KEGG   ORTHOLOGY: K03678Help
Entry
K03678                      KO                                     

Name
RRP45, EXOSC9
Definition
exosome complex component RRP45
Pathway
ko03018  RNA degradation
Module
M00391  Exosome, eukaryotes
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:ko00001]
 09120 Genetic Information Processing
  09123 Folding, sorting and degradation
   03018 RNA degradation
    K03678  RRP45, EXOSC9; exosome complex component RRP45
 09180 Brite Hierarchies
  09182 Protein families: genetic information processing
   03019 Messenger RNA Biogenesis
    K03678  RRP45, EXOSC9; exosome complex component RRP45
KEGG modules [BR:ko00002]
 Structural complex
  Genetic information processing
   RNA processing
    M00391  Exosome, eukaryotes
     K03678  RRP45, EXOSC9; exosome complex component RRP45
Messenger RNA biogenesis [BR:ko03019]
 Eukaryotic Type
  mRNA degradation factors
   3'-5' decay
    Core exosome factors
     K03678  RRP45, EXOSC9; exosome complex component RRP45
BRITE hierarchy
Other DBs
COG: COG2123
Genes
HSA: 5393(EXOSC9)
PTR: 741653(EXOSC9)
PPS: 100987100(EXOSC9)
GGO: 101129398(EXOSC9)
PON: 100452434(EXOSC9)
NLE: 100587975(EXOSC9)
MCC: 707368(EXOSC9)
MCF: 102123036(EXOSC9)
CSAB: 103236202(EXOSC9)
RRO: 104661790(EXOSC9)
RBB: 108515586(EXOSC9)
CJC: 100388650(EXOSC9)
SBQ: 101053890(EXOSC9)
MMU: 50911(Exosc9)
RNO: 294975(Exosc9)
CGE: 100759081(Exosc9)
NGI: 103746958(Exosc9)
HGL: 101718139(Exosc9)
CCAN: 109702212(Exosc9)
OCU: 100355640(EXOSC9)
TUP: 102476624(EXOSC9)
CFA: 476093(EXOSC9)
AML: 100482524(EXOSC9)
UMR: 103661797(EXOSC9)
ORO: 101363911(EXOSC9)
FCA: 101088836(EXOSC9)
PTG: 102958383(EXOSC9)
AJU: 106977097(EXOSC9) 106988241
BTA: 508005(EXOSC9)
BOM: 102273601(EXOSC9)
BIU: 109560206(EXOSC9)
PHD: 102324224(EXOSC9) 102325070
CHX: 102187847(EXOSC9)
OAS: 101108309(EXOSC9)
SSC: 100521809(EXOSC9)
CFR: 102512765(EXOSC9)
CDK: 105093658(EXOSC9)
BACU: 103019361(EXOSC9)
LVE: 103073708(EXOSC9)
OOR: 101272828(EXOSC9)
ECB: 100063958(EXOSC9)
EPZ: 103559560(EXOSC9)
EAI: 106834073(EXOSC9)
MYB: 102252284(EXOSC9)
MYD: 102759114(EXOSC9)
HAI: 109396623(EXOSC9)
RSS: 109452468(EXOSC9)
PALE: 102893843(EXOSC9)
LAV: 100654693(EXOSC9)
TMU: 101358963
MDO: 100011147(EXOSC9)
SHR: 100916940(EXOSC9)
OAA: 100082337(EXOSC9)
GGA: 619530(EXOSC9)
MGP: 100538471(EXOSC9)
CJO: 107313564(EXOSC9)
APLA: 101792563(EXOSC9)
ACYG: 106042450(EXOSC9)
TGU: 100221921(EXOSC9) 100226665
GFR: 102033014(EXOSC9)
FAB: 101821393(EXOSC9)
PHI: 102105952(EXOSC9)
PMAJ: 107203437(EXOSC9)
CCW: 104693688(EXOSC9)
FPG: 101922917(EXOSC9)
FCH: 102057782(EXOSC9)
CLV: 102093818(EXOSC9)
EGZ: 104129323(EXOSC9)
AAM: 106492063(EXOSC9)
ASN: 102384078(EXOSC9)
AMJ: 102566442(EXOSC9)
PSS: 102444140(EXOSC9)
CMY: 102930768(EXOSC9)
CPIC: 101941916(EXOSC9)
ACS: 100565770(exosc9)
PVT: 110072821(EXOSC9)
PBI: 103067638(EXOSC9)
GJA: 107115398(EXOSC9)
XLA: 443865(exosc9.L)
XTR: 100145275(exosc9)
NPR: 108793712(EXOSC9)
DRE: 450057(exosc9)
SRX: 107746036 107754146(exosc9)
SGH: 107551568(exosc9) 107591532
CCAR: 109055531(exosc9)
IPU: 108260480(exosc9)
AMEX: 103023601(exosc9)
TRU: 101063486 101069941(exosc9)
LCO: 104922816(exosc9)
MZE: 101483125(exosc9)
OLA: 101156627(exosc9)
XMA: 102227859(exosc9)
PRET: 103463790(exosc9)
NFU: 107375325(exosc9)
CSEM: 103384250(exosc9)
LCF: 108900132(exosc9)
HCQ: 109527460(exosc9)
BPEC: 110175156(exosc9)
ELS: 105020844(exosc9)
SFM: 108924423(exosc9)
LCM: 102362509(EXOSC9)
CMK: 103188312(exosc9)
CIN: 100176284
SPU: 583847
APLC: 110984110
SKO: 100369178
DME: Dmel_CG9606(Rrp45)
DSI: Dsimw501_GD15722(Dsim_GD15722)
MDE: 101894278
AAG: 110679386
AME: 551855(GB15723)
BIM: 100748874
BTER: 100642712
SOC: 105193070
AEC: 105144254
ACEP: 105619234
PBAR: 105433078
HST: 105182043
CFO: 105251335
LHU: 105668454
PGC: 109857920
NVI: 100117441
TCA: 662987
DPA: 109535328
NVL: 108569219
PMAC: 106707370
PXY: 105390674
API: 100169585
DNX: 107167225
ZNE: 110833021
FCD: 110846595
TUT: 107364203
CBR: CBG16619(Cbr-exos-9)
TSP: Tsp_00006
CRG: 105348766
MYI: 110449527
OBI: 106872890
SHX: MS3_05401
EPA: 110252535
ADF: 107348721
HMG: 100212566
AQU: 100639813
ATH: AT3G12990(RRP45a) AT3G60500(CER7)
CPAP: 110811840
CIT: 102613621
EGR: 104414033
VRA: 106777618
VAR: 108320827
CCAJ: 109810869
CAM: 101515009
LJA: Lj1g3v4753360.1(Lj1g3v4753360.1)
ADU: 107488383
AIP: 107643143
FVE: 101302011
PPER: 18781541
PMUM: 103326742
PAVI: 110753943
ZJU: 107412457
CSV: 101215027
CMO: 103492017
MCHA: 111021616
CMAX: 111485448
CMOS: 111461486
RCU: 8286126
JRE: 109005327
VVI: 100265860
SLY: 101263517
SPEN: 107018553
SOT: 102588839
CANN: 107870599
NSY: 104246838
NTO: 104104024
SIND: 105170905
OEU: 111411891
OSA: 4329627
DOSA: Os02t0550700-01(Os02g0550700)
OBR: 102712419
BDI: 100832261
ATS: 109761812(LOC109761812) 109763739(LOC109763739)
SBI: 110435026
ZMA: 100384304(cl22768_2) 103638336 103645589
PDA: 103697132
EGU: 105059352
DCT: 110101363
AOF: 109830331
ATR: 18448109
PPP: 112292501
APRO: F751_2326
SCE: YDR280W(RRP45)
ERC: Ecym_4741
KMX: KLMA_30400(RRP45)
NCS: NCAS_0H01580(NCAS0H01580)
NDI: NDAI_0C02040(NDAI0C02040)
TPF: TPHA_0E02160(TPHA0E02160)
TBL: TBLA_0A10310(TBLA0A10310)
TDL: TDEL_0E03380(TDEL0E03380)
KAF: KAFR_0J00440(KAFR0J00440)
CAL: CAALFM_C209160WA(CaO19.4078)
CAUR: QG37_00691
SLB: AWJ20_237(RRP45)
NCR: NCU00334
NTE: NEUTE1DRAFT82175(NEUTE1DRAFT_82175)
MGR: MGG_08860
MAW: MAC_02535
MAJ: MAA_03462
CMT: CCM_07544
MBE: MBM_00352
ANI: AN6111.2
ANG: ANI_1_566104(An12g04560)
ABE: ARB_04947
TVE: TRV_07133
PTE: PTT_17982
CNE: CNC02010
CNB: CNBC5230
ABP: AGABI1DRAFT122693(AGABI1DRAFT_122693)
ABV: AGABI2DRAFT228615(AGABI2DRAFT_228615)
MGL: MGL_1683
DFA: DFA_10863
EHI: EHI_000580(91.t00009)
PYO: PY17X_1141800(PY06726)
PCB: PCHAS_113990(PC000560.01.0)
TAN: TA19335
TPV: TP01_0013
BBO: BBOV_IV000120(21.m02779)
CPV: cgd7_2380
SMIN: v1.2.015823.t1(symbB.v1.2.015823.t1)
NGD: NGA_2011400(RRP45)
SPAR: SPRG_02283
 » show all
TaxonomyKoalaUniProt
Reference
  Authors
Wang HW, Wang J, Ding F, Callahan K, Bratkowski MA, Butler JS, Nogales E, Ke A
  Title
Architecture of the yeast Rrp44 exosome complex suggests routes of RNA recruitment for 3' end processing.
  Journal
Proc Natl Acad Sci U S A 104:16844-9 (2007)
DOI:10.1073/pnas.0705526104
  Sequence
[sce:YDR280W]
Reference
  Authors
Mukherjee D, Gao M, O'Connor JP, Raijmakers R, Pruijn G, Lutz CS, Wilusz J
  Title
The mammalian exosome mediates the efficient degradation of mRNAs that contain AU-rich elements.
  Journal
EMBO J 21:165-74 (2002)
DOI:10.1093/emboj/21.1.165
  Sequence
[hsa:5393]

DBGET integrated database retrieval system