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KEGG   ORTHOLOGY: K03583
Entry
K03583                      KO                                     
Symbol
recC
Name
exodeoxyribonuclease V gamma subunit [EC:3.1.11.5]
Pathway
map03440  Homologous recombination
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:ko00001]
 09120 Genetic Information Processing
  09124 Replication and repair
   03440 Homologous recombination
    K03583  recC; exodeoxyribonuclease V gamma subunit
 09180 Brite Hierarchies
  09182 Protein families: genetic information processing
   03400 DNA repair and recombination proteins
    K03583  recC; exodeoxyribonuclease V gamma subunit
Enzymes [BR:ko01000]
 3. Hydrolases
  3.1  Acting on ester bonds
   3.1.11  Exodeoxyribonucleases producing 5'-phosphomonoesters
    3.1.11.5  exodeoxyribonuclease V
     K03583  recC; exodeoxyribonuclease V gamma subunit
DNA repair and recombination proteins [BR:ko03400]
 Prokaryotic type
  DSBR (double strand breaks repair)
   HR (homologous recombination)
    RecBC pathway proteins
     K03583  recC; exodeoxyribonuclease V gamma subunit
Other DBs
COG: COG1330
GO: 0008854
Genes
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ECJ: JW2790(recC)
ECD: ECDH10B_2992(recC)
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EOI: ECO111_3550(recC)
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EOH: ECO103_3381(recC)
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Reference
PMID:19052323
  Authors
Dillingham MS, Kowalczykowski SC
  Title
RecBCD enzyme and the repair of double-stranded DNA breaks.
  Journal
Microbiol Mol Biol Rev 72:642-71, Table of Contents (2008)
DOI:10.1128/MMBR.00020-08
  Sequence
[eco:b2822]
Reference
PMID:9790841
  Authors
Yu M, Souaya J, Julin DA
  Title
Identification of the nuclease active site in the multifunctional RecBCD enzyme by creation of a chimeric enzyme.
  Journal
J Mol Biol 283:797-808 (1998)
DOI:10.1006/jmbi.1998.2127
  Sequence
[eco:b2822]

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KEGG   ORTHOLOGY: K10771
Entry
K10771                      KO                                     
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DNA repair and recombination proteins [BR:ko03400]
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 » show all
Reference
PMID:20699270
  Authors
Fantini D, Vascotto C, Marasco D, D'Ambrosio C, Romanello M, Vitagliano L, Pedone C, Poletto M, Cesaratto L, Quadrifoglio F, Scaloni A, Radicella JP, Tell G
  Title
Critical lysine residues within the overlooked N-terminal domain of human APE1 regulate its biological functions.
  Journal
Nucleic Acids Res 38:8239-56 (2010)
DOI:10.1093/nar/gkq691
  Sequence
[hsa:328]
Reference
PMID:19401441
  Authors
Barnes T, Kim WC, Mantha AK, Kim SE, Izumi T, Mitra S, Lee CH
  Title
Identification of Apurinic/apyrimidinic endonuclease 1 (APE1) as the endoribonuclease that cleaves c-myc mRNA.
  Journal
Nucleic Acids Res 37:3946-58 (2009)
DOI:10.1093/nar/gkp275
  Sequence
[hsa:328] [rno:79116]

  All links  
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KEGG   ORTHOLOGY: K10772
Entry
K10772                      KO                                     
Symbol
APEX2
Name
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 09180 Brite Hierarchies
  09182 Protein families: genetic information processing
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    K10772  APEX2; AP endonuclease 2
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     K10772  APEX2; AP endonuclease 2
DNA repair and recombination proteins [BR:ko03400]
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     K10772  APEX2; AP endonuclease 2
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  Authors
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Role of PCNA-dependent stimulation of 3'-phosphodiesterase and 3'-5' exonuclease activities of human Ape2 in repair of oxidative DNA damage.
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Reference
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  Authors
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Fission yeast Uve1 and Apn2 function in distinct oxidative damage repair pathways in vivo.
  Journal
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PMID:18585982
  Authors
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Altered gene expression profiles and higher frequency of spontaneous DNA strand breaks in APEX2-null thymus.
  Journal
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KEGG   ORTHOLOGY: K10746
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Reference
PMID:14676842
  Authors
Nielsen FC, Jager AC, Lutzen A, Bundgaard JR, Rasmussen LJ
  Title
Characterization of human exonuclease 1 in complex with mismatch repair proteins, subcellular localization and association with PCNA.
  Journal
Oncogene 23:1457-68 (2004)
DOI:10.1038/sj.onc.1207265
  Sequence
[hsa:9156]
Reference
PMID:11102356
  Authors
Kirkpatrick DT, Ferguson JR, Petes TD, Symington LS
  Title
Decreased meiotic intergenic recombination and increased meiosis I nondisjunction in exo1 mutants of Saccharomyces cerevisiae.
  Journal
Genetics 156:1549-57 (2000)
  Sequence
[sce:YOR033C]
Reference
PMID:15629726
  Authors
Cotta-Ramusino C, Fachinetti D, Lucca C, Doksani Y, Lopes M, Sogo J, Foiani M
  Title
Exo1 processes stalled replication forks and counteracts fork reversal in checkpoint-defective cells.
  Journal
Mol Cell 17:153-9 (2005)
DOI:10.1016/j.molcel.2004.11.032
  Sequence
[sce:YOR033C]

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K01141                      KO                                     
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   03430 Mismatch repair
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  09182 Protein families: genetic information processing
   03400 DNA repair and recombination proteins
    K01141  sbcB, exoI; exodeoxyribonuclease I
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