KEGG   ORTHOLOGY: K06100Help
Entry
K06100                      KO                                     

Name
SYMPK
Definition
symplekin
Pathway
ko03015  mRNA surveillance pathway
ko04530  Tight junction
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:ko00001]
 09120 Genetic Information Processing
  09122 Translation
   03015 mRNA surveillance pathway
    K06100  SYMPK; symplekin
 09140 Cellular Processes
  09144 Cellular community - eukaryotes
   04530 Tight junction
    K06100  SYMPK; symplekin
 09180 Brite Hierarchies
  09182 Protein families: genetic information processing
   03021 Transcription machinery
    K06100  SYMPK; symplekin
   03019 Messenger RNA biogenesis
    K06100  SYMPK; symplekin
Transcription machinery [BR:ko03021]
 Eukaryotic type
  RNA polymerase II system
   Other transcription-related factors
    Transcription termination factor
     K06100  SYMPK; symplekin
Messenger RNA biogenesis [BR:ko03019]
 Eukaryotic Type
  mRNA processing factors
   3' end processing
    Cleavage stimulation factor (CSTF) complex
     K06100  SYMPK; symplekin
BRITE hierarchy
Genes
HSA: 8189(SYMPK)
PTR: 456142(SYMPK)
PPS: 100983890(SYMPK)
GGO: 101140504(SYMPK)
PON: 100174376(SYMPK)
NLE: 100599532(SYMPK)
MCC: 722436(SYMPK)
MCF: 101925269 102133124(SYMPK)
CSAB: 103234884(SYMPK)
RRO: 104673426(SYMPK)
RBB: 108531037 108531085(SYMPK)
CJC: 100412467(SYMPK)
SBQ: 101052305(SYMPK)
MMU: 68188(Sympk)
RNO: 292683(Sympk)
CGE: 100758374(Sympk)
NGI: 103749208(Sympk)
HGL: 101718311(Sympk)
CCAN: 109690257(Sympk) 109690263
OCU: 100348044(SYMPK)
TUP: 102488880(SYMPK)
CFA: 476431(SYMPK)
AML: 100474335(SYMPK)
UMR: 103657060(SYMPK)
ORO: 101374978(SYMPK)
FCA: 101092974(SYMPK)
PTG: 102959341(SYMPK)
AJU: 106973585(SYMPK)
BTA: 100337373(SYMPK)
BOM: 102283378(SYMPK)
BIU: 109572587(SYMPK)
PHD: 102340537(SYMPK)
CHX: 102173962(SYMPK)
OAS: 101119155(SYMPK)
SSC: 100512609(SYMPK)
CFR: 102506715(SYMPK)
CDK: 105095438(SYMPK)
BACU: 103017674(SYMPK)
LVE: 103070921(SYMPK)
OOR: 101282819(SYMPK)
ECB: 100070949(SYMPK)
EAI: 106843770(SYMPK)
MYB: 102248403(SYMPK)
MYD: 102770963(SYMPK)
HAI: 109374722(SYMPK)
RSS: 109459928(SYMPK)
PALE: 102895083(SYMPK)
LAV: 100660841(SYMPK)
TMU: 101358072
MDO: 100010885(SYMPK)
SHR: 100930611(SYMPK)
CJO: 107307783(SYMPK)
GFR: 102044438(SYMPK)
FAB: 101819659(SYMPK)
PHI: 102112592(SYMPK)
FPG: 106112859
CLV: 102085958
EGZ: 104133525(SYMPK)
NNI: 104009697(SYMPK)
ACUN: 113490827(SYMPK)
AAM: 106490508(SYMPK)
ASN: 102376053(SYMPK)
AMJ: 102568318(SYMPK) 106739740
PSS: 102443916(SYMPK)
CMY: 102945453(SYMPK)
CPIC: 101941520(SYMPK)
ACS: 100564226(sympk)
PVT: 110075681(SYMPK)
PBI: 103063207(SYMPK)
PMUR: 107291970(SYMPK)
GJA: 107109791(SYMPK)
XLA: 379378(sympk.S)
XTR: 394872(sympk)
DRE: 570858(sympk)
IPU: 108259898(sympk)
PHYP: 113531631(sympk)
AMEX: 103042128(sympk)
TRU: 101078518(sympk)
LCO: 104925868(sympk)
MZE: 101479833(sympk)
OLA: 101158983(sympk)
XMA: 102222475(sympk)
PRET: 103460705(sympk)
NFU: 107397344(sympk)
KMR: 108250766(sympk)
CSEM: 103392410(sympk)
LCF: 108897213(sympk)
SDU: 111218742(sympk)
HCQ: 109515310(sympk)
BPEC: 110160756(sympk)
MALB: 109963763(sympk)
SASA: 106563407(sympk)
OTW: 112231253(sympk)
SALP: 111964253(sympk)
ELS: 105010849(sympk)
SFM: 108924824(sympk)
LCM: 102363760(SYMPK)
CMK: 103190127(sympk)
CIN: 100183988
SPU: 578463(SYMPK)
APLC: 110976711
SKO: 102804894
DME: Dmel_CG2097(Sym)
DER: 6552741
DPE: 6588287
DSI: Dsimw501_GD19586(Dsim_GD19586)
DWI: 6651292
MDE: 101893810
AAG: 5580150
AME: 552752
BIM: 100745785
BTER: 100644858
SOC: 105200100
MPHA: 105832630
AEC: 105146859
PBAR: 105424666
HST: 105189956
DQU: 106750651
CFO: 105251486
LHU: 105676181
PGC: 109857534
OBO: 105286821
PCF: 106785622
NVI: 100115565
TCA: 103314929
DPA: 109537403
NVL: 108562934
BMOR: 101739316
PMAC: 106711992
PRAP: 110991713
HAW: 110372114
PXY: 105397648
API: 100168598
DNX: 107169094
CLEC: 106669182
ZNE: 110828089
FCD: 110845229
TUT: 107368143
DPTE: 113793665
CEL: CELE_F25G6.2(symk-1)
CBR: CBG01489
BMY: Bm1_50390
CRG: 105342182
MYI: 110463504
OBI: 106875137
LAK: 106181495
SHX: MS3_00973
EGL: EGR_07431
EPA: 110231240
ADF: 107345049
PDAM: 113678751
SPIS: 111339260
HMG: 100201752
AQU: 100632240
ATH: AT1G27595 AT5G01400(ESP4)
LJA: Lj0g3v0198949.1(Lj0g3v0198949.1) Lj0g3v0248759.1(Lj0g3v0248759.1) Lj0g3v0248759.2(Lj0g3v0248759.2) Lj0g3v0248759.3(Lj0g3v0248759.3) Lj0g3v0248759.4(Lj0g3v0248759.4) Lj1g3v2096250.1(Lj1g3v2096250.1)
ZJU: 107421396
POP: 7466073
VVI: 100262578
HAN: 110909912
DOSA: Os07t0693900-01(Os07g0693900)
ATS: 109755058 109771047(LOC109771047)
PPP: 112277347
APRO: F751_5132
SCE: YAL043C(PTA1)
ERC: Ecym_5027
KMX: KLMA_30586(PTA1)
NCS: NCAS_0A07540(NCAS0A07540)
NDI: NDAI_0H01920(NDAI0H01920)
TPF: TPHA_0N00270(TPHA0N00270)
TBL: TBLA_0E00650(TBLA0E00650)
TDL: TDEL_0H04230(TDEL0H04230)
KAF: KAFR_0K00460(KAFR0K00460)
CAL: CAALFM_C700780WA(CaO19.7041)
CAUR: QG37_07540
SLB: AWJ20_5263(PTA1)
NCR: NCU09128
NTE: NEUTE1DRAFT125957(NEUTE1DRAFT_125957)
MGR: MGG_10820
SSCK: SPSK_08562
MAW: MAC_03202
MAJ: MAA_04297
CMT: CCM_02289
BFU: BCIN_02g03610(Bcpta1)
MBE: MBM_09164
ANI: AN1456.2
ANG: ANI_1_1158144(An16g08620)
ABE: ARB_06482
TVE: TRV_00580
PTE: PTT_10537
SPO: SPAC1071.01c(pta1)
CNE: CNF01910
CNB: CNBF2790
ABP: AGABI1DRAFT54870(AGABI1DRAFT_54870)
ABV: AGABI2DRAFT206048(AGABI2DRAFT_206048)
MGL: MGL_0013
DDI: DDB_G0284319(sympk)
DFA: DFA_10034(sympk)
SMIN: v1.2.034054.t1(symbB.v1.2.034054.t1)
SPAR: SPRG_04950
 » show all
TaxonomyKoalaUniProt
Reference
  Authors
Kolev NG, Steitz JA
  Title
Symplekin and multiple other polyadenylation factors participate in 3'-end maturation of histone mRNAs.
  Journal
Genes Dev 19:2583-92 (2005)
DOI:10.1101/gad.1371105
Reference
PMID:8769423
  Authors
Keon BH, Schafer S, Kuhn C, Grund C, Franke WW
  Title
Symplekin, a novel type of tight junction plaque protein.
  Journal
J Cell Biol 134:1003-18 (1996)
DOI:10.1083/jcb.134.4.1003
  Sequence
[hsa:8189]

DBGET integrated database retrieval system