KEGG   ORTHOLOGY: K12598Help
Entry
K12598                      KO                                     

Name
MTR4, SKIV2L2
Definition
ATP-dependent RNA helicase DOB1 [EC:3.6.4.13]
Pathway
ko03018  RNA degradation
Module
M00393  TRAMP complex
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:ko00001]
 Genetic Information Processing
  Folding, sorting and degradation
   03018 RNA degradation
    K12598  MTR4, SKIV2L2; ATP-dependent RNA helicase DOB1
KEGG modules [BR:ko00002]
 Structural complex
  Genetic information processing
   RNA processing
    M00393  TRAMP complex
     K12598  MTR4, SKIV2L2; ATP-dependent RNA helicase DOB1
Enzymes [BR:ko01000]
 3. Hydrolases
  3.6  Acting on acid anhydrides
   3.6.4  Acting on acid anhydrides to facilitate cellular and subcellular movement
    3.6.4.13  RNA helicase
     K12598  MTR4, SKIV2L2; ATP-dependent RNA helicase DOB1
Messenger RNA biogenesis [BR:ko03019]
 Eukaryotic Type
  mRNA degradation factors
   3'-5' decay
    TRAMP complex
     K12598  MTR4, SKIV2L2; ATP-dependent RNA helicase DOB1
Spliceosome [BR:ko03041]
 Complex B
  U4/U6.U5 tri-snRNP components
   U4/U6.U5 tri-snRNP related factors
    K12598  MTR4, SKIV2L2; ATP-dependent RNA helicase DOB1
 Complex C
  U4/U6.U5 tri-snRNP components
   U4/U6.U5 tri-SnRNP related factors
    K12598  MTR4, SKIV2L2; ATP-dependent RNA helicase DOB1
Ribosome biogenesis [BR:ko03009]
 Eukaryotic Type
  Pre-60S particles
   Helicases
    K12598  MTR4, SKIV2L2; ATP-dependent RNA helicase DOB1
Transfer RNA biogenesis [BR:ko03016]
 Eukaryotic Type
  tRNA degradation factors
   TRAMP complex
    K12598  MTR4, SKIV2L2; ATP-dependent RNA helicase DOB1
BRITE hierarchy
Other DBs
COG: COG0513
GO: 0034459
Genes
HSA: 23517(MTREX)
PTR: 461870(MTREX)
PPS: 100986507(SKIV2L2)
GGO: 101152149(SKIV2L2)
PON: 100447175(MTREX)
NLE: 100605886(SKIV2L2)
MCC: 706419(SKIV2L2)
MCF: 102145811(SKIV2L2)
CSAB: 103221515(SKIV2L2)
RRO: 104680487(SKIV2L2)
RBB: 108530980(SKIV2L2)
CJC: 100399268(SKIV2L2)
SBQ: 101033038(SKIV2L2)
MMU: 72198(Skiv2l2)
RNO: 365668(Skiv2l2)
CGE: 100768244(Skiv2l2)
NGI: 103739917(Skiv2l2)
HGL: 101724541(Skiv2l2)
CCAN: 109691720(Skiv2l2) 109691743
OCU: 100347578(SKIV2L2)
TUP: 102498741(SKIV2L2)
CFA: 607950(SKIV2L2)
AML: 100479623(SKIV2L2)
UMR: 103663675(SKIV2L2)
ORO: 101370395(SKIV2L2)
FCA: 101088299(MTREX)
PTG: 102971190(SKIV2L2)
AJU: 106987315(SKIV2L2)
BTA: 520256(MTREX)
BOM: 102279402(SKIV2L2)
BIU: 109574776(SKIV2L2)
PHD: 102315339(SKIV2L2)
CHX: 102190356(SKIV2L2)
OAS: 101115066(SKIV2L2)
SSC: 100518521(SKIV2L2)
CFR: 102505637(SKIV2L2)
CDK: 105087142(SKIV2L2)
BACU: 102997872(SKIV2L2)
LVE: 103077784(SKIV2L2)
OOR: 101284931(SKIV2L2)
ECB: 100051945(MTREX)
EPZ: 103559062(SKIV2L2)
EAI: 106843360(SKIV2L2)
MYB: 102252808(SKIV2L2)
MYD: 102752659(SKIV2L2)
HAI: 109382140(SKIV2L2)
RSS: 109453433(SKIV2L2)
PALE: 102879653(SKIV2L2)
LAV: 100653830(MTREX)
TMU: 101360684
MDO: 100017078(SKIV2L2)
SHR: 100934235(MTREX)
OAA: 100083276(SKIV2L2)
GGA: 427137(SKIV2L2)
CJO: 107305984(SKIV2L2)
APLA: 101800697(SKIV2L2)
ACYG: 106035590(SKIV2L2)
TGU: 100229654(SKIV2L2)
GFR: 102037101(SKIV2L2)
FAB: 101822019(SKIV2L2)
PHI: 102107384(SKIV2L2)
PMAJ: 107216075(SKIV2L2)
CCW: 104686770(SKIV2L2)
FPG: 101911883(SKIV2L2)
FCH: 102052203(SKIV2L2)
CLV: 102096300(SKIV2L2)
EGZ: 104134678(SKIV2L2)
ASN: 102385002(SKIV2L2)
AMJ: 102557938(SKIV2L2)
PSS: 102457515(SKIV2L2)
CMY: 102932564(SKIV2L2)
CPIC: 101933895(SKIV2L2)
ACS: 100556882(skiv2l2)
PVT: 110085397(SKIV2L2)
PBI: 103050278(SKIV2L2)
GJA: 107120509(SKIV2L2)
XLA: 108707288(skiv2l2.S) 108718355(skiv2l2.L)
XTR: 100496866(skiv2l2)
NPR: 108796692(SKIV2L2)
DRE: 406795(mtrex)
SANH: 107685151(skiv2l2) 107686493
CCAR: 109096825(skiv2l2) 109097793
IPU: 108277035(skiv2l2)
AMEX: 103046062(skiv2l2)
TRU: 101069433(skiv2l2)
LCO: 104920099(skiv2l2)
NCC: 104941820
MZE: 101471175(mtrex)
OLA: 100304468(mtrex)
XMA: 102228439(mtrex)
PRET: 103473474(skiv2l2)
NFU: 107374728(skiv2l2)
CSEM: 103390251(skiv2l2)
HCQ: 109527849(skiv2l2)
BPEC: 110157399(skiv2l2)
SASA: 100380870(sk2l2) 106568406
ELS: 105026680(skiv2l2)
SFM: 108925051(skiv2l2)
LCM: 102361351(SKIV2L2)
CMK: 103177819(skiv2l2)
CIN: 100182540
SPU: 584685(SKIV2L2) 762385
APLC: 110980177
SKO: 100379085
DME: Dmel_CG4152(Mtr4)
DSI: Dsimw501_GD24019(Dsim_GD24019)
MDE: 101893682
AAG: 5571427
AME: 551637
BIM: 100740506
BTER: 100649317
AEC: 105149222
ACEP: 105627092
PBAR: 105427772
HST: 105182137
CFO: 105258686
LHU: 105671997
PGC: 109853771
NVI: 100116475
TCA: 658969
DPA: 109533618
NVL: 108557812
BMOR: 101743187
PRAP: 111003836
API: 100158988
ZNE: 110826482
FCD: 110847776
TUT: 107362011
CEL: CELE_W08D2.7(mtr-4)
CBR: CBG03473(Cbr-mtr-4)
BMY: Bm1_42300
CRG: 105341233
MYI: 110463294
OBI: 106881995
LAK: 106161202
ATH: AT1G59760(MTR4) AT2G06990(HEN2)
LJA: Lj1g3v3329390.1(Lj1g3v3329390.1) Lj4g3v3015040.1(Lj4g3v3015040.1) Lj4g3v3015040.2(Lj4g3v3015040.2)
VVI: 100246661 100258243(SKIV2L2)
DOSA: Os11t0176200-01(Os11g0176200) Os12t0279000-01(Os12g0279000)
ATS: 109733440(LOC109733440) 109737999(LOC109737999) 109773536(LOC109773536)
MNG: MNEG_9013
SCE: YJL050W(MTR4)
ERC: Ecym_6303
KMX: KLMA_50057(MTR4)
NCS: NCAS_0A09110(NCAS0A09110)
NDI: NDAI_0G05850(NDAI0G05850)
TPF: TPHA_0O01420(TPHA0O01420)
TBL: TBLA_0F01280(TBLA0F01280)
TDL: TDEL_0D01990(TDEL0D01990)
KAF: KAFR_0A00860(KAFR0A00860)
PIC: PICST_36809(MTR4)
CAL: CAALFM_C703400CA(CaO19.1335)
CAUR: QG37_00829
SLB: AWJ20_4263(MTR4)
NCR: NCU03363(frh)
NTE: NEUTE1DRAFT84510(NEUTE1DRAFT_84510)
MGR: MGG_03931
MAW: MAC_05806
MAJ: MAA_08584
CMT: CCM_02156
MBE: MBM_08039
ANI: AN4412.2
ANG: ANI_1_338184(An04g01570)
ABE: ARB_01604
TVE: TRV_03549
PTE: PTT_10466
CNE: CND05090
CNB: CNBD1250
ABP: AGABI1DRAFT101993(AGABI1DRAFT_101993) AGABI1DRAFT46451(AGABI1DRAFT_46451)
ABV: AGABI2DRAFT77358(AGABI2DRAFT_77358)
MGL: MGL_2627
DFA: DFA_11873
EHI: EHI_134610(131.t00001)
PYO: PY17X_0102500(PY01861)
PCB: PCHAS_010160(PC000427.02.0)
TAN: TA13610
TPV: TP02_0517
BBO: BBOV_II005660(18.m06470)
CPV: cgd8_2520
SMIN: v1.2.001880.t1(symbB.v1.2.001880.t1) v1.2.040668.t1(symbB.v1.2.040668.t1)
SPAR: SPRG_14450
TCR: 510105.9
CTHM: CFE_0125
 » show all
TaxonomyKoalaUniProt
Reference
  Authors
Vanacova S, Wolf J, Martin G, Blank D, Dettwiler S, Friedlein A, Langen H, Keith G, Keller W
  Title
A new yeast poly(A) polymerase complex involved in RNA quality control.
  Journal
PLoS Biol 3:e189 (2005)
DOI:10.1371/journal.pbio.0030189
  Sequence
[sce:YJL050W]
Reference
  Authors
Schilders G, van Dijk E, Pruijn GJ
  Title
C1D and hMtr4p associate with the human exosome subunit PM/Scl-100 and are involved in pre-rRNA processing.
  Journal
Nucleic Acids Res 35:2564-72 (2007)
DOI:10.1093/nar/gkm082
  Sequence
[hsa:23517]

DBGET integrated database retrieval system