KEGG   ORTHOLOGY: K11927Help
Entry
K11927                      KO                                     

Name
rhlE
Definition
ATP-dependent RNA helicase RhlE [EC:3.6.4.13]
Pathway
ko03018  RNA degradation
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:ko00001]
 09120 Genetic Information Processing
  09123 Folding, sorting and degradation
   03018 RNA degradation
    K11927  rhlE; ATP-dependent RNA helicase RhlE
 09180 Brite Hierarchies
  09182 Protein families: genetic information processing
   03019 Messenger RNA Biogenesis
    K11927  rhlE; ATP-dependent RNA helicase RhlE
Enzymes [BR:ko01000]
 3. Hydrolases
  3.6  Acting on acid anhydrides
   3.6.4  Acting on acid anhydrides to facilitate cellular and subcellular movement
    3.6.4.13  RNA helicase
     K11927  rhlE; ATP-dependent RNA helicase RhlE
Messenger RNA biogenesis [BR:ko03019]
 Prokaryotic Type
  Bacterial mRNA degradation factors
   RNA degradosome components
    Helicases
     K11927  rhlE; ATP-dependent RNA helicase RhlE
BRITE hierarchy
Other DBs
COG: COG0513
Genes
ECO: b0797(rhlE)
ECJ: JW0781(rhlE)
ECD: ECDH10B_0865(rhlE)
EBW: BWG_0650(rhlE)
ECOK: ECMDS42_0647(rhlE)
ECE: Z1017(rhlE)
ECS: ECs0875
ECF: ECH74115_0945
ETW: ECSP_0893(rhlE)
ELX: CDCO157_0853
EOJ: ECO26_0923(rhlE)
EOI: ECO111_0858(rhlE)
EOH: ECO103_0833(rhlE)
ECG: E2348C_0749(rhlE)
EOK: G2583_1025(rhlE)
ECC: c0880(rhlE)
ECP: ECP_0811
ECI: UTI89_C0798(rhlE)
ECV: APECO1_1293(rhlE)
ECY: ECSE_0852
ECR: ECIAI1_0833(rhlE)
ECQ: ECED1_0762(rhlE)
ECK: EC55989_0841(rhlE)
ECT: ECIAI39_0773(rhlE)
EOC: CE10_0817(rhlE)
EUM: ECUMN_0941(rhlE)
ECZ: ECS88_0815(rhlE)
ELO: EC042_0887(rhlE)
ELH: ETEC_0864
ESE: ECSF_0723
ESO: O3O_07920
ESM: O3M_17340
ESL: O3K_17365
EBR: ECB_00764(rhlE)
EBD: ECBD_2826
EKF: KO11_19795(rhlE)
EAB: ECABU_c08390(rhlE)
EDJ: ECDH1ME8569_0750(rhlE)
ENA: ECNA114_0729(rhlE)
ELW: ECW_m0853(rhlE)
ELL: WFL_04140(rhlE)
ELC: i14_0846(rhlE)
ELD: i02_0846(rhlE)
EBL: ECD_00764(rhlE)
EBE: B21_00781(rhlE)
ELF: LF82_1872(rhlE)
ECOI: ECOPMV1_00800(rhlE)
ECOJ: P423_03950
ECOO: ECRM13514_0872(rhlE)
ECOH: ECRM13516_0827(rhlE)
ECOS: EC958_0909(rhlE)
EFE: EFER_2311(rhlE)
STY: STY0855(rhlE)
STT: t2068(rhlE)
STM: STM0820(rhlE)
SEO: STM14_951(rhlE)
SEY: SL1344_0796(rhlE)
SEJ: STMUK_0825(rhlE)
SEB: STM474_0846(rhlE)
SEF: UMN798_0889(rhlE)
SENR: STMDT2_07971(rhlE)
SEND: DT104_08361(rhlE)
SENI: CY43_04395
SPT: SPA1933(rhlE)
SEK: SSPA1802
SEI: SPC_0817
SEC: SCH_0817(rhlE)
SHB: SU5_01491
SENS: Q786_03980
SED: SeD_A0915
SEG: SG0799(rhlE)
SEL: SPUL_2156(rhlE)
SEGA: SPUCDC_2142(rhlE)
SET: SEN0766(rhlE)
SENA: AU38_03970
SENO: AU37_03955
SENV: AU39_03960
SENQ: AU40_04405
SENL: IY59_04025
SEEP: I137_09795
SENB: BN855_7900
SENE: IA1_04165
SBG: SBG_0705(rhlE)
SBZ: A464_784
SFL: SF0747(rhlE)
SFX: S0788(rhlE)
SFV: SFV_0780(rhlE)
SFE: SFxv_0813(rhlE)
SFN: SFy_1014
SFS: SFyv_1056
SFT: NCTC1_00754(rhlE)
SSN: SSON_0776(rhlE)
SBO: SBO_0685(rhlE)
SDY: SDY_0806(rhlE)
ENC: ECL_02938
EEC: EcWSU1_01341(rhlE)
ECLX: LI66_06610
ECLY: LI62_07510
ECLZ: LI64_07115
ESA: ESA_02548
CSK: ES15_2642(rhlE)
CTU: CTU_13960(rhlE)
KPN: KPN_00830(rhlE)
KPU: KP1_1785(rhlE)
KPP: A79E_3412
KPE: KPK_3740
KPR: KPR_3758(rhlE)
KPJ: N559_3505
KPX: PMK1_03162(rhlE)
KPNU: LI86_17935
KPNK: BN49_1879(rhlE)
KVA: Kvar_3551
KOX: KOX_15070
KOE: A225_1842
EAE: EAE_14570
EAR: CCG31054
CKO: CKO_02330
CRO: ROD_08031(rhlE)
CAMA: F384_03655
HDE: HDEF_0292(rhlE)
SECT: A359_00900
EBT: EBL_c26040(rhlE)
EBF: D782_3047
PSTS: E05_08850(rhlE)
YPM: YP_0973(srmB1)
YPZ: YPZ3_1076
YPD: YPD4_1035 YPD4_1041(rhlE)
YPS: YPTB1214(rhlE)
YPO: BZ17_1313
YPB: YPTS_1294
YPQ: DJ40_1027(rhlE)
YPU: BZ21_477
YPR: BZ20_778
YPC: BZ23_808
YPF: BZ19_612
YEN: YE2889(rhlE)
YEY: Y11_17991
YEW: CH47_2243(rhlE)
YET: CH48_2983
YEE: YE5303_33161(rhlE)
YAL: AT01_3868
YFR: AW19_573(rhlE)
YIN: CH53_3203
YKR: CH54_1089
YRO: CH64_3844
YRU: BD65_3093
SPE: Spro_1331
SRL: SOD_c12000(rhlE)
SPLY: Q5A_006690(rhlE)
SMAF: D781_1258
SMW: SMWW4_v1c13000(rhlE)
SMAR: SM39_0751(rhlE)
SMAC: SMDB11_0577(rhlE)
SERF: L085_21940
RAA: Q7S_15535
ECA: ECA2805(rhlE)
PATR: EV46_13735
PATO: GZ59_17530(rhlE)
PCT: PC1_1528
PEC: W5S_2921
SGL: SG0913
SOD: Sant_2721(rhlE)
PES: SOPEG_0511(rhlE)
DDD: Dda3937_04013(rhlE)
DDQ: DDI_1517
ETA: ETA_22510(rhlE)
EPY: EpC_23830(rhlE)
EPR: EPYR_02578(rhlE)
EAM: EAMY_1224(rhlE)
EAY: EAM_1226(rhlE)
EBI: EbC_13610(rhlE)
ERJ: EJP617_23450(rhlE)
EGE: EM595_1176(rhlE)
PAM: PANA_1232(rhlE)
PLF: PANA5342_3056(rhlE)
PAJ: PAJ_0553(rhlE)
PVA: Pvag_0609(rhlE)
PSTW: DSJ_08635
PLU: plu1511(rhlE)
PAY: PAU_02922(rhlE)
PMR: PMI0620(rhlE)
PMIB: BB2000_0696(rhlE)
XBO: XBJ1_0969(rhlE)
XBV: XBW1_3446(rhlE)
XNE: XNC1_1460(rhlE)
XNM: XNC2_1423(rhlE)
XDO: XDD1_1414(rhlE)
XPO: XPG1_2306(rhlE)
PSI: S70_16005
PSX: DR96_2261(rhlE)
PRG: RB151_011810(rhlE)
MMK: MU9_1441
ETR: ETAE_2327(rhlE)
ETD: ETAF_2099(rhlE)
ETE: ETEE_0349(rhlE)
PSHI: SAMEA2665130_0921(rhlE_2)
XFA: XF_0192
XFT: PD_0157(rhlE)
XCC: XCC0590(rhlE)
XCB: XC_3643
XCA: xcc-b100_3760(rhlE2)
XCP: XCR_0742
XCV: XCV3733(rhlE)
XAX: XACM_3510(rhlE)
XAC: XAC3610(rhlE)
XCI: XCAW_04313(srmB)
XFU: XFF4834R_chr35040(rhlE2)
XOO: XOO0770(rhlE)
XOM: XOO0700(XOO0700)
XOP: PXO_03147
XOR: XOC_3880
XAL: XALC_2720(rhlE)
XPH: XppCFBP6546_16265(XppCFBP6546P_16265)
SML: Smlt0605(rhlE1)
SMT: Smal_0480
SMZ: SMD_0517(rhlE)
SACZ: AOT14_05990(rhlE_1)
PSUW: WQ53_11095
PSD: DSC_14335
LAQ: GLA29479_3183(rhlE)
LEZ: GLE_3468
LEM: LEN_1666
DKO: I596_2268
VCO: VC0395_0709 VC0395_1024(rhlE-2)
VCR: VC395_A0242(rhlE-2) VC395_A0546
VCM: VCM66_A0200(rhlE-2) VCM66_A0727
VNI: VIBNI_A1518(rhlE) VIBNI_B0910(rhlE)
VSC: VSVS12_03359(dbpA) VSVS12_03815(rhlE)
VTA: A0510(rhlE) B1158(rhlE)
VFI: VF_A0151(rhlE) VF_A0374
VSA: VSAL_II0142(rhlE) VSAL_II0429(rhlE)
AWD: AWOD_II_0231(rhlE) AWOD_II_0391(rhlE)
PPR: PBPRA1748(RHLE) PBPRB1232(RHLE)
PAE: PA0428
PAEV: N297_439
PAEI: N296_439
PAU: PA14_05560(rhlE)
PNC: NCGM2_5769(rhlE)
PAEB: NCGM1900_0436(rhlE)
PAEP: PA1S_02170
PAEM: U769_02205
PAEL: T223_02165
PAEG: AI22_01730
PAEC: M802_438
PAEO: M801_439
PMY: Pmen_0420
PMK: MDS_0475
PPSE: BN5_0322(rhlE)
PCQ: PcP3B5_58270(rhlE_3)
PPU: PP_4980(rhlE-II)
PPF: Pput_4853
PPT: PPS_4824
PPI: YSA_04061
PPX: T1E_1128(rhlE)
PPUH: B479_24365
PPUT: L483_30050
PPUN: PP4_50460(rhlE)
PPUD: DW66_5214
PMON: X969_23820
PMOT: X970_23455
PSB: Psyr_0458
PSYR: N018_02195
PFL: PFL_5801(rhlE_2)
PPRC: PFLCHA0_c57560(rhlE3)
PPRO: PPC_5748(rhlE_2)
PFO: Pfl01_5283(rhlE)
PFS: PFLU_5724(rhlE1)
PFE: PSF113_5505(rhlE1)
PFC: PflA506_5023(rhlE_2)
PFW: PF1751_v1c51460(rhlE)
PFB: VO64_2608
PMAN: OU5_3894(rhlE1)
PEN: PSEEN5042
PSA: PST_3937
PKC: PKB_5377
PSES: PSCI_2103
PSEM: TO66_29345
PSOS: POS17_5737(rhlE_2)
PANR: A7J50_5450
PSET: THL1_312
PSIL: PMA3_28270
SON: SO_3783(rhlE)
SDN: Sden_3026
SFR: Sfri_3215
SAZ: Sama_2687
SBL: Sbal_3466
SLO: Shew_0604
SSE: Ssed_3851
SPL: Spea_3497
SHL: Shal_3591
SWD: Swoo_0703
SWP: swp_0800
SVO: SVI_0523
SPSW: Sps_05030
ILO: IL1491 IL1546(rhlE)
CPS: CPS_1125
PHA: PSHAa1930(rhlE)
PAT: Patl_2135
PSM: PSM_A1118(rhlE)
PTN: PTRA_a2365(rhlE)
PEA: PESP_a1437(rhlE)
PSPO: PSPO_b1241(rhlE) PSPO_b1447(rhlE)
PART: PARC_a2566(rhlE)
PNG: PNIG_a2591(rhlE)
PTD: PTET_a1268(rhlE)
PSEN: PNC201_04625(rhlE1)
MAQ: Maqu_3825
MHC: MARHY3753(rhlE)
MAD: HP15_3607
MBS: MRBBS_3719(rhlE)
AMAL: I607_15800
AMAE: I876_16100
AMAO: I634_16045
AMAD: I636_15945
AMAI: I635_16585
AMAG: I533_15640
GNI: GNIT_2944(rhlE) GNIT_3008
PIN: Ping_3259
FBL: Fbal_2463
MVS: MVIS_2214 MVIS_3304(rhlE)
CJA: CJA_1706
SDE: Sde_3200
SAGA: M5M_18910
MICC: AUP74_00426(rhlE)
CBU: CBU_0670(rhlE)
CBD: CBUD_0681(rhlE)
CBG: CbuG_1335(rhlE)
CBC: CbuK_1587(rhlE)
LPN: lpg0250
LPH: LPV_0333(rhlE)
LPO: LPO_0290(rhlE)
LPM: LP6_0251(rhlE)
LPF: lpl0304(rhlE)
LPP: lpp0320(rhlE)
LPC: LPC_0327(rhlE)
LPA: lpa_00441
LPE: lp12_0254
LLO: LLO_1328(rhlE)
LFA: LFA_1489(rhlE)
LHA: LHA_2138(rhlE)
LOK: Loa_01382
LCD: clem_04015(rhlE)
TMC: LMI_0697(rhlE)
MCA: MCA1011
MAH: MEALZ_0370(rhlE) MEALZ_0542(rhlE)
FTU: FTT_0952(rhlE)
FTQ: RO31_1095
FTF: FTF0952(rhlE)
FTW: FTW_0850
FTT: FTV_0907(rhlE)
FTG: FTU_0991(rhlE)
FTL: FTL_1252
FTH: FTH_1229(rhlE)
FTA: FTA_1324
FTS: F92_06945
FTI: FTS_1226(rhlE)
FTC: DA46_1523
FTV: CH67_1624
FTZ: CH68_1355
FTM: FTM_0997
FTN: FTN_0831
FTX: AW25_1187
FTD: AS84_1708
FTY: CH70_1190
FPH: Fphi_1783
FPT: BZ13_206
FPI: BF30_39
FPM: LA56_391
FPX: KU46_1513
FPZ: LA55_1002
FPJ: LA02_1478
TCX: Tcr_0779
CYQ: Q91_0599(rhlE)
TEE: Tel_10145
AEH: Mlg_1613
HHA: Hhal_0924
TGR: Tgr7_1678
TKM: TK90_1028
TNI: TVNIR_2396(rhlE_[H])
TVR: TVD_05305
GAI: IMCC3135_12530(rhlE_1)
HCH: HCH_04705
CSA: Csal_0817
HEL: HELO_2451(rhlE)
HAM: HALO2269
HCO: LOKO_01040(rhlE)
HBE: BEI_1981(rhlE)
ABO: ABO_0734
ADI: B5T_03252
APAC: S7S_06395
AXE: P40_15210
KKO: Kkor_0090
KGE: TQ33_2167
OAI: OLEAN_C00680(rhlE)
ASA: ASA_1934(rhlE) ASA_2264(rhlE)
ASR: WL1483_1462(rhlE) WL1483_3001(rhlE)
OCE: GU3_13805
SLIM: SCL_1407
SALN: SALB1_2276
TBN: TBH_C2219
RMA: Rmag_0127
VOK: COSY_0132(rhlE)
EBH: BSEPE_1321(rhlE)
ENM: EBS_0932(rhlE)
CVI: CV_0383(rhlE3)
LHK: LHK_03130(rhlE3)
PSE: NH8B_0086(rhlE)
RSO: RSc0539(rhlE1)
RSC: RCFBP_20937(rhlE)
RSL: RPSI07_2820(rhlE)
RSM: CMR15_30362(rhlE)
RSE: F504_552(rhlE)
RPI: Rpic_0420
REH: H16_A0531(rhlE1)
CNC: CNE_1c05530(rhlE1)
RME: Rmet_0456(rhlE1)
CTI: RALTA_A0488(rhlE1)
CGD: CR3_2142(rhlE)
BMA: BMA0248(rhlE-2)
BMV: BMASAVP1_A2698(rhlE)
BML: BMA10229_A2379(rhlE)
BMN: BMA10247_2460(rhlE)
BMAL: DM55_1648
BMAE: DM78_345
BMAQ: DM76_1626
BMAI: DM57_2280
BMAF: DM51_50
BMAZ: BM44_834
BMAB: BM45_569
BPS: BPSL0695(rhlE1)
BPM: BURPS1710b_0914(rhlE1)
BPR: GBP346_A0665(rhlE)
BPSE: BDL_1309
BPSM: BBQ_2732
BPSU: BBN_2855
BPSD: BBX_3256
BPZ: BP1026B_I2827(rhlE1)
BPK: BBK_790
BPSH: DR55_398
BPSA: BBU_1456
BPSO: X996_5
BUT: X994_2020
BTE: BTH_I0607
BTQ: BTQ_627
BTJ: BTJ_1858
BTZ: BTL_3094
BTD: BTI_3093
BTV: BTHA_3377
BTHE: BTN_1618
BTHM: BTRA_3437
BTHA: DR62_1805
BTHL: BG87_3287
BOK: DM82_125
BOC: BG90_897
BVE: AK36_1220
BCN: Bcen_2059
BCJ: BCAL0933(rhlE1)
BCEN: DM39_2762
BCEW: DM40_296
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Reference
  Authors
Bizebard T, Ferlenghi I, Iost I, Dreyfus M
  Title
Studies on three E. coli DEAD-box helicases point to an unwinding mechanism different from that of model DNA helicases.
  Journal
Biochemistry 43:7857-66 (2004)
DOI:10.1021/bi049852s
  Sequence
[eco:b0797]

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