KEGG   ORTHOLOGY: K10802
Entry
K10802                      KO                                     
Symbol
HMGB1
Name
high mobility group protein B1
Pathway
map03410  Base excision repair
map04140  Autophagy - animal
map04217  Necroptosis
map04613  Neutrophil extracellular trap formation
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:ko00001]
 09120 Genetic Information Processing
  09124 Replication and repair
   03410 Base excision repair
    K10802  HMGB1; high mobility group protein B1
 09140 Cellular Processes
  09141 Transport and catabolism
   04140 Autophagy - animal
    K10802  HMGB1; high mobility group protein B1
  09143 Cell growth and death
   04217 Necroptosis
    K10802  HMGB1; high mobility group protein B1
 09150 Organismal Systems
  09151 Immune system
   04613 Neutrophil extracellular trap formation
    K10802  HMGB1; high mobility group protein B1
 09180 Brite Hierarchies
  09182 Protein families: genetic information processing
   03036 Chromosome and associated proteins
    K10802  HMGB1; high mobility group protein B1
   03400 DNA repair and recombination proteins
    K10802  HMGB1; high mobility group protein B1
  09183 Protein families: signaling and cellular processes
   04147 Exosome
    K10802  HMGB1; high mobility group protein B1
Chromosome and associated proteins [BR:ko03036]
 Eukaryotic type
  Nucleosome assembly factors
   HMG (high mobility group) proteins
    K10802  HMGB1; high mobility group protein B1
DNA repair and recombination proteins [BR:ko03400]
 Eukaryotic type
  SSBR (single strand breaks repair)
   BER (base exicision repair)
    Other BER factors
     K10802  HMGB1; high mobility group protein B1
   MMR (mismatch excision repair)
    Other MMR factors
     K10802  HMGB1; high mobility group protein B1
Exosome [BR:ko04147]
 Exosomal proteins
  Exosomal proteins of colorectal cancer cells
   K10802  HMGB1; high mobility group protein B1
Genes
HSA: 3146(HMGB1)
PTR: 107970066 452518(HMGB1) 749521 749557
PPS: 100969724 100971286(HMGB1) 100980430 100982133 106634197 106634503 117981477
GGO: 101123873 101142826(HMGB1) 109025566
PON: 100461759(HMGB1)
NLE: 100596767(HMGB1)
MCC: 712849(HMGB1)
MCF: 101865000(HMGB1) 102133926 102135996 102140502 102142094
CSAB: 103237177
CATY: 105587913(HMGB1)
PANU: 100137373(HMGB1)
TGE: 112610619(HMGB1) 112636475
RRO: 104654245 104665311(HMGB1)
RBB: 108524822(HMGB1)
TFN: 117085285 117097800(HMGB1)
PTEH: 111536140
CJC: 100392312(HMGB1)
SBQ: 101039324
CSYR: 103255078(HMGB1) 103275450
MMUR: 105861171(HMGB1) 105875612
MMU: 102641752(Gm38574) 15289(Hmgb1) 385454(Gm5396)
MCAL: 110310350
MPAH: 110313910
MCOC: 116104720(Hmgb1)
CGE: 100754755(Hmgb1) 113836333
PLEU: 114699146(Hmgb1)
NGI: 103727222(Hmgb1)
HGL: 101705428(Hmgb1)
CPOC: 100720324 106025160(Hmgb1)
CCAN: 109676201
DORD: 105993914(Hmgb1)
DSP: 122112526(Hmgb1)
OCU: 100328641(HMGB1)
OPI: 101517266 101533787(HMGB1)
TUP: 106733777
CFA: 403170(HMGB1)
VVP: 112918651(HMGB1)
VLG: 121494150 121497506(HMGB1)
AML: 100467802
UMR: 103664333(HMGB1)
UAH: 113251226(HMGB1)
UAR: 123791939(HMGB1) 123797218
ELK: 111153902
MPUF: 101687406
ORO: 101384635(HMGB1)
MLX: 118007649 118009539(HMGB1)
FCA: 101089823(HMGB1)
PTG: 102961808(HMGB1)
PPAD: 109266100(HMGB1)
HHV: 120247285(HMGB1)
BTA: 282691(HMGB1)
BOM: 102267614(HMGB1)
BIU: 109566810(HMGB1)
BBUB: 102415236(HMGB1)
CHX: 102185752(HMGB1)
OAS: 101112071(HMGB1)
ODA: 120883148(HMGB1)
SSC: 445521(HMGB1)
CFR: 102523723(HMGB1)
CBAI: 105066234(HMGB1)
CDK: 105086594(HMGB1)
VPC: 102544250(HMGB1)
BACU: 103011749(HMGB1)
LVE: 103077348(HMGB1)
OOR: 101280200(HMGB1)
DLE: 111175202(HMGB1)
PCAD: 102983656(HMGB1)
ECB: 100033873(HMGB1)
EPZ: 103549273(HMGB1)
MYB: 102263143(HMGB1)
MYD: 102773633(HMGB1)
MMYO: 118650253(HMGB1)
MLF: 102420405(HMGB1)
MNA: 107537540(HMGB1)
PKL: 118721343 118728778(HMGB1)
HAI: 109385461
DRO: 112296204(HMGB1) 112301232
SHON: 118980506(HMGB1) 119004244
AJM: 119037404(HMGB1)
PHAS: 123822706(HMGB1)
MMF: 118624110(HMGB1)
PALE: 102882684(HMGB1)
PGIG: 120602316(HMGB1)
PVP: 105292095(HMGB1)
RAY: 107514313(HMGB1)
MJV: 108386102(HMGB1)
TOD: 119239393 119258812(HMGB1)
SARA: 101543730(HMGB1) 101545376
LAV: 100673297(HMGB1)
TMU: 101355630
MDO: 100020248(HMGB1)
SHR: 100932515(HMGB1)
PCW: 110215580(HMGB1)
OAA: 100078150(HMGB1)
GGA: 395724(HMGB1)
PCOC: 116244150(HMGB1)
MGP: 100543659(HMGB1)
CJO: 107308252(HMGB1)
NMEL: 110388810(HMGB1)
APLA: 101797353(HMGB1)
ACYG: 106041136(HMGB1)
AFUL: 116500877(HMGB1)
TGU: 100230146(HMGB1)
LSR: 110476748(HMGB1)
SCAN: 103827346(HMGB1)
PMOA: 120506608(HMGB1)
OTC: 121341975(HMGB1)
PRUF: 121364144(HMGB1)
GFR: 102043316(HMGB1)
FAB: 101821040(HMGB1)
PHI: 102109700(HMGB1)
PMAJ: 107202640(HMGB1)
CCAE: 111923099(HMGB1)
CCW: 104689901(HMGB1)
CBRC: 103613624(HMGB1)
ETL: 114057840(HMGB1)
ZAB: 102067646(HMGB1)
FCH: 102059204(HMGB1)
CLV: 102092823(HMGB1)
EGZ: 104131756(HMGB1)
NNI: 104023014(HMGB1)
PLET: 104618918(HMGB1)
PCRI: 104025908(HMGB1)
ACUN: 113483169(HMGB1)
TALA: 104359593(HMGB1)
PADL: 103920085(HMGB1)
ACHC: 115353335(HMGB1)
HALD: 104318681(HMGB2)
CCRI: 104167495(HMGB1)
CSTI: 104554997(HMGB1)
EHS: 104513944(HMGB1)
CMAC: 104483248(HMGB1)
FGA: 104078342(HMGB1)
GSTE: 104261031(HMGB1)
LDI: 104345708(HMGB1)
MNB: 103776011(HMGB1)
OHA: 104332708(HMGB1)
AAM: 106500383(HMGB1)
AROW: 112970342(HMGB1)
NPD: 112956323(HMGB1)
DNE: 112988406(HMGB1)
ASN: 102376428(HMGB1)
AMJ: 102573973(HMGB1)
CPOO: 109306620(HMGB1)
GGN: 109302896(HMGB1)
PSS: 102454149(HMGB1)
CMY: 102935166(HMGB1)
CPIC: 101940978(HMGB1)
TST: 117871069(HMGB1)
CABI: 116834088(HMGB1)
MRV: 120404875(HMGB1)
ACS: 100560708(hmgb1)
PVT: 110076447(HMGB1)
SUND: 121924875(HMGB1)
PBI: 103050122(HMGB1)
PMUR: 107286799(HMGB1)
TSR: 106550941(HMGB1)
PGUT: 117661781(HMGB1)
VKO: 123029241(HMGB1)
PMUA: 114595769(HMGB1)
ZVI: 118085386(HMGB1)
GJA: 107122492(HMGB1)
STOW: 125431073(HMGB1)
XLA: 108709952 380530(hmgb1.L)
XTR: 394834(hmgb1)
NPR: 108786235(HMGB1)
RTEM: 120929187(HMGB1)
BBUF: 120996315(HMGB1)
BGAR: 122931995(HMGB1)
DRE: 110438871 321622(hmgb1a) 795095(hmgb1b)
CCAR: 109053685
PPRM: 120478935(hmgb1b) 120482131(hmgb1a)
MAMB: 125249530(hmgb1b) 125261279(hmgb1a)
IPU: 100304841(hmgb1a) 108278352(hmgb1b)
SMEO: 124393452(hmgb1a) 124394274(hmgb1b)
TFD: 113638293(hmgb1a) 113649435(hmgb1b)
EEE: 113584910(hmgb1) 113589274
TRU: 101067170
LCO: 104939928(hmgb1)
NCC: 104942154 104966775(hmgb1)
CGOB: 115018099 115019122(hmgb1)
ELY: 117246734 117259613(hmgb1b)
EFO: 125889331(hmgb1b) 125898058
PLEP: 121943077(hmgb1b) 121952452(hmgb1a)
SLUC: 116036923(hmgb1a) 116048341(hmgb1b)
ECRA: 117941992(hmgb1b) 117955121
GAT: 120821450 120822396(hmgb1b)
PPUG: 119215585 119216630(hmgb1b)
MSAM: 119883389(hmgb1b) 119895611
CUD: 121515258(hmgb1b) 121519040(hmgb1a)
ALAT: 119009169(hmgb1b) 119031546
OAU: 116310855(hmgb1b) 116311911(hmgb1a)
OML: 112140333 112149362(hmgb1b)
PLAI: 106939807 106952381(hmgb1)
GAF: 122832173(hmgb1b) 122844528
CTUL: 119779197(hmgb1a) 119789511(hmgb1b)
GMU: 124876612 124883588(hmgb1b)
NFU: 107380026 107386925(hmgb1)
KMR: 108235979(hmgb1b) 108236971
NWH: 119411339(hmgb1b) 119420538(hmgb1a)
MCEP: 125014049(hmgb1b) 125021355(hmgb1a)
CSEM: 103377997 103395238(hmgb1)
HHIP: 117772743(hmgb1b) 117773880
HSP: 118106147 118121810(hmgb1a)
SDU: 111217084(hmgb1) 111224459
SLAL: 111653110 111662674(hmgb1)
XGL: 120792406(hmgb1b) 120802163(hmgb1a)
BPEC: 110158348(hmgb1)
BSPL: 114868076(hmgb1b) 114869232
SASA: 100194543(hmgb1) 100286669(hmgb1) 106580642(HMGB1) 106612439(HMGB1)
AANG: 118236432
LOC: 102685223(hmgb1)
PSPA: 121302871(hmgb1a)
ARUT: 117406720
LCM: 102366474(HMGB1)
CMK: 103180230(hmgb2a)
SKO: 100329022
DME: Dmel_CG12223(Dsp1)
DER: 6550554
DSE: 6617923
DSI: Dsimw501_GD17278(Dsim_GD17278)
DAN: 6501878
DSR: 110175957
DPO: 4814544
DPE: 6599360
DMN: 108164526
DWI: 6648778
DAZ: 108619196
DNV: 108656751
DHE: 111595352
DVI: 6631914
CCAT: 101453999
BOD: 106614400
MDE: 101891750
SCAC: 106082152
LCQ: 111684194
LSQ: 119600733
HIS: 119656735
AARA: 120906095
ASTE: 118517458
AAG: 5574747
AALB: 109415242
CPII: 120432327
CNS: 116344404
BCOO: 119068314
AME: 725551
ALAB: 122714915
BIM: 100749348
BBIF: 117207028
BVK: 117231140
BVAN: 117154246
BTER: 100650757
BPYO: 122577950
CCAL: 108625965
OBB: 114874086
MGEN: 117218371
NMEA: 116429356
CGIG: 122403543
SOC: 105194067
MPHA: 105836693
AEC: 105145826
ACEP: 105619150
PBAR: 105434110
VEM: 105570595
HST: 105191035
DQU: 106744121
CFO: 105259163
FEX: 115246222
LHU: 105667555
PGC: 109857958
OBO: 105284753
PCF: 106785590
PFUC: 122517175
VPS: 122629205
NVI: 100122354
CSOL: 105365427
TPRE: 106653170
MDL: 103572523
CGLO: 123262453
FAS: 105271495
DAM: 107047858
AGIF: 122851875
LHT: 122509694
CCIN: 107268538
TCA: 662763
SOY: 115874515
ATD: 109598422
CSET: 123309376
AGB: 108917046
LDC: 111501830
NVL: 108569226
APLN: 108743314
PPYR: 116168560
OTU: 111421406
BMAN: 114249191
BANY: 112049277
PMAC: 106710620
PPOT: 106100611
PXU: 106123402
PRAP: 111001226
ZCE: 119833439
HAW: 110371859
TNL: 113508514
OFU: 114353187
PXY: 105390684
API: 100167132
DNX: 107170862
AGS: 114122406
RMD: 113549322
BTAB: 109030378
DCI: 103524935
CLEC: 106666905
NLU: 111058862
FOC: 113206251
TPAL: 117644403
ZNE: 110833040
CSEC: 111874266
FCD: 110851183
PVM: 113804281
HAME: 121859474
DSV: 119449867
RSAN: 119382755
RMP: 119170112
VDE: 111247446
VJA: 111261156
DPTE: 113788902
DFR: 124490993
CSCU: 111624015
PTEP: 107455393
SDM: 118184464
CBR: CBG_27412
PCAN: 112559279
BGT: 106074940
GAE: 121374925
CRG: 105329085
MYI: 110449530
PMAX: 117328975
MMER: 123556335
OSN: 115214265
LAK: 106163172
XEN: 124446140
 » show all
Reference
PMID:9184213
  Authors
van Gent DC, Hiom K, Paull TT, Gellert M
  Title
Stimulation of V(D)J cleavage by high mobility group proteins.
  Journal
EMBO J 16:2665-70 (1997)
DOI:10.1093/emboj/16.10.2665
  Sequence
[mmu:15289]

DBGET integrated database retrieval system