KEGG   ORTHOLOGY: K12812Help
Entry
K12812                      KO                                     

Name
UAP56, BAT1, SUB2
Definition
ATP-dependent RNA helicase UAP56/SUB2 [EC:3.6.4.13]
Pathway
ko03013  RNA transport
ko03015  mRNA surveillance pathway
ko03040  Spliceosome
ko05164  Influenza A
Module
M00406  TREX complex
M00430  Exon junction complex (EJC)
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:ko00001]
 Genetic Information Processing
  Transcription
   03040 Spliceosome
    K12812  UAP56, BAT1, SUB2; ATP-dependent RNA helicase UAP56/SUB2
  Translation
   03013 RNA transport
    K12812  UAP56, BAT1, SUB2; ATP-dependent RNA helicase UAP56/SUB2
   03015 mRNA surveillance pathway
    K12812  UAP56, BAT1, SUB2; ATP-dependent RNA helicase UAP56/SUB2
 Human Diseases
  Infectious diseases
   05164 Influenza A
    K12812  UAP56, BAT1, SUB2; ATP-dependent RNA helicase UAP56/SUB2
KEGG modules [BR:ko00002]
 Structural complex
  Genetic information processing
   RNA processing
    M00430  Exon junction complex (EJC)
     K12812  UAP56, BAT1, SUB2; ATP-dependent RNA helicase UAP56/SUB2
    M00406  TREX complex
     K12812  UAP56, BAT1, SUB2; ATP-dependent RNA helicase UAP56/SUB2
Enzymes [BR:ko01000]
 3. Hydrolases
  3.6  Acting on acid anhydrides
   3.6.4  Acting on acid anhydrides to facilitate cellular and subcellular movement
    3.6.4.13  RNA helicase
     K12812  UAP56, BAT1, SUB2; ATP-dependent RNA helicase UAP56/SUB2
Messenger RNA biogenesis [BR:ko03019]
 Eukaryotic Type
  mRNA surveillance and transport factors
   Transport factors
    EJC complex
     K12812  UAP56, BAT1, SUB2; ATP-dependent RNA helicase UAP56/SUB2
Spliceosome [BR:ko03041]
 Complex C
  Other components
   EJC/TREX
    K12812  UAP56, BAT1, SUB2; ATP-dependent RNA helicase UAP56/SUB2
 Other splicing related proteins
  Spliceosome associated proteins (SAPs)
   TREX complex
    K12812  UAP56, BAT1, SUB2; ATP-dependent RNA helicase UAP56/SUB2
BRITE hierarchy
Other DBs
COG: COG0513
Genes
HSA: 7919(DDX39B)
PTR: 463180(DDX39B)
PPS: 100978005(DDX39B)
GGO: 101147472(DDX39B)
PON: 100174561(DDX39B)
NLE: 100583305(DDX39B)
MCC: 715233(DDX39B)
MCF: 101865332(DDX39B)
CSAB: 103221767(DDX39B)
RRO: 104661907(DDX39B)
RBB: 108520224(DDX39B)
CJC: 100395064(DDX39B)
SBQ: 101036182 101038331(DDX39B)
MMU: 53817(Ddx39b)
RNO: 114612(Ddx39b)
NGI: 103724455(Ddx39b)
HGL: 101719937(Ddx39b)
CCAN: 109690379(Ddx39b)
OCU: 100349333(DDX39B)
TUP: 102495885(DDX39B)
CFA: 474839(DDX39B)
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UMR: 103682342(DDX39B)
ORO: 101366446(DDX39B)
FCA: 101083847(DDX39B)
PTG: 102960336(DDX39B)
AJU: 106975939 106983968(DDX39B)
BTA: 540191(DDX39B)
BOM: 102276014(DDX39B)
BIU: 109577017(DDX39B)
PHD: 102324521(DDX39B)
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SSC: 448813(DDX39B)
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LVE: 103084702(DDX39B)
OOR: 101271173(DDX39B)
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PTI: PHATRDRAFT_51301(helicase_5)
SPAR: SPRG_06983
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TaxonomyKoalaUniProt
Reference
  Authors
Luo ML, Zhou Z, Magni K, Christoforides C, Rappsilber J, Mann M, Reed R
  Title
Pre-mRNA splicing and mRNA export linked by direct interactions between UAP56 and Aly.
  Journal
Nature 413:644-7 (2001)
DOI:10.1038/35098106
  Sequence
[hsa:7919]
Reference
  Authors
Boyne JR, Colgan KJ, Whitehouse A
  Title
Recruitment of the complete hTREX complex is required for Kaposi's sarcoma-associated herpesvirus intronless mRNA nuclear export and virus replication.
  Journal
PLoS Pathog 4:e1000194 (2008)
DOI:10.1371/journal.ppat.1000194
  Sequence
[hsa:7919]

DBGET integrated database retrieval system