KEGG   ORTHOLOGY: K12603Help
Entry
K12603                      KO                                     

Name
CNOT6, CCR4
Definition
CCR4-NOT transcription complex subunit 6 [EC:3.1.13.4]
Pathway
ko03018  RNA degradation
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:ko00001]
 09120 Genetic Information Processing
  09123 Folding, sorting and degradation
   03018 RNA degradation
    K12603  CNOT6, CCR4; CCR4-NOT transcription complex subunit 6
 09180 Brite Hierarchies
  09182 Protein families: genetic information processing
   03019 Messenger RNA biogenesis
    K12603  CNOT6, CCR4; CCR4-NOT transcription complex subunit 6
Enzymes [BR:ko01000]
 3. Hydrolases
  3.1  Acting on ester bonds
   3.1.13  Exoribonucleases producing 5'-phosphomonoesters
    3.1.13.4  poly(A)-specific ribonuclease
     K12603  CNOT6, CCR4; CCR4-NOT transcription complex subunit 6
Messenger RNA biogenesis [BR:ko03019]
 Eukaryotic Type
  mRNA surveillance and transport factors
   mRNA cycle factors
    P-body specific factors
     K12603  CNOT6, CCR4; CCR4-NOT transcription complex subunit 6
  mRNA degradation factors
   3'-5' decay
    Ccr4-NOT complex
     K12603  CNOT6, CCR4; CCR4-NOT transcription complex subunit 6
BRITE hierarchy
Other DBs
COG: COG5239
GO: 0004535
Genes
HSA: 246175(CNOT6L) 57472(CNOT6)
PTR: 462338(CNOT6) 467690(CNOT6L)
PPS: 100986322(CNOT6L) 100991206(CNOT6)
GGO: 101130011(CNOT6) 101132161(CNOT6L)
PON: 100171660(CNOT6L) 100460246(CNOT6)
NLE: 100582571(CNOT6) 100606122(CNOT6L)
MCC: 697981(CNOT6L) 716286(CNOT6)
MCF: 102121928(CNOT6) 102122150(CNOT6L)
CSAB: 103235851(CNOT6L) 103245122(CNOT6)
RRO: 104671527(CNOT6) 104679096(CNOT6L)
RBB: 108514171(CNOT6) 108532506(CNOT6L)
CJC: 100390585(CNOT6L) 100414347(CNOT6)
SBQ: 101032829(CNOT6) 101035015(CNOT6L)
MMU: 104625(Cnot6) 231464(Cnot6l)
MCAL: 110294221(Cnot6l) 110305259(Cnot6)
MPAH: 110330454(Cnot6l) 110331230(Cnot6)
RNO: 287249(Cnot6) 360917(Cnot6l)
MUN: 110547366(Cnot6) 110549700(Cnot6l)
CGE: 100764369 100769928(Cnot6l)
NGI: 103742612(Cnot6l) 103749363(Cnot6)
HGL: 101700106(Cnot6) 101708643(Cnot6l)
CCAN: 109686724(Cnot6) 109700800(Cnot6l)
OCU: 100343097(CNOT6) 100350183(CNOT6L)
TUP: 102496231(CNOT6) 102501402(CNOT6L)
CFA: 481463(CNOT6) 487817(CNOT6L)
VVP: 112911873(CNOT6) 112919716(CNOT6L)
AML: 100474935(CNOT6L) 100478261(CNOT6)
UMR: 103665339(CNOT6L) 103679993(CNOT6)
UAH: 113261545(CNOT6) 113263242(CNOT6L)
ORO: 101370394(CNOT6L) 101375417(CNOT6)
FCA: 101084253(CNOT6) 101096648(CNOT6L)
PTG: 102952677(CNOT6L) 102961768(CNOT6)
AJU: 106969943(CNOT6) 106976919(CNOT6L)
BTA: 518225(CNOT6L) 534707(CNOT6)
BOM: 102266193(CNOT6) 102279992(CNOT6L) 106701477
BIU: 109560613(CNOT6L) 109561328(CNOT6)
BBUB: 102402368(CNOT6) 102415466(CNOT6L)
PHD: 102323224(CNOT6L) 102325735(CNOT6)
CHX: 102169374(CNOT6) 102191783(CNOT6L)
OAS: 101111369(CNOT6L) 101120323(CNOT6)
SSC: 100512848(CNOT6L) 100516183(CNOT6)
CFR: 102505226(CNOT6) 102520991(CNOT6L)
CDK: 105091691(CNOT6L) 105100623(CNOT6)
BACU: 103005398(CNOT6) 103006131(CNOT6L)
LVE: 103069542(CNOT6L) 103074639(CNOT6)
OOR: 101285116(CNOT6L) 101288361(CNOT6)
DLE: 111170901(CNOT6) 111187650(CNOT6L)
ECB: 100057912(CNOT6) 100059049(CNOT6L)
EPZ: 103545209 103549482(CNOT6L) 103566204(CNOT6)
EAI: 106843728(CNOT6) 106846336(CNOT6L)
MYB: 102261756(CNOT6) 102263967(CNOT6L)
MYD: 102756082(CNOT6) 102759558 102760982(CNOT6L)
MNA: 107528436(CNOT6) 107532981(CNOT6L)
HAI: 109374695(CNOT6L) 109392776(CNOT6)
RSS: 109437632(CNOT6) 109440079(CNOT6L)
DRO: 112296380(CNOT6) 112321739(CNOT6L)
PALE: 102890026(CNOT6) 102898411(CNOT6L)
LAV: 100655410(CNOT6) 100659725(CNOT6L)
MDO: 100009944(CNOT6L) 100032045(CNOT6)
SHR: 100917730(CNOT6) 100924852(CNOT6L)
PCW: 110209736(CNOT6L) 110216713(CNOT6)
OAA: 100074018(CNOT6) 100075507(CNOT6L)
GGA: 416293(CNOT6) 422508(CNOT6L)
MGP: 100539601(CNOT6L) 100540861(CNOT6)
CJO: 107313176(CNOT6L) 107320180(CNOT6)
APLA: 101798399(CNOT6) 101800648(CNOT6L)
ACYG: 106032807(CNOT6) 106049330(CNOT6L)
TGU: 100218557(CNOT6L) 100231015(CNOT6)
LSR: 110471194(CNOT6L) 110482773(CNOT6)
SCAN: 103817286(CNOT6) 103823436(CNOT6L)
GFR: 102043885(CNOT6) 102044826(CNOT6L)
FAB: 101817075(CNOT6L) 101820084(CNOT6)
PHI: 102103701(CNOT6L) 102107484(CNOT6)
PMAJ: 107203340(CNOT6L) 107210718(CNOT6)
CCAE: 111929501(CNOT6L) 111935560(CNOT6)
CCW: 104689593(CNOT6) 104696810(CNOT6L)
ETL: 114060022(CNOT6L) 114065199(CNOT6)
FPG: 101912941(CNOT6L) 101920906(CNOT6)
FCH: 102049107(CNOT6L) 102055496(CNOT6)
CLV: 102091681(CNOT6) 102092282(CNOT6L)
EGZ: 104128425(CNOT6) 104128681(CNOT6L)
NNI: 104018442(CNOT6) 104023380(CNOT6L)
ACUN: 113479610(CNOT6L) 113485178(CNOT6)
AAM: 106492108(CNOT6L) 106493462(CNOT6)
ASN: 102369135(CNOT6L) 102375620(CNOT6)
AMJ: 102558230(CNOT6) 106737139(CNOT6L)
PSS: 102454438(CNOT6) 102460953(CNOT6L)
CMY: 102937437(CNOT6L) 102943090(CNOT6)
CPIC: 101940954(CNOT6L) 101951072(CNOT6)
ACS: 100556448(cnot6l) 100565621(cnot6)
PVT: 110073475(CNOT6) 110085245(CNOT6L)
PBI: 103060122(CNOT6) 103064231(CNOT6L)
PMUR: 107285859(CNOT6) 107287831(CNOT6L)
GJA: 107118872(CNOT6L) 107123713(CNOT6)
XLA: 100505426(cnot6) 432104(cnot6l.L) 495050(cnot6l.S) 779198
XTR: 100145505(cnot6l)
NPR: 108804444(CNOT6L)
DRE: 324048(cnot6a) 553665(cnot6l) 560386(cnot6b)
EEE: 113571280(cnot6) 113581528 113589371(cnot6l)
TRU: 101072935(cnot6) 101076674(cnot6l)
LCO: 104927070(cnot6) 104935033(cnot6l)
MZE: 101474769(cnot6l) 101479043(cnot6)
OLA: 101160421 101166103(cnot6l)
XMA: 102216502(cnot6l) 102235957
XCO: 114138922 114154682(cnot6l)
PRET: 103469825(cnot6l) 103471263
NFU: 107375846 107386047(cnot6l)
KMR: 108240592(cnot6) 108242797
LCF: 108881616(cnot6l) 108899234(cnot6)
HCQ: 109518774(cnot6) 109526929
BPEC: 110157614(cnot6) 110162078
MALB: 109957331(cnot6l) 109973146(cnot6)
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DFA: DFA_09793
PYO: PY17X_1237700(PY04723)
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TaxonomyKoalaUniProt
Reference
  Authors
Chen J, Chiang YC, Denis CL
  Title
CCR4, a 3'-5' poly(A) RNA and ssDNA exonuclease, is the catalytic component of the cytoplasmic deadenylase.
  Journal
EMBO J 21:1414-26 (2002)
DOI:10.1093/emboj/21.6.1414
  Sequence
[hsa:57472] [sce:YAL021C]

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