rnhA)
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SBO: SBO_0203(rnhA)
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CRO: ROD_02191(rnhA)
CAMA: F384_01105
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BPN: BPEN_231(rnhA)
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SBW: TGUWTKB_0770(rnhA)
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PSTS: E05_03650(rnhA)
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XOP: PXO_02469(rnhA)
XOY: AZ54_19380(rnhA)
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VNI: VIBNI_A2478(rnhA)
VAN: VAA_03551
VAU: VANGNB10_cI2021(rnhA)
VTA: B0336
VFI: VF_1936(rnhA) VF_A0524
VFM: VFMJ11_2071(rnhA)
VSA: VSAL_I2399(rnhA)
AWD: AWOD_I_1319(rnhA) AWOD_I_2054(rnhA)
PPR: PBPRA1876 PBPRA2918(PLU0942)
PAE: PA1815(rnhA)
PAEV: N297_1870
PAEI: N296_1870
PAU: PA14_41060(rnhA)
PAP: PSPA7_3481(rnhA)
PAG: PLES_35121(rnhA)
PAF: PAM18_3229(rnhA)
PNC: NCGM2_2727(rnhA)
PAEB: NCGM1900_4683(rnhA)
PDK: PADK2_16590(rnhA)
PSG: G655_16080(rnhA)
PRP: M062_09495(rnhA)
PAEP: PA1S_16885(rnhA)
PAEM: U769_16600(rnhA)
PAEL: T223_17940(rnhA)
PAEU: BN889_01955(rnhA)
PAEG: AI22_17105(rnhA)
PAEC: M802_1868
PAEO: M801_1869
PMK: MDS_2219
PRE: PCA10_36710(rnhA)
PPSE: BN5_2216(rnhA)
PALC: A0T30_10630(rnhA)
PCQ: PcP3B5_22200(rnhA)
PPU: PP_4142(rnhA)
PPF: Pput_1723
PPT: PPS_3539
PPB: PPUBIRD1_1707(rnhA)
PPI: YSA_08564
PPX: T1E_4124(rnhA)
PPUH: B479_17625(rnhA)
PPUT: L483_23055(rnhA)
PPUN: PP4_16140(rnhA)
PPUD: DW66_3986
PMON: X969_16925(rnhA)
PMOT: X970_16575(rnhA)
PMOS: O165_014360(rnhA)
POR: APT59_10920(rnhA)
PST: PSPTO_3712(rnhA)
PSB: Psyr_1763(rnhA)
PSYR: N018_17460(rnhA)
PSP: PSPPH_1712(rnhA)
PFL: PFL_3297(rnhA)
PPRC: PFLCHA0_c33270(rnhA)
PPRO: PPC_3321(rnhA)
PFS: PFLU_2645
PFC: PflA506_2452(rnhA)
PFN: HZ99_04360(rnhA)
PFW: PF1751_v1c23110(rnhA)
PFF: PFLUOLIPICF725160(rnhA)
PPZ: H045_06905(rnhA)
PFB: VO64_5734
PMAN: OU5_0675(rnhA)
PTV: AA957_02015(rnhA)
PCG: AXG94_04035(rnhA)
PAZO: AYR47_20065(rnhA)
PEN: PSEEN3559(rnhA)
PSA: PST_2252(rnhA)
PSZ: PSTAB_2137(rnhA)
PSR: PSTAA_2279(rnhA)
PSC: A458_09525(rnhA)
PSJ: PSJM300_10215(rnhA)
PSTU: UIB01_10720(rnhA)
PSTT: CH92_12040(rnhA)
PBM: CL52_08945(rnhA)
PBC: CD58_12730(rnhA)
PPUU: PputUW4_02879(rnhA)
PDR: H681_10850(rnhA)
PSV: PVLB_08615(rnhA)
PSK: U771_14315(rnhA)
PKC: PKB_2001(rnhA)
PCH: EY04_13000(rnhA)
PCP: JM49_16950(rnhA)
PFZ: AV641_16280(rnhA)
PRH: LT40_02200(rnhA)
PSW: LK03_14300(rnhA)
PPV: NJ69_09850(rnhA)
PSES: PSCI_3604(rnhA)
PSEM: TO66_13710(rnhA)
PSEC: CCOS191_1687(rnhA)
PPSY: AOC04_13640(rnhA)
PSOS: POS17_2774(rnhA)
PKR: AYO71_13580(rnhA)
PANR: A7J50_2407
PSET: THL1_3627
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AVD: AvCA6_29600(rnhA)
ACX: Achr_18260(rnhA)
PBB: AKN87_01990(rnhA)
SON: SO_2560(rnhA)
SAZ: Sama_1881
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SVO: SVI_2385(rnhA-1) SVI_3069(rnhA-2)
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PAT: Patl_2365
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PSEO: OM33_08730
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PART: PARC_a2598(rnhA)
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NOC: Noc_2815
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TNI: TVNIR_2724(rnhA_[H])
TTI: THITH_13185(rnhA)
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SPIU: SPICUR_07060(rnhA)
EBS: ECTOBSL9_0180(rnhA)
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CSA: Csal_1942
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APAC: S7S_09815
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KKO: Kkor_1930
KGE: TQ33_0610
TOL: TOL_1843
AHA: AHA_1568(rnhA)
AHY: AHML_08670(rnhA)
ASA: ASA_2788(rnhA)
AVR: B565_1320
AMED: B224_3600
ASR: WL1483_1777(rnhA)
ACAV: VI35_06730
TAU: Tola_0911
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DNO: DNO_1102(rnhA)
SLIM: SCL_1858
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SEDS: AAY24_07515(rnhA)
RMA: Rmag_0374
VOK: COSY_0352(rnhA)
EBH: BSEPE_1013(rnhA)
BCI: BCI_0474(rnhA)
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ENM: EBS_1349(rnhA)
NME: NMB1618(rnhA)
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RSE: F504_1850
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REH: H16_A2466(rnhA)
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BMAL: DM55_2736
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BMAF: DM51_530
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BPS: BPSL1342(rnhA)
BPM: BURPS1710b_1600(rnhA)
BPL: BURPS1106A_1496(rnhA)
BPD: BURPS668_1466(rnhA)
BPR: GBP346_A1500(rnhA)
BPSE: BDL_674
BPSM: BBQ_2100
BPSU: BBN_2226
BPSD: BBX_2614
BPZ: BP1026B_I2197(rnhA)
BPK: BBK_178
BPSH: DR55_3255
BPSA: BBU_851
BPSO: X996_2862
BUT: X994_1322
BTE: BTH_I2790(rnhA)
BTQ: BTQ_1229
BTJ: BTJ_1204
BTZ: BTL_2439
BTD: BTI_2489
BTV: BTHA_2625
BTHE: BTN_2219
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SMER: DU99_04715
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REP: IE4803_CH00971(rnhA-1) IE4803_CH02399(rnhA-2)
REI: IE4771_CH01011(rnhA-1) IE4771_CH02487(rnhA-2)
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TaxonomyVtaxonomyKoalaUniProt
Reference
  Authors
Usongo V, Nolent F, Sanscartier P, Tanguay C, Broccoli S, Baaklini I, Drlica K, Drolet M
  Title
Depletion of RNase HI activity in Escherichia coli lacking DNA topoisomerase I leads to defects in DNA supercoiling and segregation.
  Journal
Mol Microbiol 69:968-81 (2008)
DOI:10.1111/j.1365-2958.2008.06334.x
  Sequence
[eco:b0214]
Reference
  Authors
Wu H, Sun H, Liang X, Lima WF, Crooke ST
  Title
Human RNase H1 is associated with protein P32 and is involved in mitochondrial pre-rRNA processing.
  Journal
PLoS One 8:e71006 (2013)
DOI:10.1371/journal.pone.0071006
  Sequence
[hsa:246243]
Reference
  Authors
Ohtani N, Yanagawa H, Tomita M, Itaya M
  Title
Identification of the first archaeal Type 1 RNase H gene from Halobacterium sp. NRC-1: archaeal RNase HI can cleave an RNA-DNA junction.
  Journal
Biochem J 381:795-802 (2004)
DOI:10.1042/BJ20040153
  Sequence
[hal:VNG_0255C]

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