KEGG   ORTHOLOGY: K12625Help
Entry
K12625                      KO                                     

Name
LSM6
Definition
U6 snRNA-associated Sm-like protein LSm6
Pathway
ko03018  RNA degradation
ko03040  Spliceosome
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:ko00001]
 09120 Genetic Information Processing
  09121 Transcription
   03040 Spliceosome
    K12625  LSM6; U6 snRNA-associated Sm-like protein LSm6
  09123 Folding, sorting and degradation
   03018 RNA degradation
    K12625  LSM6; U6 snRNA-associated Sm-like protein LSm6
 09180 Brite Hierarchies
  09182 Protein families: genetic information processing
   03019 Messenger RNA biogenesis
    K12625  LSM6; U6 snRNA-associated Sm-like protein LSm6
   03041 Spliceosome
    K12625  LSM6; U6 snRNA-associated Sm-like protein LSm6
Messenger RNA biogenesis [BR:ko03019]
 Eukaryotic type
  mRNA surveillance and transport factors
   mRNA cycle factors
    P-body specific factors
     K12625  LSM6; U6 snRNA-associated Sm-like protein LSm6
  mRNA degradation factors
   5'-3' decay
    Lsm complex
     K12625  LSM6; U6 snRNA-associated Sm-like protein LSm6
Spliceosome [BR:ko03041]
 Complex B
  U4/U6.U5 tri-snRNP components
   LSm proteins
    K12625  LSM6; U6 snRNA-associated Sm-like protein LSm6
BRITE hierarchy
Other DBs
COG: COG1958
Genes
HSA: 11157(LSM6)
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PPS: 100994728(LSM6)
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SPAR: SPRG_02970
BARC: AOA65_1064
 » show all
TaxonomyKoalaUniProt
Reference
  Authors
Kufel J, Bousquet-Antonelli C, Beggs JD, Tollervey D
  Title
Nuclear pre-mRNA decapping and 5' degradation in yeast require the Lsm2-8p complex.
  Journal
Mol Cell Biol 24:9646-57 (2004)
DOI:10.1128/MCB.24.21.9646-9657.2004
  Sequence
[sce:YDR378C]

DBGET integrated database retrieval system