KEGG   ORTHOLOGY: K12622Help
Entry
K12622                      KO                                     

Name
LSM3
Definition
U6 snRNA-associated Sm-like protein LSm3
Pathway
ko03018  RNA degradation
ko03040  Spliceosome
Module
M00354  Spliceosome, U4/U6.U5 tri-snRNP
M00396  Lsm 2-8 complex
M00397  Lsm 1-7 complex
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:ko00001]
 Genetic Information Processing
  Transcription
   03040 Spliceosome
    K12622  LSM3; U6 snRNA-associated Sm-like protein LSm3
  Folding, sorting and degradation
   03018 RNA degradation
    K12622  LSM3; U6 snRNA-associated Sm-like protein LSm3
KEGG modules [BR:ko00002]
 Structural complex
  Genetic information processing
   Spliceosome
    M00354  Spliceosome, U4/U6.U5 tri-snRNP
     K12622  LSM3; U6 snRNA-associated Sm-like protein LSm3
    M00396  Lsm 2-8 complex
     K12622  LSM3; U6 snRNA-associated Sm-like protein LSm3
    M00397  Lsm 1-7 complex
     K12622  LSM3; U6 snRNA-associated Sm-like protein LSm3
Messenger RNA biogenesis [BR:ko03019]
 Eukaryotic Type
  mRNA surveillance and transport factors
   mRNA cycle factors
    P-body specific factors
     K12622  LSM3; U6 snRNA-associated Sm-like protein LSm3
  mRNA degradation factors
   5'-3' decay
    Lsm complex
     K12622  LSM3; U6 snRNA-associated Sm-like protein LSm3
Spliceosome [BR:ko03041]
 Complex B
  U4/U6.U5 tri-snRNP components
   LSm proteins
    K12622  LSM3; U6 snRNA-associated Sm-like protein LSm3
 Complex C
  U2 snRNP components
   LSm proteins
    K12622  LSM3; U6 snRNA-associated Sm-like protein LSm3
BRITE hierarchy
Other DBs
COG: COG1958
Genes
HSA: 27258(LSM3)
PTR: 742889(LSM3)
PPS: 100993995(LSM3)
GGO: 101148856(LSM3)
PON: 100443823(LSM3)
NLE: 100589617(LSM3)
MCC: 701060(LSM3)
MCF: 102146040(LSM3)
CSAB: 103228048(LSM3)
RRO: 104679026(LSM3)
RBB: 108544869(LSM3)
CJC: 100389959(LSM3)
SBQ: 101054153(LSM3)
MMU: 67678(Lsm3)
RNO: 297455(Lsm3)
CGE: 100765189(Lsm3)
NGI: 103751469(Lsm3)
HGL: 101708310(Lsm3)
CCAN: 109694028(Lsm3)
OCU: 100345430 100346711(LSM3)
TUP: 102473763(LSM3)
CFA: 607248(LSM3)
AML: 100473950(LSM3)
UMR: 103669509(LSM3)
ORO: 101380364(LSM3)
FCA: 101101627(LSM3)
PTG: 102969019(LSM3) 102970689
AJU: 106978680(LSM3)
BTA: 614759(LSM3)
BOM: 102276281(LSM3)
BIU: 109576432(LSM3)
CHX: 102190828(LSM3)
OAS: 101105285(LSM3)
SSC: 100514071(LSM3)
CFR: 102521069(LSM3)
CDK: 105093076(LSM3)
BACU: 103013829(LSM3)
LVE: 103070003 103090883(LSM3)
OOR: 101278135(LSM3)
ECB: 100629288(LSM3)
EPZ: 103559395(LSM3)
EAI: 106829369(LSM3)
MYB: 102246960(LSM3)
MYD: 102758071(LSM3) 102774183
HAI: 109384563(LSM3)
RSS: 109440582 109455511(LSM3)
PALE: 102895065(LSM3)
LAV: 100676033(LSM3)
TMU: 101340864
MDO: 100016218(LSM3)
SHR: 100918710(LSM3) 100924692
OAA: 100075732(LSM3)
GGA: 416040(LSM3)
MGP: 100546610(LSM3)
CJO: 107319911(LSM3)
APLA: 101796253(LSM3)
TGU: 100190009(LSM3)
GFR: 102042014(LSM3)
FAB: 101807977(LSM3)
PHI: 102107832(LSM3)
PMAJ: 107210338(LSM3)
CCW: 104683307(LSM3)
FPG: 101913641(LSM3)
FCH: 102058638(LSM3)
CLV: 102094969(LSM3)
EGZ: 104126623(LSM3)
AAM: 106498978(LSM3)
ASN: 102386899(LSM3)
AMJ: 102574303(LSM3)
PSS: 102462854(LSM3)
CMY: 102938974(LSM3)
CPIC: 101948934(LSM3)
ACS: 100553365(lsm3)
PVT: 110088150(LSM3)
PBI: 103056626(LSM3)
GJA: 107125915(LSM3)
XLA: 100049097(lsm3.L) 108714652
XTR: 100125161(lsm3)
NPR: 108795916(LSM3)
DRE: 100535720(lsm3)
SRX: 107710252 107720345(lsm3)
IPU: 108255226(lsm3)
AMEX: 103043938(lsm3)
TRU: 101063179(lsm3)
LCO: 104936091(lsm3)
NCC: 104944783(lsm3)
MZE: 101485712(lsm3)
OLA: 101175071(lsm3)
XMA: 102216790(lsm3)
PRET: 103464300(lsm3)
NFU: 107384980(lsm3)
CSEM: 103386519(lsm3)
LCF: 108884373(lsm3)
HCQ: 109510258(lsm3)
BPEC: 110162526(lsm3)
SASA: 100286430(lsm3)
ELS: 105006270(lsm3)
SFM: 108931268(lsm3)
LCM: 106703644(LSM3)
CMK: 103176687(lsm3)
CIN: 100186320
SPU: 581166
APLC: 110988583
SKO: 100370083
DME: Dmel_CG31184(LSm3)
DSI: Dsimw501_GD21053(Dsim_GD21053)
MDE: 101897462
AAG: 5572242
AME: 725401
BIM: 100742499
BTER: 100644665
SOC: 105198728
AEC: 105149693
ACEP: 105618989
PBAR: 105433079
HST: 105183337
CFO: 105252535
LHU: 105673106
PGC: 109856296
NVI: 100120443
TCA: 662059
DPA: 109544686
NVL: 108566870
BMOR: 732955
PMAC: 106721042
PRAP: 110997245
API: 100167860
DNX: 107161401
ZNE: 110831066
FCD: 110853948
TUT: 107365189
CEL: CELE_Y62E10A.12(lsm-3)
CBR: CBG01776(Cbr-lsm-3)
BMY: Bm1_38870
TSP: Tsp_00417
CRG: 105323611
MYI: 110445371
OBI: 106870208
LAK: 106155143
SHX: MS3_10410
EPA: 110236762
HMG: 105844489
AQU: 100635851
ATH: AT1G21190(LSM3A) AT1G76860(LSM3B)
CPAP: 110808045
CIT: 102612141
TCC: 18592602
EGR: 104449601
VRA: 106766048
VAR: 108344860
CCAJ: 109817296
CAM: 101510224
ADU: 107491632
AIP: 107644933
LJA: Lj0g3v0068179.1(Lj0g3v0068179.1) Lj1g3v3609490.1(Lj1g3v3609490.1)
FVE: 101296823
CSV: 101203558
CMO: 103485621
MCHA: 111006032
RCU: 8262315
HBR: 110648971
VVI: 100253870
SLY: 101264277
SPEN: 107004446
SOT: 102597966
CANN: 107851126
NTO: 104118388
INI: 109193453
LSV: 111897034
DCR: 108216357
BVG: 104895756
SOE: 110797006
OSA: 4325074
DOSA: Os01t0866700-01(Os01g0866700)
OBR: 102706052
BDI: 100822834
ATS: 109750384(LOC109750384) 109753143(LOC109753143)
SBI: 8060974
ZMA: 100194361
DCT: 110102905
ATR: 18444320
PPP: 112276367
CRE: CHLREDRAFT_185131(SMP8)
APRO: F751_3145
SCE: YLR438C-A(LSM3)
ERC: Ecym_1162
KMX: KLMA_50176(LSM3)
NCS: NCAS_0J01950(NCAS0J01950)
NDI: NDAI_0J02710(NDAI0J02710)
TPF: TPHA_0B00530(TPHA0B00530)
TBL: TBLA_0E04630(TBLA0E04630)
TDL: TDEL_0D00990(TDEL0D00990)
KAF: KAFR_0E04140(KAFR0E04140)
CAL: CAALFM_CR07330WA(SMX4)
CAUR: QG37_03248
NCR: NCU09512
NTE: NEUTE1DRAFT121723(NEUTE1DRAFT_121723)
MGR: MGG_16841
MAW: MAC_01618
MAJ: MAA_02450
CMT: CCM_07996
BFU: BCIN_08g06440(Bclsm3)
MBE: MBM_01032
ANG: ANI_1_908124(An14g06620)
PBN: PADG_11958(PADG_05668)
ABE: ARB_03397
TVE: TRV_08082
PTE: PTT_08854
SPO: SPBC9B6.05c(lsm3)
CNE: CNA07590
CNB: CNBA7410
ABP: AGABI1DRAFT72874(AGABI1DRAFT_72874)
ABV: AGABI2DRAFT203319(AGABI2DRAFT_203319)
MGL: MGL_2961
DDI: DDB_G0277107(lsm3)
DFA: DFA_01036(lsm3)
EHI: EHI_151310(2.t00032)
PYO: PY17X_0711100(PY03069)
TAN: TA15990
TPV: TP02_0106
BBO: BBOV_III010410(17.m07899)
CPV: cgd7_690
SPAR: SPRG_10785
 » show all
TaxonomyKoalaUniProt
Reference
  Authors
Kufel J, Bousquet-Antonelli C, Beggs JD, Tollervey D
  Title
Nuclear pre-mRNA decapping and 5' degradation in yeast require the Lsm2-8p complex.
  Journal
Mol Cell Biol 24:9646-57 (2004)
DOI:10.1128/MCB.24.21.9646-9657.2004
  Sequence
[sce:YLR438C-A]

DBGET integrated database retrieval system