KEGG   ORTHOLOGY: K12845Help
Entry
K12845                      KO                                     

Name
SNU13, NHP2L
Definition
U4/U6 small nuclear ribonucleoprotein SNU13
Pathway
ko03008  Ribosome biogenesis in eukaryotes
ko03040  Spliceosome
Module
M00354  Spliceosome, U4/U6.U5 tri-snRNP
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:ko00001]
 Genetic Information Processing
  Transcription
   03040 Spliceosome
    K12845  SNU13, NHP2L; U4/U6 small nuclear ribonucleoprotein SNU13
  Translation
   03008 Ribosome biogenesis in eukaryotes
    K12845  SNU13, NHP2L; U4/U6 small nuclear ribonucleoprotein SNU13
KEGG modules [BR:ko00002]
 Structural complex
  Genetic information processing
   Spliceosome
    M00354  Spliceosome, U4/U6.U5 tri-snRNP
     K12845  SNU13, NHP2L; U4/U6 small nuclear ribonucleoprotein SNU13
Spliceosome [BR:ko03041]
 Complex B
  U4/U6.U5 tri-snRNP components
   U4/U6 snRNP specific factors
    K12845  SNU13, NHP2L; U4/U6 small nuclear ribonucleoprotein SNU13
Ribosome biogenesis [BR:ko03009]
 Eukaryotic Type
  Sno RNPs
   Box C/D snoRNPs
    K12845  SNU13, NHP2L; U4/U6 small nuclear ribonucleoprotein SNU13
BRITE hierarchy
Other DBs
COG: COG1358
Genes
HSA: 4809(SNU13)
PTR: 458869(SNU13)
PPS: 100968235(SNU13)
GGO: 101129194(SNU13)
PON: 100447181(SNU13)
NLE: 100600266(SNU13)
MCC: 708283(SNU13)
MCF: 101926085(SNU13)
CSAB: 103223391(SNU13)
RRO: 104671607(SNU13)
CJC: 100390384(SNU13)
SBQ: 101028525(NHP2L1)
MMU: 100862468 20826(Snu13)
RNO: 100359574 300092(Nhp2l1)
CGE: 100771351(Snu13) 103160319
NGI: 103743470(Snu13)
HGL: 101703114(Snu13)
CCAN: 109689387(Snu13)
OCU: 100351699(SNU13)
TUP: 102492648 102497810(SNU13)
CFA: 474484(SNU13)
AML: 100478368(SNU13)
UMR: 103674077(SNU13)
ORO: 101383074(NHP2L1)
FCA: 101081647(SNU13)
PTG: 102961087(SNU13)
AJU: 106979937(SNU13)
BTA: 767931(SNU13)
BOM: 102276892(SNU13)
BIU: 109559866(SNU13)
PHD: 102323332(SNU13)
CHX: 102168897(SNU13)
OAS: 101112386(SNU13)
SSC: 100155420(SNU13)
CFR: 102521603(SNU13)
CDK: 105091892(SNU13)
BACU: 103003350(SNU13) 103004724
LVE: 103082397 103089777(SNU13)
OOR: 101275200(NHP2L1)
ECB: 100070695(SNU13)
EPZ: 103562701(SNU13)
EAI: 106848514(SNU13)
MYB: 102244468 102256910(SNU13)
MYD: 102756919(SNU13)
HAI: 109377513(SNU13)
RSS: 109448847(SNU13)
PALE: 102889833(SNU13)
LAV: 100655775(SNU13)
TMU: 101361106
MDO: 100028876(SNU13)
SHR: 100924060(SNU13)
OAA: 100076480(SNU13)
GGA: 417986(SNU13)
MGP: 100546935(SNU13)
CJO: 107313195(SNU13)
APLA: 106020692(SNU13)
ACYG: 106045249(SNU13)
TGU: 100221514(SNU13) 100230738
GFR: 102039006(SNU13)
FAB: 101806665(SNU13)
PHI: 102106194(SNU13)
PMAJ: 107204597(SNU13)
CCW: 104692300 104696539(SNU13)
FPG: 101923234(SNU13)
FCH: 102046835(SNU13)
EGZ: 104134256(NHP2L1)
AAM: 106488871(SNU13)
ASN: 102368710(SNU13)
AMJ: 102558074(SNU13)
PSS: 102445152(SNU13)
CMY: 102946830(SNU13)
CPIC: 101945752(SNU13)
ACS: 100552266(snu13)
PVT: 110076064(SNU13)
PBI: 103054140(SNU13)
GJA: 107117165(SNU13)
XLA: 380416(snu13.L) 495253(snu13.S)
XTR: 394590(snu13)
NPR: 108793020(SNU13)
DRE: 321114(snu13b) 393282(snu13a)
TRU: 101079948(snu13)
LCO: 104918064(snu13)
NCC: 104958529(nhp2l1)
MZE: 101484437(snu13)
OLA: 101175271(snu13)
XMA: 102217383(snu13)
PRET: 103481973(snu13)
NFU: 107388175(snu13)
CSEM: 103382356(snu13)
LCF: 108880776(snu13)
HCQ: 109516574(snu13)
BPEC: 110159671(snu13)
SASA: 106589607(NH2L1) 106601742(NH2L1) 106606728 106609990
SFM: 108939966(snu13)
LCM: 102367071(SNU13)
CMK: 103178742(snu13)
CIN: 100182620
SPU: 587294
APLC: 110981887
SKO: 100371232
DME: Dmel_CG3949(hoip)
DSI: Dsimw501_GD23622(Dsim_GD23622)
MDE: 101888628
AAG: 5577910
AME: 102655272
BIM: 105681017
BTER: 105666221
SOC: 105205201
AEC: 105152628
ACEP: 105621762
PBAR: 105426119
CFO: 105249083
LHU: 105671353
PGC: 109851868
NVI: 103317617
TCA: 664143
DPA: 109544783
NVL: 108566492
BMOR: 692972(RpL7Ae)
PMAC: 106720749
PRAP: 111003458
PXY: 105383607
API: 100164236
ZNE: 110837339
FCD: 110842222
CEL: CELE_M28.5(M28.5)
CBR: CBG03041
BMY: Bm1_42550
TSP: Tsp_02465
MYI: 110453768
OBI: 106882140
LAK: 106156251
EPA: 110240820
HMG: 100207378
AQU: 100636318
CPAP: 110812736
TCC: 18588745
AIP: 107620074
LJA: Lj0g3v0120989.1(Lj0g3v0120989.1) Lj1g3v0672680.1(Lj1g3v0672680.1)
FVE: 101301807
ZJU: 107404143
CSV: 101222939
RCU: 8275870
JCU: 105639351
SIND: 105170591
BVG: 104902053
DOSA: Os03t0241200-00(Os03g0241200) Os10t0124000-01(Os10g0124000)
OBR: 102722656
ATS: 109740262(LOC109740262)
SITA: 101781743
DCT: 110093060
MNG: MNEG_1179
APRO: F751_2002
SCE: YEL026W(SNU13)
ERC: Ecym_1375
KMX: KLMA_10721(SNU13)
NCS: NCAS_0A08350(NCAS0A08350)
NDI: NDAI_0G04810(NDAI0G04810)
TPF: TPHA_0B04030(TPHA0B04030)
TBL: TBLA_0D01990(TBLA0D01990)
TDL: TDEL_0B05380(TDEL0B05380)
KAF: KAFR_0F01320(KAFR0F01320)
CAL: CAALFM_C304380CA(CaO19.5885)
CAUR: QG37_07090
SLB: AWJ20_3897(SNU13)
NCR: NCU01331
NTE: NEUTE1DRAFT115856(NEUTE1DRAFT_115856)
MGR: MGG_02467
MAW: MAC_03411
MAJ: MAA_02009
CMT: CCM_00301
MBE: MBM_04703
ANI: AN1319.2
ANG: ANI_1_1980024(An02g14340)
ABE: ARB_02998
TVE: TRV_01714
PNO: SNOG_10693(SNOG_10692)
PTE: PTT_16812
SPO: SPAC607.03c(snu13)
CNE: CNG01500
CNB: CNBG3280
MRR: Moror_841
MGL: MGL_0793
DDI: DDB_G0282243(nhp2l1)
DFA: DFA_07073(nhp2l1)
EHI: EHI_053440(59.t00026) EHI_104600(415.t00007)
PYO: PY17X_0926400(PY03136)
PCB: PCHAS_092000(PC000674.04.0)
TAN: TA11075
BBO: BBOV_III009740(17.m07845)
CPV: cgd6_3850
SMIN: v1.2.021437.t1(symbB.v1.2.021437.t1)
TPS: THAPSDRAFT_28570(L7Ae)
NGD: NGA_0448500(SNU13)
SPAR: SPRG_04028
 » show all
TaxonomyKoalaUniProt
Reference
  Authors
Dobbyn HC, McEwan PA, Krause A, Novak-Frazer L, Bella J, O'Keefe RT
  Title
Analysis of pre-mRNA and pre-rRNA processing factor Snu13p structure and mutants.
  Journal
Biochem Biophys Res Commun 360:857-62 (2007)
DOI:10.1016/j.bbrc.2007.06.163
  Sequence
[sce:YEL026W]
Reference
  Authors
Liu S, Li P, Dybkov O, Nottrott S, Hartmuth K, Luhrmann R, Carlomagno T, Wahl MC
  Title
Binding of the human Prp31 Nop domain to a composite RNA-protein platform in U4 snRNP.
  Journal
Science 316:115-20 (2007)
DOI:10.1126/science.1137924
  Sequence
[hsa:4809]

DBGET integrated database retrieval system