KEGG   ORTHOLOGY: K12812Help
Entry
K12812                      KO                                     

Name
DDX39B, UAP56, SUB2
Definition
ATP-dependent RNA helicase UAP56/SUB2 [EC:3.6.4.13]
Pathway
ko03013  RNA transport
ko03015  mRNA surveillance pathway
ko03040  Spliceosome
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:ko00001]
 09120 Genetic Information Processing
  09121 Transcription
   03040 Spliceosome
    K12812  DDX39B, UAP56, SUB2; ATP-dependent RNA helicase UAP56/SUB2
  09122 Translation
   03013 RNA transport
    K12812  DDX39B, UAP56, SUB2; ATP-dependent RNA helicase UAP56/SUB2
   03015 mRNA surveillance pathway
    K12812  DDX39B, UAP56, SUB2; ATP-dependent RNA helicase UAP56/SUB2
 09180 Brite Hierarchies
  09182 Protein families: genetic information processing
   03019 Messenger RNA biogenesis
    K12812  DDX39B, UAP56, SUB2; ATP-dependent RNA helicase UAP56/SUB2
   03041 Spliceosome
    K12812  DDX39B, UAP56, SUB2; ATP-dependent RNA helicase UAP56/SUB2
Enzymes [BR:ko01000]
 3. Hydrolases
  3.6  Acting on acid anhydrides
   3.6.4  Acting on acid anhydrides to facilitate cellular and subcellular movement
    3.6.4.13  RNA helicase
     K12812  DDX39B, UAP56, SUB2; ATP-dependent RNA helicase UAP56/SUB2
Messenger RNA biogenesis [BR:ko03019]
 Eukaryotic type
  mRNA surveillance and transport factors
   Transport factors
    EJC complex
     K12812  DDX39B, UAP56, SUB2; ATP-dependent RNA helicase UAP56/SUB2
Spliceosome [BR:ko03041]
 Complex C
  Other components
   EJC/TREX
    K12812  DDX39B, UAP56, SUB2; ATP-dependent RNA helicase UAP56/SUB2
 Other splicing related proteins
  Spliceosome associated proteins (SAPs)
   TREX complex
    K12812  DDX39B, UAP56, SUB2; ATP-dependent RNA helicase UAP56/SUB2
BRITE hierarchy
Other DBs
COG: COG0513
GO: 0003724
TC: 3.A.18.1 3.A.22.1
Genes
HSA: 7919(DDX39B)
PTR: 463180(DDX39B)
PPS: 100978005(DDX39B)
GGO: 101147472(DDX39B)
PON: 100174561(DDX39B)
NLE: 100583305(DDX39B)
MCC: 715233(DDX39B)
MCF: 101865332(DDX39B)
CSAB: 103221767(DDX39B)
RRO: 104657239 104661907(DDX39B)
RBB: 108520224(DDX39B)
CJC: 100395064(DDX39B)
SBQ: 101036182 101038331(DDX39B)
MMU: 53817(Ddx39b)
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MPAH: 110335531(Ddx39b)
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MYD: 102757850(DDX39B)
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PTI: PHATRDRAFT_51301(helicase_5)
SPAR: SPRG_06983
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TaxonomyKoalaUniProt
Reference
  Authors
Luo ML, Zhou Z, Magni K, Christoforides C, Rappsilber J, Mann M, Reed R
  Title
Pre-mRNA splicing and mRNA export linked by direct interactions between UAP56 and Aly.
  Journal
Nature 413:644-7 (2001)
DOI:10.1038/35098106
  Sequence
[hsa:7919]
Reference
  Authors
Boyne JR, Colgan KJ, Whitehouse A
  Title
Recruitment of the complete hTREX complex is required for Kaposi's sarcoma-associated herpesvirus intronless mRNA nuclear export and virus replication.
  Journal
PLoS Pathog 4:e1000194 (2008)
DOI:10.1371/journal.ppat.1000194
  Sequence
[hsa:7919]

DBGET integrated database retrieval system