KEGG   ORTHOLOGY: K12893Help
Entry
K12893                      KO                                     

Name
SFRS4_5_6
Definition
splicing factor, arginine/serine-rich 4/5/6
Pathway
ko03040  Spliceosome
ko05168  Herpes simplex infection
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:ko00001]
 09120 Genetic Information Processing
  09121 Transcription
   03040 Spliceosome
    K12893  SFRS4_5_6; splicing factor, arginine/serine-rich 4/5/6
 09160 Human Diseases
  09172 Infectious diseases: Viral
   05168 Herpes simplex infection
    K12893  SFRS4_5_6; splicing factor, arginine/serine-rich 4/5/6
 09180 Brite Hierarchies
  09182 Protein families: genetic information processing
   03041 Spliceosome
    K12893  SFRS4_5_6; splicing factor, arginine/serine-rich 4/5/6
Spliceosome [BR:ko03041]
 Common components
  Common spliceosomal components
   SR proteins
    K12893  SFRS4_5_6; splicing factor, arginine/serine-rich 4/5/6
BRITE hierarchy
Genes
HSA: 6429(SRSF4) 6430(SRSF5) 6431(SRSF6)
PTR: 453000(SRSF5) 469946(SRSF6) 740597(SRSF4)
PPS: 100968653(SRSF6) 100985817(SRSF5) 100993552(SRSF4)
GGO: 101134512(SRSF4) 101138719(SRSF6) 101147676(SRSF5)
PON: 100454854(SRSF4) 100455023(SRSF6) 100458472(SRSF5)
NLE: 100587770(SRSF6) 100597914(SRSF4) 100602397(SRSF5)
MCC: 696054(SRSF6) 712867(SRSF5) 717401(SRSF4)
MCF: 101926639(SRSF5) 101926826(SRSF6) 102122830(SRSF4)
CSAB: 103225244(SRSF4) 103229250(SRSF5) 103245801(SRSF6)
RRO: 104659643(SRSF5) 104675686(SRSF4) 104678890(SRSF6)
RBB: 108520276(SRSF5) 108530044(SRSF4) 108533396(SRSF6)
CJC: 100399294(SRSF6) 100402973(SRSF4) 100411323(SRSF5)
SBQ: 101028976(SRSF4) 101037943(SRSF6) 101045545(SRSF5)
MMU: 20384(Srsf5) 57317(Srsf4) 67996(Srsf6)
RNO: 29667(Srsf5) 362264(Srsf6) 362612(Srsf4)
CGE: 100757287(Srsf5) 100762302(Srsf4) 100771875(Srsf6)
NGI: 103744206(Srsf5) 103745906(Srsf4) 103748370(Srsf6)
HGL: 101703416(Srsf5) 101719303(Srsf6) 101723832(Srsf4)
CCAN: 109682917(Srsf4) 109685997(Srsf5) 109692505(Srsf6) 109697626
OCU: 100008654(SRSF6) 100340192(SRSF5) 100350179(SRSF4)
TUP: 102470546(SRSF6) 102494938(SRSF5) 102503073(SRSF4)
CFA: 403667(SRSF6) 478160(SRSF4) 490754(SRSF5)
AML: 100470426(SRSF6) 100471264(SRSF5) 100475275(SRSF4)
UMR: 103666475(SRSF4) 103669887(SRSF6) 103671593(SRSF5)
ORO: 101362612(SRSF6) 101372555(SRSF5) 101380558(SRSF4)
FCA: 101089628(SRSF4) 101091686(SRSF6) 101101389(SRSF5)
PTG: 102952138(SRSF6) 102953180(SRSF5) 102970401(SRSF4)
AJU: 106970374(SRSF4) 106974470(SRSF5) 113602547(SRSF6)
BTA: 507828(SRSF6) 510474(SRSF5) 614310(SRSF4)
BOM: 102266791(SRSF5) 102272846(SRSF4) 102278589(SRSF6)
BIU: 109565293(SRSF5) 109567458(SRSF6) 109572723(SRSF4)
PHD: 102317821(SRSF6) 102325412(SRSF4) 102338030(SRSF5)
CHX: 102171331(SRSF6) 102176083(SRSF4) 102176537(SRSF5)
OAS: 101106704(SRSF6) 101109078(SRSF4) 101119990(SRSF5)
SSC: 100154509(SRSF5) 768101(SRSF4) 768102(SRSF6)
CFR: 102507939(SRSF6) 102512933(SRSF5) 102520954(SRSF4)
CDK: 105086152(SRSF5) 105087126(SRSF6) 105090396(SRSF4)
BACU: 103008022(SRSF4) 103009581(SRSF6) 103015975(SRSF5) 103018603
LVE: 103070665(SRSF6) 103085336(SRSF5) 103086100(SRSF4)
OOR: 101270820 101281391(SRSF4) 101283089(SRSF6) 101287933(SRSF5)
ECB: 100053264(SRSF5) 100070669(SRSF6) 106780873(SRSF4)
EPZ: 103544133(SRSF5) 103548193(SRSF6) 103550919(SRSF4)
EAI: 106834394(SRSF6) 106839134(SRSF4) 106847735(SRSF5)
MYB: 102239956(SRSF5) 102244545(SRSF4) 102252211(SRSF6)
MYD: 102759937(SRSF5) 102766736(SRSF6) 102774250(SRSF4)
HAI: 109379958(SRSF6) 109382108(SRSF5) 109392089(SRSF4)
RSS: 109442855 109448368(SRSF5) 109449178(SRSF4) 109456224(SRSF6)
PALE: 102890422(SRSF5) 102897377(SRSF6) 102898727(SRSF4)
LAV: 100655448(SRSF6) 100661167(SRSF4) 100663406(SRSF5)
MDO: 100015407(SRSF4) 100023766(SRSF5) 100028254(SRSF6)
SHR: 100916980 100925223(SRSF6) 100926958(SRSF5)
OAA: 100082305(SRSF4) 100087972(SRSF5) 100091342
GGA: 419116(SRSF6) 419600(SRSF4) 423258(SRSF5) 423265(SRSF5A)
MGP: 100538990(SRSF5) 100547039(SRSF4) 100549826 100550929(SRSF6)
CJO: 107314910(SRSF5) 107314951 107322819(SRSF6) 107324009(SRSF4)
APLA: 101791210(SRSF4) 101794750 101795346(SRSF5) 101799354(SRSF6)
ACYG: 106031649(SRSF5) 106031662 106045151(SRSF4) 106045401(SRSF6)
TGU: 100217999(SRSF4) 100220017 100228119(SRSF6) 100231521(SRSF5)
GFR: 102033517(SRSF6) 102034095(SRSF5) 102037958(SRSF4) 102042172
FAB: 101808178(SRSF4) 101811195(SRSF5) 101814351 101819644(SRSF6)
PHI: 102101156 102104174(SRSF4) 102113526(SRSF6) 102114356(SRSF5)
PMAJ: 107206036 107206095(SRSF5) 107213332(SRSF6) 107214251(SRSF4)
FPG: 101911789 101914580(SRSF4) 101917668(SRSF5) 101924417(SRSF6)
FCH: 102048374 102048755(SRSF6) 102057070(SRSF5) 102059726(SRSF4)
EGZ: 104122074(SRSF5) 104122104 104125453(SRSF6) 104132563(SRSF4)
NNI: 104017923(SRSF4) 104019950(SRSF6) 104020308 104020420(SRSF5)
ACUN: 113480531 113480764(SRSF5) 113488358(SRSF4) 113490662(SRSF6)
AAM: 106494654(SRSF4) 106498086(SRSF5) 106498327 106499908(SRSF6)
ASN: 102373471(SRSF4) 102379116(SRSF5) 102388763(SRSF6)
AMJ: 102561126(SRSF6) 102561322(SRSF4) 102561644(SRSF5)
PSS: 102444787(SRSF4) 102448185(SRSF6) 102453174 102456485(SRSF5)
CMY: 102930099(SRSF5) 102932940 102935368(SRSF6) 102938198(SRSF4)
CPIC: 101942745(SRSF6) 101944773 101947357(SRSF4) 101951372(SRSF5)
PVT: 110076403(SRSF5) 110076419 110082276(SRSF4) 110083026(SRSF6)
PMUR: 107285833 107286030(SRSF4) 107291069(SRSF5) 107296397(SRSF6)
GJA: 107107728 107112211(SRSF5) 107112282(SRSF6) 107121099(SRSF4)
XLA: 108699194(srsf5.L) 108708224 108709565 379230(krt5.1b) 379334(srsf6.S) 379840(srsf6.L) 432350(srsf5.S) 443807(srsf4.L)
XTR: 100038227(srsf4) 407954(srsf6) 448003(srsf5) 448104(krt5.1)
NPR: 108787982(SRSF6) 108792965(SRSF4) 108795758 108798644(SRSF5)
DRE: 321872(srsf4) 335396(srsf5a) 406775(srsf6a) 436883(srsf5b) 494133(srsf6b)
PHYP: 113537922(srsf6) 113541882(srsf5) 113545638
NCC: 104943887(srsf6) 104962905(srsf5) 104967457
CSEM: 103381036(srsf5) 103381207 103384514(srsf6) 103393948
SASA: 100195236(sfrs6) 106570648 106571090 106571981(SFRS6) 106582777(srsf6) 106589034 106602985(SFRS5) 106608158(SFRS5) 106611464(SFRS5)
SPU: 594205
APLC: 110975229
DME: Dmel_CG10851(B52)
DER: 6553611
DPE: 6588545
DSI: Dsimw501_GD18917(Dsim_GD18917)
DWI: 6651081
MDE: 101896719
AME: 408309
BIM: 100746299
BTER: 100648221
SOC: 105197570
MPHA: 105834588
AEC: 105146840
ACEP: 105627920
PBAR: 105431051
HST: 105191216
DQU: 106747914
CFO: 105256427
LHU: 105671346
PGC: 109859402
OBO: 105287805
PCF: 106784567
NVI: 100113663
MDL: 103576378
BMOR: 733142(Sfrs6)
PMAC: 106707716
PRAP: 110992464
HAW: 110376278
TNL: 113499340
PXY: 105382628
API: 100162182
DNX: 107166790
CLEC: 106667508
ZNE: 110837167
FCD: 110851985
TUT: 107360570
DPTE: 113793415
CEL: CELE_W02B12.2(rsp-2) CELE_W02B12.3(rsp-1)
CBR: CBG02890(Cbr-rsp-1) CBG02891(Cbr-rsp-2)
BMY: Bm1_52870
MYI: 110449184
OBI: 106873382
LAK: 106155630
SHX: MS3_07135
EGL: EGR_04214
AQU: 100632166
ATH: AT2G46610(RS31a) AT3G61860(RS31) AT4G25500(RS40) AT5G52040(RS41)
LJA: Lj0g3v0286629.1(Lj0g3v0286629.1) Lj0g3v0286629.2(Lj0g3v0286629.2) Lj1g3v5038220.1(Lj1g3v5038220.1) Lj2g3v0435440.1(Lj2g3v0435440.1) Lj3g3v2477780.1(Lj3g3v2477780.1) Lj5g3v2027300.1(Lj5g3v2027300.1)
DOSA: Os02t0122800-01(Os02g0122800) Os04t0118900-01(Os04g0118900)
ATS: 109733832(LOC109733832) 109786429(LOC109786429) 109786837(LOC109786837)
ZMA: 100192821(magi26728) 100193841 100281308 542174(SRP1A) 542693(TIDP3418)
PPP: 112293707
MNG: MNEG_6372
APRO: F751_1508
SPO: SPAC16.02c(srp2)
ABP: AGABI1DRAFT111169(AGABI1DRAFT_111169)
ABV: AGABI2DRAFT190388(AGABI2DRAFT_190388)
MGL: MGL_4119
PYO: PY17X_0507700(PY01659)
PCB: PCHAS_050670(PC000212.01.0)
 » show all
TaxonomyKoalaUniProt
Reference
  Authors
Wang J, Gao QS, Wang Y, Lafyatis R, Stamm S, Andreadis A
  Title
Tau exon 10, whose missplicing causes frontotemporal dementia, is regulated by an intricate interplay of cis elements and trans factors.
  Journal
J Neurochem 88:1078-90 (2004)
DOI:10.1046/j.1471-4159.2003.02232.x
  Sequence
[hsa:6429 6431]

DBGET integrated database retrieval system