KEGG   ORTHOLOGY: K14399
Entry
K14399                      KO                                     
Symbol
CLP1, HERB
Name
polyribonucleotide 5'-hydroxyl-kinase [EC:2.7.1.78]
Pathway
map03015  mRNA surveillance pathway
Disease
H00897  Pontocerebellar hypoplasia
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:ko00001]
 09120 Genetic Information Processing
  09122 Translation
   03015 mRNA surveillance pathway
    K14399  CLP1, HERB; polyribonucleotide 5'-hydroxyl-kinase
 09180 Brite Hierarchies
  09182 Protein families: genetic information processing
   03019 Messenger RNA biogenesis
    K14399  CLP1, HERB; polyribonucleotide 5'-hydroxyl-kinase
Enzymes [BR:ko01000]
 2. Transferases
  2.7  Transferring phosphorus-containing groups
   2.7.1  Phosphotransferases with an alcohol group as acceptor
    2.7.1.78  polynucleotide 5'-hydroxyl-kinase
     K14399  CLP1, HERB; polyribonucleotide 5'-hydroxyl-kinase
Messenger RNA biogenesis [BR:ko03019]
 Eukaryotic type
  mRNA processing factors
   3' end processing
    Pre-mRNA cleavage factor IIm (CFIIm)
     K14399  CLP1, HERB; polyribonucleotide 5'-hydroxyl-kinase
Other DBs
GO: 0046404 0051736
Genes
HSA: 10978(CLP1)
PTR: 451198(CLP1)
PPS: 100994100(CLP1)
GGO: 101143287(CLP1)
PON: 100460422(CLP1)
NLE: 100584876(CLP1)
MCC: 705071(CLP1)
MCF: 102133691(CLP1)
CSAB: 103235350(CLP1)
CATY: 105600787(CLP1)
PANU: 101017673(CLP1)
TGE: 112606862(CLP1)
RRO: 104677688(CLP1)
RBB: 108514865(CLP1)
TFN: 117080064(CLP1)
PTEH: 111544862(CLP1)
CJC: 100386802(CLP1)
SBQ: 101048258(CLP1)
CSYR: 103257790(CLP1)
MMUR: 105863131(CLP1)
OGA: 100951731(CLP1)
MMU: 98985(Clp1)
MCAL: 110288417(Clp1)
MPAH: 110318689(Clp1)
RNO: 311166(Clp1)
MCOC: 116090397(Clp1)
MUN: 110551958(Clp1)
CGE: 100755872(Clp1)
PLEU: 114689709 114710117(Clp1)
NGI: 103736636(Clp1)
HGL: 101723956(Clp1)
CPOC: 100721583(Clp1)
CCAN: 109688983(Clp1)
DORD: 106002502(Clp1)
DSP: 122104929(Clp1)
OCU: 100350312(CLP1)
OPI: 101535929(CLP1)
TUP: 102490551(CLP1)
CFA: 610161(CLP1)
VVP: 112930585(CLP1)
VLG: 121501317(CLP1)
AML: 100478336(CLP1)
UMR: 103666119(CLP1)
UAH: 113246377(CLP1)
UAR: 123785062(CLP1)
MPUF: 101689132(CLP1)
ORO: 101365436(CLP1)
EJU: 114215417(CLP1)
ZCA: 113914318(CLP1)
MLX: 118015866(CLP1)
FCA: 101091047(CLP1)
PYU: 121043402(CLP1)
PBG: 122483786(CLP1)
PTG: 102960670(CLP1)
PPAD: 109246457(CLP1)
AJU: 106979564(CLP1)
HHV: 120240288(CLP1)
BTA: 506507(CLP1)
BOM: 102277848(CLP1)
BIU: 109569885(CLP1)
BBUB: 102398381(CLP1)
CHX: 102171898(CLP1)
OAS: 101106031(CLP1)
ODA: 120877078(CLP1)
CCAD: 122449909(CLP1)
SSC: 100520541(CLP1)
CFR: 102515013(CLP1)
CBAI: 105066934(CLP1)
CDK: 105101224(CLP1)
VPC: 102527876(CLP1)
BACU: 103006007(CLP1)
LVE: 103089865(CLP1)
OOR: 101280708(CLP1)
DLE: 111183935(CLP1)
PCAD: 102975489(CLP1)
PSIU: 116758774(CLP1)
ECB: 100066955(CLP1)
EPZ: 103558224(CLP1)
EAI: 106822557(CLP1)
MYB: 102240760 102247153(CLP1)
MMYO: 118665008(CLP1) 118676825
MLF: 102427341(CLP1)
MNA: 107527665(CLP1)
PKL: 118712876(CLP1)
HAI: 109371620(CLP1)
DRO: 112320303(CLP1)
SHON: 118982782(CLP1)
AJM: 119062349(CLP1)
PDIC: 114500027(CLP1)
PHAS: 123831447(CLP1)
MMF: 118627985(CLP1)
RFQ: 117029593(CLP1)
PALE: 102890706(CLP1)
PGIG: 120600817(CLP1)
PVP: 105304745(CLP1)
RAY: 107518402(CLP1)
MJV: 108402313(CLP1)
TOD: 119254370(CLP1)
SARA: 101552672(CLP1)
LAV: 100657486(CLP1)
TMU: 101359940
DNM: 101439531(CLP1)
MDO: 100017655 100022871(CLP1)
GAS: 123251351(CLP1)
SHR: 100931522(CLP1)
PCW: 110199481(CLP1)
OAA: 100091140(CLP1)
GGA: 423131(CLP1)
PCOC: 116229070(CLP1)
MGP: 100547570(CLP1)
CJO: 107314449(CLP1)
NMEL: 110401415(CLP1)
ACYG: 106033820(CLP1)
AFUL: 116489972(CLP1)
TGU: 100220989(CLP1)
LSR: 110467565(CLP1)
SCAN: 103822156
PMOA: 120501004(CLP1)
OTC: 121334799(CLP1)
PRUF: 121352357(CLP1)
GFR: 102032848(CLP1)
FAB: 101819677(CLP1)
PHI: 102108463(CLP1)
PMAJ: 107205510(CLP1)
CCAE: 111930384(CLP1)
CCW: 120410132(CLP1)
ETL: 114063289(CLP1)
FPG: 101916434(CLP1)
FCH: 102056567(CLP1)
CLV: 102091765(CLP1)
EGZ: 104129563(CLP1)
NNI: 104010537(CLP1)
ACUN: 113481203(CLP1)
TALA: 116959841(CLP1)
ACHC: 115351937(CLP1)
AAM: 106489148(CLP1)
AROW: 112962476(CLP1)
NPD: 112948016(CLP1)
DNE: 112991677(CLP1)
ASN: 102384463(CLP1)
AMJ: 102571624(CLP1)
CPOO: 109318141(CLP1)
GGN: 109295672(CLP1)
PSS: 102462947(CLP1)
CMY: 102932686(CLP1)
CPIC: 101933800(CLP1)
TST: 117873131(CLP1)
CABI: 116822150(CLP1)
MRV: 120403675(CLP1)
ACS: 100556487(clp1)
PVT: 110078286(CLP1)
SUND: 121919831(CLP1)
PBI: 103048829(CLP1)
PMUR: 107291539(CLP1)
TSR: 106541472(CLP1)
VKO: 123018602(CLP1)
PMUA: 114601208(CLP1)
ZVI: 118089774(CLP1)
GJA: 107110661(CLP1)
STOW: 125427323(CLP1)
XLA: 431824(clp1.L)
XTR: 493364(clp1)
NPR: 108788104(CLP1)
RTEM: 120909407(CLP1)
BBUF: 121005094(CLP1)
BGAR: 122941368(CLP1)
DRE: 565621(clp1)
SGH: 107594873(clp1) 107594950
CCAR: 109065566(clp1) 109102920
CAUA: 113057594(clp1) 113113321
PPRM: 120461161(clp1)
MAMB: 125258853(clp1)
IPU: 108268688(clp1)
PHYP: 113542851(clp1)
SMEO: 124386507(clp1)
TFD: 113647715(clp1)
AMEX: 103032393(clp1)
EEE: 113570726(clp1)
TRU: 101064782 115246464(clp1)
NCC: 104951307(clp1)
CGOB: 115014228(clp1)
ELY: 117260451(clp1)
PLEP: 121948015(clp1)
SLUC: 116052629(clp1)
ECRA: 117952132(clp1)
PFLV: 114562827(clp1)
GAT: 120818086(clp1)
PPUG: 119211588(clp1)
MSAM: 119888900(clp1)
CUD: 121516856(clp1)
MZE: 101487618(clp1)
ONL: 100693433(clp1)
OAU: 116332983(clp1)
OLA: 101158455(clp1)
OML: 112152991(clp1)
XMA: 102216608(clp1)
XCO: 114139372(clp1)
XHE: 116714775(clp1)
PRET: 103471362(clp1)
PFOR: 103147478(clp1)
PLAI: 106935350(clp1)
PMEI: 106905531(clp1)
GAF: 122836668(clp1)
CVG: 107085664(clp1)
CTUL: 119788302(clp1)
GMU: 124860474(clp1)
NFU: 107376815(clp1)
KMR: 108243041(clp1)
ALIM: 106534459(clp1)
NWH: 119408971(clp1)
AOCE: 111576498(clp1)
CSEM: 103390956(clp1)
POV: 109625289(clp1)
SSEN: 122778940(clp1)
HHIP: 117769053(clp1)
LCF: 108885554(clp1)
SDU: 111232652(clp1)
SLAL: 111662733(clp1)
XGL: 120784959(clp1)
HCQ: 109524444(clp1)
BPEC: 110163851
MALB: 109954801(clp1)
ELS: 105028688(clp1)
SFM: 108935929(clp1)
PKI: 111834195(clp1)
AANG: 118232393(clp1)
LOC: 102689404(clp1)
PSPA: 121302119(clp1)
LCM: 102366070(CLP1)
RTP: 109925629(clp1)
BFO: 118423976
CIN: 100183747
SCLV: 120347060
SPU: 763581
APLC: 110977606
SKO: 102808002
DME: Dmel_CG5970(cbc)
DER: 6549640
DSE: 6609009
DSI: Dsimw501_GD25757(Dsim_GD25757)
DAN: 6494046
DSR: 110177794
DPE: 6592646
DWI: 6640990
DGR: 6568947
DAZ: 108615616
DNV: 108653838
DHE: 111599696
DVI: 6635342
CCAT: 101459473
BOD: 106620353
MDE: 101894426
SCAC: 106089418
LCQ: 111681096
AGA: AgaP_AGAP007701(CLP1_ANOGA)
ACOZ: 120953964
AARA: 120902290
AAG: 5571757
AALB: 109409346
CPII: 120417829
CNS: 116338706
AME: 551305
ACER: 108001960
ALAB: 122714439
BIM: 100743602
BBIF: 117217093
BVK: 117236422
BVAN: 117154561
BTER: 100645103
BPYO: 122576454
CCAL: 108623335
OBB: 114877876
MGEN: 117222372
NMEA: 116430731
CGIG: 122402228
SOC: 105197589
MPHA: 105838509
AEC: 105149961
ACEP: 105627146
PBAR: 105432806
HST: 105183231
DQU: 106746897
CFO: 105250962
FEX: 115243457
LHU: 105677442
PGC: 109854870
OBO: 105280550
PCF: 106787686
PFUC: 122513578
VPS: 122632460
CSOL: 105364680
FAS: 105268627
DAM: 107043263
CCIN: 107269014
TCA: 663900
DPA: 109545015
SOY: 115874748
CSET: 123315981
AGB: 108911506
NVL: 108561836
APLN: 108734369
PPYR: 116173480
OTU: 111425487
BMOR: 101736699
BMAN: 114251203
MSEX: 115449623
BANY: 112054488
PMAC: 106708729
PPOT: 106101089
PRAP: 111001347
ZCE: 119828770
HAW: 110381936
TNL: 113504921
SLIU: 111350434
PXY: 105387358
API: 100169363
DNX: 107173297
AGS: 114125919
BTAB: 109043788
CLEC: 106660895
HHAL: 106677506
FOC: 113206288
ZNE: 110837369
FCD: 110852753
DMK: 116924530
PVM: 113804964
PJA: 122251289
PCHN: 125043746
HAME: 121861488
PTRU: 123505160
HAZT: 108671817
EAF: 111701702
DSV: 119442956
RSAN: 119388036
RMP: 119187385
VDE: 111248739
VJA: 111270488
TUT: 107369488
DPTE: 113799326
DFR: 124500214
CSCU: 111617773
CEL: CELE_F59A2.4(clpf-1)
BMY: BM_BM13976(Bma-clpf-1)
PCAN: 112565160
BGT: 106053831
GAE: 121381357
HRF: 124114702
HRJ: 124267770
CRG: 105326854
MYI: 110459436
PMAX: 117343689
MMER: 123549509
OBI: 106872450
OSN: 115216516
LAK: 106154821
EGL: EGR_04072
NVE: 5521765
EPA: 110231468
ATEN: 116304488
ADF: 107341117
AMIL: 114951457
PDAM: 113666996
SPIS: 111344292
DGT: 114515992
XEN: 124440343
HMG: 100197448
AQU: 100635760
ATH: AT3G04680(CLPS3) AT5G39930(CLPS5)
THJ: 104811064
CIT: 102629299
TCC: 18601443
GRA: 105779456
GAB: 108458267
DZI: 111292887
EGR: 104419345
VRA: 106772085
VAR: 108326051
VUN: 114191005
CCAJ: 109815121
APRC: 113871962
CAM: 101492204
LJA: Lj5g3v2290070.2(Lj5g3v2290070.2) Lj5g3v2290070.3(Lj5g3v2290070.3)
ADU: 107494525
LANG: 109355315
FVE: 101299204
RCN: 112190468
PPER: 18784353
PMUM: 103329966
PAVI: 110752441
PDUL: 117623589
ZJU: 107415545
MNT: 21385122
CSV: 101211613
CMO: 103498469
BHJ: 120079029
MCHA: 111006662
CMAX: 111487604
CMOS: 111430040
CPEP: 111795469
RCU: 8276022
JCU: 105642601
HBR: 110643088
MESC: 110605501
POP: 7495951
PEU: 105109996
PALZ: 118031831
QLO: 115976814
VVI: 100242380
SLY: 101249197
SPEN: 107001065
SOT: 102579213
CANN: 107875978
NSY: 104238607
NTO: 104120109
NAU: 109231792
ITR: 116024610
SIND: 105178237
OEU: 111407478
EGT: 105967223
ECAD: 122587176
LSV: 111906788
CCAV: 112515973
DCR: 108226436
BVG: 104887406
SOE: 110781838
MING: 122060477
TSS: 122672763
NCOL: 116247625
OSA: 4328733
DOSA: Os02t0217500-01(Os02g0217500)
OBR: 102719269
BDI: 100820915
ATS: 109748167
SBI: 8082954
ZMA: 100284798
SITA: 101758957
SVS: 117846609
PHAI: 112881937
PDA: 103709610
MUS: 103999305
ATR: 18433022
PPP: 112273924
APRO: F751_3781
MPP: MICPUCDRAFT_37065(CLP1)
SCE: YOR250C(CLP1)
SEUB: DI49_5071
ERC: Ecym_2382
KMX: KLMA_30448(CLP1)
NCS: NCAS_0B01210(NCAS0B01210)
NDI: NDAI_0E01090(NDAI0E01090)
TPF: TPHA_0D01350(TPHA0D01350)
TBL: TBLA_0D01320(TBLA0D01320)
TDL: TDEL_0A06350(TDEL0A06350)
KAF: KAFR_0A03930(KAFR0A03930)
KNG: KNAG_0G02640(KNAG0G02640)
CAL: CAALFM_C303840CA(CaO19.6931)
SLB: AWJ20_420(CLP1)
NCR: NCU06314
NTE: NEUTE1DRAFT79143(NEUTE1DRAFT_79143)
MGR: MGG_08804
SSCK: SPSK_08992
MAJ: MAA_04815
CMT: CCM_08834
BFU: BCIN_12g03610(Bcclp1)
MBE: MBM_03259
ANI: AN0161.2
ANG: ANI_1_612164(An18g04570)
ALUC: AKAW2_31141S(CLP1)
ACHE: ACHE_41142S(CLP1)
APUU: APUU_11982S(CLP1)
ABE: ARB_03056
TVE: TRV_03023
PTE: PTT_17730
CNE: CNE04260
CNB: CNBE4250
TASA: A1Q1_06646
MORE: E1B28_009067(CLP1)
ABP: AGABI1DRAFT104404(AGABI1DRAFT_104404)
ABV: AGABI2DRAFT176420(AGABI2DRAFT_176420)
MGL: MGL_1095
MRT: MRET_3059
DDI: DDB_G0285507(clp1)
DFA: DFA_01263(clp1)
EHI: EHI_008100(55.t00023)
PCB: PCHAS_071830(PC000337.04.0)
TAN: TA06270
TPV: TP01_0895
BBO: BBOV_IV008810(23.m06130)
CPV: cgd5_2880
TCR: 507027.59
 » show all
Reference
  Authors
Ramirez A, Shuman S, Schwer B
  Title
Human RNA 5'-kinase (hClp1) can function as a tRNA splicing enzyme in vivo.
  Journal
RNA 14:1737-45 (2008)
DOI:10.1261/rna.1142908
  Sequence
[hsa:10978]

DBGET integrated database retrieval system