KEGG   ORTHOLOGY: K12857Help
Entry
K12857                      KO                                     

Name
SNRNP40, PRP8BP
Definition
Prp8 binding protein
Pathway
ko03040  Spliceosome
Module
M00354  Spliceosome, U4/U6.U5 tri-snRNP
M00355  Spliceosome, 35S U5-snRNP
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:ko00001]
 Genetic Information Processing
  Transcription
   03040 Spliceosome
    K12857  SNRNP40, PRP8BP; Prp8 binding protein
KEGG modules [BR:ko00002]
 Structural complex
  Genetic information processing
   Spliceosome
    M00354  Spliceosome, U4/U6.U5 tri-snRNP
     K12857  SNRNP40, PRP8BP; Prp8 binding protein
    M00355  Spliceosome, 35S U5-snRNP
     K12857  SNRNP40, PRP8BP; Prp8 binding protein
Spliceosome [BR:ko03041]
 Complex B
  U4/U6.U5 tri-snRNP components
   U5 snRNP specific factors
    K12857  SNRNP40, PRP8BP; Prp8 binding protein
 Complex C
  U4/U6.U5 tri-snRNP components
   U5 SnRNP specific factors
    K12857  SNRNP40, PRP8BP; Prp8 binding protein
BRITE hierarchy
Genes
HSA: 9410(SNRNP40)
PTR: 470976(SNRNP40)
PPS: 100968772(SNRNP40)
GGO: 101139239(SNRNP40)
PON: 100171563(SNRNP40)
NLE: 100583223(SNRNP40)
MCC: 705059(SNRNP40)
MCF: 101865580(SNRNP40)
CSAB: 103225228(SNRNP40)
RRO: 104654457(SNRNP40)
RBB: 108518577(SNRNP40)
CJC: 100392445(SNRNP40)
SBQ: 101051539(SNRNP40)
MMU: 66585(Snrnp40)
RNO: 313056(Snrnp40)
CGE: 100761430(Snrnp40)
NGI: 103746146(Snrnp40)
HGL: 101701280 101704694(Snrnp40)
CCAN: 109681728 109685951(Snrnp40)
OCU: 100348498(SNRNP40)
TUP: 102488994(SNRNP40)
CFA: 611914(SNRNP40)
AML: 100482861(SNRNP40)
UMR: 103666464(SNRNP40)
ORO: 101375958(SNRNP40)
FCA: 101094774(SNRNP40)
PTG: 102969891(SNRNP40)
AJU: 106981658 106982402(SNRNP40)
BTA: 534645(SNRNP40)
BOM: 102281849(SNRNP40)
BIU: 109572598(SNRNP40)
PHD: 102328406(SNRNP40)
CHX: 102171935(SNRNP40)
OAS: 101120474(SNRNP40)
SSC: 100624754(SNRNP40)
CFR: 102521942(SNRNP40)
CDK: 105085816(SNRNP40)
BACU: 103013772(SNRNP40)
LVE: 103085582(SNRNP40)
OOR: 101278629(SNRNP40)
ECB: 100070474(SNRNP40)
EPZ: 103541822(SNRNP40)
EAI: 106829073(SNRNP40)
MYB: 102241462(SNRNP40)
MYD: 102771032(SNRNP40)
HAI: 109390472(SNRNP40)
RSS: 109446510(SNRNP40)
PALE: 102896746(SNRNP40)
LAV: 100662588(SNRNP40)
TMU: 101342309
MDO: 100027017(SNRNP40)
SHR: 100918723(SNRNP40)
OAA: 100090783(SNRNP40)
GGA: 419556(SNRNP40)
MGP: 100541327(SNRNP40)
CJO: 107324035(SNRNP40)
APLA: 101795204(SNRNP40)
ACYG: 106045153(SNRNP40)
GFR: 102038970(SNRNP40)
FAB: 101812662(SNRNP40)
PHI: 102105510(SNRNP40)
PMAJ: 107214059(SNRNP40)
CCW: 104697701(SNRNP40)
FPG: 101920054(SNRNP40)
FCH: 102057055(SNRNP40)
CLV: 102090736(SNRNP40)
EGZ: 104132567(SNRNP40)
AAM: 106484209(SNRNP40)
ASN: 102372907(SNRNP40)
AMJ: 102566389(SNRNP40)
PSS: 102446849(SNRNP40)
CMY: 102935476(SNRNP40)
CPIC: 101951931(SNRNP40)
ACS: 100558825(snrnp40)
PVT: 110089358(SNRNP40)
PBI: 103067888(SNRNP40)
GJA: 107110859(SNRNP40)
XLA: 379514(snrnp40.L) 380404(snrnp40.S)
XTR: 594941(snrnp40)
NPR: 108795603(SNRNP40)
DRE: 393292(snrnp40)
SRX: 107706130 107742865(snrnp40)
IPU: 100528200(snrnp40)
AMEX: 103032740(snrnp40)
TRU: 101071364(snrnp40)
LCO: 104922079(snrnp40)
NCC: 104967410(snrnp40)
MZE: 101487450(snrnp40)
OLA: 101156339(snrnp40)
XMA: 102238284(snrnp40)
PRET: 103472318(snrnp40)
NFU: 107394789(snrnp40)
CSEM: 103394346(snrnp40)
LCF: 108897762(snrnp40)
HCQ: 109518375(snrnp40)
BPEC: 110167414(snrnp40)
ELS: 105012435(snrnp40)
SFM: 108931854(snrnp40)
LCM: 102351311(SNRNP40)
CMK: 103179512(snrnp40)
CIN: 100183839
SPU: 578850
APLC: 110980462
SKO: 100373287
DSI: Dsimw501_GD23005(Dsim_GD23005)
MDE: 101891716
AME: 552715
BIM: 100740532
BTER: 100644493
SOC: 105207618
AEC: 105143859
ACEP: 105620074
PBAR: 105432131
HST: 105191549
CFO: 105253119
LHU: 105671255
PGC: 109854673
NVI: 100122941
TCA: 656388
DPA: 109545232
NVL: 108566735
BMOR: 101740129
PMAC: 106713171
PRAP: 110999128
PXY: 105380555
API: 100168082(Snrnp40)
DNX: 107164606
ZNE: 110830506
FCD: 110848211
TUT: 107361742
CEL: CELE_C18E3.5(snrp-40.2) CELE_F08G12.2(snrp-40.1)
CBR: CBG17375
BMY: Bm1_20440
TSP: Tsp_07793
CRG: 105327775
MYI: 110445362
OBI: 106880024
LAK: 106175601
SHX: MS3_03669
EPA: 110239124
ADF: 107336855
HMG: 100199715
AQU: 100635981
ATH: AT2G43770
CRB: 17888275
BRP: 103866741
BOE: 106341909
CPAP: 110819819
CIT: 102624666
TCC: 18602336
GRA: 105776916
GHI: 107896773
EGR: 104428012
GMX: 100789793
VRA: 106753980
VAR: 108329674
CCAJ: 109792216
CAM: 101492623
ADU: 107494046
AIP: 107604804
LJA: Lj1g3v3975960.1(Lj1g3v3975960.1) Lj1g3v3975970.1(Lj1g3v3975970.1)
LANG: 109358703
FVE: 101313272
PPER: 18791673
PMUM: 103323618
PAVI: 110758436
PXB: 103950482
ZJU: 107407354
CSV: 101216854
CMO: 103488871
MCHA: 111019808
CMAX: 111466479
CMOS: 111449859
CPEP: 111802267
RCU: 8286371
JCU: 105636685
POP: 112325249
JRE: 109005832
VVI: 100267975
SLY: 101256361
SPEN: 107015323
SOT: 102605588
CANN: 107843970
NTA: 107782719
NSY: 104237284
NTO: 104104446
INI: 109170122
SIND: 105158805
HAN: 110942492
LSV: 111909090
DCR: 108205791
BVG: 104907051
SOE: 110805923
NNU: 104607792
OSA: 4341706
DOSA: Os06t0653800-01(Os06g0653800)
OBR: 102718845
BDI: 100826831
ATS: 109749438(LOC109749438)
SBI: 8069357
ZMA: 100193655(pco139470) 100216905
SITA: 101767192
PDA: 103708149
EGU: 105047027
MUS: 103976945
DCT: 110096155
AOF: 109844349
ATR: 18448665
MNG: MNEG_7485
APRO: F751_5335
ERC: Ecym_8044
SLB: AWJ20_4347(ASC1)
NCR: NCU05797
NTE: NEUTE1DRAFT148308(NEUTE1DRAFT_148308)
MGR: MGG_04693
MAW: MAC_02475
MAJ: MAA_00349
CMT: CCM_06748
MBE: MBM_04669
ANI: AN9085.2
ANG: ANI_1_46104(An12g00370)
ABE: ARB_04658
TVE: TRV_07285
PTE: PTT_05673
SPO: SPBC1289.11(spf38)
CNE: CNG00230
CNB: CNBG4530
ABP: AGABI1DRAFT57038(AGABI1DRAFT_57038)
ABV: AGABI2DRAFT229038(AGABI2DRAFT_229038)
MGL: MGL_1420
DDI: DDB_G0271788(wdr57)
DFA: DFA_02480(wdr57)
PYO: PY17X_0708100(PY02499)
PCB: PCHAS_071710(PC000823.04.0)
TAN: TA09305
TPV: TP04_0151
BBO: BBOV_II003890(18.m06324)
CPV: cgd4_3140
NGD: NGA_2061700(SNRNP40)
SPAR: SPRG_03552
 » show all
TaxonomyKoalaUniProt
Reference
PMID:9774689
  Authors
Achsel T, Ahrens K, Brahms H, Teigelkamp S, Luhrmann R
  Title
The human U5-220kD protein (hPrp8) forms a stable RNA-free complex with several U5-specific proteins, including an RNA unwindase, a homologue of ribosomal elongation factor EF-2, and a novel WD-40 protein.
  Journal
Mol Cell Biol 18:6756-66 (1998)
DOI:10.1128/MCB.18.11.6756
  Sequence
[hsa:9410]

DBGET integrated database retrieval system