KEGG   ORTHOLOGY: K05590Help
Entry
K05590                      KO                                     

Name
srmB
Definition
ATP-dependent RNA helicase SrmB [EC:3.6.4.13]
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:ko00001]
 09180 Brite Hierarchies
  09182 Protein families: genetic information processing
   03009 Ribosome biogenesis
    K05590  srmB; ATP-dependent RNA helicase SrmB
Enzymes [BR:ko01000]
 3. Hydrolases
  3.6  Acting on acid anhydrides
   3.6.4  Acting on acid anhydrides to facilitate cellular and subcellular movement
    3.6.4.13  RNA helicase
     K05590  srmB; ATP-dependent RNA helicase SrmB
Ribosome biogenesis [BR:ko03009]
 Prokaryotic Type
  rRNA helicases
   K05590  srmB; ATP-dependent RNA helicase SrmB
BRITE hierarchy
Other DBs
COG: COG0513
GO: 0004004
Genes
ECO: b2576(srmB)
ECJ: JW2560(srmB)
ECD: ECDH10B_2744(srmB)
EBW: BWG_2340(srmB)
ECOK: ECMDS42_2121(srmB)
ECE: Z3859(srmB)
ECS: ECs3442
ECF: ECH74115_3813(srmB)
ETW: ECSP_3522(srmB)
ELX: CDCO157_3210
EOJ: ECO26_3623(srmB)
EOI: ECO111_3302(srmB)
EOH: ECO103_3154(srmB)
ECG: E2348C_2853(srmB)
EOK: G2583_3158(srmB)
ECC: c3100(srmB)
ECP: ECP_2578
ECV: APECO1_39552(srmB)
ECX: EcHS_A2732(srmB)
ECW: EcE24377A_2863(srmB)
ECM: EcSMS35_2729(srmB)
ECY: ECSE_2864
ECR: ECIAI1_2690(srmB)
ECQ: ECED1_3007(srmB)
ECK: EC55989_2865(srmB)
ECT: ECIAI39_2781(srmB)
EOC: CE10_3009(srmB)
EUM: ECUMN_2899(srmB)
ECZ: ECS88_2750(srmB)
ELO: EC042_2780(srmB)
ELH: ETEC_2789
ESE: ECSF_2415
ESO: O3O_19120
ESM: O3M_06570
ESL: O3K_06525
EBR: ECB_02470(srmB)
EBD: ECBD_1104
EKF: KO11_09940(srmB)
EAB: ECABU_c28780(srmB)
EDJ: ECDH1ME8569_2503(srmB)
EIH: ECOK1_2920(srmB)
ENA: ECNA114_2649(srmB)
ELW: ECW_m2805(srmB)
ELL: WFL_13725(srmB)
ELC: i14_2895(srmB)
ELD: i02_2895(srmB)
ELP: P12B_c2677(srmB)
EBL: ECD_02470(srmB)
EBE: B21_02434(srmB)
ELF: LF82_2175(srmB)
ECOI: ECOPMV1_02758(srmB)
ECOJ: P423_14085
ECOO: ECRM13514_3403(srmB)
ECOH: ECRM13516_3259(srmB)
ECOS: EC958_2882
EFE: EFER_0497(srmB)
EAL: EAKF1_ch3425c(srmB)
STY: STY2836(srmB)
STT: t0267(srmB)
STM: STM2643(srmB)
SEO: STM14_3240(srmB)
SEY: SL1344_2607(srmB)
SEJ: STMUK_2679(srmB)
SEB: STM474_2756(srmB)
SEF: UMN798_2850(srmB)
SENR: STMDT2_25951(srmB)
SEND: DT104_26971(srmB)
SENI: CY43_14080
SPT: SPA0275(srmB)
SEK: SSPA0260
SEI: SPC_2755(srmB)
SEC: SCH_2648(srmB)
SHB: SU5_03186
SENS: Q786_12820
SED: SeD_A2971
SEG: SG2627(srmB)
SEL: SPUL_0282(srmB)
SEGA: SPUCDC_0282(srmB)
SET: SEN2570(srmB)
SENA: AU38_13015
SENO: AU37_13025
SENV: AU39_13025
SENQ: AU40_14645
SENL: IY59_13370
SEEP: I137_01295
SENE: IA1_12945
SBG: SBG_2361(srmB)
SBZ: A464_2701
SFL: SF2638(srmB)
SFX: S2811(srmB)
SFV: SFV_2639(srmB)
SFE: SFxv_2895(srmB)
SFN: SFy_3748
SFS: SFyv_3825
SFT: NCTC1_02900(srmB)
SSN: SSON_2702(srmB)
SBO: SBO_2606(srmB)
SBC: SbBS512_E2944(srmB)
SDY: SDY_2817(srmB)
ENC: ECL_03914
ECLO: ENC_36840
EEC: EcWSU1_03390(srmB)
ECLX: LI66_16470
ECLY: LI62_18245
ECLZ: LI64_15945
ENF: AKI40_1290(srmB)
ESA: ESA_00682
CSK: ES15_0956(srmB)
CTU: CTU_31670(srmB)
KPN: KPN_02901(srmB)
KPU: KP1_4158(srmB)
KPP: A79E_1201
KPE: KPK_1220(srmB)
KPR: KPR_1372(srmB)
KPJ: N559_1352
KPX: PMK1_00398(srmB)
KPNU: LI86_06530
KPNK: BN49_4110(srmB)
KVA: Kvar_1162
KOX: KOX_27595
KOE: A225_4427
EAE: EAE_00975
EAR: CCG33927
CKO: CKO_00206
CRO: ROD_25231(srmB)
CAMA: F384_14150
HDE: HDEF_0456(srmB)
SECT: A359_04040
EBT: EBL_c09870(srmB)
EBF: D782_1098
PSTS: E05_27320
YPE: YPO2708(srmB)
YPK: y1287(srmB)
YPH: YPC_3142(srmB)
YPA: YPA_2442
YPN: YPN_1196
YPM: YP_2512(srmB2)
YPG: YpAngola_A3601(srmB)
YPZ: YPZ3_2389(srmB)
YPD: YPD4_2323(srmB)
YPX: YPD8_2368(srmB)
YPW: CH59_3593
YPJ: CH55_1458
YPV: BZ15_820
YPL: CH46_2396
YPS: YPTB2900(srmB)
YPO: BZ17_3731
YPI: YpsIP31758_1126(srmB)
YPY: YPK_1179
YPB: YPTS_3011
YPQ: DJ40_3592(srmB)
YPU: BZ21_2201
YPR: BZ20_3275
YPC: BZ23_2483
YPF: BZ19_2268
YEN: YE1007(rbaB)
YEY: Y11_42261
YEW: CH47_422(srmB)
YET: CH48_601
YEE: YE5303_07641(rbaB)
YAL: AT01_3481
YFR: AW19_154(srmB)
YIN: CH53_690
YKR: CH54_1509
YRO: CH64_1521
YRU: BD65_1091
SPE: Spro_3679
SRL: SOD_c36510(srmB)
SPLY: Q5A_019405(srmB_1)
SSZ: SCc_244(srmB)
SMAF: D781_3416
SMW: SMWW4_v1c37800(srmB)
SMAR: SM39_3277(srmB)
SMAC: SMDB11_3067(srmB)
SERF: L085_09725
RAA: Q7S_17340
ECA: ECA3287(srmB)
PATR: EV46_16295
PATO: GZ59_33040(srmB)
PCT: PC1_3080
PEC: W5S_1105
SGL: SG1795
SOD: Sant_1088(srmB)
PES: SOPEG_3224(srmB)
DDD: Dda3937_03841(srmB)
DDQ: DDI_3053
ETA: ETA_09810
EPY: EpC_09940
EPR: EPYR_01052(srmB)
EAM: EAMY_2635(srmB)
EAY: EAM_2525(srmB)
EBI: EbC_34220
EGE: EM595_2719(srmB)
PAM: PANA_2902(srmB)
PLF: PANA5342_1141(srmB)
PAJ: PAJ_2193(srmB)
PVA: Pvag_2324(srmB)
PSTW: DSJ_07080
PLU: plu3349(srmB)
PAY: PAU_01296(srmB)
PMR: PMI1897(srmB)
PMIB: BB2000_2013(srmB)
XBO: XBJ1_3156(srmB)
XBV: XBW1_1653(srmB)
XNE: XNC1_3265(srmB)
XNM: XNC2_3141(srmB)
XDO: XDD1_2818(srmB)
XPO: XPG1_0980(srmB)
PSI: S70_03190
PSX: DR96_3811(srmB)
PRG: RB151_028640(srmB)
MMK: MU9_1649
ETR: ETAE_2731(srmB)
ETD: ETAF_2465(srmB)
ETE: ETEE_0885
PSHI: SAMEA2665130_2617(srmB)
HIN: HI0422(srmB)
HIT: NTHI0546(srmB)
HIU: HIB_05310
HIE: R2846_0158(srmB)
HIZ: R2866_0153(srmB)
HIK: HifGL_000130(srmB)
HIA: H733_0315(srmB)
HIW: NTHI477_01534(srmB)
HIC: NTHIC486_00566(srmB)
HIX: NTHI723_01267(srmB)
HDU: HD_0213(srmB)
HAP: HAPS_2036(srmB)
HPAZ: K756_08820
HPAS: JL26_07740
HPAK: JT17_05005
HSO: HS_1295(srmB)
HSM: HSM_0323
PMU: PM1840(srmB)
PMV: PMCN06_1530(srmB)
PMP: Pmu_14920(srmB)
PMUL: DR93_93
PDAG: 4362423_01993(srmB)
MSU: MS1950(srmB)
MHT: D648_3960
MHAT: B824_22770
MHX: MHH_c09410(srmB)
MHAE: F382_09855
MHAM: J450_08775
MHAO: J451_10075
MHAL: N220_01945
MHAQ: WC39_11910
MHAY: VK67_11915
MVR: X781_3100
MVI: X808_2670
MVG: X874_2780
APL: APL_2008(srmB)
APJ: APJL_2058(srmB)
APA: APP7_2095(srmB)
ASU: Asuc_0024
AAT: D11S_0177
AAN: D7S_01650
AACN: AANUM_0481
BTO: WQG_7400
BTRE: F542_14650
BTRH: F543_16310
BTRA: F544_7750
VCH: VC0660
VCS: MS6_0479
VCE: Vch1786_I0162(srmB)
VCI: O3Y_03085
VCO: VC0395_A0191(srmB)
VCR: VC395_0677(srmB)
VCM: VCM66_0618(srmB)
VVU: VV1_0534
VVY: VV0660
VPA: VP0505
VAG: N646_2658
VSP: VS_0506
VNI: VIBNI_A0312(srmB)
VAN: VAA_00381
VAU: VANGNB10_cI0559c(srmB)
VTA: A2608(srmB)
VFI: VF_0444(srmB)
VSA: VSAL_I0558(srmB)
AWD: AWOD_I_2240(srmB)
PPR: PBPRA0562(STY2836)
SON: SO_0947(srmB)
SDN: Sden_0744
SFR: Sfri_0660
SAZ: Sama_2742
SBL: Sbal_0840
SLO: Shew_0767
SSE: Ssed_0890
SPL: Spea_0802
SHL: Shal_0857
SWD: Swoo_0892
SWP: swp_4231
SVO: SVI_0726(srmB)
SPSW: Sps_02629
ILO: IL2131(srmB)
CPS: CPS_4097(srmB)
PHA: PSHAa0510(srmB)
PAT: Patl_3284
PSM: PSM_A2535(srmB)
PSEO: OM33_06740
PTN: PTRA_a0575(srmB)
PEA: PESP_a0691(srmB)
PSPO: PSPO_a0805(srmB)
PART: PARC_a3348(srmB)
PTU: PTUN_a1081(srmB)
PNG: PNIG_a0609(srmB)
PTD: PTET_a2896(srmB)
PSEN: PNC201_13040(srmB)
AMAL: I607_04295
AMAE: I876_04505
AMAO: I634_04680
AMAD: I636_04525
AMAI: I635_04500
AMAG: I533_04245
AMAC: MASE_04050
AAUS: EP12_04470
GNI: GNIT_0979(srmB)
GPS: C427_1551
PIN: Ping_3036
FBL: Fbal_3074
MVS: MVIS_0502(srmB)
TCX: Tcr_1883
MEJ: Q7A_2927
MEC: Q7C_1247
AHA: AHA_3668
ASA: ASA_3635(srmB)
AVR: B565_0564
AMED: B224_4629
ASR: WL1483_1709(srmB)
ACAV: VI35_18150
TAU: Tola_0969
OCE: GU3_15460
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TaxonomyKoalaUniProt
Reference
  Authors
Charollais J, Pflieger D, Vinh J, Dreyfus M, Iost I
  Title
The DEAD-box RNA helicase SrmB is involved in the assembly of 50S ribosomal subunits in Escherichia coli.
  Journal
Mol Microbiol 48:1253-65 (2003)
DOI:10.1046/j.1365-2958.2003.03513.x
  Sequence
[eco:b2576]

DBGET integrated database retrieval system