KEGG   ORTHOLOGY: K14403
Entry
K14403                      KO                                     
Symbol
CPSF3, YSH1
Name
cleavage and polyadenylation specificity factor subunit 3 [EC:3.1.27.-]
Pathway
map03015  mRNA surveillance pathway
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:ko00001]
 09120 Genetic Information Processing
  09122 Translation
   03015 mRNA surveillance pathway
    K14403  CPSF3, YSH1; cleavage and polyadenylation specificity factor subunit 3
 09180 Brite Hierarchies
  09182 Protein families: genetic information processing
   03021 Transcription machinery
    K14403  CPSF3, YSH1; cleavage and polyadenylation specificity factor subunit 3
   03019 Messenger RNA biogenesis
    K14403  CPSF3, YSH1; cleavage and polyadenylation specificity factor subunit 3
Enzymes [BR:ko01000]
 3. Hydrolases
  3.1  Acting on ester bonds
   3.1.27  Endoribonucleases producing 3'-phosphomonoesters
    3.1.27.-
     K14403  CPSF3, YSH1; cleavage and polyadenylation specificity factor subunit 3
Transcription machinery [BR:ko03021]
 Eukaryotic type
  RNA polymerase II system
   Other transcription-related factors
    Transcription termination factor
     K14403  CPSF3, YSH1; cleavage and polyadenylation specificity factor subunit 3
Messenger RNA biogenesis [BR:ko03019]
 Eukaryotic type
  mRNA processing factors
   3' end processing
    Cleavage and polyadenylation specificity factor (CPSF) complex
     K14403  CPSF3, YSH1; cleavage and polyadenylation specificity factor subunit 3
    U7-dependent histone pre-mRNA processing factors
     K14403  CPSF3, YSH1; cleavage and polyadenylation specificity factor subunit 3
Genes
HSA: 51692(CPSF3)
PTR: 459017(CPSF3)
PPS: 100987738(CPSF3)
GGO: 101148124(CPSF3)
PON: 100174072(CPSF3)
NLE: 100604815(CPSF3)
MCC: 694036(CPSF3)
MCF: 101866893(CPSF3)
CSAB: 103220849(CPSF3)
CATY: 105587541(CPSF3)
PANU: 101020847(CPSF3)
TGE: 112605245(CPSF3)
RRO: 104675214(CPSF3)
RBB: 108515992(CPSF3)
TFN: 117062751(CPSF3)
PTEH: 111531719(CPSF3)
CJC: 100407252(CPSF3)
SBQ: 101042576(CPSF3)
CSYR: 103273748(CPSF3)
MMUR: 105882943(CPSF3)
OGA: 100947235(CPSF3)
MMU: 54451(Cpsf3)
MCAL: 110306804(Cpsf3)
MPAH: 110324958(Cpsf3)
RNO: 298916(Cpsf3)
MCOC: 116080553(Cpsf3)
MUN: 110564169(Cpsf3)
CGE: 100758811(Cpsf3)
PLEU: 114698859(Cpsf3)
NGI: 103747630(Cpsf3)
HGL: 101721287(Cpsf3)
CPOC: 100732642(Cpsf3)
CCAN: 109695925(Cpsf3)
DORD: 105983730(Cpsf3)
DSP: 122108770(Cpsf3)
NCAR: 124963679
OCU: 100354833(CPSF3)
OPI: 101518776(CPSF3)
TUP: 102497729(CPSF3)
CFA: 100856414(CPSF3)
VVP: 112927732(CPSF3)
VLG: 121491285(CPSF3)
AML: 100482521(CPSF3)
UMR: 103660911(CPSF3)
UAH: 113269703(CPSF3)
UAR: 123778548(CPSF3)
ELK: 111154091
LLV: 125108561
MPUF: 101676865(CPSF3)
ORO: 101378844(CPSF3)
EJU: 114205801(CPSF3)
ZCA: 113937541(CPSF3)
FCA: 101089510(CPSF3)
PYU: 121044069(CPSF3)
PBG: 122497482(CPSF3)
PTG: 102952910(CPSF3)
PPAD: 109268842(CPSF3)
AJU: 106982958(CPSF3)
HHV: 120231141(CPSF3)
BTA: 281712(CPSF3)
BOM: 102279685(CPSF3)
BIU: 109566406(CPSF3)
BBUB: 102393889(CPSF3)
CHX: 102187686(CPSF3)
OAS: 101116553(CPSF3)
ODA: 120851892(CPSF3)
CCAD: 122442089(CPSF3)
SSC: 100622181(CPSF3)
CFR: 102508573(CPSF3)
CBAI: 105076038(CPSF3)
CDK: 105091234(CPSF3)
VPC: 102542259(CPSF3)
BACU: 103004786(CPSF3)
LVE: 103087288(CPSF3)
OOR: 101272771(CPSF3)
DLE: 111164461(CPSF3)
PCAD: 102977623(CPSF3)
PSIU: 116764497(CPSF3)
ECB: 100072510(CPSF3)
EPZ: 103560848(CPSF3)
EAI: 106847481(CPSF3)
MYB: 102247452(CPSF3)
MYD: 102759958(CPSF3)
MMYO: 118669300(CPSF3)
MLF: 102424456(CPSF3)
MNA: 107526645(CPSF3)
PKL: 118715936(CPSF3)
HAI: 109386662(CPSF3)
DRO: 112297706(CPSF3)
SHON: 118988747(CPSF3)
AJM: 119053922(CPSF3)
PDIC: 114499376(CPSF3)
PHAS: 123822494(CPSF3)
MMF: 118630842(CPSF3)
RFQ: 117033082(CPSF3)
PALE: 102894311(CPSF3)
PGIG: 120622060(CPSF3)
PVP: 105295435(CPSF3)
RAY: 107498265(CPSF3)
MJV: 108385352
TOD: 119259571(CPSF3)
SARA: 101542046(CPSF3)
LAV: 100657725(CPSF3)
TMU: 101351216
DNM: 101426833(CPSF3)
MDO: 100028117(CPSF3)
GAS: 123237028(CPSF3)
SHR: 100927308(CPSF3)
PCW: 110212608(CPSF3)
OAA: 100073852(CPSF3)
GGA: 421929(CPSF3)
PCOC: 116240406(CPSF3)
MGP: 100549104(CPSF3)
CJO: 107312201(CPSF3)
NMEL: 110395714(CPSF3)
APLA: 101803425(CPSF3)
ACYG: 106030709(CPSF3)
AFUL: 116488131(CPSF3)
TGU: 100221106(CPSF3)
LSR: 110467960(CPSF3)
SCAN: 103820423(CPSF3)
PMOA: 120505305(CPSF3)
OTC: 121344847(CPSF3)
PRUF: 121359130(CPSF3)
GFR: 102038451(CPSF3)
FAB: 101819553(CPSF3)
PHI: 102101589(CPSF3)
PMAJ: 107201527(CPSF3)
CCAE: 111925942(CPSF3)
CCW: 104685511(CPSF3)
ETL: 114058985(CPSF3)
ZAB: 102063018(CPSF3)
FPG: 101915451(CPSF3)
FCH: 102052345(CPSF3)
CLV: 102097287(CPSF3)
EGZ: 104127141(CPSF3)
NNI: 104013021(CPSF3)
ACUN: 113478186(CPSF3)
TALA: 104355761(CPSF3)
PADL: 103924057(CPSF3)
ACHC: 115350915(CPSF3)
AAM: 106494754(CPSF3)
AROW: 112976493(CPSF3)
NPD: 112945463(CPSF3)
DNE: 112981508(CPSF3)
ASN: 102371539(CPSF3)
AMJ: 102558228(CPSF3)
CPOO: 109311661(CPSF3)
GGN: 109300142(CPSF3)
PSS: 102454887(CPSF3)
CMY: 102933619(CPSF3)
CPIC: 101939420(CPSF3)
TST: 117875287(CPSF3)
CABI: 116833589(CPSF3)
MRV: 120401284(CPSF3)
ACS: 100564303(cpsf3)
PVT: 110080594(CPSF3)
SUND: 121919587(CPSF3)
PBI: 103059216(CPSF3)
PMUR: 107287629(CPSF3)
PGUT: 117674211(CPSF3)
VKO: 123017175(CPSF3)
PMUA: 114593779(CPSF3)
ZVI: 118082400(CPSF3)
GJA: 107111205(CPSF3)
XLA: 108718236(cpsf3.S) 495111(cpsf3.L)
XTR: 448456(cpsf3)
NPR: 108789870(CPSF3)
RTEM: 120936361(CPSF3)
BBUF: 120989346 120997414(CPSF3)
BGAR: 122931590 122934398(CPSF3)
DRE: 324554(cpsf3)
SRX: 107721258(cpsf3) 107756584
PPRM: 120493962(cpsf3)
IPU: 100304904(cpsf3)
PHYP: 113532342(cpsf3)
SMEO: 124377473(cpsf3)
TFD: 113655630(cpsf3)
AMEX: 103041693(cpsf3)
EEE: 113570512(cpsf3)
TRU: 101073122(cpsf3) 101075419
NCC: 104953606(cpsf3)
CGOB: 115027261(cpsf3)
PLEP: 121953421
ECRA: 117936318(cpsf3)
PFLV: 114546854(cpsf3)
PPUG: 119195237(cpsf3) 119227478
CUD: 121521363(cpsf3) 121526288
MZE: 101469767 101471316(cpsf3)
ONL: 100690485(cpsf3) 100692710
OAU: 116312427(cpsf3) 116334804
OLA: 101164375(cpsf3)
OML: 112138401(cpsf3)
XMA: 102220704 102227387(cpsf3)
XCO: 114133816(cpsf3) 114159050
PFOR: 103146800 103147269(cpsf3)
PLAI: 106936798 106958487(cpsf3)
PMEI: 106925344(cpsf3) 106928437
GAF: 122825648(cpsf3) 122845602
CVG: 107084701(cpsf3) 107089585
GMU: 124882394(cpsf3) 124884845
NFU: 107377927 107392273(cpsf3)
KMR: 108232094 108249674(cpsf3)
ALIM: 106530771(cpsf3) 106534293
AOCE: 111565927(cpsf3) 111587228
CSEM: 103377651(cpsf3)
POV: 109628010(cpsf3) 109645546
HHIP: 117755869 117758714(cpsf3)
LCF: 108888139(cpsf3) 108891568
SDU: 111225735(cpsf3) 111236101
SLAL: 111644788(cpsf3) 111672593
XGL: 120789207(cpsf3) 120795170
HCQ: 109526156(cpsf3) 109531721
BPEC: 110155234(cpsf3) 110173245
MALB: 109955017(cpsf3) 109974481
SASA: 100194853(cpsf3)
OTW: 112217456(cpsf3)
OMY: 110522061(cpsf3)
OGO: 123994870(cpsf3)
ONE: 115139644(cpsf3)
SALP: 111972679(cpsf3)
SNH: 120019619(cpsf3)
ELS: 105017804(cpsf3)
SFM: 108929323(cpsf3)
PKI: 111851204(cpsf3)
AANG: 118229283(cpsf3)
LOC: 102688287(cpsf3)
PSPA: 121315404 121317739(cpsf3)
ARUT: 117402197 117410608(cpsf3)
LCM: 102367080(CPSF3)
CMK: 103187130(cpsf3)
RTP: 109924290(cpsf3)
BFO: 118430430
BBEL: 109480154
CIN: 100184465
SCLV: 120336359
SPU: 591455
APLC: 110983149
SKO: 100377481(CPSF3)
DME: Dmel_CG7698(Cpsf73)
DER: 6551815
DSE: 6613738
DSI: Dsimw501_GD20157(Dsim_GD20157)
DAN: 6500879
DSR: 110188080
DPE: 6587287
DMN: 108154986
DWI: 6651349
DGR: 6563476
DAZ: 108618630
DNV: 108659173
DHE: 111596746
DVI: 6632583
CCAT: 101454714
BOD: 106620049
MDE: 101900097
SCAC: 106090509
LCQ: 111684681
ACOZ: 120952809
AARA: 120896928
AAG: 5569752
AALB: 109404703
CPII: 120413346
CNS: 116342142
AME: 102653588
ACER: 107999786
ALAB: 122713098
BIM: 105681196
BBIF: 117206335
BVK: 117242799
BVAN: 117163441
BTER: 105666336
BPYO: 122573836
CCAL: 108629027
OBB: 114879397
MGEN: 117222435
NMEA: 116430991
CGIG: 122400140
SOC: 105201764
MPHA: 105832925
AEC: 105151475
ACEP: 105619881
PBAR: 105431852
VEM: 105566479
HST: 105187255
DQU: 106741703
CFO: 105252772
FEX: 115237196
PGC: 109855224
OBO: 105287517
PFUC: 122513306
NVI: 100121469
CSOL: 105364520
TPRE: 106653065
CGLO: 123268650
FAS: 105268046
DAM: 107048737
CCIN: 107273009
TCA: 103314846
DPA: 109534129
SOY: 115891144
CSET: 123306917
AGB: 108914006
LDC: 111514009
NVL: 108566329
PPYR: 116159355
OTU: 111417631
BMOR: 101737197
BMAN: 114249040
MSEX: 115444098
BANY: 112044845
PMAC: 106718880
PPOT: 106102065
PRAP: 110995530
ZCE: 119831876
HAW: 110377925
TNL: 113501978
SLIU: 111348424
OFU: 114353544
PXY: 105384053
API: 100162150
DNX: 107173259
AGS: 114125850
RMD: 113552831
BTAB: 109038365
DCI: 103511055
CLEC: 106669194
HHAL: 106690184
NLU: 111064442
FOC: 113207218
ZNE: 110827382
CSEC: 111863259
FCD: 110859727
PVM: 113814808
PJA: 122257621
PCHN: 125029977
HAME: 121854393
PCLA: 123763779
PTRU: 123502843
HAZT: 108674371
EAF: 111704067
DSV: 119450002
RSAN: 119383010
RMP: 119170214
VDE: 111250612
VJA: 111261621
TUT: 107367365
DPTE: 113796217
DFR: 124492185
CSCU: 111612627
PTEP: 107436523
SDM: 118202967
CEL: CELE_Y67H2A.1(cpsf-3)
CBR: CBG_01798(Cbr-cpsf-3)
BMY: BM_BM13814(Bma-cpsf-3)
TSP: Tsp_06065
PCAN: 112559367
BGT: 106054456
GAE: 121380523
HRF: 124135376
HRJ: 124256157
CRG: 105319722
MYI: 110451365
PMAX: 117335579
MMER: 123536324
OBI: 106876794
OSN: 115225313
LAK: 106169923
EGL: EGR_00716
EPA: 110233128
ATEN: 116301399
ADF: 107345440
AMIL: 114972479
PDAM: 113684147
SPIS: 111329613
DGT: 114531104
XEN: 124453760
HMG: 100212355
AQU: 100632053
ATH: AT1G61010(CPSF73-I)
ALY: 9324176
CRB: 17894668
BRP: 103830284
BOE: 106312852
RSZ: 108813036
THJ: 104819173
CPAP: 110809608
MINC: 123213793
TCC: 18607833
GRA: 105783128
GAB: 108464316
VRA: 106776218
VAR: 108343387
VUN: 114187067
CCAJ: 109803884
APRC: 113872997
CAM: 101507429
ADU: 107460068
AIP: 107610064
LANG: 109334515
ZJU: 107415200
MNT: 21396987
CMO: 103503202
BHJ: 120070103
MCHA: 111019708
RCU: 8289311
JCU: 105633321
MESC: 110624826
JRE: 109002306
TWL: 119984248
SLY: 101265747
SPEN: 107026412
SOT: 102582676
NTA: 107816413
NTO: 104119480
NAU: 109229117
INI: 109169319
ITR: 116027134
SIND: 105169117
OEU: 111384213
EGT: 105970042
HAN: 110921719
ECAD: 122594043
LSV: 111913654
CCAV: 112504247
DCR: 108209888
CSIN: 114287328
SOE: 110801727
CQI: 110703384
NNU: 104610329
TSS: 122645935
PSOM: 113297540
NCOL: 116266255
OSA: 4334816
DOSA: Os03t0852900-01(Os03g0852900)
OBR: 102719189
SBI: 8061396
SITA: 101772119
SVS: 117837515
PHAI: 112875636
EGU: 105051523
MUS: 103986566
DCT: 110110593
PEQ: 110021782
AOF: 109825379
MNG: MNEG_0425
APRO: F751_0464
SCE: YLR277C(YSH1) YOR179C(SYC1)
SEUB: DI49_3787
ERC: Ecym_3113
KMX: KLMA_10210(YSH1)
NCS: NCAS_0D02950(NCAS0D02950)
NDI: NDAI_0I01950(NDAI0I01950)
TPF: TPHA_0K01110(TPHA0K01110)
TBL: TBLA_0A09750(TBLA0A09750)
TDL: TDEL_0G03980(TDEL0G03980)
KAF: KAFR_0A04950(KAFR0A04950)
KNG: KNAG_0F03030(KNAG0F03030)
CAL: CAALFM_C206230WA(CaO19.5486)
SLB: AWJ20_2352(YSH1)
NCR: NCU03479
NTE: NEUTE1DRAFT84705(NEUTE1DRAFT_84705)
MGR: MGG_01804
SSCK: SPSK_08326
MAW: MAC_02910
MAJ: MAA_01686
CMT: CCM_04784
BFU: BCIN_03g04080(Bcysh1)
MBE: MBM_01770
ANI: AN0990.2
ANG: ANI_1_1378014(An01g10140)
ALUC: AKAW2_21053A(YSH1)
ACHE: ACHE_30079A(YSH1)
APUU: APUU_50798A(YSH1)
ABE: ARB_02217
TVE: TRV_00467
PTE: PTT_11224
SPO: SPAC17G6.16c(ysh1)
CNE: CNH02710
CNB: CNBL2750
TASA: A1Q1_04233
MORE: E1B28_010113(YSH1)
ABP: AGABI1DRAFT70926(AGABI1DRAFT_70926)
ABV: AGABI2DRAFT203789(AGABI2DRAFT_203789)
MGL: MGL_2640
MRT: MRET_0447
DDI: DDB_G0274799(cpsf3)
DFA: DFA_09743(cpsf3)
EHI: EHI_136170(33.t00006)
PCB: PCHAS_130560(PC000290.00.0)
TAN: TA05230
TPV: TP03_0560
BBO: BBOV_IV001630(21.m03044)
CPV: cgd8_460
SMIN: v1.2.010659.t1(symbB.v1.2.010659.t1)
SPAR: SPRG_12757
PPY: PPE_00132
PPM: PPSC2_00670(ysh1)
PPO: PPM_0126(ysh1)
PPQ: PPSQR21_001310(ySH1)
PPOY: RE92_11035
THX: Thet_1888
TTM: Tthe_0594
TSH: Tsac_1212
AMU: Amuc_1883
AGL: PYTT_0681
MIN: Minf_0268(ysh1)
MKC: kam1_1882
MEAP: MTHMO_2250(ysh)
SRU: SRU_1941
SRM: SRM_02156
RMR: Rmar_2131
IAL: IALB_2671
MRO: MROS_1639
KOL: Kole_1411
 » show all
Reference
  Authors
Zhelkovsky A, Tacahashi Y, Nasser T, He X, Sterzer U, Jensen TH, Domdey H, Moore C
  Title
The role of the Brr5/Ysh1 C-terminal domain and its homolog Syc1 in mRNA 3'-end processing in Saccharomyces cerevisiae.
  Journal
RNA 12:435-45 (2006)
DOI:10.1261/rna.2267606
  Sequence
[sce:YLR277C]
Reference
  Authors
Kaufmann I, Martin G, Friedlein A, Langen H, Keller W
  Title
Human Fip1 is a subunit of CPSF that binds to U-rich RNA elements and stimulates poly(A) polymerase.
  Journal
EMBO J 23:616-26 (2004)
DOI:10.1038/sj.emboj.7600070
  Sequence
[hsa:51692]

DBGET integrated database retrieval system